MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 12502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017223	GGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	75 %	25 %	384202564
2	NC_017223	GACG	2	8	616	623	25 %	0 %	50 %	25 %	384202564
3	NC_017223	CGCA	2	8	751	758	25 %	0 %	25 %	50 %	384202564
4	NC_017223	CATC	2	8	836	843	25 %	25 %	0 %	50 %	384202564
5	NC_017223	GCCT	2	8	947	954	0 %	25 %	25 %	50 %	384202564
6	NC_017223	GCTG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	384202564
7	NC_017223	GCAA	2	8	1904	1911	50 %	0 %	25 %	25 %	384202564
8	NC_017223	GCCG	2	8	1988	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	384202565
9	NC_017223	GTCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	384202565
10	NC_017223	GGCC	2	8	2423	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	384202565
11	NC_017223	CCGC	2	8	2631	2638	0 %	0 %	25 %	75 %	384202566
12	NC_017223	GCCC	2	8	3006	3013	0 %	0 %	25 %	75 %	384202566
13	NC_017223	GCTG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	50 %	25 %	384202566
14	NC_017223	TGCT	2	8	3420	3427	0 %	50 %	25 %	25 %	384202567
15	NC_017223	GCCA	2	8	4031	4038	25 %	0 %	25 %	50 %	384202567
16	NC_017223	CCTG	2	8	4337	4344	0 %	25 %	25 %	50 %	384202568
17	NC_017223	GTGC	2	8	4455	4462	0 %	25 %	50 %	25 %	384202568
18	NC_017223	GGCC	2	8	4532	4539	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
19	NC_017223	GGCG	2	8	4784	4791	0 %	0 %	75 %	25 %	384202568
20	NC_017223	GGCC	2	8	5265	5272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017223	CGAC	2	8	5381	5388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017223	CGGC	2	8	5697	5704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017223	GGCG	2	8	7537	7544	0 %	0 %	75 %	25 %	384202569
24	NC_017223	TATG	2	8	7980	7987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017223	TTGC	2	8	8316	8323	0 %	50 %	25 %	25 %	384202570
26	NC_017223	AAGG	2	8	8937	8944	50 %	0 %	50 %	0 %	384202571
27	NC_017223	CCCG	2	8	9356	9363	0 %	0 %	25 %	75 %	384202572
28	NC_017223	CCTA	2	8	11762	11769	25 %	25 %	0 %	50 %	384202576
29	NC_017223	TCGT	2	8	12076	12083	0 %	50 %	25 %	25 %	384202576
30	NC_017223	GTCG	2	8	13662	13669	0 %	25 %	50 %	25 %	384202576
31	NC_017223	TCGC	2	8	14195	14202	0 %	25 %	25 %	50 %	384202576
32	NC_017223	GGCC	2	8	14916	14923	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
33	NC_017223	TCGC	2	8	15735	15742	0 %	25 %	25 %	50 %	384202576
34	NC_017223	CAAG	2	8	15797	15804	50 %	0 %	25 %	25 %	384202577
35	NC_017223	ATGG	2	8	16478	16485	25 %	25 %	50 %	0 %	384202577
36	NC_017223	AAGG	2	8	17721	17728	50 %	0 %	50 %	0 %	384202577
37	NC_017223	ATCG	2	8	18536	18543	25 %	25 %	25 %	25 %	384202577
38	NC_017223	GGTG	2	8	19079	19086	0 %	25 %	75 %	0 %	384202577
39	NC_017223	ACTG	2	8	20025	20032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017223	CCTG	2	8	21093	21100	0 %	25 %	25 %	50 %	384202579
41	NC_017223	GCCC	2	8	21856	21863	0 %	0 %	25 %	75 %	384202579
42	NC_017223	CACG	2	8	21974	21981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017223	TTCG	2	8	22158	22165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017223	CACG	2	8	22271	22278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017223	CGGA	2	8	22301	22308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017223	GCCG	2	8	23010	23017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017223	CGCC	2	8	23523	23530	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_017223	GGCC	2	8	23709	23716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017223	GCTG	2	8	24169	24176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017223	GCCG	2	8	24177	24184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017223	GCCA	2	8	24302	24309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017223	CGGG	2	8	24314	24321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017223	TGCT	2	8	25315	25322	0 %	50 %	25 %	25 %	384202580
54	NC_017223	GCCT	2	8	25917	25924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017223	GCCG	2	8	26540	26547	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
56	NC_017223	TGAG	2	8	26703	26710	25 %	25 %	50 %	0 %	384202581
57	NC_017223	CGCC	2	8	26836	26843	0 %	0 %	25 %	75 %	384202581
58	NC_017223	CTGC	2	8	26848	26855	0 %	25 %	25 %	50 %	384202581
59	NC_017223	GCCG	2	8	26884	26891	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
60	NC_017223	CGGC	2	8	27096	27103	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
61	NC_017223	GCTG	2	8	27136	27143	0 %	25 %	50 %	25 %	384202581
62	NC_017223	CGGC	2	8	27870	27877	0 %	0 %	50 %	50 %	384202582
63	NC_017223	GCTG	2	8	27931	27938	0 %	25 %	50 %	25 %	384202582
64	NC_017223	CCGG	2	8	28234	28241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017223	GGCC	2	8	28501	28508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017223	CGAA	2	8	28727	28734	50 %	0 %	25 %	25 %	384202583
67	NC_017223	GGCC	2	8	28963	28970	0 %	0 %	50 %	50 %	384202583
68	NC_017223	CAGC	2	8	29177	29184	25 %	0 %	25 %	50 %	384202584
69	NC_017223	AGCC	2	8	29320	29327	25 %	0 %	25 %	50 %	384202584
70	NC_017223	GGCG	2	8	29513	29520	0 %	0 %	75 %	25 %	384202584
71	NC_017223	CGTG	2	8	29612	29619	0 %	25 %	50 %	25 %	384202584
72	NC_017223	GGCC	2	8	30044	30051	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
73	NC_017223	AATC	2	8	30635	30642	50 %	25 %	0 %	25 %	384202585
74	NC_017223	AGCA	2	8	31239	31246	50 %	0 %	25 %	25 %	384202586
75	NC_017223	GCCT	2	8	32007	32014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017223	TCGC	2	8	32791	32798	0 %	25 %	25 %	50 %	384202587
77	NC_017223	AAGG	2	8	32941	32948	50 %	0 %	50 %	0 %	384202587
78	NC_017223	CCCG	2	8	33075	33082	0 %	0 %	25 %	75 %	384202588
79	NC_017223	GCAC	2	8	33911	33918	25 %	0 %	25 %	50 %	384202588
80	NC_017223	CACC	2	8	34037	34044	25 %	0 %	0 %	75 %	384202588
81	NC_017223	CCGG	2	8	34618	34625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017223	CAGC	2	8	34921	34928	25 %	0 %	25 %	50 %	384202589
83	NC_017223	GCCG	2	8	34982	34989	0 %	0 %	50 %	50 %	384202589
84	NC_017223	CCAC	2	8	35920	35927	25 %	0 %	0 %	75 %	384202590
85	NC_017223	TGCC	2	8	35953	35960	0 %	25 %	25 %	50 %	384202590
86	NC_017223	GGCC	2	8	36223	36230	0 %	0 %	50 %	50 %	384202590
87	NC_017223	CAAG	2	8	37060	37067	50 %	0 %	25 %	25 %	384202591
88	NC_017223	GCTC	2	8	37296	37303	0 %	25 %	25 %	50 %	384202591
89	NC_017223	GCCG	2	8	37892	37899	0 %	0 %	50 %	50 %	384202591
90	NC_017223	GGCC	2	8	38501	38508	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
91	NC_017223	GACC	2	8	38975	38982	25 %	0 %	25 %	50 %	384202592
92	NC_017223	GGCG	2	8	39881	39888	0 %	0 %	75 %	25 %	384202592
93	NC_017223	GCAG	2	8	40465	40472	25 %	0 %	50 %	25 %	384202593
94	NC_017223	AAGA	2	8	40898	40905	75 %	0 %	25 %	0 %	384202594
95	NC_017223	ATCG	2	8	40961	40968	25 %	25 %	25 %	25 %	384202594
96	NC_017223	CGGC	2	8	41409	41416	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
97	NC_017223	GCCG	2	8	41426	41433	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
98	NC_017223	TGGC	2	8	41826	41833	0 %	25 %	50 %	25 %	384202595
99	NC_017223	GGCC	2	8	42579	42586	0 %	0 %	50 %	50 %	384202596
100	NC_017223	GCCG	2	8	42903	42910	0 %	0 %	50 %	50 %	384202597
101	NC_017223	CGGC	2	8	43128	43135	0 %	0 %	50 %	50 %	384202597
102	NC_017223	CCGC	2	8	43350	43357	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_017223	CGCC	2	8	43400	43407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_017223	CCGG	2	8	43656	43663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017223	CAGC	2	8	43959	43966	25 %	0 %	25 %	50 %	384202598
106	NC_017223	GCCG	2	8	44020	44027	0 %	0 %	50 %	50 %	384202598
107	NC_017223	GGCC	2	8	44763	44770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017223	GGGC	2	8	44839	44846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017223	GGCC	2	8	44916	44923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017223	GCCA	2	8	44988	44995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017223	CGGC	2	8	45015	45022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017223	GCTC	2	8	45025	45032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017223	CGTG	2	8	45335	45342	0 %	25 %	50 %	25 %	384202599
114	NC_017223	CCGG	2	8	45352	45359	0 %	0 %	50 %	50 %	384202599
115	NC_017223	CGAC	2	8	45646	45653	25 %	0 %	25 %	50 %	384202599
116	NC_017223	GCGG	2	8	45871	45878	0 %	0 %	75 %	25 %	384202600
117	NC_017223	GCAG	2	8	45912	45919	25 %	0 %	50 %	25 %	384202600
118	NC_017223	CGGC	2	8	45986	45993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017223	CTGG	2	8	46621	46628	0 %	25 %	50 %	25 %	384202601
120	NC_017223	AGGT	2	8	47142	47149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017223	GGCC	2	8	47367	47374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017223	CGCC	2	8	47526	47533	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_017223	GGCC	2	8	47588	47595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017223	GGCA	2	8	48014	48021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017223	TGCC	2	8	48176	48183	0 %	25 %	25 %	50 %	384202602
126	NC_017223	GGCC	2	8	48530	48537	0 %	0 %	50 %	50 %	384202602
127	NC_017223	ACCT	2	8	48898	48905	25 %	25 %	0 %	50 %	384202602
128	NC_017223	GCCG	2	8	48951	48958	0 %	0 %	50 %	50 %	384202602
129	NC_017223	CGAC	2	8	49172	49179	25 %	0 %	25 %	50 %	384202602
130	NC_017223	CCGG	2	8	50134	50141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017223	CAGC	2	8	50437	50444	25 %	0 %	25 %	50 %	384202604
132	NC_017223	GCCG	2	8	50498	50505	0 %	0 %	50 %	50 %	384202604
133	NC_017223	GCTG	2	8	51646	51653	0 %	25 %	50 %	25 %	384202605
134	NC_017223	CGGC	2	8	51735	51742	0 %	0 %	50 %	50 %	384202605
135	NC_017223	CGCT	2	8	52008	52015	0 %	25 %	25 %	50 %	384202605
136	NC_017223	ACCT	2	8	52236	52243	25 %	25 %	0 %	50 %	384202605
137	NC_017223	GGCA	2	8	52532	52539	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017223	TCGA	2	8	53669	53676	25 %	25 %	25 %	25 %	384202606
139	NC_017223	CAGC	2	8	55407	55414	25 %	0 %	25 %	50 %	384202607
140	NC_017223	CTGG	2	8	55970	55977	0 %	25 %	50 %	25 %	384202608
141	NC_017223	ACGT	2	8	56223	56230	25 %	25 %	25 %	25 %	384202608
142	NC_017223	TCGG	2	8	56533	56540	0 %	25 %	50 %	25 %	384202609
143	NC_017223	CAGC	2	8	56922	56929	25 %	0 %	25 %	50 %	384202609
144	NC_017223	GCCG	2	8	56943	56950	0 %	0 %	50 %	50 %	384202609
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