MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 4530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017217	GGCT	2	8	236	243	0 %	25 %	50 %	25 %	384194623
2	NC_017217	GTTC	2	8	792	799	0 %	50 %	25 %	25 %	384194623
3	NC_017217	CGAG	2	8	1056	1063	25 %	0 %	50 %	25 %	384194623
4	NC_017217	ACGA	2	8	1070	1077	50 %	0 %	25 %	25 %	384194623
5	NC_017217	CATG	2	8	1780	1787	25 %	25 %	25 %	25 %	384194623
6	NC_017217	TTCG	2	8	2512	2519	0 %	50 %	25 %	25 %	384194624
7	NC_017217	ACGC	2	8	2553	2560	25 %	0 %	25 %	50 %	384194624
8	NC_017217	CGGC	2	8	3366	3373	0 %	0 %	50 %	50 %	384194624
9	NC_017217	AGGA	2	8	3645	3652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017217	CGTT	2	8	4094	4101	0 %	50 %	25 %	25 %	384194625
11	NC_017217	GCCG	2	8	4906	4913	0 %	0 %	50 %	50 %	384194625
12	NC_017217	GCAT	2	8	4968	4975	25 %	25 %	25 %	25 %	384194625
13	NC_017217	GCAG	2	8	4976	4983	25 %	0 %	50 %	25 %	384194625
14	NC_017217	GAGC	2	8	5085	5092	25 %	0 %	50 %	25 %	384194625
15	NC_017217	GCCG	2	8	5133	5140	0 %	0 %	50 %	50 %	384194626
16	NC_017217	CGCA	2	8	5352	5359	25 %	0 %	25 %	50 %	384194626
17	NC_017217	TGGG	2	8	5365	5372	0 %	25 %	75 %	0 %	384194626
18	NC_017217	GCAA	2	8	5543	5550	50 %	0 %	25 %	25 %	384194626
19	NC_017217	CAAC	2	8	5786	5793	50 %	0 %	0 %	50 %	384194627
20	NC_017217	CGAG	2	8	7215	7222	25 %	0 %	50 %	25 %	384194627
21	NC_017217	CGGC	2	8	7536	7543	0 %	0 %	50 %	50 %	384194627
22	NC_017217	AACC	2	8	7973	7980	50 %	0 %	0 %	50 %	384194628
23	NC_017217	CGAT	2	8	8117	8124	25 %	25 %	25 %	25 %	384194628
24	NC_017217	GAGC	2	8	8179	8186	25 %	0 %	50 %	25 %	384194628
25	NC_017217	CCGC	2	8	8567	8574	0 %	0 %	25 %	75 %	384194628
26	NC_017217	TGCG	2	8	8825	8832	0 %	25 %	50 %	25 %	384194628
27	NC_017217	CATT	2	8	9143	9150	25 %	50 %	0 %	25 %	384194628
28	NC_017217	CGCC	2	8	9183	9190	0 %	0 %	25 %	75 %	384194628
29	NC_017217	GCAC	2	8	9749	9756	25 %	0 %	25 %	50 %	384194628
30	NC_017217	CGAC	2	8	10082	10089	25 %	0 %	25 %	50 %	384194628
31	NC_017217	GATG	2	8	10221	10228	25 %	25 %	50 %	0 %	384194628
32	NC_017217	ACCG	2	8	10987	10994	25 %	0 %	25 %	50 %	384194629
33	NC_017217	CGCC	2	8	11027	11034	0 %	0 %	25 %	75 %	384194629
34	NC_017217	CGGT	2	8	11158	11165	0 %	25 %	50 %	25 %	384194629
35	NC_017217	CTGC	2	8	11473	11480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017217	CGCA	2	8	11481	11488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017217	TTCA	2	8	11807	11814	25 %	50 %	0 %	25 %	384194630
38	NC_017217	TGCG	2	8	12064	12071	0 %	25 %	50 %	25 %	384194630
39	NC_017217	TTGC	2	8	12527	12534	0 %	50 %	25 %	25 %	384194630
40	NC_017217	TGCA	2	8	13668	13675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017217	GTTG	2	8	13879	13886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017217	GCGA	3	12	14744	14755	25 %	0 %	50 %	25 %	384194632
43	NC_017217	CGCC	2	8	14863	14870	0 %	0 %	25 %	75 %	384194632
44	NC_017217	GCCG	2	8	15218	15225	0 %	0 %	50 %	50 %	384194632
45	NC_017217	CCTC	2	8	15392	15399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_017217	TCGG	2	8	16490	16497	0 %	25 %	50 %	25 %	384194633
47	NC_017217	GCCG	2	8	16677	16684	0 %	0 %	50 %	50 %	384194633
48	NC_017217	GCCG	2	8	17097	17104	0 %	0 %	50 %	50 %	384194635
49	NC_017217	TGGC	2	8	17348	17355	0 %	25 %	50 %	25 %	384194635
50	NC_017217	GATC	2	8	17549	17556	25 %	25 %	25 %	25 %	384194635
51	NC_017217	TTCC	2	8	17722	17729	0 %	50 %	0 %	50 %	384194635
52	NC_017217	TGCA	2	8	18222	18229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017217	GCGT	2	8	19316	19323	0 %	25 %	50 %	25 %	384194637
54	NC_017217	ATGT	2	8	19468	19475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017217	AGAA	2	8	19856	19863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017217	GGTG	2	8	19923	19930	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017217	ATTC	2	8	19931	19938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017217	TCGA	2	8	20406	20413	25 %	25 %	25 %	25 %	384194638
59	NC_017217	ACTC	2	8	20597	20604	25 %	25 %	0 %	50 %	384194638
60	NC_017217	GGAA	2	8	20668	20675	50 %	0 %	50 %	0 %	384194638
61	NC_017217	TGAC	2	8	21710	21717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017217	CAGT	2	8	21817	21824	25 %	25 %	25 %	25 %	384194640
63	NC_017217	GCAT	2	8	23016	23023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017217	TTTC	2	8	23043	23050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017217	CCAA	2	8	23236	23243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017217	GAGC	2	8	23843	23850	25 %	0 %	50 %	25 %	384194642
67	NC_017217	CGCA	2	8	24440	24447	25 %	0 %	25 %	50 %	384194642
68	NC_017217	GTGA	2	8	24924	24931	25 %	25 %	50 %	0 %	384194642
69	NC_017217	GCGA	2	8	24972	24979	25 %	0 %	50 %	25 %	384194642
70	NC_017217	GCCT	2	8	25198	25205	0 %	25 %	25 %	50 %	384194642
71	NC_017217	GGCG	2	8	25373	25380	0 %	0 %	75 %	25 %	384194642
72	NC_017217	GAGT	2	8	26034	26041	25 %	25 %	50 %	0 %	384194642
73	NC_017217	CCGA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017217	ATGC	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017217	CATT	2	8	27401	27408	25 %	50 %	0 %	25 %	384194644
76	NC_017217	GACG	2	8	27804	27811	25 %	0 %	50 %	25 %	384194644
77	NC_017217	AAGG	2	8	28125	28132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017217	ACTG	2	8	28379	28386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017217	GTCG	2	8	28651	28658	0 %	25 %	50 %	25 %	384194645
80	NC_017217	GCTT	2	8	29053	29060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017217	GCAG	2	8	29438	29445	25 %	0 %	50 %	25 %	384194646
82	NC_017217	AATC	2	8	29572	29579	50 %	25 %	0 %	25 %	384194646
83	NC_017217	GACT	2	8	29949	29956	25 %	25 %	25 %	25 %	384194646
84	NC_017217	GTTT	2	8	29994	30001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017217	GCTT	2	8	31989	31996	0 %	50 %	25 %	25 %	384194650
86	NC_017217	TGGC	2	8	32674	32681	0 %	25 %	50 %	25 %	384194652
87	NC_017217	TTTC	2	8	32914	32921	0 %	75 %	0 %	25 %	384194652
88	NC_017217	ATTT	2	8	33195	33202	25 %	75 %	0 %	0 %	384194652
89	NC_017217	ACGA	2	8	33211	33218	50 %	0 %	25 %	25 %	384194652
90	NC_017217	CTTG	2	8	33368	33375	0 %	50 %	25 %	25 %	384194652
91	NC_017217	TTTA	2	8	33384	33391	25 %	75 %	0 %	0 %	384194652
92	NC_017217	ATTC	2	8	33666	33673	25 %	50 %	0 %	25 %	384194652
93	NC_017217	TGAT	2	8	34097	34104	25 %	50 %	25 %	0 %	384194653
94	NC_017217	GTTT	2	8	34200	34207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017217	AATT	2	8	34339	34346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017217	GAGC	2	8	34870	34877	25 %	0 %	50 %	25 %	384194654
97	NC_017217	GCCA	2	8	35688	35695	25 %	0 %	25 %	50 %	384194654
98	NC_017217	CTCG	2	8	36208	36215	0 %	25 %	25 %	50 %	384194655
99	NC_017217	TGTC	2	8	36971	36978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017217	TGCT	2	8	37689	37696	0 %	50 %	25 %	25 %	384194656
101	NC_017217	TGGG	2	8	37736	37743	0 %	25 %	75 %	0 %	384194656
102	NC_017217	AGCG	2	8	37778	37785	25 %	0 %	50 %	25 %	384194656
103	NC_017217	GAAA	2	8	38316	38323	75 %	0 %	25 %	0 %	384194656
104	NC_017217	CTTG	2	8	41618	41625	0 %	50 %	25 %	25 %	384194658
105	NC_017217	GCTT	2	8	41659	41666	0 %	50 %	25 %	25 %	384194658
106	NC_017217	TGAT	2	8	42022	42029	25 %	50 %	25 %	0 %	384194658
107	NC_017217	CAAT	2	8	42259	42266	50 %	25 %	0 %	25 %	384194658
108	NC_017217	CGCA	2	8	42911	42918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017217	AGTG	2	8	43586	43593	25 %	25 %	50 %	0 %	384194660
110	NC_017217	GGTC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017217	GATT	2	8	44113	44120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017217	GTCG	2	8	44332	44339	0 %	25 %	50 %	25 %	384194661
113	NC_017217	AGAA	2	8	44644	44651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017217	TTTG	2	8	44880	44887	0 %	75 %	25 %	0 %	384194662
115	NC_017217	AAGG	2	8	45092	45099	50 %	0 %	50 %	0 %	384194663
116	NC_017217	GGAT	2	8	45700	45707	25 %	25 %	50 %	0 %	384194665
117	NC_017217	TGCT	2	8	45948	45955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017217	CGGT	2	8	46492	46499	0 %	25 %	50 %	25 %	384194666
119	NC_017217	GTGA	2	8	46759	46766	25 %	25 %	50 %	0 %	384194666
120	NC_017217	CGGT	2	8	47241	47248	0 %	25 %	50 %	25 %	384194667
121	NC_017217	GCTG	2	8	47728	47735	0 %	25 %	50 %	25 %	384194668
122	NC_017217	CGGC	2	8	48080	48087	0 %	0 %	50 %	50 %	384194669
123	NC_017217	GGGC	2	8	48486	48493	0 %	0 %	75 %	25 %	384194669
124	NC_017217	CCTG	2	8	48669	48676	0 %	25 %	25 %	50 %	384194669
125	NC_017217	CCCT	2	8	49234	49241	0 %	25 %	0 %	75 %	384194669
126	NC_017217	GTGC	2	8	49253	49260	0 %	25 %	50 %	25 %	384194669
127	NC_017217	CGGT	2	8	49796	49803	0 %	25 %	50 %	25 %	384194669
128	NC_017217	CGAA	2	8	49920	49927	50 %	0 %	25 %	25 %	384194669
129	NC_017217	TGAA	2	8	50378	50385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017217	CAAT	2	8	50520	50527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017217	GGTA	2	8	51056	51063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017217	TGGC	2	8	51772	51779	0 %	25 %	50 %	25 %	384194670
133	NC_017217	GAGG	2	8	52507	52514	25 %	0 %	75 %	0 %	384194671
134	NC_017217	GCTC	2	8	53889	53896	0 %	25 %	25 %	50 %	384194672
135	NC_017217	CAGG	2	8	54913	54920	25 %	0 %	50 %	25 %	384194672
136	NC_017217	GCAC	2	8	55205	55212	25 %	0 %	25 %	50 %	384194672
137	NC_017217	ATCG	2	8	55313	55320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017217	GCCG	2	8	55383	55390	0 %	0 %	50 %	50 %	384194673
139	NC_017217	AGGT	2	8	55553	55560	25 %	25 %	50 %	0 %	384194673
140	NC_017217	CCCA	2	8	55697	55704	25 %	0 %	0 %	75 %	384194673
141	NC_017217	CGAA	2	8	56409	56416	50 %	0 %	25 %	25 %	384194673
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143	NC_017217	GCGG	2	8	56662	56669	0 %	0 %	75 %	25 %	384194673
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