MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017217	AGGA	2	8	3645	3652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017217	CTGC	2	8	11473	11480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017217	CGCA	2	8	11481	11488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017217	TGCA	2	8	13668	13675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017217	GTTG	2	8	13879	13886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017217	CCTC	2	8	15392	15399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_017217	TGCA	2	8	18222	18229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017217	ATGT	2	8	19468	19475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017217	AGAA	2	8	19856	19863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017217	GGTG	2	8	19923	19930	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017217	ATTC	2	8	19931	19938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017217	TGAC	2	8	21710	21717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017217	GCAT	2	8	23016	23023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017217	TTTC	2	8	23043	23050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017217	CCAA	2	8	23236	23243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017217	CCGA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017217	ATGC	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017217	AAGG	2	8	28125	28132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017217	ACTG	2	8	28379	28386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017217	GCTT	2	8	29053	29060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017217	GTTT	2	8	29994	30001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017217	GTTT	2	8	34200	34207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017217	AATT	2	8	34339	34346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017217	TGTC	2	8	36971	36978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017217	CGCA	2	8	42911	42918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017217	GGTC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017217	GATT	2	8	44113	44120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017217	AGAA	2	8	44644	44651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017217	TGCT	2	8	45948	45955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017217	TGAA	2	8	50378	50385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017217	CAAT	2	8	50520	50527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017217	GGTA	2	8	51056	51063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017217	ATCG	2	8	55313	55320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017217	TACG	2	8	60419	60426	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017217	CAAA	2	8	61992	61999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017217	TCGC	2	8	64033	64040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017217	AAGG	2	8	65509	65516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017217	GGTC	2	8	66895	66902	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017217	GGGC	2	8	71414	71421	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017217	TTCC	2	8	73037	73044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017217	TGCG	2	8	81707	81714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017217	TATC	2	8	85922	85929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017217	GTCT	2	8	89939	89946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017217	GCCA	2	8	89987	89994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017217	AGCG	2	8	92722	92729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017217	CTTC	2	8	92765	92772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017217	TGCC	2	8	92921	92928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017217	TGCC	2	8	111542	111549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017217	CCCG	2	8	112118	112125	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_017217	AGCT	2	8	116080	116087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017217	TTGC	2	8	116156	116163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017217	CATG	2	8	127416	127423	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017217	GCTG	2	8	127516	127523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017217	TGCA	2	8	131348	131355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017217	TGTT	2	8	138033	138040	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017217	CGTG	2	8	143580	143587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017217	GGCC	2	8	143787	143794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017217	CATG	2	8	143987	143994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017217	CAGA	2	8	157823	157830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017217	GGGA	2	8	164220	164227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017217	GCGT	2	8	164398	164405	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017217	TGAG	2	8	164640	164647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017217	AGAA	2	8	164801	164808	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017217	ATCT	2	8	166319	166326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017217	GCGT	2	8	166434	166441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017217	GCAT	2	8	167728	167735	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017217	GTTT	2	8	167877	167884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017217	GCAT	2	8	168159	168166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017217	GGGT	2	8	170294	170301	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017217	CTTT	2	8	171746	171753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017217	GCGG	2	8	171896	171903	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017217	AGTA	2	8	171949	171956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017217	AATG	2	8	171957	171964	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017217	TGCT	2	8	176872	176879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017217	AGTG	2	8	177647	177654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017217	CTTG	2	8	179695	179702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017217	TAAG	2	8	179824	179831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017217	CGGT	2	8	183514	183521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017217	TGAA	2	8	192659	192666	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017217	GTAA	2	8	192681	192688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017217	GATA	2	8	195355	195362	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017217	GCAA	2	8	201552	201559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017217	AAAC	2	8	201977	201984	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017217	ACGG	2	8	203401	203408	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017217	TGGT	2	8	203564	203571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017217	CGGT	2	8	203844	203851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017217	GGCG	2	8	211196	211203	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017217	ATGA	2	8	215487	215494	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017217	ATTC	2	8	217230	217237	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017217	CACG	2	8	223494	223501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017217	TGCA	2	8	223711	223718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017217	TCAT	2	8	225748	225755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017217	AGGC	2	8	227744	227751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017217	AGGG	2	8	232893	232900	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017217	TTGT	2	8	234697	234704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017217	CCGG	2	8	235097	235104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017217	GGGC	2	8	239755	239762	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017217	CGTC	2	8	243800	243807	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017217	GGCA	2	8	245153	245160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017217	GACA	2	8	249340	249347	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017217	CGGT	2	8	251091	251098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017217	GTTC	2	8	251130	251137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017217	GCCG	2	8	254387	254394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017217	GCCG	2	8	256972	256979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017217	CTGG	2	8	257004	257011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017217	TGAC	2	8	266770	266777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017217	TCCC	2	8	271023	271030	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_017217	CCAT	2	8	274197	274204	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017217	TGAT	2	8	274930	274937	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017217	AGGG	2	8	275033	275040	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017217	GCTT	2	8	276828	276835	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017217	GCGG	2	8	277015	277022	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017217	TTCG	2	8	278014	278021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017217	GCGG	2	8	278068	278075	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017217	GAAA	2	8	278314	278321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017217	CGGA	2	8	279469	279476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017217	AAAG	2	8	281169	281176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017217	GGCT	2	8	284623	284630	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017217	TGAG	2	8	285027	285034	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017217	TGGC	2	8	286757	286764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017217	ATGT	2	8	286946	286953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017217	GACA	2	8	288090	288097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017217	AGCG	2	8	288113	288120	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017217	TACC	2	8	290407	290414	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017217	ACTC	2	8	291165	291172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017217	ATGA	2	8	291270	291277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017217	TGAA	2	8	291281	291288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017217	AGGA	2	8	291612	291619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017217	GCGG	2	8	293154	293161	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017217	TGCT	2	8	294692	294699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017217	TTTG	2	8	295039	295046	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017217	CGCT	2	8	296251	296258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017217	AGCG	2	8	296478	296485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017217	CCCG	2	8	297521	297528	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_017217	CATG	2	8	299151	299158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017217	TTGC	2	8	300433	300440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017217	GTTT	2	8	300545	300552	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017217	GCGG	2	8	300570	300577	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017217	GGTT	2	8	310162	310169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017217	CAGG	2	8	313609	313616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017217	CTGT	2	8	324786	324793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017217	ACAG	2	8	325162	325169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017217	GTGG	2	8	326807	326814	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017217	CGTT	2	8	332008	332015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017217	GCAT	2	8	332144	332151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017217	TCTT	2	8	333638	333645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017217	TCTG	2	8	336848	336855	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017217	CTGG	2	8	337065	337072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017217	GGGC	2	8	337230	337237	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017217	AGAT	2	8	337287	337294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017217	AGGG	2	8	337708	337715	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017217	CGCA	2	8	339399	339406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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154	NC_017217	GCAT	2	8	342607	342614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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156	NC_017217	TTCG	2	8	346875	346882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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160	NC_017217	TTCG	2	8	352932	352939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_017217	GCTG	2	8	360507	360514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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496	NC_017217	AGTC	2	8	1376326	1376333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_017217	AGCG	2	8	1381688	1381695	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_017217	GACC	2	8	1383996	1384003	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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