MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697

Total Repeats: 1194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017219	GACT	2	8	1541	1548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017219	TTAC	2	8	2114	2121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017219	CGTA	2	8	2170	2177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017219	CAAA	2	8	5105	5112	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017219	GGAA	2	8	5263	5270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017219	CCTC	2	8	7380	7387	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_017219	TGGC	2	8	11175	11182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017219	GGAA	2	8	11249	11256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017219	CGTT	2	8	13136	13143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017219	AGAT	2	8	14589	14596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017219	TCCT	2	8	15519	15526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017219	TTTC	2	8	15662	15669	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017219	CCCG	2	8	15922	15929	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_017219	TTGT	2	8	17887	17894	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017219	CTTT	2	8	18624	18631	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017219	GCCG	2	8	26430	26437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017219	TTCG	2	8	28835	28842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017219	ACCA	2	8	28989	28996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017219	CCAG	2	8	28999	29006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017219	GACC	2	8	29015	29022	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017219	TATG	2	8	30566	30573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017219	GCTG	2	8	32607	32614	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017219	CATT	2	8	33960	33967	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017219	AATG	2	8	34080	34087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017219	GGTT	2	8	34991	34998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017219	CTGA	2	8	35314	35321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017219	CGAT	2	8	38934	38941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017219	TCCC	2	8	40881	40888	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_017219	CGGA	2	8	41198	41205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017219	CGGT	2	8	45645	45652	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017219	CGAT	2	8	46350	46357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017219	GTTT	2	8	46540	46547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017219	CGGA	2	8	47838	47845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017219	AAGT	2	8	47875	47882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017219	ATCA	2	8	49418	49425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017219	CGGT	2	8	52644	52651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017219	CGGC	2	8	55789	55796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017219	AAGT	2	8	58382	58389	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017219	AGAT	2	8	58587	58594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017219	CCTG	2	8	58599	58606	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017219	CTAT	2	8	58907	58914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017219	GCAT	2	8	60878	60885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017219	AATC	2	8	65394	65401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017219	ACGC	2	8	65613	65620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017219	CGTT	2	8	66010	66017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017219	CCGT	2	8	66043	66050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017219	CGCT	2	8	66227	66234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017219	TCGG	2	8	66243	66250	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017219	GACT	2	8	73361	73368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017219	GCAG	2	8	74540	74547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017219	AGGG	2	8	80303	80310	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017219	GGAA	2	8	82347	82354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017219	CATC	2	8	84872	84879	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017219	GGCC	2	8	86592	86599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017219	GATA	2	8	86669	86676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017219	AACT	2	8	108074	108081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017219	GTTC	2	8	110366	110373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017219	TTGC	2	8	110404	110411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017219	GCTC	2	8	111404	111411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017219	TTGA	2	8	114446	114453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017219	CATG	2	8	115603	115610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017219	CCCT	2	8	116206	116213	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_017219	GGCT	2	8	116216	116223	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017219	CGGC	2	8	116648	116655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017219	GCCT	2	8	117425	117432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017219	GCTG	2	8	117513	117520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017219	TCAA	2	8	119404	119411	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017219	GCCG	2	8	124173	124180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017219	CGGG	2	8	129623	129630	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017219	CCCG	2	8	129660	129667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_017219	ATGG	2	8	129750	129757	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017219	GCCC	2	8	133466	133473	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_017219	CCGT	2	8	134180	134187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017219	GAAA	2	8	135056	135063	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017219	CCGT	2	8	138287	138294	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017219	ACGG	2	8	148360	148367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017219	GAAA	2	8	148382	148389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017219	AATG	2	8	148549	148556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017219	CCGC	2	8	151526	151533	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_017219	AAAG	2	8	151634	151641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017219	CGCC	2	8	153725	153732	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_017219	AAAT	2	8	155333	155340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017219	GGAG	2	8	156457	156464	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017219	CAAG	2	8	156492	156499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017219	TTGC	2	8	158535	158542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017219	TTGG	2	8	158623	158630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017219	GCGT	2	8	158708	158715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017219	CGGG	2	8	158964	158971	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017219	ATTT	2	8	159046	159053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017219	TGAT	2	8	159057	159064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017219	CTTG	2	8	166006	166013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017219	CGCC	2	8	168752	168759	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_017219	TGAG	2	8	168844	168851	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017219	ACCG	2	8	168989	168996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017219	GAAC	2	8	169018	169025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017219	GCCG	2	8	169089	169096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017219	CCAA	2	8	172811	172818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017219	TGTT	2	8	173427	173434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017219	GCTG	2	8	182575	182582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017219	AAAG	2	8	187159	187166	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017219	AGGT	2	8	187295	187302	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017219	CGGC	2	8	191889	191896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017219	ACTT	2	8	192086	192093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017219	GGAT	2	8	192874	192881	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017219	CAAA	2	8	193023	193030	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017219	GTAA	2	8	193848	193855	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017219	TACT	2	8	200725	200732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017219	GCAC	2	8	203270	203277	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017219	AAGC	2	8	210643	210650	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017219	GTCT	2	8	211024	211031	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017219	ACTG	2	8	213716	213723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017219	CTGA	2	8	217371	217378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017219	CGAA	2	8	220150	220157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017219	CGTA	2	8	220180	220187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017219	GTCG	2	8	230285	230292	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017219	GGCG	2	8	231848	231855	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017219	GGAA	2	8	231962	231969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017219	CAGG	2	8	238406	238413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017219	GCTG	2	8	243127	243134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017219	TGAT	2	8	248078	248085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017219	CGTG	2	8	249916	249923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017219	ATGA	2	8	257163	257170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017219	CTCC	2	8	259351	259358	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_017219	CGAT	2	8	259395	259402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017219	AATA	2	8	264886	264893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017219	GCCG	2	8	267057	267064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017219	GTAA	2	8	281058	281065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017219	CAAT	2	8	281765	281772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017219	GCCG	2	8	283008	283015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017219	GCGA	2	8	290178	290185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017219	AACC	2	8	290188	290195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017219	GTCA	2	8	290431	290438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017219	AGAA	2	8	290669	290676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017219	CAAC	2	8	291960	291967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017219	TCCG	2	8	293535	293542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017219	CTTC	2	8	293628	293635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017219	GGAA	2	8	293680	293687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017219	GCAA	2	8	293699	293706	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017219	AACG	2	8	293710	293717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017219	TTGA	2	8	294817	294824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017219	CATG	2	8	294827	294834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017219	TTCC	2	8	297568	297575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017219	TCTG	2	8	302593	302600	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017219	TGGG	2	8	302693	302700	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017219	TTGG	2	8	302881	302888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017219	GGAA	2	8	304989	304996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017219	TGAG	2	8	314376	314383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017219	CGAA	2	8	314392	314399	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017219	TATT	2	8	317305	317312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017219	GTGG	2	8	319534	319541	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017219	ACAA	2	8	321473	321480	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017219	CCGG	2	8	321502	321509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017219	ACGA	2	8	329106	329113	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_017219	CCGT	2	8	329150	329157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
155	NC_017219	GGGA	2	8	340816	340823	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017219	TCCC	2	8	341014	341021	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
157	NC_017219	TCAT	2	8	341396	341403	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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163	NC_017219	GATT	2	8	348501	348508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017219	TCGT	2	8	348886	348893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_017219	TATG	2	8	361441	361448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017219	GCCG	2	8	418975	418982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
192	NC_017219	CCGC	2	8	421522	421529	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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499	NC_017219	TGCT	2	8	1185353	1185360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_017219	ATCA	2	8	1185979	1185986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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