MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 plasmid BLNIAS_P1

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017220	CGC	2	6	25	30	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017220	AGG	2	6	50	55	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017220	GCG	2	6	82	87	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017220	GAT	2	6	178	183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017220	CAC	2	6	234	239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017220	GTT	2	6	318	323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017220	CAT	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017220	AAC	2	6	346	351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017220	ATC	2	6	491	496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017220	TGG	2	6	559	564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017220	GCA	2	6	612	617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017220	CGG	2	6	839	844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202548
13	NC_017220	CAT	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384202548
14	NC_017220	CCT	2	6	1107	1112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
15	NC_017220	CTC	2	6	1186	1191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
16	NC_017220	GCC	2	6	1198	1203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202549
17	NC_017220	TCC	2	6	1283	1288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
18	NC_017220	GCC	2	6	1289	1294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202549
19	NC_017220	GCC	2	6	1383	1388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202549
20	NC_017220	TGG	2	6	1446	1451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202549
21	NC_017220	GCA	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202549
22	NC_017220	GGC	2	6	1618	1623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202549
23	NC_017220	GAT	2	6	1636	1641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384202549
24	NC_017220	GGC	2	6	1648	1653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202549
25	NC_017220	CTC	2	6	1660	1665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
26	NC_017220	CTC	2	6	1676	1681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
27	NC_017220	CAC	2	6	1682	1687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202549
28	NC_017220	GGC	2	6	1773	1778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202549
29	NC_017220	GGC	2	6	1861	1866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202549
30	NC_017220	CAG	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202549
31	NC_017220	TGC	2	6	1932	1937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202549
32	NC_017220	TGG	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384202549
33	NC_017220	TCT	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202549
34	NC_017220	GCT	2	6	2274	2279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384202549
35	NC_017220	GCC	2	6	2293	2298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202549
36	NC_017220	CGA	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202549
37	NC_017220	TTG	2	6	2348	2353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202549
38	NC_017220	CTC	2	6	2422	2427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384202549
39	NC_017220	CCA	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202549
40	NC_017220	TCT	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202549
41	NC_017220	CGG	2	6	2541	2546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384202549
42	NC_017220	GCA	2	6	2577	2582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202549
43	NC_017220	GCA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202549
44	NC_017220	CGC	2	6	2631	2636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384202549
45	NC_017220	GCG	2	6	2788	2793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017220	GCG	2	6	2821	2826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017220	GAT	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017220	GCG	2	6	3200	3205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017220	ACC	2	6	3318	3323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384202551
50	NC_017220	GAC	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202551
51	NC_017220	GAC	2	6	3731	3736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384202552
52	NC_017220	GTT	2	6	3850	3855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384202552
53	NC_017220	CTT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384202552
54	NC_017220	GAT	3	9	4143	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017220	GGA	2	6	4178	4183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017220	CGC	2	6	4220	4225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.