MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT8513

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017207	TAT	2	6	5	10	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017207	GAC	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017207	CAC	2	6	376	381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017207	TGA	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017207	AGT	2	6	712	717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017207	TTG	2	6	816	821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017207	TAG	2	6	850	855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017207	GTG	2	6	919	924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017207	ATG	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017207	CGG	2	6	1222	1227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017207	ATT	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183625
12	NC_017207	TGT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183625
13	NC_017207	TTG	2	6	1564	1569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183625
14	NC_017207	TGA	2	6	1708	1713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183625
15	NC_017207	GTG	2	6	1863	1868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183625
16	NC_017207	ACA	2	6	1921	1926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183625
17	NC_017207	AGA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183625
18	NC_017207	GTC	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183625
19	NC_017207	AGA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183625
20	NC_017207	TGA	3	9	2404	2412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183625
21	NC_017207	GAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183625
22	NC_017207	CAA	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183625
23	NC_017207	GAG	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017207	AGA	2	6	3082	3087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
25	NC_017207	AGA	3	9	3163	3171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
26	NC_017207	GGA	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183626
27	NC_017207	GAT	2	6	3260	3265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183626
28	NC_017207	GAC	2	6	3314	3319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183626
29	NC_017207	TAA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183626
30	NC_017207	TCA	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183626
31	NC_017207	GAA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
32	NC_017207	AAC	2	6	3483	3488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183626
33	NC_017207	ATT	2	6	3598	3603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183626
34	NC_017207	AAG	2	6	3631	3636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
35	NC_017207	AAG	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
36	NC_017207	GTC	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183626
37	NC_017207	ATT	2	6	3842	3847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183626
38	NC_017207	ATT	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183626
39	NC_017207	TAT	3	9	4071	4079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183627
40	NC_017207	ATT	2	6	4185	4190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183627
41	NC_017207	TAA	2	6	4292	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017207	GCA	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017207	CTA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017207	GAT	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183628
45	NC_017207	TTG	2	6	4884	4889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017207	ATG	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017207	TTA	2	6	5193	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183629
48	NC_017207	ATA	2	6	5502	5507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017207	ATT	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017207	GTA	2	6	5659	5664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017207	ATA	2	6	5702	5707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183630
52	NC_017207	TAA	2	6	5751	5756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183630
53	NC_017207	TCT	2	6	5779	5784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183630
54	NC_017207	GAT	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183630
55	NC_017207	AAT	2	6	5876	5881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183630
56	NC_017207	ATG	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017207	TAG	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183631
58	NC_017207	TGA	2	6	6145	6150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017207	ATT	2	6	6387	6392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
60	NC_017207	ATT	2	6	6427	6432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
61	NC_017207	AAC	2	6	6472	6477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183632
62	NC_017207	AGA	3	9	6480	6488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
63	NC_017207	TAT	2	6	6505	6510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
64	NC_017207	TAT	2	6	6622	6627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
65	NC_017207	AGA	2	6	6711	6716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
66	NC_017207	TGA	2	6	6723	6728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183632
67	NC_017207	TAT	2	6	6769	6774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
68	NC_017207	TCA	2	6	6780	6785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183632
69	NC_017207	TTA	2	6	6790	6795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
70	NC_017207	AGA	2	6	6921	6926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
71	NC_017207	TAA	2	6	6945	6950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183632
72	NC_017207	TCT	2	6	7050	7055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183632
73	NC_017207	AAG	2	6	7073	7078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
74	NC_017207	TTA	2	6	7099	7104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
75	NC_017207	GAA	2	6	7318	7323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
76	NC_017207	GAA	2	6	7342	7347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183632
77	NC_017207	TTA	2	6	7405	7410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183632
78	NC_017207	ATG	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183632
79	NC_017207	ACA	2	6	7470	7475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183633
80	NC_017207	AAT	2	6	7497	7502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183633
81	NC_017207	ATG	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183633
82	NC_017207	ATT	2	6	7539	7544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183633
83	NC_017207	CAA	2	6	7545	7550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183633
84	NC_017207	CAA	2	6	7585	7590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017207	ATT	2	6	7615	7620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017207	TAT	2	6	7653	7658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017207	AAT	2	6	7667	7672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017207	GGA	2	6	7766	7771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183634
89	NC_017207	AAT	2	6	7802	7807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183634
90	NC_017207	AAC	2	6	7829	7834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183634
91	NC_017207	ATA	2	6	7838	7843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183634
92	NC_017207	GAA	2	6	7922	7927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183634
93	NC_017207	TTG	2	6	7956	7961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183634
94	NC_017207	TAA	2	6	7972	7977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183634
95	NC_017207	ATG	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183634
96	NC_017207	ACA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183634
97	NC_017207	TGG	2	6	8134	8139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183634
98	NC_017207	AAG	2	6	8172	8177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183634
99	NC_017207	TTA	2	6	8242	8247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183634
100	NC_017207	ATT	2	6	8400	8405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017207	TAG	2	6	8419	8424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.