MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697

Total Repeats: 41488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017219	GCC	2	6	34	39	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198023
2	NC_017219	GTT	2	6	118	123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384198023
3	NC_017219	ACA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384198023
4	NC_017219	CGG	2	6	296	301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198023
5	NC_017219	CAG	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198023
6	NC_017219	CGG	2	6	810	815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198023
7	NC_017219	TTC	2	6	838	843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384198023
8	NC_017219	GCC	2	6	975	980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198023
9	NC_017219	TTC	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384198023
10	NC_017219	CTT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384198023
11	NC_017219	CAC	2	6	1191	1196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198023
12	NC_017219	CAT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198023
13	NC_017219	CAC	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198023
14	NC_017219	GCA	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198023
15	NC_017219	GTC	2	6	1656	1661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198024
16	NC_017219	GAC	2	6	1665	1670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198024
17	NC_017219	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198024
18	NC_017219	CCA	2	6	2399	2404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198025
19	NC_017219	CTG	2	6	2454	2459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198025
20	NC_017219	GTC	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198025
21	NC_017219	ACC	2	6	2805	2810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198025
22	NC_017219	ACT	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198025
23	NC_017219	TGA	2	6	2855	2860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198025
24	NC_017219	GCT	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198025
25	NC_017219	CGG	2	6	2965	2970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198025
26	NC_017219	CGA	2	6	2987	2992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198025
27	NC_017219	CAA	2	6	3014	3019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384198025
28	NC_017219	CCG	2	6	3115	3120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198025
29	NC_017219	CGA	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198025
30	NC_017219	CGA	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198025
31	NC_017219	AGG	2	6	3211	3216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384198025
32	NC_017219	CCG	2	6	3223	3228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198025
33	NC_017219	GAC	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198025
34	NC_017219	CAG	2	6	3291	3296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198025
35	NC_017219	CGA	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198025
36	NC_017219	AAC	2	6	3354	3359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384198025
37	NC_017219	TGG	2	6	3505	3510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384198026
38	NC_017219	CCA	2	6	3592	3597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198026
39	NC_017219	TGA	2	6	3614	3619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198026
40	NC_017219	GTG	2	6	3661	3666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384198026
41	NC_017219	GTC	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198026
42	NC_017219	ATC	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198026
43	NC_017219	CGC	2	6	3786	3791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198026
44	NC_017219	ATG	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198026
45	NC_017219	TTG	2	6	3882	3887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384198026
46	NC_017219	AAT	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384198026
47	NC_017219	CGA	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198026
48	NC_017219	GAT	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198026
49	NC_017219	TGA	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198026
50	NC_017219	CGC	2	6	4730	4735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198027
51	NC_017219	TGA	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198027
52	NC_017219	CCA	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198027
53	NC_017219	GCG	2	6	4829	4834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198027
54	NC_017219	GTG	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384198027
55	NC_017219	CGG	3	9	5084	5092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198027
56	NC_017219	AGC	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198028
57	NC_017219	GGC	2	6	5311	5316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198028
58	NC_017219	CAA	2	6	5329	5334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384198028
59	NC_017219	CAC	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198028
60	NC_017219	TCG	2	6	5496	5501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198028
61	NC_017219	CGA	2	6	5512	5517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198028
62	NC_017219	GTG	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384198028
63	NC_017219	TGA	2	6	5649	5654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198028
64	NC_017219	CGG	2	6	5668	5673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198028
65	NC_017219	CGG	4	12	5680	5691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198028
66	NC_017219	CGG	2	6	5704	5709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198028
67	NC_017219	ACC	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198028
68	NC_017219	CAG	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198028
69	NC_017219	CGA	2	6	5992	5997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198028
70	NC_017219	CGA	2	6	6019	6024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198028
71	NC_017219	CGG	2	6	6039	6044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198028
72	NC_017219	TCA	2	6	6156	6161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198028
73	NC_017219	CCG	2	6	6195	6200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198028
74	NC_017219	ACC	2	6	6218	6223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198028
75	NC_017219	CCA	2	6	6264	6269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198028
76	NC_017219	GGC	2	6	6275	6280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198028
77	NC_017219	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384198028
78	NC_017219	CGA	2	6	6379	6384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198028
79	NC_017219	CCG	2	6	6402	6407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198028
80	NC_017219	TGA	2	6	6498	6503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198028
81	NC_017219	CAT	2	6	6553	6558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198028
82	NC_017219	GCC	2	6	6593	6598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198028
83	NC_017219	CGC	2	6	6620	6625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198028
84	NC_017219	CCG	2	6	6642	6647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198028
85	NC_017219	TCC	2	6	6677	6682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384198028
86	NC_017219	ATG	2	6	6824	6829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198028
87	NC_017219	CGG	3	9	6865	6873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198028
88	NC_017219	TCA	3	9	6918	6926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198028
89	NC_017219	TTC	2	6	6980	6985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384198028
90	NC_017219	GAT	2	6	7000	7005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198028
91	NC_017219	CCG	2	6	7008	7013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198028
92	NC_017219	GCC	2	6	7033	7038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198028
93	NC_017219	GCC	2	6	7131	7136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198028
94	NC_017219	ACC	2	6	7208	7213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198028
95	NC_017219	CGC	3	9	7258	7266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198028
96	NC_017219	CGA	2	6	7270	7275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198028
97	NC_017219	CGC	2	6	7313	7318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198028
98	NC_017219	ACA	2	6	7447	7452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384198029
99	NC_017219	CGA	2	6	7457	7462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198029
100	NC_017219	AGG	2	6	7504	7509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384198029
101	NC_017219	ACC	2	6	7515	7520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198029
102	NC_017219	GCG	2	6	7540	7545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198029
103	NC_017219	GCA	2	6	7568	7573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198029
104	NC_017219	TCG	2	6	7615	7620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198029
105	NC_017219	ACG	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198029
106	NC_017219	ACA	2	6	7717	7722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384198029
107	NC_017219	ACC	2	6	7759	7764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198029
108	NC_017219	TCG	2	6	7834	7839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198029
109	NC_017219	GCC	3	9	7878	7886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198029
110	NC_017219	ACG	2	6	7975	7980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198029
111	NC_017219	TGC	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198029
112	NC_017219	CCG	2	6	8041	8046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198029
113	NC_017219	CCA	2	6	8065	8070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198029
114	NC_017219	CGC	2	6	8077	8082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198029
115	NC_017219	CTG	2	6	8151	8156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198029
116	NC_017219	CAT	2	6	8171	8176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198029
117	NC_017219	CCA	2	6	8203	8208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198029
118	NC_017219	TCA	2	6	8257	8262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198029
119	NC_017219	GAG	2	6	8286	8291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384198029
120	NC_017219	TGG	2	6	8311	8316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384198029
121	NC_017219	CGA	2	6	8414	8419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198029
122	NC_017219	GGT	2	6	8480	8485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384198029
123	NC_017219	AAC	2	6	8490	8495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384198029
124	NC_017219	GCA	2	6	8516	8521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198029
125	NC_017219	ACC	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198029
126	NC_017219	GAG	2	6	8658	8663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384198029
127	NC_017219	GCT	2	6	8774	8779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198029
128	NC_017219	ATC	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198029
129	NC_017219	CGA	2	6	8945	8950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198029
130	NC_017219	CGA	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198029
131	NC_017219	CGA	2	6	8978	8983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198029
132	NC_017219	CGC	2	6	8985	8990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384198029
133	NC_017219	GTG	2	6	9051	9056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384198029
134	NC_017219	TCA	2	6	9079	9084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198029
135	NC_017219	CGA	2	6	9098	9103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198029
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151	NC_017219	GAC	2	6	9645	9650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198029
152	NC_017219	CTG	2	6	9654	9659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384198029
153	NC_017219	GTG	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384198029
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255	NC_017219	ATC	2	6	17639	17644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198038
256	NC_017219	ATG	2	6	17719	17724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198038
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258	NC_017219	CGG	2	6	18197	18202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384198039
259	NC_017219	TGA	2	6	18230	18235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384198039
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498	NC_017219	CGA	2	6	33689	33694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384198053
499	NC_017219	CAC	2	6	33722	33727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384198053
500	NC_017219	ATC	2	6	34252	34257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384198054

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