MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017217	A	7	7	32816	32822	100 %	0 %	0 %	0 %	384194652
2	NC_017217	A	7	7	33145	33151	100 %	0 %	0 %	0 %	384194652
3	NC_017217	A	6	6	33416	33421	100 %	0 %	0 %	0 %	384194652
4	NC_017217	T	6	6	33537	33542	0 %	100 %	0 %	0 %	384194652
5	NC_017217	C	7	7	58453	58459	0 %	0 %	0 %	100 %	384194674
6	NC_017217	G	6	6	91638	91643	0 %	0 %	100 %	0 %	384194702
7	NC_017217	G	6	6	92435	92440	0 %	0 %	100 %	0 %	384194702
8	NC_017217	T	7	7	141891	141897	0 %	100 %	0 %	0 %	384194745
9	NC_017217	G	8	8	159526	159533	0 %	0 %	100 %	0 %	384194759
10	NC_017217	G	7	7	184723	184729	0 %	0 %	100 %	0 %	384194779
11	NC_017217	C	6	6	226349	226354	0 %	0 %	0 %	100 %	384194811
12	NC_017217	G	6	6	252471	252476	0 %	0 %	100 %	0 %	384194834
13	NC_017217	G	6	6	272327	272332	0 %	0 %	100 %	0 %	384194844
14	NC_017217	A	6	6	304748	304753	100 %	0 %	0 %	0 %	384194869
15	NC_017217	G	6	6	413117	413122	0 %	0 %	100 %	0 %	384194943
16	NC_017217	G	6	6	424108	424113	0 %	0 %	100 %	0 %	384194950
17	NC_017217	G	6	6	484650	484655	0 %	0 %	100 %	0 %	384195017
18	NC_017217	G	6	6	512671	512676	0 %	0 %	100 %	0 %	384195036
19	NC_017217	C	6	6	518403	518408	0 %	0 %	0 %	100 %	384195042
20	NC_017217	G	6	6	573719	573724	0 %	0 %	100 %	0 %	384195084
21	NC_017217	G	6	6	589422	589427	0 %	0 %	100 %	0 %	384195096
22	NC_017217	C	6	6	637240	637245	0 %	0 %	0 %	100 %	384195134
23	NC_017217	A	6	6	654365	654370	100 %	0 %	0 %	0 %	384195151
24	NC_017217	A	6	6	676764	676769	100 %	0 %	0 %	0 %	384195175
25	NC_017217	A	6	6	677834	677839	100 %	0 %	0 %	0 %	384195175
26	NC_017217	A	6	6	679215	679220	100 %	0 %	0 %	0 %	384195175
27	NC_017217	G	6	6	681114	681119	0 %	0 %	100 %	0 %	384195177
28	NC_017217	A	6	6	681944	681949	100 %	0 %	0 %	0 %	384195177
29	NC_017217	G	6	6	687360	687365	0 %	0 %	100 %	0 %	384195183
30	NC_017217	C	6	6	694981	694986	0 %	0 %	0 %	100 %	384195188
31	NC_017217	G	6	6	709563	709568	0 %	0 %	100 %	0 %	384195199
32	NC_017217	A	7	7	712073	712079	100 %	0 %	0 %	0 %	384195203
33	NC_017217	A	6	6	713555	713560	100 %	0 %	0 %	0 %	384195205
34	NC_017217	G	6	6	720676	720681	0 %	0 %	100 %	0 %	384195210
35	NC_017217	G	6	6	722517	722522	0 %	0 %	100 %	0 %	384195212
36	NC_017217	G	6	6	738641	738646	0 %	0 %	100 %	0 %	384195225
37	NC_017217	G	6	6	749610	749615	0 %	0 %	100 %	0 %	384195234
38	NC_017217	C	6	6	769446	769451	0 %	0 %	0 %	100 %	384195252
39	NC_017217	G	6	6	779819	779824	0 %	0 %	100 %	0 %	384195262
40	NC_017217	G	6	6	783464	783469	0 %	0 %	100 %	0 %	384195264
41	NC_017217	A	6	6	793944	793949	100 %	0 %	0 %	0 %	384195273
42	NC_017217	T	6	6	800658	800663	0 %	100 %	0 %	0 %	384195277
43	NC_017217	A	6	6	806724	806729	100 %	0 %	0 %	0 %	384195282
44	NC_017217	C	6	6	812168	812173	0 %	0 %	0 %	100 %	384195287
45	NC_017217	G	6	6	823185	823190	0 %	0 %	100 %	0 %	384195294
46	NC_017217	A	6	6	839262	839267	100 %	0 %	0 %	0 %	384195309
47	NC_017217	G	6	6	859137	859142	0 %	0 %	100 %	0 %	384195325
48	NC_017217	G	9	9	871364	871372	0 %	0 %	100 %	0 %	384195335
49	NC_017217	G	6	6	889463	889468	0 %	0 %	100 %	0 %	384195352
50	NC_017217	G	6	6	893165	893170	0 %	0 %	100 %	0 %	384195355
51	NC_017217	G	6	6	900927	900932	0 %	0 %	100 %	0 %	384195363
52	NC_017217	G	6	6	902392	902397	0 %	0 %	100 %	0 %	384195365
53	NC_017217	C	6	6	907938	907943	0 %	0 %	0 %	100 %	384195370
54	NC_017217	G	6	6	914225	914230	0 %	0 %	100 %	0 %	384195378
55	NC_017217	A	6	6	925607	925612	100 %	0 %	0 %	0 %	384195391
56	NC_017217	G	6	6	942458	942463	0 %	0 %	100 %	0 %	384195407
57	NC_017217	G	6	6	942733	942738	0 %	0 %	100 %	0 %	384195407
58	NC_017217	G	6	6	943667	943672	0 %	0 %	100 %	0 %	384195408
59	NC_017217	C	6	6	953524	953529	0 %	0 %	0 %	100 %	384195418
60	NC_017217	G	6	6	964661	964666	0 %	0 %	100 %	0 %	384195429
61	NC_017217	C	6	6	964672	964677	0 %	0 %	0 %	100 %	384195429
62	NC_017217	C	6	6	971615	971620	0 %	0 %	0 %	100 %	384195435
63	NC_017217	G	6	6	982890	982895	0 %	0 %	100 %	0 %	384195444
64	NC_017217	G	6	6	984600	984605	0 %	0 %	100 %	0 %	384195444
65	NC_017217	C	6	6	993274	993279	0 %	0 %	0 %	100 %	384195452
66	NC_017217	G	6	6	1038648	1038653	0 %	0 %	100 %	0 %	384195490
67	NC_017217	G	6	6	1055699	1055704	0 %	0 %	100 %	0 %	384195506
68	NC_017217	G	6	6	1056208	1056213	0 %	0 %	100 %	0 %	384195506
69	NC_017217	T	6	6	1056630	1056635	0 %	100 %	0 %	0 %	384195506
70	NC_017217	C	6	6	1069847	1069852	0 %	0 %	0 %	100 %	384195520
71	NC_017217	T	6	6	1082436	1082441	0 %	100 %	0 %	0 %	384195532
72	NC_017217	T	6	6	1101214	1101219	0 %	100 %	0 %	0 %	384195554
73	NC_017217	A	6	6	1101757	1101762	100 %	0 %	0 %	0 %	384195554
74	NC_017217	A	6	6	1102684	1102689	100 %	0 %	0 %	0 %	384195554
75	NC_017217	T	6	6	1104189	1104194	0 %	100 %	0 %	0 %	384195555
76	NC_017217	T	7	7	1104290	1104296	0 %	100 %	0 %	0 %	384195556
77	NC_017217	C	6	6	1113250	1113255	0 %	0 %	0 %	100 %	384195561
78	NC_017217	G	6	6	1113903	1113908	0 %	0 %	100 %	0 %	384195561
79	NC_017217	G	6	6	1116667	1116672	0 %	0 %	100 %	0 %	384195563
80	NC_017217	T	6	6	1117272	1117277	0 %	100 %	0 %	0 %	384195563
81	NC_017217	C	6	6	1122206	1122211	0 %	0 %	0 %	100 %	384195566
82	NC_017217	G	6	6	1132022	1132027	0 %	0 %	100 %	0 %	384195574
83	NC_017217	C	7	7	1132795	1132801	0 %	0 %	0 %	100 %	384195575
84	NC_017217	G	6	6	1134857	1134862	0 %	0 %	100 %	0 %	384195577
85	NC_017217	A	6	6	1135994	1135999	100 %	0 %	0 %	0 %	384195578
86	NC_017217	T	6	6	1152071	1152076	0 %	100 %	0 %	0 %	384195590
87	NC_017217	G	6	6	1157731	1157736	0 %	0 %	100 %	0 %	384195596
88	NC_017217	C	6	6	1188651	1188656	0 %	0 %	0 %	100 %	384195624
89	NC_017217	G	6	6	1188840	1188845	0 %	0 %	100 %	0 %	384195624
90	NC_017217	C	6	6	1191975	1191980	0 %	0 %	0 %	100 %	384195627
91	NC_017217	G	6	6	1217665	1217670	0 %	0 %	100 %	0 %	384195645
92	NC_017217	G	6	6	1259297	1259302	0 %	0 %	100 %	0 %	384195678
93	NC_017217	C	6	6	1263796	1263801	0 %	0 %	0 %	100 %	384195680
94	NC_017217	C	6	6	1264319	1264324	0 %	0 %	0 %	100 %	384195680
95	NC_017217	C	6	6	1264465	1264470	0 %	0 %	0 %	100 %	384195680
96	NC_017217	C	6	6	1264697	1264702	0 %	0 %	0 %	100 %	384195680
97	NC_017217	C	6	6	1278717	1278722	0 %	0 %	0 %	100 %	384195690
98	NC_017217	T	6	6	1287831	1287836	0 %	100 %	0 %	0 %	384195699
99	NC_017217	C	6	6	1301942	1301947	0 %	0 %	0 %	100 %	384195710
100	NC_017217	C	6	6	1307330	1307335	0 %	0 %	0 %	100 %	384195714
101	NC_017217	G	6	6	1328187	1328192	0 %	0 %	100 %	0 %	384195729
102	NC_017217	G	6	6	1354609	1354614	0 %	0 %	100 %	0 %	384195753
103	NC_017217	C	6	6	1368780	1368785	0 %	0 %	0 %	100 %	384195765
104	NC_017217	C	6	6	1369411	1369416	0 %	0 %	0 %	100 %	384195766
105	NC_017217	C	6	6	1430471	1430476	0 %	0 %	0 %	100 %	384195820
106	NC_017217	G	6	6	1433522	1433527	0 %	0 %	100 %	0 %	384195822
107	NC_017217	C	6	6	1441998	1442003	0 %	0 %	0 %	100 %	384195829
108	NC_017217	T	6	6	1453467	1453472	0 %	100 %	0 %	0 %	384195839
109	NC_017217	G	6	6	1462208	1462213	0 %	0 %	100 %	0 %	384195847
110	NC_017217	C	6	6	1485893	1485898	0 %	0 %	0 %	100 %	384195863
111	NC_017217	C	9	9	1493657	1493665	0 %	0 %	0 %	100 %	384195870
112	NC_017217	T	6	6	1509838	1509843	0 %	100 %	0 %	0 %	384195884
113	NC_017217	T	6	6	1512175	1512180	0 %	100 %	0 %	0 %	384195885
114	NC_017217	T	6	6	1512277	1512282	0 %	100 %	0 %	0 %	384195885
115	NC_017217	T	7	7	1512869	1512875	0 %	100 %	0 %	0 %	384195885
116	NC_017217	A	6	6	1513390	1513395	100 %	0 %	0 %	0 %	384195885
117	NC_017217	T	6	6	1522556	1522561	0 %	100 %	0 %	0 %	384195890
118	NC_017217	C	6	6	1552637	1552642	0 %	0 %	0 %	100 %	384195912
119	NC_017217	C	6	6	1553093	1553098	0 %	0 %	0 %	100 %	384195912
120	NC_017217	C	6	6	1555511	1555516	0 %	0 %	0 %	100 %	384195913
121	NC_017217	G	6	6	1559191	1559196	0 %	0 %	100 %	0 %	384195913
122	NC_017217	C	6	6	1561193	1561198	0 %	0 %	0 %	100 %	384195914
123	NC_017217	C	6	6	1566203	1566208	0 %	0 %	0 %	100 %	384195915
124	NC_017217	G	6	6	1583810	1583815	0 %	0 %	100 %	0 %	384195924
125	NC_017217	A	6	6	1624084	1624089	100 %	0 %	0 %	0 %	384195959
126	NC_017217	G	6	6	1627604	1627609	0 %	0 %	100 %	0 %	384195962
127	NC_017217	T	6	6	1633541	1633546	0 %	100 %	0 %	0 %	384195968
128	NC_017217	T	6	6	1633988	1633993	0 %	100 %	0 %	0 %	384195968
129	NC_017217	T	7	7	1635061	1635067	0 %	100 %	0 %	0 %	384195969
130	NC_017217	T	6	6	1635472	1635477	0 %	100 %	0 %	0 %	384195969
131	NC_017217	T	6	6	1644642	1644647	0 %	100 %	0 %	0 %	384195977
132	NC_017217	A	6	6	1645090	1645095	100 %	0 %	0 %	0 %	384195978
133	NC_017217	A	6	6	1645524	1645529	100 %	0 %	0 %	0 %	384195978
134	NC_017217	A	6	6	1645586	1645591	100 %	0 %	0 %	0 %	384195978
135	NC_017217	G	6	6	1646288	1646293	0 %	0 %	100 %	0 %	384195979
136	NC_017217	T	6	6	1646344	1646349	0 %	100 %	0 %	0 %	384195979
137	NC_017217	G	6	6	1646690	1646695	0 %	0 %	100 %	0 %	384195979
138	NC_017217	A	7	7	1648025	1648031	100 %	0 %	0 %	0 %	384195981
139	NC_017217	A	6	6	1648706	1648711	100 %	0 %	0 %	0 %	384195982
140	NC_017217	T	8	8	1648997	1649004	0 %	100 %	0 %	0 %	384195982
141	NC_017217	A	6	6	1649014	1649019	100 %	0 %	0 %	0 %	384195982
142	NC_017217	T	7	7	1650001	1650007	0 %	100 %	0 %	0 %	384195983
143	NC_017217	T	6	6	1660364	1660369	0 %	100 %	0 %	0 %	384195989
144	NC_017217	T	7	7	1660373	1660379	0 %	100 %	0 %	0 %	384195989
145	NC_017217	A	6	6	1680747	1680752	100 %	0 %	0 %	0 %	384196004
146	NC_017217	A	6	6	1680757	1680762	100 %	0 %	0 %	0 %	384196004
147	NC_017217	T	6	6	1694280	1694285	0 %	100 %	0 %	0 %	384196017
148	NC_017217	A	6	6	1697471	1697476	100 %	0 %	0 %	0 %	384196021
149	NC_017217	A	6	6	1697485	1697490	100 %	0 %	0 %	0 %	384196021
150	NC_017217	C	6	6	1700182	1700187	0 %	0 %	0 %	100 %	384196025
151	NC_017217	G	6	6	1722554	1722559	0 %	0 %	100 %	0 %	384196037
152	NC_017217	T	6	6	1753961	1753966	0 %	100 %	0 %	0 %	384196061
153	NC_017217	C	6	6	1757127	1757132	0 %	0 %	0 %	100 %	384196063
154	NC_017217	T	6	6	1770624	1770629	0 %	100 %	0 %	0 %	384196079
155	NC_017217	A	7	7	1841588	1841594	100 %	0 %	0 %	0 %	384196128
156	NC_017217	G	6	6	1862432	1862437	0 %	0 %	100 %	0 %	384196143
157	NC_017217	C	6	6	1919434	1919439	0 %	0 %	0 %	100 %	384196176
158	NC_017217	C	6	6	1933609	1933614	0 %	0 %	0 %	100 %	384196185

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.