MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 9831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017223	GGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	75 %	25 %	384202564
2	NC_017223	GACG	2	8	616	623	25 %	0 %	50 %	25 %	384202564
3	NC_017223	CGCA	2	8	751	758	25 %	0 %	25 %	50 %	384202564
4	NC_017223	CATC	2	8	836	843	25 %	25 %	0 %	50 %	384202564
5	NC_017223	GCCT	2	8	947	954	0 %	25 %	25 %	50 %	384202564
6	NC_017223	GCTG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	384202564
7	NC_017223	GCAA	2	8	1904	1911	50 %	0 %	25 %	25 %	384202564
8	NC_017223	GCCG	2	8	1988	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	384202565
9	NC_017223	GTCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	384202565
10	NC_017223	GGCC	2	8	2423	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	384202565
11	NC_017223	CCGC	2	8	2631	2638	0 %	0 %	25 %	75 %	384202566
12	NC_017223	GCCC	2	8	3006	3013	0 %	0 %	25 %	75 %	384202566
13	NC_017223	GCTG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	50 %	25 %	384202566
14	NC_017223	TGCT	2	8	3420	3427	0 %	50 %	25 %	25 %	384202567
15	NC_017223	GCCA	2	8	4031	4038	25 %	0 %	25 %	50 %	384202567
16	NC_017223	CCTG	2	8	4337	4344	0 %	25 %	25 %	50 %	384202568
17	NC_017223	GTGC	2	8	4455	4462	0 %	25 %	50 %	25 %	384202568
18	NC_017223	GGCC	2	8	4532	4539	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
19	NC_017223	GGCG	2	8	4784	4791	0 %	0 %	75 %	25 %	384202568
20	NC_017223	GGCG	2	8	7537	7544	0 %	0 %	75 %	25 %	384202569
21	NC_017223	TTGC	2	8	8316	8323	0 %	50 %	25 %	25 %	384202570
22	NC_017223	AAGG	2	8	8937	8944	50 %	0 %	50 %	0 %	384202571
23	NC_017223	CCCG	2	8	9356	9363	0 %	0 %	25 %	75 %	384202572
24	NC_017223	CCTA	2	8	11762	11769	25 %	25 %	0 %	50 %	384202576
25	NC_017223	TCGT	2	8	12076	12083	0 %	50 %	25 %	25 %	384202576
26	NC_017223	GTCG	2	8	13662	13669	0 %	25 %	50 %	25 %	384202576
27	NC_017223	TCGC	2	8	14195	14202	0 %	25 %	25 %	50 %	384202576
28	NC_017223	GGCC	2	8	14916	14923	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
29	NC_017223	TCGC	2	8	15735	15742	0 %	25 %	25 %	50 %	384202576
30	NC_017223	CAAG	2	8	15797	15804	50 %	0 %	25 %	25 %	384202577
31	NC_017223	ATGG	2	8	16478	16485	25 %	25 %	50 %	0 %	384202577
32	NC_017223	AAGG	2	8	17721	17728	50 %	0 %	50 %	0 %	384202577
33	NC_017223	ATCG	2	8	18536	18543	25 %	25 %	25 %	25 %	384202577
34	NC_017223	GGTG	2	8	19079	19086	0 %	25 %	75 %	0 %	384202577
35	NC_017223	CCTG	2	8	21093	21100	0 %	25 %	25 %	50 %	384202579
36	NC_017223	GCCC	2	8	21856	21863	0 %	0 %	25 %	75 %	384202579
37	NC_017223	TGCT	2	8	25315	25322	0 %	50 %	25 %	25 %	384202580
38	NC_017223	GCCG	2	8	26540	26547	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
39	NC_017223	TGAG	2	8	26703	26710	25 %	25 %	50 %	0 %	384202581
40	NC_017223	CGCC	2	8	26836	26843	0 %	0 %	25 %	75 %	384202581
41	NC_017223	CTGC	2	8	26848	26855	0 %	25 %	25 %	50 %	384202581
42	NC_017223	GCCG	2	8	26884	26891	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
43	NC_017223	CGGC	2	8	27096	27103	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
44	NC_017223	GCTG	2	8	27136	27143	0 %	25 %	50 %	25 %	384202581
45	NC_017223	CGGC	2	8	27870	27877	0 %	0 %	50 %	50 %	384202582
46	NC_017223	GCTG	2	8	27931	27938	0 %	25 %	50 %	25 %	384202582
47	NC_017223	CGAA	2	8	28727	28734	50 %	0 %	25 %	25 %	384202583
48	NC_017223	GGCC	2	8	28963	28970	0 %	0 %	50 %	50 %	384202583
49	NC_017223	CAGC	2	8	29177	29184	25 %	0 %	25 %	50 %	384202584
50	NC_017223	AGCC	2	8	29320	29327	25 %	0 %	25 %	50 %	384202584
51	NC_017223	GGCG	2	8	29513	29520	0 %	0 %	75 %	25 %	384202584
52	NC_017223	CGTG	2	8	29612	29619	0 %	25 %	50 %	25 %	384202584
53	NC_017223	GGCC	2	8	30044	30051	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
54	NC_017223	AATC	2	8	30635	30642	50 %	25 %	0 %	25 %	384202585
55	NC_017223	AGCA	2	8	31239	31246	50 %	0 %	25 %	25 %	384202586
56	NC_017223	TCGC	2	8	32791	32798	0 %	25 %	25 %	50 %	384202587
57	NC_017223	AAGG	2	8	32941	32948	50 %	0 %	50 %	0 %	384202587
58	NC_017223	CCCG	2	8	33075	33082	0 %	0 %	25 %	75 %	384202588
59	NC_017223	GCAC	2	8	33911	33918	25 %	0 %	25 %	50 %	384202588
60	NC_017223	CACC	2	8	34037	34044	25 %	0 %	0 %	75 %	384202588
61	NC_017223	CAGC	2	8	34921	34928	25 %	0 %	25 %	50 %	384202589
62	NC_017223	GCCG	2	8	34982	34989	0 %	0 %	50 %	50 %	384202589
63	NC_017223	CCAC	2	8	35920	35927	25 %	0 %	0 %	75 %	384202590
64	NC_017223	TGCC	2	8	35953	35960	0 %	25 %	25 %	50 %	384202590
65	NC_017223	GGCC	2	8	36223	36230	0 %	0 %	50 %	50 %	384202590
66	NC_017223	CAAG	2	8	37060	37067	50 %	0 %	25 %	25 %	384202591
67	NC_017223	GCTC	2	8	37296	37303	0 %	25 %	25 %	50 %	384202591
68	NC_017223	GCCG	2	8	37892	37899	0 %	0 %	50 %	50 %	384202591
69	NC_017223	GGCC	2	8	38501	38508	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
70	NC_017223	GACC	2	8	38975	38982	25 %	0 %	25 %	50 %	384202592
71	NC_017223	GGCG	2	8	39881	39888	0 %	0 %	75 %	25 %	384202592
72	NC_017223	GCAG	2	8	40465	40472	25 %	0 %	50 %	25 %	384202593
73	NC_017223	AAGA	2	8	40898	40905	75 %	0 %	25 %	0 %	384202594
74	NC_017223	ATCG	2	8	40961	40968	25 %	25 %	25 %	25 %	384202594
75	NC_017223	CGGC	2	8	41409	41416	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
76	NC_017223	GCCG	2	8	41426	41433	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
77	NC_017223	TGGC	2	8	41826	41833	0 %	25 %	50 %	25 %	384202595
78	NC_017223	GGCC	2	8	42579	42586	0 %	0 %	50 %	50 %	384202596
79	NC_017223	GCCG	2	8	42903	42910	0 %	0 %	50 %	50 %	384202597
80	NC_017223	CGGC	2	8	43128	43135	0 %	0 %	50 %	50 %	384202597
81	NC_017223	CAGC	2	8	43959	43966	25 %	0 %	25 %	50 %	384202598
82	NC_017223	GCCG	2	8	44020	44027	0 %	0 %	50 %	50 %	384202598
83	NC_017223	CGTG	2	8	45335	45342	0 %	25 %	50 %	25 %	384202599
84	NC_017223	CCGG	2	8	45352	45359	0 %	0 %	50 %	50 %	384202599
85	NC_017223	CGAC	2	8	45646	45653	25 %	0 %	25 %	50 %	384202599
86	NC_017223	GCGG	2	8	45871	45878	0 %	0 %	75 %	25 %	384202600
87	NC_017223	GCAG	2	8	45912	45919	25 %	0 %	50 %	25 %	384202600
88	NC_017223	CTGG	2	8	46621	46628	0 %	25 %	50 %	25 %	384202601
89	NC_017223	TGCC	2	8	48176	48183	0 %	25 %	25 %	50 %	384202602
90	NC_017223	GGCC	2	8	48530	48537	0 %	0 %	50 %	50 %	384202602
91	NC_017223	ACCT	2	8	48898	48905	25 %	25 %	0 %	50 %	384202602
92	NC_017223	GCCG	2	8	48951	48958	0 %	0 %	50 %	50 %	384202602
93	NC_017223	CGAC	2	8	49172	49179	25 %	0 %	25 %	50 %	384202602
94	NC_017223	CAGC	2	8	50437	50444	25 %	0 %	25 %	50 %	384202604
95	NC_017223	GCCG	2	8	50498	50505	0 %	0 %	50 %	50 %	384202604
96	NC_017223	GCTG	2	8	51646	51653	0 %	25 %	50 %	25 %	384202605
97	NC_017223	CGGC	2	8	51735	51742	0 %	0 %	50 %	50 %	384202605
98	NC_017223	CGCT	2	8	52008	52015	0 %	25 %	25 %	50 %	384202605
99	NC_017223	ACCT	2	8	52236	52243	25 %	25 %	0 %	50 %	384202605
100	NC_017223	TCGA	2	8	53669	53676	25 %	25 %	25 %	25 %	384202606
101	NC_017223	CAGC	2	8	55407	55414	25 %	0 %	25 %	50 %	384202607
102	NC_017223	CTGG	2	8	55970	55977	0 %	25 %	50 %	25 %	384202608
103	NC_017223	ACGT	2	8	56223	56230	25 %	25 %	25 %	25 %	384202608
104	NC_017223	TCGG	2	8	56533	56540	0 %	25 %	50 %	25 %	384202609
105	NC_017223	CAGC	2	8	56922	56929	25 %	0 %	25 %	50 %	384202609
106	NC_017223	GCCG	2	8	56943	56950	0 %	0 %	50 %	50 %	384202609
107	NC_017223	GGGC	2	8	57344	57351	0 %	0 %	75 %	25 %	384202609
108	NC_017223	CGGC	2	8	58085	58092	0 %	0 %	50 %	50 %	384202610
109	NC_017223	GCTG	2	8	58146	58153	0 %	25 %	50 %	25 %	384202610
110	NC_017223	GCCA	2	8	59506	59513	25 %	0 %	25 %	50 %	384202611
111	NC_017223	ATGT	2	8	59606	59613	25 %	50 %	25 %	0 %	384202611
112	NC_017223	CTGG	2	8	59879	59886	0 %	25 %	50 %	25 %	384202611
113	NC_017223	CCTT	2	8	60512	60519	0 %	50 %	0 %	50 %	384202612
114	NC_017223	ACGC	2	8	60822	60829	25 %	0 %	25 %	50 %	384202612
115	NC_017223	TCGC	2	8	61225	61232	0 %	25 %	25 %	50 %	384202613
116	NC_017223	AGCA	2	8	61291	61298	50 %	0 %	25 %	25 %	384202613
117	NC_017223	ACGA	2	8	61552	61559	50 %	0 %	25 %	25 %	384202613
118	NC_017223	TGCC	2	8	62889	62896	0 %	25 %	25 %	50 %	384202614
119	NC_017223	ATTA	2	8	64067	64074	50 %	50 %	0 %	0 %	384202616
120	NC_017223	CAAA	2	8	64490	64497	75 %	0 %	0 %	25 %	384202617
121	NC_017223	TCTT	2	8	64910	64917	0 %	75 %	0 %	25 %	384202617
122	NC_017223	GAAT	2	8	65025	65032	50 %	25 %	25 %	0 %	384202617
123	NC_017223	TGGA	2	8	65994	66001	25 %	25 %	50 %	0 %	384202618
124	NC_017223	TCGG	2	8	66138	66145	0 %	25 %	50 %	25 %	384202618
125	NC_017223	ACAA	2	8	66171	66178	75 %	0 %	0 %	25 %	384202618
126	NC_017223	AATA	2	8	66668	66675	75 %	25 %	0 %	0 %	384202618
127	NC_017223	ATCA	2	8	68389	68396	50 %	25 %	0 %	25 %	384202619
128	NC_017223	CAGC	2	8	69381	69388	25 %	0 %	25 %	50 %	384202620
129	NC_017223	GCCG	2	8	69442	69449	0 %	0 %	50 %	50 %	384202620
130	NC_017223	GGGT	2	8	71851	71858	0 %	25 %	75 %	0 %	384202622
131	NC_017223	GCCG	2	8	72149	72156	0 %	0 %	50 %	50 %	384202622
132	NC_017223	GAAG	2	8	72812	72819	50 %	0 %	50 %	0 %	384202622
133	NC_017223	CAGC	2	8	73811	73818	25 %	0 %	25 %	50 %	384202623
134	NC_017223	TCCA	2	8	74034	74041	25 %	25 %	0 %	50 %	384202623
135	NC_017223	GGTC	2	8	74432	74439	0 %	25 %	50 %	25 %	384202624
136	NC_017223	CTGG	2	8	74793	74800	0 %	25 %	50 %	25 %	384202624
137	NC_017223	GGGC	2	8	74851	74858	0 %	0 %	75 %	25 %	384202624
138	NC_017223	CAGC	2	8	74904	74911	25 %	0 %	25 %	50 %	384202624
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