MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bordetella pertussis CS chromosome

Total Repeats: 14774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017223	GT	3	6	638	643	0 %	50 %	50 %	0 %	384202564
2	NC_017223	CG	3	6	1259	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	384202564
3	NC_017223	CG	3	6	1463	1468	0 %	0 %	50 %	50 %	384202564
4	NC_017223	CG	3	6	1680	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	384202564
5	NC_017223	CG	4	8	1827	1834	0 %	0 %	50 %	50 %	384202564
6	NC_017223	GC	4	8	2167	2174	0 %	0 %	50 %	50 %	384202565
7	NC_017223	GC	3	6	2234	2239	0 %	0 %	50 %	50 %	384202565
8	NC_017223	GC	3	6	2305	2310	0 %	0 %	50 %	50 %	384202565
9	NC_017223	CG	3	6	2847	2852	0 %	0 %	50 %	50 %	384202566
10	NC_017223	CG	3	6	3329	3334	0 %	0 %	50 %	50 %	384202566
11	NC_017223	CG	3	6	3336	3341	0 %	0 %	50 %	50 %	384202566
12	NC_017223	GC	3	6	3342	3347	0 %	0 %	50 %	50 %	384202566
13	NC_017223	GC	3	6	3470	3475	0 %	0 %	50 %	50 %	384202567
14	NC_017223	GC	3	6	3569	3574	0 %	0 %	50 %	50 %	384202567
15	NC_017223	GC	4	8	4044	4051	0 %	0 %	50 %	50 %	384202567
16	NC_017223	GC	3	6	4355	4360	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
17	NC_017223	GC	3	6	4396	4401	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
18	NC_017223	CG	3	6	4518	4523	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
19	NC_017223	CG	3	6	4907	4912	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
20	NC_017223	CG	3	6	4963	4968	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
21	NC_017223	CG	3	6	5011	5016	0 %	0 %	50 %	50 %	384202568
22	NC_017223	CG	3	6	7068	7073	0 %	0 %	50 %	50 %	384202569
23	NC_017223	GC	3	6	7339	7344	0 %	0 %	50 %	50 %	384202569
24	NC_017223	GC	3	6	8621	8626	0 %	0 %	50 %	50 %	384202571
25	NC_017223	GT	3	6	9004	9009	0 %	50 %	50 %	0 %	384202571
26	NC_017223	CG	3	6	9027	9032	0 %	0 %	50 %	50 %	384202571
27	NC_017223	CG	3	6	9442	9447	0 %	0 %	50 %	50 %	384202572
28	NC_017223	GC	3	6	9589	9594	0 %	0 %	50 %	50 %	384202573
29	NC_017223	GC	3	6	11869	11874	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
30	NC_017223	GC	3	6	11961	11966	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
31	NC_017223	GC	3	6	12424	12429	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
32	NC_017223	GC	3	6	12651	12656	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
33	NC_017223	GC	3	6	12729	12734	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
34	NC_017223	CG	4	8	12759	12766	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
35	NC_017223	CG	3	6	12869	12874	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
36	NC_017223	GC	3	6	13095	13100	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
37	NC_017223	CG	3	6	13295	13300	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
38	NC_017223	CG	3	6	13413	13418	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
39	NC_017223	CG	3	6	14231	14236	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
40	NC_017223	GC	3	6	14385	14390	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
41	NC_017223	CG	3	6	14483	14488	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
42	NC_017223	GC	3	6	14508	14513	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
43	NC_017223	GC	3	6	15188	15193	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
44	NC_017223	GC	3	6	15340	15345	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
45	NC_017223	CG	3	6	15477	15482	0 %	0 %	50 %	50 %	384202576
46	NC_017223	GC	3	6	17375	17380	0 %	0 %	50 %	50 %	384202577
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48	NC_017223	GC	4	8	18106	18113	0 %	0 %	50 %	50 %	384202577
49	NC_017223	GC	3	6	18457	18462	0 %	0 %	50 %	50 %	384202577
50	NC_017223	CG	3	6	18973	18978	0 %	0 %	50 %	50 %	384202577
51	NC_017223	CG	3	6	19189	19194	0 %	0 %	50 %	50 %	384202577
52	NC_017223	GC	3	6	20343	20348	0 %	0 %	50 %	50 %	384202578
53	NC_017223	GC	4	8	20999	21006	0 %	0 %	50 %	50 %	384202579
54	NC_017223	CG	3	6	21103	21108	0 %	0 %	50 %	50 %	384202579
55	NC_017223	GC	3	6	21257	21262	0 %	0 %	50 %	50 %	384202579
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59	NC_017223	GC	4	8	24657	24664	0 %	0 %	50 %	50 %	384202580
60	NC_017223	CG	3	6	24937	24942	0 %	0 %	50 %	50 %	384202580
61	NC_017223	TC	3	6	25366	25371	0 %	50 %	0 %	50 %	384202580
62	NC_017223	CA	3	6	25420	25425	50 %	0 %	0 %	50 %	384202580
63	NC_017223	GC	4	8	26510	26517	0 %	0 %	50 %	50 %	384202581
64	NC_017223	GC	3	6	27341	27346	0 %	0 %	50 %	50 %	384202582
65	NC_017223	GC	3	6	27961	27966	0 %	0 %	50 %	50 %	384202582
66	NC_017223	CA	3	6	28150	28155	50 %	0 %	0 %	50 %	384202582
67	NC_017223	GC	3	6	28716	28721	0 %	0 %	50 %	50 %	384202583
68	NC_017223	CG	3	6	28869	28874	0 %	0 %	50 %	50 %	384202583
69	NC_017223	AC	3	6	28991	28996	50 %	0 %	0 %	50 %	384202583
70	NC_017223	GC	3	6	29231	29236	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
71	NC_017223	GA	3	6	29562	29567	50 %	0 %	50 %	0 %	384202584
72	NC_017223	AG	3	6	29763	29768	50 %	0 %	50 %	0 %	384202584
73	NC_017223	CG	3	6	29775	29780	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
74	NC_017223	GC	3	6	30038	30043	0 %	0 %	50 %	50 %	384202584
75	NC_017223	AT	3	6	30152	30157	50 %	50 %	0 %	0 %	384202584
76	NC_017223	CG	3	6	31153	31158	0 %	0 %	50 %	50 %	384202586
77	NC_017223	TA	3	6	31628	31633	50 %	50 %	0 %	0 %	384202586
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81	NC_017223	CG	3	6	32768	32773	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
82	NC_017223	CG	3	6	32839	32844	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
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84	NC_017223	GC	3	6	32992	32997	0 %	0 %	50 %	50 %	384202587
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102	NC_017223	CG	3	6	38299	38304	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
103	NC_017223	GC	3	6	38317	38322	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
104	NC_017223	GC	3	6	38619	38624	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
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107	NC_017223	CG	4	8	39083	39090	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
108	NC_017223	GC	3	6	39572	39577	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
109	NC_017223	CG	3	6	39687	39692	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
110	NC_017223	GC	3	6	39921	39926	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
111	NC_017223	GC	3	6	39983	39988	0 %	0 %	50 %	50 %	384202592
112	NC_017223	CG	3	6	40168	40173	0 %	0 %	50 %	50 %	384202593
113	NC_017223	GC	3	6	40226	40231	0 %	0 %	50 %	50 %	384202593
114	NC_017223	CG	3	6	40280	40285	0 %	0 %	50 %	50 %	384202593
115	NC_017223	CG	3	6	40390	40395	0 %	0 %	50 %	50 %	384202593
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118	NC_017223	CG	3	6	41061	41066	0 %	0 %	50 %	50 %	384202594
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120	NC_017223	GC	4	8	41470	41477	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
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122	NC_017223	GC	3	6	41856	41861	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
123	NC_017223	GC	3	6	41894	41899	0 %	0 %	50 %	50 %	384202595
124	NC_017223	GC	4	8	42771	42778	0 %	0 %	50 %	50 %	384202597
125	NC_017223	TG	3	6	43742	43747	0 %	50 %	50 %	0 %	384202598
126	NC_017223	GC	3	6	43931	43936	0 %	0 %	50 %	50 %	384202598
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128	NC_017223	CG	3	6	45422	45427	0 %	0 %	50 %	50 %	384202599
129	NC_017223	GC	3	6	45492	45497	0 %	0 %	50 %	50 %	384202599
130	NC_017223	GC	4	8	45500	45507	0 %	0 %	50 %	50 %	384202599
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133	NC_017223	GC	3	6	45791	45796	0 %	0 %	50 %	50 %	384202600
134	NC_017223	GC	3	6	45850	45855	0 %	0 %	50 %	50 %	384202600
135	NC_017223	CG	3	6	45927	45932	0 %	0 %	50 %	50 %	384202600
136	NC_017223	CG	3	6	46277	46282	0 %	0 %	50 %	50 %	384202601
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138	NC_017223	GC	4	8	46594	46601	0 %	0 %	50 %	50 %	384202601
139	NC_017223	GC	3	6	46720	46725	0 %	0 %	50 %	50 %	384202601
140	NC_017223	GC	3	6	46871	46876	0 %	0 %	50 %	50 %	384202601
141	NC_017223	GC	3	6	48606	48611	0 %	0 %	50 %	50 %	384202602
142	NC_017223	GC	3	6	48616	48621	0 %	0 %	50 %	50 %	384202602
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