MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium breve ACS-071-V-Sch8b chromosome

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017218	GCCCCT	2	12	17844	17855	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017218	GTCGCC	2	12	21744	21755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017218	GCCGTG	2	12	58559	58570	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017218	TGCACC	2	12	58575	58586	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017218	CCTGCC	2	12	62310	62321	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017218	CTGGTT	2	12	62345	62356	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017218	GTTCGT	2	12	94553	94564	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017218	AGGCGA	2	12	134745	134756	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017218	ATGCAT	2	12	143324	143335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017218	ACCGTA	2	12	144198	144209	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017218	TCAACT	2	12	147667	147678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017218	ACCTAC	2	12	147900	147911	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017218	TTGCGT	2	12	195455	195466	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017218	ACGATT	2	12	209005	209016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017218	GTCGAT	2	12	209799	209810	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017218	GGGACC	2	12	223269	223280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017218	GATTGG	2	12	252657	252668	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017218	CGCCAG	2	12	262742	262753	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017218	ACGGTG	2	12	263528	263539	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017218	ATGGGC	2	12	266988	266999	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017218	TTCCCG	2	12	267387	267398	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017218	ACGCGA	2	12	274272	274283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017218	GCGACC	2	12	275525	275536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017218	GGAGAA	2	12	275974	275985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017218	CAGCAA	2	12	277611	277622	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017218	CCAAAA	2	12	307988	307999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017218	CTACGA	2	12	335525	335536	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017218	TGCATC	2	12	338992	339003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017218	TTCGGC	2	12	371604	371615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017218	TAATCC	2	12	388931	388942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017218	GGCGAG	2	12	408911	408922	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017218	TTGGCG	2	12	435018	435029	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017218	TGGCGG	2	12	435046	435057	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017218	GAGCTG	2	12	435288	435299	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017218	GCCTAC	2	12	458285	458296	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017218	TCTCCT	2	12	510438	510449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017218	ATATAC	2	12	554705	554716	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017218	ATCAAG	2	12	555200	555211	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017218	TTCCTC	2	12	556552	556563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017218	ATGAGC	2	12	556931	556942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017218	CAAGCC	2	12	564673	564684	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017218	CTTCGG	2	12	621790	621801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017218	TCCGGG	2	12	685210	685221	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017218	CCGGTG	2	12	686253	686264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017218	TGCCTG	2	12	704166	704177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017218	CATTTC	2	12	713292	713303	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017218	TCTATA	2	12	784683	784694	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017218	CGTACC	2	12	806421	806432	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017218	TGAGCT	2	12	832166	832177	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017218	GTCACT	2	12	832258	832269	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017218	ACCGTC	2	12	832480	832491	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017218	CTACCA	2	12	877667	877678	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017218	CGGTGA	2	12	934359	934370	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017218	GGCCAC	2	12	945796	945807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017218	GAAAAG	2	12	969787	969798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017218	TCATTG	2	12	999495	999506	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017218	CGGCAC	2	12	1060601	1060612	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017218	TCAAAA	2	12	1077914	1077925	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017218	TCGATA	2	12	1078014	1078025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017218	GAACGG	2	12	1116276	1116287	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017218	CCCGCT	2	12	1127335	1127346	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017218	GCCACG	2	12	1161034	1161045	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017218	TTGAAC	2	12	1163960	1163971	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017218	AACGAG	2	12	1197540	1197551	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017218	GCAGAT	2	12	1246952	1246963	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017218	ACTGCG	2	12	1248887	1248898	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017218	TTGTAC	2	12	1282237	1282248	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017218	CGGGCG	2	12	1335003	1335014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017218	CGTTCC	2	12	1338054	1338065	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017218	CATCGC	2	12	1387967	1387978	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017218	TTCAAA	2	12	1414196	1414207	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017218	CGCCAT	2	12	1434356	1434367	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017218	TCCGGC	2	12	1437500	1437511	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017218	GCCGGA	2	12	1441036	1441047	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017218	CATATC	2	12	1459533	1459544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017218	TGTTGC	2	12	1495988	1495999	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017218	GGCCGG	2	12	1499364	1499375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017218	TTCATG	2	12	1504556	1504567	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017218	CCGGAA	2	12	1542838	1542849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017218	GAGGGT	2	12	1543009	1543020	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017218	GCCGGA	2	12	1543651	1543662	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017218	TTCTTA	2	12	1611383	1611394	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017218	TTGCTG	2	12	1614922	1614933	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017218	TTGGCG	2	12	1636999	1637010	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017218	AATTGA	2	12	1639937	1639948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017218	ATCAAG	2	12	1646194	1646205	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017218	TGTTCG	2	12	1657611	1657622	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017218	ACCCAC	2	12	1682271	1682282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017218	ATATCA	2	12	1682646	1682657	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017218	CGAATT	2	12	1690276	1690287	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017218	CATCGT	2	12	1751251	1751262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017218	TTACCG	2	12	1784981	1784992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017218	GTTAAC	2	12	1794900	1794911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017218	CGAACG	2	12	1795055	1795066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017218	CGGCCG	2	12	1798249	1798260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017218	CGGGAG	2	12	1823775	1823786	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017218	TGGTCT	2	12	1831266	1831277	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017218	CGGCTG	2	12	1873406	1873417	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017218	GCATCT	2	12	1898625	1898636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017218	GCCCCA	2	12	1953630	1953641	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017218	CACGGC	2	12	1960691	1960702	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017218	CATTGC	2	12	2021564	2021575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017218	TACGAC	2	12	2021576	2021587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017218	CACTCC	2	12	2044153	2044164	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017218	CGGACA	2	12	2096781	2096792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017218	AAGCCA	2	12	2096947	2096958	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017218	CTTCGG	2	12	2111604	2111615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017218	AGCAAC	2	12	2120968	2120979	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017218	TCACCG	2	12	2121446	2121457	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017218	CGCACA	2	12	2135383	2135394	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017218	ATCAGC	2	12	2151861	2151872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017218	ACCGCA	2	12	2154708	2154719	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017218	CAGCCG	2	12	2174980	2174991	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017218	CCCACT	2	12	2210988	2210999	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017218	GGAAAA	2	12	2226094	2226105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017218	CCCGGA	2	12	2228257	2228268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017218	CCCGGA	2	12	2234504	2234515	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017218	CCAGCG	2	12	2246901	2246912	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017218	CAGACG	2	12	2262940	2262951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017218	TCGTTA	2	12	2290881	2290892	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017218	CGTCAG	2	12	2303647	2303658	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.