MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 17987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017223	GT	3	6	638	643	0 %	50 %	50 %	0 %	384202564
2	NC_017223	CG	3	6	1259	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	384202564
3	NC_017223	CG	3	6	1463	1468	0 %	0 %	50 %	50 %	384202564
4	NC_017223	CG	3	6	1680	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	384202564
5	NC_017223	CG	4	8	1827	1834	0 %	0 %	50 %	50 %	384202564
6	NC_017223	GC	4	8	2167	2174	0 %	0 %	50 %	50 %	384202565
7	NC_017223	GC	3	6	2234	2239	0 %	0 %	50 %	50 %	384202565
8	NC_017223	GC	3	6	2305	2310	0 %	0 %	50 %	50 %	384202565
9	NC_017223	CG	3	6	2847	2852	0 %	0 %	50 %	50 %	384202566
10	NC_017223	CG	3	6	3329	3334	0 %	0 %	50 %	50 %	384202566
11	NC_017223	CG	3	6	3336	3341	0 %	0 %	50 %	50 %	384202566
12	NC_017223	GC	3	6	3342	3347	0 %	0 %	50 %	50 %	384202566
13	NC_017223	GC	3	6	3470	3475	0 %	0 %	50 %	50 %	384202567
14	NC_017223	GC	3	6	3569	3574	0 %	0 %	50 %	50 %	384202567
15	NC_017223	GC	4	8	4044	4051	0 %	0 %	50 %	50 %	384202567
16	NC_017223	GC	3	6	4355	4360	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
17	NC_017223	GC	3	6	4396	4401	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
18	NC_017223	CG	3	6	4518	4523	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
19	NC_017223	CG	3	6	4907	4912	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
20	NC_017223	CG	3	6	4963	4968	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
21	NC_017223	CG	3	6	5011	5016	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
22	NC_017223	GC	3	6	5183	5188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017223	GC	3	6	5275	5280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017223	GC	3	6	5352	5357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017223	GC	3	6	5927	5932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017223	CG	3	6	6093	6098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017223	GC	3	6	6376	6381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017223	CG	3	6	7068	7073	0 %	0 %	50 %	50 %	384202569
29	NC_017223	GC	3	6	7339	7344	0 %	0 %	50 %	50 %	384202569
30	NC_017223	GC	3	6	8621	8626	0 %	0 %	50 %	50 %	384202571
31	NC_017223	GT	3	6	9004	9009	0 %	50 %	50 %	0 %	384202571
32	NC_017223	CG	3	6	9027	9032	0 %	0 %	50 %	50 %	384202571
33	NC_017223	CG	3	6	9442	9447	0 %	0 %	50 %	50 %	384202572
34	NC_017223	GC	3	6	9589	9594	0 %	0 %	50 %	50 %	384202573
35	NC_017223	GC	3	6	11869	11874	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
36	NC_017223	GC	3	6	11961	11966	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
37	NC_017223	GC	3	6	12424	12429	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
38	NC_017223	GC	3	6	12651	12656	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
39	NC_017223	GC	3	6	12729	12734	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
40	NC_017223	CG	4	8	12759	12766	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
41	NC_017223	CG	3	6	12869	12874	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
42	NC_017223	GC	3	6	13095	13100	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
43	NC_017223	CG	3	6	13295	13300	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
44	NC_017223	CG	3	6	13413	13418	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
45	NC_017223	CG	3	6	14231	14236	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
46	NC_017223	GC	3	6	14385	14390	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
47	NC_017223	CG	3	6	14483	14488	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
48	NC_017223	GC	3	6	14508	14513	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
49	NC_017223	GC	3	6	15188	15193	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
50	NC_017223	GC	3	6	15340	15345	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
51	NC_017223	CG	3	6	15477	15482	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
52	NC_017223	GC	3	6	17375	17380	0 %	0 %	50 %	50 %	384202577
53	NC_017223	CG	3	6	17671	17676	0 %	0 %	50 %	50 %	384202577
54	NC_017223	GC	4	8	18106	18113	0 %	0 %	50 %	50 %	384202577
55	NC_017223	GC	3	6	18457	18462	0 %	0 %	50 %	50 %	384202577
56	NC_017223	CG	3	6	18973	18978	0 %	0 %	50 %	50 %	384202577
57	NC_017223	CG	3	6	19189	19194	0 %	0 %	50 %	50 %	384202577
58	NC_017223	GC	3	6	20037	20042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017223	GC	3	6	20343	20348	0 %	0 %	50 %	50 %	384202578
60	NC_017223	GC	4	8	20999	21006	0 %	0 %	50 %	50 %	384202579
61	NC_017223	CG	3	6	21103	21108	0 %	0 %	50 %	50 %	384202579
62	NC_017223	GC	3	6	21257	21262	0 %	0 %	50 %	50 %	384202579
63	NC_017223	CG	3	6	22181	22186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017223	CG	5	10	22418	22427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017223	CG	3	6	22507	22512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017223	CG	3	6	22651	22656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017223	GC	3	6	22776	22781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017223	GC	3	6	22913	22918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017223	CG	3	6	23016	23021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017223	CG	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017223	GC	3	6	23488	23493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017223	CG	4	8	23926	23933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017223	GC	3	6	24295	24300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017223	GC	3	6	24517	24522	0 %	0 %	50 %	50 %	384202580
75	NC_017223	CG	3	6	24583	24588	0 %	0 %	50 %	50 %	384202580
76	NC_017223	TA	3	6	24599	24604	50 %	50 %	0 %	0 %	384202580
77	NC_017223	GC	4	8	24657	24664	0 %	0 %	50 %	50 %	384202580
78	NC_017223	CG	3	6	24937	24942	0 %	0 %	50 %	50 %	384202580
79	NC_017223	TC	3	6	25366	25371	0 %	50 %	0 %	50 %	384202580
80	NC_017223	CA	3	6	25420	25425	50 %	0 %	0 %	50 %	384202580
81	NC_017223	TC	3	6	25465	25470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017223	CG	3	6	25677	25682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017223	CG	3	6	25865	25870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017223	CG	3	6	26280	26285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017223	GC	4	8	26510	26517	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
86	NC_017223	GC	3	6	27341	27346	0 %	0 %	50 %	50 %	384202582
87	NC_017223	GC	3	6	27961	27966	0 %	0 %	50 %	50 %	384202582
88	NC_017223	CA	3	6	28150	28155	50 %	0 %	0 %	50 %	384202582
89	NC_017223	GC	3	6	28716	28721	0 %	0 %	50 %	50 %	384202583
90	NC_017223	CG	3	6	28869	28874	0 %	0 %	50 %	50 %	384202583
91	NC_017223	AC	3	6	28991	28996	50 %	0 %	0 %	50 %	384202583
92	NC_017223	GC	3	6	29231	29236	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
93	NC_017223	GA	3	6	29562	29567	50 %	0 %	50 %	0 %	384202584
94	NC_017223	AG	3	6	29763	29768	50 %	0 %	50 %	0 %	384202584
95	NC_017223	CG	3	6	29775	29780	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
96	NC_017223	GC	3	6	30038	30043	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
97	NC_017223	AT	3	6	30152	30157	50 %	50 %	0 %	0 %	384202584
98	NC_017223	GC	3	6	30892	30897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017223	TC	3	6	30971	30976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017223	CG	3	6	31153	31158	0 %	0 %	50 %	50 %	384202586
101	NC_017223	TA	3	6	31628	31633	50 %	50 %	0 %	0 %	384202586
102	NC_017223	GC	3	6	31673	31678	0 %	0 %	50 %	50 %	384202586
103	NC_017223	GC	3	6	31731	31736	0 %	0 %	50 %	50 %	384202586
104	NC_017223	GC	3	6	32128	32133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017223	GC	3	6	32762	32767	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
106	NC_017223	CG	3	6	32768	32773	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
107	NC_017223	CG	3	6	32839	32844	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
108	NC_017223	GC	4	8	32970	32977	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
109	NC_017223	GC	3	6	32992	32997	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
110	NC_017223	GA	3	6	33039	33044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017223	CG	3	6	33767	33772	0 %	0 %	50 %	50 %	384202588
112	NC_017223	GC	3	6	34174	34179	0 %	0 %	50 %	50 %	384202588
113	NC_017223	GC	5	10	34378	34387	0 %	0 %	50 %	50 %	384202588
114	NC_017223	TG	3	6	34704	34709	0 %	50 %	50 %	0 %	384202589
115	NC_017223	GC	3	6	34893	34898	0 %	0 %	50 %	50 %	384202589
116	NC_017223	GC	3	6	35513	35518	0 %	0 %	50 %	50 %	384202589
117	NC_017223	CG	3	6	35590	35595	0 %	0 %	50 %	50 %	384202590
118	NC_017223	CG	3	6	36071	36076	0 %	0 %	50 %	50 %	384202590
119	NC_017223	GC	5	10	36130	36139	0 %	0 %	50 %	50 %	384202590
120	NC_017223	GC	6	12	36354	36365	0 %	0 %	50 %	50 %	384202590
121	NC_017223	GC	3	6	36977	36982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017223	GC	3	6	37135	37140	0 %	0 %	50 %	50 %	384202591
123	NC_017223	GC	3	6	37159	37164	0 %	0 %	50 %	50 %	384202591
124	NC_017223	GC	3	6	37772	37777	0 %	0 %	50 %	50 %	384202591
125	NC_017223	GC	3	6	37798	37803	0 %	0 %	50 %	50 %	384202591
126	NC_017223	CG	3	6	37833	37838	0 %	0 %	50 %	50 %	384202591
127	NC_017223	GC	3	6	38024	38029	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
128	NC_017223	GC	3	6	38037	38042	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
129	NC_017223	CG	3	6	38299	38304	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
130	NC_017223	GC	3	6	38317	38322	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
131	NC_017223	GC	3	6	38619	38624	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
132	NC_017223	CG	4	8	38999	39006	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
133	NC_017223	GC	3	6	39074	39079	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
134	NC_017223	CG	4	8	39083	39090	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
135	NC_017223	GC	3	6	39572	39577	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
136	NC_017223	CG	3	6	39687	39692	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
137	NC_017223	GC	3	6	39921	39926	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
138	NC_017223	GC	3	6	39983	39988	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
139	NC_017223	CG	3	6	40168	40173	0 %	0 %	50 %	50 %	384202593
140	NC_017223	GC	3	6	40226	40231	0 %	0 %	50 %	50 %	384202593
141	NC_017223	CG	3	6	40280	40285	0 %	0 %	50 %	50 %	384202593
142	NC_017223	CG	3	6	40390	40395	0 %	0 %	50 %	50 %	384202593
143	NC_017223	GC	4	8	40749	40756	0 %	0 %	50 %	50 %	384202594
144	NC_017223	CG	3	6	40875	40880	0 %	0 %	50 %	50 %	384202594
145	NC_017223	CG	3	6	41061	41066	0 %	0 %	50 %	50 %	384202594
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