MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 plasmid BLNIAS_P2

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017222	GCT	3	9	220	228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202554
2	NC_017222	GCT	2	6	274	279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202554
3	NC_017222	CCG	2	6	331	336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202554
4	NC_017222	CGG	2	6	388	393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202554
5	NC_017222	CAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202554
6	NC_017222	TCG	2	6	435	440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202554
7	NC_017222	TCG	2	6	453	458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202554
8	NC_017222	GCC	2	6	488	493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202554
9	NC_017222	GAT	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202554
10	NC_017222	GCT	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202554
11	NC_017222	CTC	2	6	608	613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202554
12	NC_017222	TCA	2	6	772	777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202555
13	NC_017222	GCC	2	6	789	794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202555
14	NC_017222	CCG	2	6	796	801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202555
15	NC_017222	AGC	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202555
16	NC_017222	GGT	2	6	1086	1091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202556
17	NC_017222	CGG	2	6	1172	1177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202556
18	NC_017222	GCC	2	6	1293	1298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202556
19	NC_017222	CCT	2	6	1315	1320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202556
20	NC_017222	CGA	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202556
21	NC_017222	TGC	2	6	1417	1422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202556
22	NC_017222	GAA	2	6	1511	1516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202556
23	NC_017222	GGA	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202556
24	NC_017222	TCG	2	6	1669	1674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202556
25	NC_017222	GCG	2	6	1710	1715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202556
26	NC_017222	AGA	2	6	1789	1794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202556
27	NC_017222	CAA	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384202556
28	NC_017222	CCA	2	6	1971	1976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202556
29	NC_017222	CGG	2	6	2014	2019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202556
30	NC_017222	GAG	2	6	2038	2043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202556
31	NC_017222	CTC	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202556
32	NC_017222	GGC	2	6	2100	2105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202557
33	NC_017222	CGC	2	6	2143	2148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202557
34	NC_017222	CGC	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202557
35	NC_017222	GGA	2	6	2369	2374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384202557
36	NC_017222	CCG	2	6	2395	2400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202557
37	NC_017222	CTG	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202557
38	NC_017222	CGT	2	6	3302	3307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202558
39	NC_017222	CCG	2	6	3352	3357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202558
40	NC_017222	GCA	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202558
41	NC_017222	GCA	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202560
42	NC_017222	TGG	2	6	4037	4042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202560
43	NC_017222	CGT	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202560
44	NC_017222	GAA	2	6	4069	4074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384202560
45	NC_017222	ATG	2	6	4094	4099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202560
46	NC_017222	GAC	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202560
47	NC_017222	CTG	2	6	4138	4143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202560
48	NC_017222	CGG	2	6	4172	4177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202560
49	NC_017222	ACG	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202560
50	NC_017222	AGC	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202561
51	NC_017222	CGC	2	6	4492	4497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202561
52	NC_017222	GAC	2	6	4633	4638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202561
53	NC_017222	GCA	2	6	4641	4646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202561
54	NC_017222	ACC	2	6	4651	4656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202561
55	NC_017222	CGC	2	6	4814	4819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202561
56	NC_017222	AGT	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202562
57	NC_017222	CAC	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202562
58	NC_017222	GCC	2	6	5427	5432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202562
59	NC_017222	CTT	3	9	5496	5504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202562
60	NC_017222	CAG	2	6	5532	5537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202562
61	NC_017222	CTC	3	9	5547	5555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202562
62	NC_017222	TTG	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202562
63	NC_017222	CGG	2	6	5620	5625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202562
64	NC_017222	CCT	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202562
65	NC_017222	GAT	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202562
66	NC_017222	TTC	2	6	5976	5981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202562
67	NC_017222	TTG	2	6	6082	6087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202562

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.