MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis BLC1

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017216	TCTGT	2	10	21251	21260	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017216	GCCGT	2	10	25934	25943	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017216	AGAGA	2	10	28030	28039	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017216	CGGTT	2	10	28079	28088	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017216	GAAGA	2	10	30890	30899	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017216	TTCAC	2	10	31302	31311	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017216	TTTTG	2	10	33854	33863	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017216	TGAGT	2	10	34340	34349	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017216	AAATC	2	10	35874	35883	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017216	CAAGC	2	10	44188	44197	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017216	GGAAG	2	10	45790	45799	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017216	GGGAA	2	10	64260	64269	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017216	TTGTA	2	10	76997	77006	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017216	CGGCT	2	10	87643	87652	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017216	GAGAA	2	10	89732	89741	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017216	ATACA	2	10	91353	91362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017216	CGCCC	2	10	107303	107312	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_017216	AGGAA	2	10	108566	108575	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017216	TGTTT	2	10	111320	111329	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017216	GCAAA	2	10	111748	111757	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017216	GTGCG	2	10	118855	118864	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017216	AGGTG	2	10	125579	125588	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017216	TGGGT	2	10	134382	134391	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017216	TGGAT	2	10	136646	136655	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017216	TGAGG	2	10	137912	137921	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017216	TCTCA	2	10	143892	143901	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017216	ATCTC	2	10	146805	146814	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017216	CTCGC	2	10	147070	147079	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017216	AACAG	2	10	147224	147233	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017216	ATGAG	2	10	151629	151638	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017216	TCCCG	2	10	159912	159921	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_017216	CGGCG	2	10	166407	166416	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017216	GTGCG	2	10	167544	167553	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017216	GGAGG	2	10	171774	171783	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017216	CTCAT	2	10	177501	177510	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017216	TGAGG	2	10	179926	179935	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017216	GCACC	2	10	181670	181679	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_017216	AGCCG	2	10	198951	198960	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017216	GCGCC	2	10	200427	200436	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_017216	GAAGT	2	10	200473	200482	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017216	ACGAG	2	10	209653	209662	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017216	GTGAG	2	10	216333	216342	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017216	ATGCA	2	10	221488	221497	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017216	CAGCA	2	10	229139	229148	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017216	CAATA	2	10	249166	249175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017216	TGCGT	2	10	251743	251752	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017216	GCGCG	2	10	252118	252127	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017216	CGTTG	2	10	254208	254217	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017216	GTTGG	2	10	258406	258415	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017216	TGCCG	2	10	259831	259840	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017216	GGCTG	2	10	268783	268792	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017216	AGTGT	2	10	274936	274945	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017216	CGGGG	2	10	276832	276841	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017216	TGTAG	2	10	279146	279155	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017216	AGGAG	2	10	291464	291473	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017216	CGTTC	2	10	297662	297671	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017216	AGCGT	2	10	302451	302460	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017216	CCGAT	2	10	324834	324843	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017216	AGAGA	2	10	337102	337111	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017216	ATGAG	2	10	348789	348798	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017216	CTGGG	2	10	348815	348824	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017216	AGTGT	2	10	368071	368080	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017216	ACGGC	2	10	410853	410862	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017216	TTCGC	2	10	419120	419129	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017216	GGCGG	2	10	419224	419233	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017216	CCCGC	2	10	419282	419291	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
67	NC_017216	TGGGG	2	10	420621	420630	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017216	CTGTC	2	10	431008	431017	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017216	ATTCG	2	10	453037	453046	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017216	GCACG	2	10	454851	454860	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017216	AGCAA	2	10	480061	480070	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017216	CGTTG	2	10	496905	496914	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017216	ACACG	2	10	498417	498426	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017216	CGAAT	2	10	498733	498742	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017216	CGATG	2	10	515452	515461	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017216	CCTTG	2	10	515518	515527	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017216	GGCAT	2	10	515634	515643	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017216	GGAAG	2	10	526946	526955	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017216	CCGCG	2	10	534318	534327	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_017216	GCAAT	2	10	543918	543927	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017216	TCGTC	2	10	544482	544491	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017216	TCGAT	2	10	545400	545409	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017216	GAGAG	2	10	546218	546227	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017216	AAGAG	2	10	549517	549526	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017216	GTGCG	2	10	554349	554358	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017216	ATCGG	2	10	564338	564347	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017216	GATGC	2	10	572750	572759	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017216	CATGC	2	10	596504	596513	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017216	CCGCA	2	10	602501	602510	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_017216	CTTTC	2	10	605934	605943	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017216	CCGAA	2	10	606144	606153	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017216	GGCTG	2	10	610527	610536	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017216	ATGAC	2	10	614316	614325	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017216	AGCGT	2	10	630466	630475	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017216	CGGGG	2	10	642692	642701	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017216	TGCCA	2	10	642883	642892	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017216	ATGGC	2	10	646575	646584	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017216	CTGCA	2	10	653612	653621	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017216	AAATG	2	10	655243	655252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017216	GGAGT	2	10	655448	655457	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017216	GCCAT	2	10	657193	657202	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017216	AATGG	2	10	666614	666623	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017216	GGCAA	2	10	673678	673687	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017216	TTTCG	2	10	675710	675719	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017216	TGGCA	2	10	680695	680704	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017216	ACATG	2	10	711778	711787	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017216	TCAAC	2	10	711795	711804	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_017216	CCAAC	2	10	721921	721930	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_017216	TGGGC	2	10	724599	724608	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017216	CAGAG	2	10	726164	726173	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017216	CGAGG	2	10	726221	726230	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017216	CACAA	2	10	729886	729895	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017216	TGCAC	2	10	732921	732930	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017216	TGGAA	2	10	752566	752575	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017216	CTGTT	2	10	768860	768869	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017216	TGCGT	2	10	770774	770783	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017216	GTTCC	2	10	772897	772906	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017216	CATTG	2	10	786031	786040	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017216	TCCCC	2	10	787574	787583	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
120	NC_017216	GCATC	2	10	789029	789038	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017216	GGCGG	2	10	789074	789083	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017216	ACGGG	2	10	808839	808848	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017216	CCCGT	2	10	808898	808907	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
124	NC_017216	TGGTC	2	10	833365	833374	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017216	TCGCA	2	10	838511	838520	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017216	GATTC	2	10	867542	867551	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017216	CATGG	2	10	881288	881297	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017216	CATGG	2	10	881409	881418	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017216	AACAC	2	10	892291	892300	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017216	CTAAA	2	10	894834	894843	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017216	TGTCA	2	10	929962	929971	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017216	TTTTC	2	10	935498	935507	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017216	GTTCA	2	10	956478	956487	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017216	CGTGT	2	10	957470	957479	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017216	TCCCC	2	10	967465	967474	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
136	NC_017216	TTGCC	2	10	974995	975004	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017216	GAGTG	2	10	998534	998543	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017216	CATTT	2	10	1001475	1001484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017216	GAAGC	2	10	1002614	1002623	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017216	ATGCA	2	10	1002995	1003004	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017216	CTTCG	2	10	1022138	1022147	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017216	TCTTT	2	10	1032146	1032155	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017216	ACACG	2	10	1047158	1047167	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017216	TCCTT	2	10	1051751	1051760	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017216	CCTAA	2	10	1056674	1056683	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017216	CGAAT	2	10	1061637	1061646	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017216	TATGC	2	10	1083425	1083434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017216	ATTGG	2	10	1090652	1090661	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017216	CCATG	2	10	1092062	1092071	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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152	NC_017216	ACGTG	2	10	1122292	1122301	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017216	CACGT	2	10	1122312	1122321	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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159	NC_017216	AGGTG	2	10	1197915	1197924	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_017216	CCCCA	2	10	1197997	1198006	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
162	NC_017216	AGACA	2	10	1203084	1203093	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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168	NC_017216	GCCCC	2	10	1240361	1240370	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
169	NC_017216	CACAA	2	10	1242928	1242937	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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171	NC_017216	TGCTC	2	10	1265580	1265589	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
172	NC_017216	CGCGC	2	10	1265629	1265638	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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174	NC_017216	TAGCG	2	10	1314112	1314121	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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271	NC_017216	CCCAC	2	10	1875972	1875981	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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273	NC_017216	ACCCC	2	10	1876528	1876537	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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284	NC_017216	CCCAC	2	10	1934362	1934371	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
285	NC_017216	CGCAC	2	10	1935593	1935602	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
286	NC_017216	CACCG	2	10	1935649	1935658	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.