MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 chromosome

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017215	TCTGT	2	10	21413	21422	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017215	GCCGT	2	10	26096	26105	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017215	AGAGA	2	10	28192	28201	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017215	CGGTT	2	10	28241	28250	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017215	TTCAC	2	10	31464	31473	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017215	AAATC	2	10	36036	36045	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017215	GGAAG	2	10	45952	45961	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017215	GGGAA	2	10	64403	64412	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017215	TTGTA	2	10	77140	77149	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017215	CGGCT	2	10	87786	87795	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017215	GAGAA	2	10	89875	89884	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017215	ATACA	2	10	91496	91505	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017215	CGCCC	2	10	107446	107455	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14	NC_017215	AGGAA	2	10	108709	108718	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017215	GTGCG	2	10	118998	119007	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017215	AGGTG	2	10	125722	125731	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017215	TGGGT	2	10	134525	134534	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017215	TGAGG	2	10	138055	138064	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017215	TCTCA	2	10	144035	144044	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017215	AACAG	2	10	147367	147376	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017215	TCCCG	2	10	160055	160064	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017215	GCGAA	2	10	163892	163901	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017215	GGAGG	2	10	171917	171926	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017215	CTCAT	2	10	177644	177653	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017215	TGAGG	2	10	180070	180079	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017215	GCACC	2	10	181814	181823	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017215	GCGCC	2	10	200571	200580	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_017215	GAAGT	2	10	200617	200626	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017215	ACGAG	2	10	209797	209806	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017215	GTGAG	2	10	216477	216486	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017215	CAGCA	2	10	229283	229292	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017215	CAATA	2	10	249310	249319	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017215	TGCGT	2	10	251887	251896	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017215	CGTTG	2	10	254352	254361	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017215	GTTGG	2	10	258550	258559	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017215	TGCCG	2	10	259975	259984	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017215	GGCTG	2	10	268927	268936	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017215	AGTGT	2	10	275080	275089	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017215	AGGAG	2	10	291608	291617	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017215	CGTTC	2	10	297808	297817	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017215	AGCGT	2	10	302597	302606	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017215	AGAGA	2	10	337248	337257	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017215	ATGAG	2	10	348936	348945	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017215	CTGGG	2	10	348962	348971	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017215	AGTGT	2	10	368218	368227	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017215	ACGGC	2	10	411000	411009	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017215	TTCGC	2	10	419269	419278	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017215	CCCGC	2	10	419425	419434	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
49	NC_017215	TGGGG	2	10	420764	420773	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017215	CTGTC	2	10	431151	431160	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017215	AGCAA	2	10	480204	480213	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017215	CGTTG	2	10	497048	497057	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017215	CGAAT	2	10	498876	498885	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017215	GGAAG	2	10	527089	527098	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017215	ATGCG	2	10	528881	528890	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017215	GGTCA	2	10	529377	529386	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017215	CCGCG	2	10	534461	534470	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_017215	GACCC	2	10	536149	536158	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_017215	GCAAT	2	10	544061	544070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017215	TCGTC	2	10	544625	544634	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017215	TCGAT	2	10	545543	545552	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017215	AAGAG	2	10	549660	549669	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017215	CCGCA	2	10	602600	602609	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_017215	GGCTG	2	10	610626	610635	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017215	ATGAC	2	10	614392	614401	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017215	AGCGT	2	10	630542	630551	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017215	CGGGG	2	10	642754	642763	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017215	CTGCA	2	10	653674	653683	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017215	AAATG	2	10	655305	655314	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017215	GGAGT	2	10	655510	655519	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017215	GCCAT	2	10	657255	657264	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017215	AATGG	2	10	666676	666685	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017215	GGCAA	2	10	673740	673749	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017215	TGGCA	2	10	680757	680766	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017215	TCAAC	2	10	711848	711857	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017215	CCAAC	2	10	721964	721973	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
77	NC_017215	TGGGC	2	10	724642	724651	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017215	CAGAG	2	10	726191	726200	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017215	CGAGG	2	10	726248	726257	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017215	CACAA	2	10	729913	729922	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017215	TGGAA	2	10	752570	752579	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017215	CTGTT	2	10	768864	768873	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017215	TGCGT	2	10	770779	770788	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017215	GTTCC	2	10	772902	772911	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017215	GCATC	2	10	789009	789018	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017215	CCCGT	2	10	808848	808857	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_017215	TGGTC	2	10	833317	833326	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017215	TCGCA	2	10	838463	838472	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017215	GATTC	2	10	867494	867503	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017215	CATGG	2	10	881213	881222	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017215	CATGG	2	10	881334	881343	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017215	AACAC	2	10	892216	892225	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017215	CTAAA	2	10	894759	894768	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017215	TGTCA	2	10	929887	929896	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017215	TTTTC	2	10	935423	935432	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017215	GTTCA	2	10	956403	956412	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017215	TCCCC	2	10	967363	967372	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_017215	GAAGC	2	10	1002512	1002521	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017215	ATGCA	2	10	1002893	1002902	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017215	CTTCG	2	10	1022036	1022045	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017215	TCTTT	2	10	1032044	1032053	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017215	ACACG	2	10	1047035	1047044	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017215	CCTAA	2	10	1056521	1056530	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017215	ATTGG	2	10	1090459	1090468	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017215	ATCGT	2	10	1113777	1113786	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017215	ACGTG	2	10	1122070	1122079	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017215	CACGT	2	10	1122090	1122099	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_017215	AGGTG	2	10	1197557	1197566	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017215	TGGGG	2	10	1197569	1197578	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017215	AGACA	2	10	1202707	1202716	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017215	GCTCC	2	10	1204339	1204348	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_017215	GTTCT	2	10	1237588	1237597	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017215	GGGGC	2	10	1239968	1239977	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017215	GCCCC	2	10	1239984	1239993	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
115	NC_017215	CACAA	2	10	1242551	1242560	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017215	AACCG	2	10	1249393	1249402	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017215	AGATG	2	10	1321612	1321621	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017215	TCGCC	2	10	1327739	1327748	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_017215	TCAAA	2	10	1330607	1330616	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017215	GGTTC	2	10	1348530	1348539	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017215	ACACT	2	10	1351968	1351977	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017215	TTCCA	2	10	1361737	1361746	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017215	CCGCG	2	10	1367138	1367147	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_017215	CCGGT	2	10	1375538	1375547	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_017215	AATCG	2	10	1381395	1381404	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017215	TCGAG	2	10	1381481	1381490	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017215	AAGCG	2	10	1412788	1412797	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017215	GTGCA	2	10	1413089	1413098	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017215	TGCGC	2	10	1413577	1413586	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017215	TCTCC	2	10	1438462	1438471	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_017215	CAGAT	2	10	1463086	1463095	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017215	TTTGC	2	10	1475727	1475736	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017215	GGGGC	2	10	1477649	1477658	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017215	CTCCC	2	10	1478747	1478756	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
135	NC_017215	ACCCC	2	10	1479457	1479466	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
136	NC_017215	CACAC	2	10	1479633	1479642	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
137	NC_017215	CACGA	2	10	1480226	1480235	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017215	CCCAT	2	10	1481066	1481075	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_017215	CCCAC	2	10	1481091	1481100	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
140	NC_017215	GGAGC	2	10	1481109	1481118	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017215	ACCCC	2	10	1481647	1481656	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
142	NC_017215	GATCA	2	10	1506676	1506685	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017215	GATGA	2	10	1532937	1532946	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017215	TGCGC	2	10	1588297	1588306	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017215	TCTAT	2	10	1596812	1596821	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017215	AATGC	2	10	1598977	1598986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017215	TTTCA	2	10	1607972	1607981	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017215	TCAGC	2	10	1630096	1630105	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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150	NC_017215	ATACT	2	10	1645490	1645499	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017215	CAGCT	2	10	1704162	1704171	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_017215	ATGAG	2	10	1765497	1765506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017215	GGGGC	2	10	1772383	1772392	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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160	NC_017215	CCCAC	2	10	1775825	1775834	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
161	NC_017215	GGAGC	2	10	1775843	1775852	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
162	NC_017215	CATAT	2	10	1779119	1779128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_017215	TTGTA	2	10	1788232	1788241	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017215	TCATA	2	10	1790078	1790087	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_017215	CGTGT	2	10	1790098	1790107	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
166	NC_017215	CCGCA	2	10	1810898	1810907	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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168	NC_017215	GCAGG	2	10	1822119	1822128	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_017215	CCATG	2	10	1854704	1854713	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
172	NC_017215	TCGTG	2	10	1857804	1857813	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_017215	CGGCC	2	10	1863175	1863184	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
174	NC_017215	GGGGC	2	10	1868559	1868568	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
175	NC_017215	CTCCC	2	10	1869657	1869666	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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179	NC_017215	CCCAT	2	10	1871976	1871985	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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181	NC_017215	GGAGC	2	10	1872019	1872028	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
182	NC_017215	ACCCC	2	10	1872557	1872566	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
183	NC_017215	GGGGC	2	10	1877268	1877277	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
184	NC_017215	CTCCC	2	10	1878366	1878375	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
185	NC_017215	ACCCC	2	10	1879076	1879085	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
186	NC_017215	CACAC	2	10	1879252	1879261	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
187	NC_017215	CACGA	2	10	1879845	1879854	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
188	NC_017215	CCCAT	2	10	1880685	1880694	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
189	NC_017215	CCCAC	2	10	1880710	1880719	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
190	NC_017215	GGAGC	2	10	1880728	1880737	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
191	NC_017215	ACCCC	2	10	1881266	1881275	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
192	NC_017215	ACACC	2	10	1881336	1881345	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
193	NC_017215	GCGCC	2	10	1883080	1883089	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
194	NC_017215	CGCAG	2	10	1895611	1895620	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
195	NC_017215	TGCCA	2	10	1902543	1902552	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
196	NC_017215	CTGCA	2	10	1905337	1905346	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
197	NC_017215	TGTGT	2	10	1916073	1916082	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017215	AAGGA	2	10	1920011	1920020	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017215	CCGAG	2	10	1921174	1921183	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
200	NC_017215	CGCAC	2	10	1940285	1940294	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
201	NC_017215	CACCG	2	10	1940341	1940350	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.