MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT14

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017209	AGCA	2	8	862	869	50 %	0 %	25 %	25 %	384183636
2	NC_017209	ACAA	2	8	1373	1380	75 %	0 %	0 %	25 %	384183636
3	NC_017209	TCCC	2	8	1539	1546	0 %	25 %	0 %	75 %	384183637
4	NC_017209	TCTT	2	8	1801	1808	0 %	75 %	0 %	25 %	384183637
5	NC_017209	TTGT	2	8	1929	1936	0 %	75 %	25 %	0 %	384183637
6	NC_017209	TCCT	2	8	2825	2832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017209	TAAT	2	8	3098	3105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017209	CAAA	2	8	3161	3168	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017209	AATA	2	8	3324	3331	75 %	25 %	0 %	0 %	384183639
10	NC_017209	TCAT	2	8	3538	3545	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017209	TATC	2	8	3834	3841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017209	CATT	3	12	3874	3885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017209	CATT	2	8	3888	3895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017209	CATT	2	8	4232	4239	25 %	50 %	0 %	25 %	384183640
15	NC_017209	CTTC	2	8	4375	4382	0 %	50 %	0 %	50 %	384183641
16	NC_017209	ACTA	2	8	4530	4537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017209	TAAA	2	8	4538	4545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017209	AATT	2	8	4835	4842	50 %	50 %	0 %	0 %	384183642
19	NC_017209	TAAA	2	8	4859	4866	75 %	25 %	0 %	0 %	384183642
20	NC_017209	CTTT	2	8	5365	5372	0 %	75 %	0 %	25 %	384183642
21	NC_017209	CATA	2	8	5836	5843	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017209	AAAG	2	8	5882	5889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017209	AAAT	2	8	5966	5973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017209	AAAT	2	8	6902	6909	75 %	25 %	0 %	0 %	384183643
25	NC_017209	CATT	2	8	6916	6923	25 %	50 %	0 %	25 %	384183643
26	NC_017209	ACCA	2	8	7028	7035	50 %	0 %	0 %	50 %	384183643
27	NC_017209	ACAA	2	8	7576	7583	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017209	TCTT	2	8	7634	7641	0 %	75 %	0 %	25 %	384183644
29	NC_017209	AAAC	2	8	7950	7957	75 %	0 %	0 %	25 %	384183645
30	NC_017209	TAAA	2	8	8598	8605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017209	ATAC	2	8	8756	8763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017209	CATA	2	8	8793	8800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017209	TAAC	2	8	8857	8864	50 %	25 %	0 %	25 %	384183647
34	NC_017209	ATAA	2	8	8935	8942	75 %	25 %	0 %	0 %	384183647
35	NC_017209	ATAC	2	8	9453	9460	50 %	25 %	0 %	25 %	384183648
36	NC_017209	CTAT	2	8	9673	9680	25 %	50 %	0 %	25 %	384183649
37	NC_017209	CTAT	2	8	9929	9936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017209	TTTC	2	8	10151	10158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017209	GAAG	2	8	10226	10233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017209	AATG	2	8	10284	10291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017209	TTAT	2	8	10589	10596	25 %	75 %	0 %	0 %	384183650
42	NC_017209	CCTT	2	8	10652	10659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017209	CAAA	2	8	11251	11258	75 %	0 %	0 %	25 %	384183651
44	NC_017209	TAGC	2	8	11698	11705	25 %	25 %	25 %	25 %	384183653
45	NC_017209	CGTT	2	8	12068	12075	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017209	TAAT	2	8	12150	12157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017209	AAAC	2	8	12237	12244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017209	TTGC	2	8	12443	12450	0 %	50 %	25 %	25 %	384183654
49	NC_017209	AAAC	2	8	12503	12510	75 %	0 %	0 %	25 %	384183655
50	NC_017209	AACA	2	8	12532	12539	75 %	0 %	0 %	25 %	384183655
51	NC_017209	CCAA	2	8	12686	12693	50 %	0 %	0 %	50 %	384183655
52	NC_017209	CATT	2	8	12724	12731	25 %	50 %	0 %	25 %	384183655
53	NC_017209	AACA	2	8	12769	12776	75 %	0 %	0 %	25 %	384183656
54	NC_017209	GTAA	2	8	12815	12822	50 %	25 %	25 %	0 %	384183656
55	NC_017209	TTAT	2	8	13911	13918	25 %	75 %	0 %	0 %	384183657
56	NC_017209	GTTT	2	8	14400	14407	0 %	75 %	25 %	0 %	384183657
57	NC_017209	ACAA	2	8	14744	14751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.