MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017219	ACTGGC	2	12	35113	35124	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017219	ATGGGA	2	12	45780	45791	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017219	TTGCGG	2	12	51531	51542	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017219	GATTGG	2	12	55904	55915	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017219	ATCACG	2	12	61982	61993	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017219	GAAGAG	2	12	65719	65730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017219	TGGCGT	2	12	73224	73235	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017219	GTGCGG	2	12	99159	99170	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017219	CGGCAA	2	12	114184	114195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017219	AAGGTC	2	12	114312	114323	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017219	CGCGCA	2	12	130890	130901	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017219	AAAAGG	2	12	192731	192742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017219	TTGCGT	2	12	193000	193011	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017219	GGCTGC	2	12	211183	211194	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017219	TGGAAG	2	12	223705	223716	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017219	ACGGTG	2	12	230321	230332	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017219	TGCATC	2	12	280645	280656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017219	ACCGGA	2	12	291928	291939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017219	ATGGCT	2	12	301504	301515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017219	CTTCGT	2	12	336925	336936	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017219	TCTTTT	2	12	347073	347084	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017219	TGCCGG	2	12	347835	347846	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017219	TATCTT	2	12	362286	362297	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017219	CTTTGT	2	12	415142	415153	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017219	ATATGT	2	12	470525	470536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017219	GTTTCG	2	12	486274	486285	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017219	GTCCTT	2	12	489842	489853	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017219	ACCGGA	2	12	491234	491245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017219	TGACGT	2	12	495347	495358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017219	AACAAT	2	12	522752	522763	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017219	GATTCT	2	12	573092	573103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017219	TCCGAT	2	12	579482	579493	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017219	GGGTTA	2	12	606276	606287	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017219	CCGTTG	3	18	637616	637633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017219	GCGTCC	2	12	657206	657217	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017219	TGTCGA	2	12	745238	745249	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017219	GCTTCT	2	12	786038	786049	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017219	GTTCTT	2	12	833957	833968	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017219	TTTGAA	2	12	853149	853160	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017219	GGCCGA	2	12	908413	908424	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017219	AGGCGA	2	12	908550	908561	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017219	TCAGGC	2	12	925710	925721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017219	TCCGGG	2	12	964304	964315	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017219	AGTGCA	2	12	965283	965294	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017219	CCGGTG	2	12	965355	965366	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017219	GCATCC	2	12	981746	981757	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017219	AAGGCG	2	12	1014077	1014088	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017219	GCGGAA	2	12	1051335	1051346	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017219	GCAACA	2	12	1051417	1051428	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017219	AGCGGG	2	12	1056908	1056919	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017219	GCGATG	2	12	1118688	1118699	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017219	ACAATG	2	12	1127155	1127166	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017219	GGTTTT	2	12	1167991	1168002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017219	CGGACC	2	12	1283297	1283308	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017219	TACGGC	2	12	1317418	1317429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017219	GTAATC	2	12	1363469	1363480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017219	GGCGAG	2	12	1372426	1372437	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017219	GGTGTC	2	12	1383074	1383085	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017219	CTTTTC	2	12	1383171	1383182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017219	GAAAAA	2	12	1421381	1421392	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017219	GCATGC	2	12	1437918	1437929	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017219	GGTGTC	2	12	1440187	1440198	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017219	CGGATC	2	12	1473320	1473331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017219	TCCGAC	2	12	1475650	1475661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017219	TCCCCT	2	12	1481833	1481844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017219	GCAGGC	2	12	1493569	1493580	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017219	AATCGT	2	12	1527267	1527278	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017219	TTCCGG	2	12	1528019	1528030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017219	AAGGGA	2	12	1528222	1528233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017219	CTCATC	2	12	1555403	1555414	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017219	AAGGCA	2	12	1573580	1573591	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017219	GGATGC	2	12	1595652	1595663	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017219	CAGACA	2	12	1692290	1692301	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017219	TGGCGG	2	12	1719508	1719519	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017219	CACGGT	2	12	1743321	1743332	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017219	CGGTCA	2	12	1772166	1772177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017219	TCCTTG	2	12	1776555	1776566	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017219	CCCACG	2	12	1798566	1798577	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017219	TTGAAC	2	12	1805601	1805612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017219	GAAAAC	2	12	1805621	1805632	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017219	CAAATC	2	12	1816360	1816371	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017219	TTTCCC	2	12	1822706	1822717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017219	TTGAAC	2	12	1827457	1827468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017219	TCGCCT	2	12	1912123	1912134	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017219	CAACGC	2	12	1967773	1967784	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017219	CGGTAA	2	12	1973581	1973592	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017219	TGGCGG	2	12	1992911	1992922	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017219	AATATG	2	12	2000741	2000752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017219	CGCTCC	2	12	2005674	2005685	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017219	CTGAGG	2	12	2027846	2027857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017219	CCCTCG	2	12	2077209	2077220	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017219	TCCGCC	2	12	2119094	2119105	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017219	GTAGCA	2	12	2211302	2211313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017219	TTCTTA	2	12	2262681	2262692	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017219	TTCACA	2	12	2292910	2292921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017219	AATTGA	2	12	2300834	2300845	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017219	AAAGAC	2	12	2303011	2303022	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017219	CCATCA	2	12	2308842	2308853	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017219	CAAGCA	2	12	2322327	2322338	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017219	GGGGAC	2	12	2339748	2339759	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017219	CTTGAG	2	12	2351345	2351356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017219	AGAAAA	2	12	2414104	2414115	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017219	TCGCCT	2	12	2448094	2448105	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017219	AAGGGT	2	12	2509947	2509958	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017219	AACGCC	2	12	2519142	2519153	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017219	TGCACT	2	12	2540156	2540167	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017219	CATGGG	2	12	2595275	2595286	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017219	CAGCCG	2	12	2698221	2698232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017219	GTGTCC	2	12	2716016	2716027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017219	TCCGTT	2	12	2729030	2729041	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017219	CACCAA	2	12	2730857	2730868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017219	TGCACT	2	12	2752111	2752122	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017219	TGCACT	2	12	2758275	2758286	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017219	CGACGG	2	12	2767922	2767933	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017219	CCAGCG	2	12	2772246	2772257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017219	CTTTTT	2	12	2808034	2808045	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.