MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 chromosome

Total Repeats: 2143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017208	TCTTTG	2	12	3537	3548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384184092
2	NC_017208	AACAAA	2	12	4471	4482	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384184093
3	NC_017208	TGGCGG	2	12	4793	4804	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384184093
4	NC_017208	AAGTTG	2	12	5236	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184093
5	NC_017208	CAAGCG	2	12	7738	7749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384184094
6	NC_017208	TGAAGA	2	12	7965	7976	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384184094
7	NC_017208	TGGTGT	2	12	16297	16308	0 %	50 %	50 %	0 %	384184096
8	NC_017208	GGCAAT	2	12	17300	17311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384184097
9	NC_017208	ACTGGA	2	12	17632	17643	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384184097
10	NC_017208	AAAGAT	2	12	17910	17921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384184097
11	NC_017208	CAGGAA	2	12	18857	18868	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384184098
12	NC_017208	ACAGGA	2	12	20839	20850	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384184100
13	NC_017208	CAAGAT	2	12	24427	24438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384184105
14	NC_017208	CGTATA	2	12	35569	35580	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384184112
15	NC_017208	AGCTTT	2	12	37073	37084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384184114
16	NC_017208	AAATGA	2	12	37660	37671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384184115
17	NC_017208	TGTAGA	2	12	37765	37776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184115
18	NC_017208	TTGAAA	2	12	39890	39901	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384184119
19	NC_017208	GCACGT	2	12	52222	52233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384184132
20	NC_017208	AAGCAA	2	12	54698	54709	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384184136
21	NC_017208	ATTAAC	2	12	56614	56625	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384184136
22	NC_017208	TGCATA	2	12	57088	57099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384184136
23	NC_017208	TTTAGG	2	12	60361	60372	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384184139
24	NC_017208	TATTGA	2	12	66216	66227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384184145
25	NC_017208	CAGGTA	2	12	69980	69991	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384184148
26	NC_017208	TGTCGG	2	12	70074	70085	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384184148
27	NC_017208	AGCGTT	2	12	72331	72342	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384184150
28	NC_017208	AAAGTA	2	12	72980	72991	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384184150
29	NC_017208	CTGGTG	2	12	73838	73849	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384184151
30	NC_017208	GCAGAA	2	12	74908	74919	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384184152
31	NC_017208	AAGGTG	2	12	77452	77463	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384184155
32	NC_017208	CGGTTA	2	12	79591	79602	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384184159
33	NC_017208	ATATCA	2	12	80331	80342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384184160
34	NC_017208	TAGAAA	2	12	89689	89700	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384184162
35	NC_017208	GTGAAG	2	12	98957	98968	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384184166
36	NC_017208	TTTAAT	2	12	104049	104060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184169
37	NC_017208	GCAGAA	2	12	104236	104247	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384184169
38	NC_017208	CAGATG	2	12	105785	105796	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384184171
39	NC_017208	CAAGAT	2	12	107316	107327	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384184172
40	NC_017208	GTAGAA	2	12	113326	113337	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384184181
41	NC_017208	TCTGGT	2	12	114156	114167	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384184182
42	NC_017208	GAAGCT	2	12	114755	114766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384184183
43	NC_017208	CTGTAG	2	12	116099	116110	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384184185
44	NC_017208	ATGCGA	2	12	124189	124200	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384184188
45	NC_017208	GCAAGA	2	12	126268	126279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384184192
46	NC_017208	AGTAGA	2	12	126373	126384	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384184192
47	NC_017208	AGCGTG	2	12	127146	127157	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384184192
48	NC_017208	AAGTTG	2	12	127920	127931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184192
49	NC_017208	GCTAAA	2	12	128306	128317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384184193
50	NC_017208	GAAACT	2	12	128513	128524	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384184193
51	NC_017208	CAAGCT	2	12	129107	129118	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384184193
52	NC_017208	AACTGA	2	12	130353	130364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384184196
53	NC_017208	TAAAGG	2	12	130575	130586	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384184196
54	NC_017208	GAAATC	2	12	131779	131790	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384184198
55	NC_017208	ACAAGC	2	12	134128	134139	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384184203
56	NC_017208	TTGAAG	2	12	137306	137317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184211
57	NC_017208	AAAGGT	2	12	137416	137427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384184211
58	NC_017208	TAGTTG	2	12	138005	138016	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384184213
59	NC_017208	CTGAAA	2	12	140546	140557	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384184217
60	NC_017208	TAAACA	2	12	142233	142244	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384184220
61	NC_017208	TTAGGT	2	12	144154	144165	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384184223
62	NC_017208	ATTTTT	2	12	146506	146517	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384184227
63	NC_017208	ATATCC	2	12	147573	147584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384184228
64	NC_017208	TGCAGT	2	12	150610	150621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384184233
65	NC_017208	TTAGAT	2	12	162501	162512	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384184239
66	NC_017208	AGCAAA	2	12	164045	164056	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384184241
67	NC_017208	AAGAAA	2	12	165149	165160	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384184242
68	NC_017208	AAGATA	2	12	165191	165202	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384184242
69	NC_017208	GATGGC	2	12	165989	166000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384184243
70	NC_017208	CGCATC	2	12	167356	167367	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384184244
71	NC_017208	ATCGTA	2	12	167736	167747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384184244
72	NC_017208	AGATAA	2	12	170672	170683	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384184245
73	NC_017208	TGAAAC	2	12	173519	173530	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384184248
74	NC_017208	CAAAAT	2	12	180594	180605	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384184255
75	NC_017208	ATTTTG	2	12	187049	187060	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384184262
76	NC_017208	AAGTAA	2	12	189788	189799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384184265
77	NC_017208	CAAATT	2	12	190290	190301	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384184265
78	NC_017208	GAAAAA	2	12	191347	191358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384184266
79	NC_017208	GTGGTT	2	12	193434	193445	0 %	50 %	50 %	0 %	384184269
80	NC_017208	AAGTTA	2	12	197145	197156	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384184271
81	NC_017208	TCTGGA	2	12	197157	197168	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384184271
82	NC_017208	TTCTTT	2	12	202124	202135	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384184277
83	NC_017208	ATTTAT	2	12	205307	205318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184280
84	NC_017208	TATGAA	2	12	210246	210257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384184285
85	NC_017208	CTAATA	2	12	213386	213397	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384184288
86	NC_017208	TATATT	2	12	213984	213995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184289
87	NC_017208	TTCATA	2	12	215537	215548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384184291
88	NC_017208	GGAACA	2	12	216556	216567	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384184292
89	NC_017208	GAAAGA	2	12	222993	223004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384184296
90	NC_017208	TAAATG	2	12	223670	223681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384184296
91	NC_017208	GAGAAT	2	12	224054	224065	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384184297
92	NC_017208	TTATTT	2	12	230974	230985	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384184304
93	NC_017208	CCATAT	2	12	232680	232691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384184306
94	NC_017208	AAGGTC	2	12	237780	237791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384184309
95	NC_017208	TAAAGA	2	12	238423	238434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384184310
96	NC_017208	AAAACA	2	12	240456	240467	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384184313
97	NC_017208	GTAAGT	2	12	240861	240872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184313
98	NC_017208	AGCTGA	2	12	254162	254173	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384184321
99	NC_017208	AGCGGT	2	12	254712	254723	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384184323
100	NC_017208	GTAATC	2	12	256505	256516	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384184324
101	NC_017208	GGATAT	2	12	258467	258478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384184325
102	NC_017208	GGCATG	2	12	262194	262205	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384184329
103	NC_017208	TTGCGA	2	12	270648	270659	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384184336
104	NC_017208	TTAAAA	2	12	285489	285500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384184341
105	NC_017208	TTATAT	2	12	290588	290599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384184346
106	NC_017208	AAACAA	2	12	290754	290765	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384184346
107	NC_017208	CATTTT	2	12	291826	291837	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384184348
108	NC_017208	TTTGCA	2	12	291876	291887	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384184348
109	NC_017208	GTAATC	2	12	292710	292721	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384184348
110	NC_017208	TTTATT	2	12	306576	306587	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384184351
111	NC_017208	TGTACG	2	12	313339	313350	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384184358
112	NC_017208	TTATGA	2	12	315576	315587	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384184359
113	NC_017208	ATCTTT	2	12	322708	322719	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384184366
114	NC_017208	GCAGGT	2	12	325408	325419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384184370
115	NC_017208	CAGAAG	2	12	325562	325573	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384184370
116	NC_017208	GACAAC	2	12	327333	327344	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384184370
117	NC_017208	AGGTGA	2	12	327474	327485	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384184370
118	NC_017208	CAAATC	2	12	328333	328344	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384184371
119	NC_017208	TTTATT	2	12	331608	331619	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384184373
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121	NC_017208	TTGCAA	2	12	333129	333140	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384184374
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124	NC_017208	TTGCTG	2	12	339209	339220	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384184380
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134	NC_017208	CAGCTG	2	12	374841	374852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384184414
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228	NC_017208	CTTTTG	2	12	589506	589517	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384184598
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