MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT8252

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017211	GAAA	2	8	227	234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017211	AGTA	2	8	248	255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017211	AAGA	2	8	295	302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017211	AATA	2	8	1189	1196	75 %	25 %	0 %	0 %	384183667
5	NC_017211	TTTG	2	8	1204	1211	0 %	75 %	25 %	0 %	384183667
6	NC_017211	GTTA	2	8	1323	1330	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017211	TTCT	2	8	1451	1458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017211	TTTA	2	8	1704	1711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017211	AATA	2	8	1742	1749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017211	TGAA	2	8	1780	1787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017211	GTAT	2	8	1919	1926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017211	TGTT	2	8	2332	2339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017211	GAAT	2	8	2747	2754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017211	ATAC	2	8	3073	3080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017211	CGGA	2	8	3100	3107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017211	AAAG	2	8	3501	3508	75 %	0 %	25 %	0 %	384183669
17	NC_017211	GAAC	2	8	3534	3541	50 %	0 %	25 %	25 %	384183669
18	NC_017211	TGTT	2	8	3743	3750	0 %	75 %	25 %	0 %	384183669
19	NC_017211	GAAA	2	8	3932	3939	75 %	0 %	25 %	0 %	384183669
20	NC_017211	AGAA	2	8	4048	4055	75 %	0 %	25 %	0 %	384183669
21	NC_017211	ATAG	2	8	4056	4063	50 %	25 %	25 %	0 %	384183669
22	NC_017211	GATT	2	8	4163	4170	25 %	50 %	25 %	0 %	384183669
23	NC_017211	GAAG	2	8	4346	4353	50 %	0 %	50 %	0 %	384183669
24	NC_017211	ATGA	2	8	4831	4838	50 %	25 %	25 %	0 %	384183670
25	NC_017211	GTTT	2	8	5058	5065	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017211	TTTG	2	8	5272	5279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017211	TGTT	2	8	5368	5375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017211	TGTT	2	8	5925	5932	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017211	TTGT	2	8	5933	5940	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017211	TGTT	2	8	5979	5986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017211	TTAG	2	8	6017	6024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017211	CTTG	2	8	6134	6141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017211	AAAG	2	8	6160	6167	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017211	ATGA	2	8	6290	6297	50 %	25 %	25 %	0 %	384183672
35	NC_017211	AATT	2	8	6540	6547	50 %	50 %	0 %	0 %	384183672
36	NC_017211	GTTT	2	8	6639	6646	0 %	75 %	25 %	0 %	384183672
37	NC_017211	TGAG	2	8	7297	7304	25 %	25 %	50 %	0 %	384183673
38	NC_017211	AAAG	2	8	7493	7500	75 %	0 %	25 %	0 %	384183673
39	NC_017211	TTTA	2	8	8008	8015	25 %	75 %	0 %	0 %	384183673
40	NC_017211	AATT	2	8	8032	8039	50 %	50 %	0 %	0 %	384183673
41	NC_017211	TGAT	2	8	8227	8234	25 %	50 %	25 %	0 %	384183673

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.