MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT8252

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017211	TTA	2	6	561	566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183666
2	NC_017211	TTA	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183667
3	NC_017211	AGT	2	6	1959	1964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183668
4	NC_017211	GTC	2	6	2079	2084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183668
5	NC_017211	GAT	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183668
6	NC_017211	AAT	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183668
7	NC_017211	ATT	2	6	3525	3530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183669
8	NC_017211	AAT	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183669
9	NC_017211	TGT	2	6	3653	3658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183669
10	NC_017211	TTG	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183669
11	NC_017211	CAA	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183669
12	NC_017211	AGA	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183669
13	NC_017211	TCT	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183669
14	NC_017211	GAT	2	6	4275	4280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183669
15	NC_017211	GAT	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183669
16	NC_017211	TGA	3	9	4499	4507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183669
17	NC_017211	GAA	2	6	4551	4556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183669
18	NC_017211	CAA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183669
19	NC_017211	GAA	2	6	4582	4587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183669
20	NC_017211	ATT	2	6	4635	4640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183670
21	NC_017211	ATT	2	6	4661	4666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183670
22	NC_017211	AAT	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183670
23	NC_017211	TGA	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183670
24	NC_017211	GAT	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183670
25	NC_017211	AAT	2	6	4934	4939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183670
26	NC_017211	TTC	2	6	5672	5677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183671
27	NC_017211	AGT	2	6	5720	5725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183671
28	NC_017211	TTG	2	6	6345	6350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183672
29	NC_017211	AAG	2	6	6360	6365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183672
30	NC_017211	GAA	2	6	6455	6460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183672
31	NC_017211	GAA	2	6	6586	6591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183672
32	NC_017211	TGA	2	6	6706	6711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183672
33	NC_017211	GTT	2	6	6827	6832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183672
34	NC_017211	GTA	2	6	7330	7335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183673
35	NC_017211	GAT	2	6	7466	7471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183673
36	NC_017211	GAC	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183673
37	NC_017211	TAA	2	6	7583	7588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183673
38	NC_017211	ATT	2	6	7589	7594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183673
39	NC_017211	GAA	2	6	7677	7682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183673
40	NC_017211	AAT	2	6	7692	7697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183673
41	NC_017211	ATT	2	6	7807	7812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183673
42	NC_017211	AAG	2	6	7840	7845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183673
43	NC_017211	TGG	2	6	8045	8050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183673
44	NC_017211	TAT	3	9	8124	8132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183673

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.