MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis BLC1

Total Repeats: 1492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017216	ACCAC	2	10	1634	1643	40 %	0 %	0 %	60 %	452892166
2	NC_017216	CCGGC	2	10	2651	2660	0 %	0 %	40 %	60 %	384193074
3	NC_017216	CCGTT	2	10	2964	2973	0 %	40 %	20 %	40 %	384193074
4	NC_017216	AACGC	2	10	3182	3191	40 %	0 %	20 %	40 %	384193074
5	NC_017216	CGATC	2	10	5697	5706	20 %	20 %	20 %	40 %	384193077
6	NC_017216	AAGGC	2	10	7511	7520	40 %	0 %	40 %	20 %	384193077
7	NC_017216	GCACG	2	10	14287	14296	20 %	0 %	40 %	40 %	384193082
8	NC_017216	GGTGG	2	10	14932	14941	0 %	20 %	80 %	0 %	384193082
9	NC_017216	GCGAG	2	10	15664	15673	20 %	0 %	60 %	20 %	384193083
10	NC_017216	CGTGC	2	10	15811	15820	0 %	20 %	40 %	40 %	384193083
11	NC_017216	GATTG	2	10	16585	16594	20 %	40 %	40 %	0 %	384193083
12	NC_017216	TTCGA	2	10	16994	17003	20 %	40 %	20 %	20 %	384193084
13	NC_017216	ACCGA	2	10	17651	17660	40 %	0 %	20 %	40 %	384193084
14	NC_017216	TCTGT	2	10	21251	21260	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017216	CGCAC	2	10	24455	24464	20 %	0 %	20 %	60 %	384193090
16	NC_017216	CGACG	2	10	25123	25132	20 %	0 %	40 %	40 %	384193090
17	NC_017216	CGCTG	2	10	25269	25278	0 %	20 %	40 %	40 %	384193090
18	NC_017216	GCCGT	2	10	25934	25943	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017216	GGGGA	2	10	26949	26958	20 %	0 %	80 %	0 %	384193091
20	NC_017216	AGAGA	2	10	28030	28039	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017216	CGGTT	2	10	28079	28088	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017216	GAAGA	2	10	30890	30899	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017216	TTCAC	2	10	31302	31311	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017216	GGGAA	2	10	32829	32838	40 %	0 %	60 %	0 %	452892170
25	NC_017216	TTTTG	2	10	33854	33863	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017216	TGAGT	2	10	34340	34349	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017216	GATGT	2	10	34899	34908	20 %	40 %	40 %	0 %	452892171
28	NC_017216	AAATC	2	10	35874	35883	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017216	TATGC	2	10	38288	38297	20 %	40 %	20 %	20 %	384193102
30	NC_017216	AAAGC	2	10	39537	39546	60 %	0 %	20 %	20 %	384193102
31	NC_017216	CATCA	2	10	40342	40351	40 %	20 %	0 %	40 %	384193103
32	NC_017216	TGCTG	2	10	40932	40941	0 %	40 %	40 %	20 %	384193104
33	NC_017216	GAGAT	2	10	43484	43493	40 %	20 %	40 %	0 %	384193105
34	NC_017216	CAAGC	2	10	44188	44197	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017216	TTCGT	2	10	44700	44709	0 %	60 %	20 %	20 %	384193106
36	NC_017216	GATCG	2	10	45630	45639	20 %	20 %	40 %	20 %	384193108
37	NC_017216	GGAAG	2	10	45790	45799	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017216	CGCCA	2	10	46298	46307	20 %	0 %	20 %	60 %	384193109
39	NC_017216	CCGAC	2	10	47532	47541	20 %	0 %	20 %	60 %	384193111
40	NC_017216	CTCGG	2	10	48250	48259	0 %	20 %	40 %	40 %	384193112
41	NC_017216	GCCAT	2	10	48950	48959	20 %	20 %	20 %	40 %	384193112
42	NC_017216	GCCCG	2	10	49827	49836	0 %	0 %	40 %	60 %	384193112
43	NC_017216	CGGTC	2	10	52410	52419	0 %	20 %	40 %	40 %	384193115
44	NC_017216	GCACG	2	10	53211	53220	20 %	0 %	40 %	40 %	384193115
45	NC_017216	ATTCA	2	10	55231	55240	40 %	40 %	0 %	20 %	384193117
46	NC_017216	TCCGC	2	10	55452	55461	0 %	20 %	20 %	60 %	384193117
47	NC_017216	TGAAT	2	10	56287	56296	40 %	40 %	20 %	0 %	384193117
48	NC_017216	GGATC	2	10	56943	56952	20 %	20 %	40 %	20 %	384193117
49	NC_017216	GGGAA	2	10	64260	64269	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017216	ATCGC	2	10	66260	66269	20 %	20 %	20 %	40 %	384193127
51	NC_017216	TGGGG	2	10	66959	66968	0 %	20 %	80 %	0 %	384193128
52	NC_017216	GGCGC	2	10	69459	69468	0 %	0 %	60 %	40 %	384193129
53	NC_017216	GCTCG	2	10	72623	72632	0 %	20 %	40 %	40 %	384193131
54	NC_017216	GCTGA	2	10	74786	74795	20 %	20 %	40 %	20 %	384193133
55	NC_017216	CATCG	2	10	76586	76595	20 %	20 %	20 %	40 %	384193133
56	NC_017216	TTGTA	2	10	76997	77006	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017216	CGGTC	2	10	79194	79203	0 %	20 %	40 %	40 %	384193135
58	NC_017216	GCACG	2	10	79995	80004	20 %	0 %	40 %	40 %	384193135
59	NC_017216	CGGTG	2	10	80585	80594	0 %	20 %	60 %	20 %	384193136
60	NC_017216	TCATT	2	10	81501	81510	20 %	60 %	0 %	20 %	384193136
61	NC_017216	CCAAA	2	10	81984	81993	60 %	0 %	0 %	40 %	384193137
62	NC_017216	CCGGG	2	10	82477	82486	0 %	0 %	60 %	40 %	384193138
63	NC_017216	CGGCT	2	10	87643	87652	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017216	CGAAC	2	10	89268	89277	40 %	0 %	20 %	40 %	384193142
65	NC_017216	GAGAA	2	10	89732	89741	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017216	GCTCG	2	10	90749	90758	0 %	20 %	40 %	40 %	384193144
67	NC_017216	ATACA	2	10	91353	91362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017216	GGTGC	2	10	96030	96039	0 %	20 %	60 %	20 %	384193148
69	NC_017216	GTCTT	2	10	102496	102505	0 %	60 %	20 %	20 %	384193153
70	NC_017216	GCGCC	2	10	106815	106824	0 %	0 %	40 %	60 %	384193155
71	NC_017216	CGCCC	2	10	107303	107312	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
72	NC_017216	GCCGC	2	10	107771	107780	0 %	0 %	40 %	60 %	384193156
73	NC_017216	AGGAA	2	10	108566	108575	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017216	TGTTT	2	10	111320	111329	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017216	GCAAA	2	10	111748	111757	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017216	CGGCG	2	10	114918	114927	0 %	0 %	60 %	40 %	384193162
77	NC_017216	TGGCG	2	10	114942	114951	0 %	20 %	60 %	20 %	384193162
78	NC_017216	ACGGC	2	10	115034	115043	20 %	0 %	40 %	40 %	384193162
79	NC_017216	GACGA	2	10	115090	115099	40 %	0 %	40 %	20 %	384193162
80	NC_017216	CCGAG	2	10	115316	115325	20 %	0 %	40 %	40 %	384193162
81	NC_017216	CGATT	2	10	115551	115560	20 %	40 %	20 %	20 %	384193162
82	NC_017216	ACCTG	2	10	116772	116781	20 %	20 %	20 %	40 %	384193163
83	NC_017216	GCCCG	2	10	117479	117488	0 %	0 %	40 %	60 %	384193163
84	NC_017216	AGTCG	2	10	117827	117836	20 %	20 %	40 %	20 %	384193163
85	NC_017216	GTGCG	2	10	118855	118864	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017216	TGGTG	2	10	121722	121731	0 %	40 %	60 %	0 %	384193166
87	NC_017216	GTTCG	2	10	123838	123847	0 %	40 %	40 %	20 %	384193168
88	NC_017216	TCGAA	2	10	125469	125478	40 %	20 %	20 %	20 %	384193169
89	NC_017216	AGGTG	2	10	125579	125588	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017216	TGGCA	2	10	127955	127964	20 %	20 %	40 %	20 %	384193173
91	NC_017216	GCCGA	2	10	127994	128003	20 %	0 %	40 %	40 %	384193173
92	NC_017216	TCGCG	2	10	128894	128903	0 %	20 %	40 %	40 %	384193174
93	NC_017216	GCGCC	2	10	133262	133271	0 %	0 %	40 %	60 %	384193178
94	NC_017216	TGGGT	2	10	134382	134391	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017216	CGCAT	2	10	135102	135111	20 %	20 %	20 %	40 %	384193181
96	NC_017216	TGGAT	2	10	136646	136655	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017216	TGAGG	2	10	137912	137921	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017216	TGCTC	2	10	139056	139065	0 %	40 %	20 %	40 %	384193186
99	NC_017216	CGGCT	2	10	140915	140924	0 %	20 %	40 %	40 %	384193188
100	NC_017216	TCTCA	2	10	143892	143901	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017216	ATCTC	2	10	146805	146814	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017216	CTCGC	2	10	147070	147079	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_017216	AACAG	2	10	147224	147233	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017216	CAAGA	2	10	147511	147520	60 %	0 %	20 %	20 %	384193193
105	NC_017216	GACAA	2	10	149735	149744	60 %	0 %	20 %	20 %	384193195
106	NC_017216	CCCGA	2	10	149912	149921	20 %	0 %	20 %	60 %	384193195
107	NC_017216	ATGAG	2	10	151629	151638	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017216	CGACG	2	10	152391	152400	20 %	0 %	40 %	40 %	384193197
109	NC_017216	GCACC	2	10	155825	155834	20 %	0 %	20 %	60 %	384193199
110	NC_017216	GCTCG	2	10	156730	156739	0 %	20 %	40 %	40 %	384193200
111	NC_017216	CGGCA	2	10	157390	157399	20 %	0 %	40 %	40 %	384193200
112	NC_017216	CGACC	2	10	158459	158468	20 %	0 %	20 %	60 %	384193201
113	NC_017216	GCTCG	2	10	158779	158788	0 %	20 %	40 %	40 %	384193202
114	NC_017216	TCCCG	2	10	159912	159921	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_017216	CACCG	2	10	161473	161482	20 %	0 %	20 %	60 %	384193204
116	NC_017216	TGGCA	2	10	162115	162124	20 %	20 %	40 %	20 %	384193204
117	NC_017216	GCGAA	2	10	163749	163758	40 %	0 %	40 %	20 %	384193207
118	NC_017216	AGTGT	2	10	164246	164255	20 %	40 %	40 %	0 %	384193207
119	NC_017216	GCGCC	2	10	164716	164725	0 %	0 %	40 %	60 %	384193208
120	NC_017216	CCGCG	2	10	165400	165409	0 %	0 %	40 %	60 %	384193208
121	NC_017216	CGGCG	2	10	166407	166416	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017216	GTGCG	2	10	167544	167553	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017216	GGAGG	2	10	171774	171783	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017216	TGCCG	2	10	174128	174137	0 %	20 %	40 %	40 %	384193213
125	NC_017216	TGCCC	2	10	176898	176907	0 %	20 %	20 %	60 %	384193216
126	NC_017216	CTCAT	2	10	177501	177510	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017216	TGCGC	2	10	177910	177919	0 %	20 %	40 %	40 %	384193217
128	NC_017216	GCGTG	2	10	178522	178531	0 %	20 %	60 %	20 %	384193218
129	NC_017216	CCACG	2	10	179428	179437	20 %	0 %	20 %	60 %	384193218
130	NC_017216	TGAGG	2	10	179926	179935	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017216	GCACC	2	10	181670	181679	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_017216	CTCGC	2	10	184209	184218	0 %	20 %	20 %	60 %	384193223
133	NC_017216	CGCCA	2	10	185817	185826	20 %	0 %	20 %	60 %	384193224
134	NC_017216	CGTGG	2	10	186508	186517	0 %	20 %	60 %	20 %	384193224
135	NC_017216	TCGCC	2	10	188549	188558	0 %	20 %	20 %	60 %	384193225
136	NC_017216	GTTCT	2	10	191286	191295	0 %	60 %	20 %	20 %	384193228
137	NC_017216	CAGCG	2	10	192897	192906	20 %	0 %	40 %	40 %	384193230
138	NC_017216	ATGGC	2	10	193118	193127	20 %	20 %	40 %	20 %	384193230
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256	NC_017216	TGCGG	2	10	337870	337879	0 %	20 %	60 %	20 %	384193331
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263	NC_017216	ATGAG	2	10	348789	348798	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017216	CTGGG	2	10	348815	348824	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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401	NC_017216	ATGGC	2	10	525588	525597	20 %	20 %	40 %	20 %	384193491
402	NC_017216	GGAAG	2	10	526946	526955	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
403	NC_017216	ATGCG	2	10	528738	528747	20 %	20 %	40 %	20 %	452892191
404	NC_017216	GGTCA	2	10	529234	529243	20 %	20 %	40 %	20 %	452892191
405	NC_017216	GCGCC	2	10	529927	529936	0 %	0 %	40 %	60 %	384193494
406	NC_017216	CCGCG	2	10	534318	534327	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
407	NC_017216	GACCC	2	10	536006	536015	20 %	0 %	20 %	60 %	452892193
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412	NC_017216	GCAAT	2	10	543918	543927	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
413	NC_017216	TCGTC	2	10	544482	544491	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
414	NC_017216	CATGC	2	10	544512	544521	20 %	20 %	20 %	40 %	384193505
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431	NC_017216	ATCGG	2	10	564338	564347	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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433	NC_017216	TATCG	2	10	569499	569508	20 %	40 %	20 %	20 %	384193523
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439	NC_017216	TCGAG	2	10	579514	579523	20 %	20 %	40 %	20 %	384193532
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444	NC_017216	GGGCA	2	10	590520	590529	20 %	0 %	60 %	20 %	384193540
445	NC_017216	CGACC	2	10	593492	593501	20 %	0 %	20 %	60 %	384193542
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448	NC_017216	GTCTT	2	10	598153	598162	0 %	60 %	20 %	20 %	452892199
449	NC_017216	ACACG	2	10	598899	598908	40 %	0 %	20 %	40 %	384193547
450	NC_017216	CGCCA	2	10	598922	598931	20 %	0 %	20 %	60 %	384193547
451	NC_017216	GCGCT	2	10	600681	600690	0 %	20 %	40 %	40 %	384193549
452	NC_017216	CCGCA	2	10	602501	602510	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
453	NC_017216	GCCGC	2	10	605469	605478	0 %	0 %	40 %	60 %	384193553
454	NC_017216	CTTTC	2	10	605934	605943	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
455	NC_017216	CCGAA	2	10	606144	606153	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
456	NC_017216	CGGCT	2	10	607176	607185	0 %	20 %	40 %	40 %	384193554
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460	NC_017216	GGGCA	2	10	610443	610452	20 %	0 %	60 %	20 %	384193556
461	NC_017216	GGCTG	2	10	610527	610536	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
462	NC_017216	AGTGA	2	10	611660	611669	40 %	20 %	40 %	0 %	384193557
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472	NC_017216	TCCGG	2	10	623539	623548	0 %	20 %	40 %	40 %	384193566
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487	NC_017216	ATGGC	2	10	646575	646584	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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499	NC_017216	GGGGA	2	10	664077	664086	20 %	0 %	80 %	0 %	384193599
500	NC_017216	GCACA	2	10	664428	664437	40 %	0 %	20 %	40 %	384193600

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