MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017217	ATGGGC	2	12	18926	18937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017217	GGTCGA	2	12	50664	50675	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017217	GGAAAA	2	12	51364	51375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017217	TTCCAG	2	12	57736	57747	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017217	CATGAG	2	12	60441	60452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017217	GGGCGG	2	12	108645	108656	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017217	TACAAA	2	12	140075	140086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017217	CTGGCA	2	12	147190	147201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017217	GATAGG	2	12	166273	166284	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017217	GCATGG	2	12	166564	166575	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017217	GGCGCG	2	12	201057	201068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017217	GCGCCC	2	12	225723	225734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017217	ACTATG	2	12	240038	240049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017217	GAGACG	2	12	286878	286889	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017217	AGAGGA	2	12	291620	291631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017217	GCTGTT	2	12	299253	299264	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017217	GCTTTT	2	12	361235	361246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017217	GTTGGC	2	12	412945	412956	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017217	CGCATC	2	12	445673	445684	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017217	GCTGAA	2	12	482469	482480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017217	GCAGCC	2	12	495378	495389	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017217	TGAGAT	2	12	498642	498653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017217	AAGGTA	2	12	499173	499184	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017217	TCCGCA	2	12	519555	519566	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017217	CATGCA	2	12	531102	531113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017217	ATGCCG	2	12	564351	564362	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017217	GCGCAC	2	12	570249	570260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017217	GGAATC	2	12	619396	619407	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017217	TCGCTC	2	12	653807	653818	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017217	GATTGC	2	12	655745	655756	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017217	TCGCTC	2	12	655802	655813	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017217	CGACAA	2	12	669307	669318	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017217	CATGCG	2	12	726563	726574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017217	ATGCCC	2	12	760231	760242	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017217	GCCACC	2	12	807080	807091	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017217	TTAGAC	2	12	862400	862411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017217	TGCGGC	2	12	884244	884255	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017217	GCCCTT	2	12	898708	898719	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017217	AAAAGG	2	12	916532	916543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017217	TATCGT	2	12	935559	935570	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017217	CGCCTG	2	12	1016924	1016935	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017217	GACATG	2	12	1091583	1091594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017217	CCCATA	2	12	1109483	1109494	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017217	ACTCAT	2	12	1114152	1114163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017217	TTCCCT	2	12	1231961	1231972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017217	GAGCGC	2	12	1266127	1266138	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017217	CGTAAG	2	12	1353780	1353791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017217	GGCCTT	2	12	1381537	1381548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017217	TTGAAG	2	12	1381592	1381603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017217	TCACAT	2	12	1411915	1411926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017217	GGCCAA	2	12	1430151	1430162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017217	TGGCTG	2	12	1469035	1469046	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017217	CTCGTT	2	12	1470362	1470373	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017217	TTGCAC	2	12	1483055	1483066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017217	CGCTTT	2	12	1499809	1499820	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017217	GCCGTT	2	12	1518320	1518331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017217	CGCTTG	2	12	1586417	1586428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017217	AGAGAA	2	12	1662108	1662119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017217	GTCGAC	2	12	1693549	1693560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017217	ATCTTG	2	12	1755022	1755033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017217	CAAAAA	2	12	1761352	1761363	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017217	CCTTTG	2	12	1815246	1815257	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017217	GCAATC	2	12	1829806	1829817	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017217	CATCTC	2	12	1841737	1841748	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017217	CAATCT	2	12	1841841	1841852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017217	ATGGGA	2	12	1867498	1867509	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017217	CCTTTG	2	12	1891469	1891480	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017217	ATCGAT	2	12	1917272	1917283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017217	CTATAC	2	12	1939982	1939993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.