MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 chromosome

Total Repeats: 1491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017215	ACCAC	2	10	1796	1805	40 %	0 %	0 %	60 %	384191412
2	NC_017215	CCGGC	2	10	2813	2822	0 %	0 %	40 %	60 %	384191413
3	NC_017215	CCGTT	2	10	3126	3135	0 %	40 %	20 %	40 %	384191413
4	NC_017215	AACGC	2	10	3344	3353	40 %	0 %	20 %	40 %	384191413
5	NC_017215	CGATC	2	10	5859	5868	20 %	20 %	20 %	40 %	384191416
6	NC_017215	AAGGC	2	10	7673	7682	40 %	0 %	40 %	20 %	384191416
7	NC_017215	GCACG	2	10	14449	14458	20 %	0 %	40 %	40 %	384191422
8	NC_017215	GGTGG	2	10	15094	15103	0 %	20 %	80 %	0 %	384191422
9	NC_017215	GCGAG	2	10	15826	15835	20 %	0 %	60 %	20 %	384191423
10	NC_017215	CGTGC	2	10	15973	15982	0 %	20 %	40 %	40 %	384191423
11	NC_017215	GATTG	2	10	16747	16756	20 %	40 %	40 %	0 %	384191423
12	NC_017215	TTCGA	2	10	17156	17165	20 %	40 %	20 %	20 %	384191425
13	NC_017215	ACCGA	2	10	17813	17822	40 %	0 %	20 %	40 %	384191425
14	NC_017215	TCTGT	2	10	21413	21422	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017215	CGCAC	2	10	24617	24626	20 %	0 %	20 %	60 %	384191433
16	NC_017215	CGACG	2	10	25285	25294	20 %	0 %	40 %	40 %	384191433
17	NC_017215	CGCTG	2	10	25431	25440	0 %	20 %	40 %	40 %	384191433
18	NC_017215	GCCGT	2	10	26096	26105	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017215	GGGGA	2	10	27111	27120	20 %	0 %	80 %	0 %	384191434
20	NC_017215	AGAGA	2	10	28192	28201	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017215	CGGTT	2	10	28241	28250	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017215	GAAGA	2	10	31052	31061	60 %	0 %	40 %	0 %	384191438
23	NC_017215	TTCAC	2	10	31464	31473	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017215	GGGAA	2	10	32991	33000	40 %	0 %	60 %	0 %	384191443
25	NC_017215	TTTTG	2	10	34016	34025	0 %	80 %	20 %	0 %	384191444
26	NC_017215	TGAGT	2	10	34502	34511	20 %	40 %	40 %	0 %	384191445
27	NC_017215	GATGT	2	10	35061	35070	20 %	40 %	40 %	0 %	384191445
28	NC_017215	AAATC	2	10	36036	36045	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017215	TATGC	2	10	38450	38459	20 %	40 %	20 %	20 %	384191448
30	NC_017215	AAAGC	2	10	39699	39708	60 %	0 %	20 %	20 %	384191448
31	NC_017215	CATCA	2	10	40504	40513	40 %	20 %	0 %	40 %	384191449
32	NC_017215	TGCTG	2	10	41094	41103	0 %	40 %	40 %	20 %	384191450
33	NC_017215	GAGAT	2	10	43646	43655	40 %	20 %	40 %	0 %	384191451
34	NC_017215	CAAGC	2	10	44350	44359	40 %	0 %	20 %	40 %	384191452
35	NC_017215	TTCGT	2	10	44862	44871	0 %	60 %	20 %	20 %	384191453
36	NC_017215	GATCG	2	10	45792	45801	20 %	20 %	40 %	20 %	384191455
37	NC_017215	GGAAG	2	10	45952	45961	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017215	CGCCA	2	10	46460	46469	20 %	0 %	20 %	60 %	384191456
39	NC_017215	CCGAC	2	10	47694	47703	20 %	0 %	20 %	60 %	384191458
40	NC_017215	CTCGG	2	10	48412	48421	0 %	20 %	40 %	40 %	384191459
41	NC_017215	GCCAT	2	10	49112	49121	20 %	20 %	20 %	40 %	384191459
42	NC_017215	GCCCG	2	10	49989	49998	0 %	0 %	40 %	60 %	384191459
43	NC_017215	CGGTC	2	10	52572	52581	0 %	20 %	40 %	40 %	384191463
44	NC_017215	GCACG	2	10	53373	53382	20 %	0 %	40 %	40 %	384191463
45	NC_017215	ATTCA	2	10	55374	55383	40 %	40 %	0 %	20 %	384191465
46	NC_017215	TCCGC	2	10	55595	55604	0 %	20 %	20 %	60 %	384191465
47	NC_017215	TGAAT	2	10	56430	56439	40 %	40 %	20 %	0 %	384191465
48	NC_017215	GGATC	2	10	57086	57095	20 %	20 %	40 %	20 %	384191465
49	NC_017215	GGGAA	2	10	64403	64412	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017215	ATCGC	2	10	66403	66412	20 %	20 %	20 %	40 %	384191475
51	NC_017215	TGGGG	2	10	67102	67111	0 %	20 %	80 %	0 %	384191476
52	NC_017215	GGCGC	2	10	69602	69611	0 %	0 %	60 %	40 %	384191477
53	NC_017215	GCTCG	2	10	72766	72775	0 %	20 %	40 %	40 %	384191479
54	NC_017215	GCTGA	2	10	74929	74938	20 %	20 %	40 %	20 %	384191481
55	NC_017215	CATCG	2	10	76729	76738	20 %	20 %	20 %	40 %	384191481
56	NC_017215	TTGTA	2	10	77140	77149	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017215	CGGTC	2	10	79337	79346	0 %	20 %	40 %	40 %	384191483
58	NC_017215	GCACG	2	10	80138	80147	20 %	0 %	40 %	40 %	384191483
59	NC_017215	CGGTG	2	10	80728	80737	0 %	20 %	60 %	20 %	384191484
60	NC_017215	TCATT	2	10	81644	81653	20 %	60 %	0 %	20 %	384191484
61	NC_017215	CCAAA	2	10	82127	82136	60 %	0 %	0 %	40 %	384191485
62	NC_017215	CCGGG	2	10	82620	82629	0 %	0 %	60 %	40 %	384191486
63	NC_017215	CGGCT	2	10	87786	87795	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017215	CGAAC	2	10	89411	89420	40 %	0 %	20 %	40 %	384191492
65	NC_017215	GAGAA	2	10	89875	89884	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017215	GCTCG	2	10	90892	90901	0 %	20 %	40 %	40 %	384191493
67	NC_017215	ATACA	2	10	91496	91505	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017215	GGTGC	2	10	96173	96182	0 %	20 %	60 %	20 %	384191498
69	NC_017215	GTCTT	2	10	102639	102648	0 %	60 %	20 %	20 %	384191503
70	NC_017215	GCGCC	2	10	106958	106967	0 %	0 %	40 %	60 %	384191507
71	NC_017215	CGCCC	2	10	107446	107455	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
72	NC_017215	GCCGC	2	10	107914	107923	0 %	0 %	40 %	60 %	384191508
73	NC_017215	AGGAA	2	10	108709	108718	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017215	TGTTT	2	10	111463	111472	0 %	80 %	20 %	0 %	384191514
75	NC_017215	GCAAA	2	10	111891	111900	60 %	0 %	20 %	20 %	384191514
76	NC_017215	CGGCG	2	10	115061	115070	0 %	0 %	60 %	40 %	384191516
77	NC_017215	TGGCG	2	10	115085	115094	0 %	20 %	60 %	20 %	384191516
78	NC_017215	ACGGC	2	10	115177	115186	20 %	0 %	40 %	40 %	384191516
79	NC_017215	GACGA	2	10	115233	115242	40 %	0 %	40 %	20 %	384191516
80	NC_017215	CCGAG	2	10	115459	115468	20 %	0 %	40 %	40 %	384191516
81	NC_017215	CGATT	2	10	115694	115703	20 %	40 %	20 %	20 %	384191516
82	NC_017215	ACCTG	2	10	116915	116924	20 %	20 %	20 %	40 %	384191517
83	NC_017215	GCCCG	2	10	117622	117631	0 %	0 %	40 %	60 %	384191517
84	NC_017215	AGTCG	2	10	117970	117979	20 %	20 %	40 %	20 %	384191517
85	NC_017215	GTGCG	2	10	118998	119007	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017215	TGGTG	2	10	121865	121874	0 %	40 %	60 %	0 %	384191520
87	NC_017215	GTTCG	2	10	123981	123990	0 %	40 %	40 %	20 %	384191522
88	NC_017215	TCGAA	2	10	125612	125621	40 %	20 %	20 %	20 %	384191523
89	NC_017215	AGGTG	2	10	125722	125731	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017215	TGGCA	2	10	128098	128107	20 %	20 %	40 %	20 %	384191528
91	NC_017215	GCCGA	2	10	128137	128146	20 %	0 %	40 %	40 %	384191528
92	NC_017215	TCGCG	2	10	129037	129046	0 %	20 %	40 %	40 %	384191529
93	NC_017215	GCGCC	2	10	133405	133414	0 %	0 %	40 %	60 %	384191533
94	NC_017215	TGGGT	2	10	134525	134534	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017215	CGCAT	2	10	135245	135254	20 %	20 %	20 %	40 %	384191536
96	NC_017215	TGGAT	2	10	136789	136798	20 %	40 %	40 %	0 %	384191537
97	NC_017215	TGAGG	2	10	138055	138064	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017215	TGCTC	2	10	139199	139208	0 %	40 %	20 %	40 %	384191540
99	NC_017215	CGGCT	2	10	141058	141067	0 %	20 %	40 %	40 %	384191542
100	NC_017215	TCTCA	2	10	144035	144044	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017215	ATCTC	2	10	146948	146957	20 %	40 %	0 %	40 %	384191547
102	NC_017215	CTCGC	2	10	147213	147222	0 %	20 %	20 %	60 %	384191547
103	NC_017215	AACAG	2	10	147367	147376	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017215	CAAGA	2	10	147654	147663	60 %	0 %	20 %	20 %	384191548
105	NC_017215	GACAA	2	10	149878	149887	60 %	0 %	20 %	20 %	384191550
106	NC_017215	CCCGA	2	10	150055	150064	20 %	0 %	20 %	60 %	384191550
107	NC_017215	ATGAG	2	10	151772	151781	40 %	20 %	40 %	0 %	384191552
108	NC_017215	CGACG	2	10	152534	152543	20 %	0 %	40 %	40 %	384191553
109	NC_017215	GCACC	2	10	155968	155977	20 %	0 %	20 %	60 %	384191555
110	NC_017215	GCTCG	2	10	156873	156882	0 %	20 %	40 %	40 %	384191556
111	NC_017215	CGGCA	2	10	157533	157542	20 %	0 %	40 %	40 %	384191556
112	NC_017215	CGACC	2	10	158602	158611	20 %	0 %	20 %	60 %	384191558
113	NC_017215	GCTCG	2	10	158922	158931	0 %	20 %	40 %	40 %	384191559
114	NC_017215	TCCCG	2	10	160055	160064	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_017215	CACCG	2	10	161616	161625	20 %	0 %	20 %	60 %	384191561
116	NC_017215	TGGCA	2	10	162258	162267	20 %	20 %	40 %	20 %	384191561
117	NC_017215	GCGAA	2	10	163892	163901	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017215	AGTGT	2	10	164389	164398	20 %	40 %	40 %	0 %	384191565
119	NC_017215	GCGCC	2	10	164859	164868	0 %	0 %	40 %	60 %	384191566
120	NC_017215	CCGCG	2	10	165543	165552	0 %	0 %	40 %	60 %	384191566
121	NC_017215	CGGCG	2	10	166550	166559	0 %	0 %	60 %	40 %	384191567
122	NC_017215	GTGCG	2	10	167687	167696	0 %	20 %	60 %	20 %	384191568
123	NC_017215	GGAGG	2	10	171917	171926	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017215	TGCCG	2	10	174271	174280	0 %	20 %	40 %	40 %	384191572
125	NC_017215	TGCCC	2	10	177041	177050	0 %	20 %	20 %	60 %	384191575
126	NC_017215	CTCAT	2	10	177644	177653	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017215	TGCGC	2	10	178053	178062	0 %	20 %	40 %	40 %	384191577
128	NC_017215	GCGTG	2	10	178666	178675	0 %	20 %	60 %	20 %	384191578
129	NC_017215	CCACG	2	10	179572	179581	20 %	0 %	20 %	60 %	384191578
130	NC_017215	TGAGG	2	10	180070	180079	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017215	GCACC	2	10	181814	181823	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_017215	CTCGC	2	10	184353	184362	0 %	20 %	20 %	60 %	384191584
133	NC_017215	CGCCA	2	10	185961	185970	20 %	0 %	20 %	60 %	384191585
134	NC_017215	CGTGG	2	10	186652	186661	0 %	20 %	60 %	20 %	384191585
135	NC_017215	TCGCC	2	10	188693	188702	0 %	20 %	20 %	60 %	384191586
136	NC_017215	GTTCT	2	10	191430	191439	0 %	60 %	20 %	20 %	384191588
137	NC_017215	CAGCG	2	10	193041	193050	20 %	0 %	40 %	40 %	384191590
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177	NC_017215	CTCGA	2	10	238151	238160	20 %	20 %	20 %	40 %	384191626
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259	NC_017215	CGGCG	2	10	341225	341234	0 %	0 %	60 %	40 %	384191703
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262	NC_017215	GCGCA	2	10	348179	348188	20 %	0 %	40 %	40 %	384191711
263	NC_017215	ATGAG	2	10	348936	348945	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017215	CTGGG	2	10	348962	348971	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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399	NC_017215	CGACC	2	10	525243	525252	20 %	0 %	20 %	60 %	384191869
400	NC_017215	ATGGC	2	10	525731	525740	20 %	20 %	40 %	20 %	384191870
401	NC_017215	GGAAG	2	10	527089	527098	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
402	NC_017215	ATGCG	2	10	528881	528890	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
403	NC_017215	GGTCA	2	10	529377	529386	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
404	NC_017215	GCGCC	2	10	530070	530079	0 %	0 %	40 %	60 %	384191872
405	NC_017215	CCGCG	2	10	534461	534470	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
406	NC_017215	GACCC	2	10	536149	536158	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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408	NC_017215	TGGCA	2	10	537683	537692	20 %	20 %	40 %	20 %	384191877
409	NC_017215	GCATC	2	10	540530	540539	20 %	20 %	20 %	40 %	384191880
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411	NC_017215	GCAAT	2	10	544061	544070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
412	NC_017215	TCGTC	2	10	544625	544634	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
413	NC_017215	CATGC	2	10	544655	544664	20 %	20 %	20 %	40 %	384191885
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421	NC_017215	GCGTC	2	10	551065	551074	0 %	20 %	40 %	40 %	384191892
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433	NC_017215	GTCGT	2	10	572112	572121	0 %	40 %	40 %	20 %	384191910
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498	NC_017215	GGGGA	2	10	664139	664148	20 %	0 %	80 %	0 %	384191990
499	NC_017215	GCACA	2	10	664490	664499	40 %	0 %	20 %	40 %	384191991
500	NC_017215	CTCGA	2	10	665558	665567	20 %	20 %	20 %	40 %	384191992

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