MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	ATTTTT	2	12	1392	1403	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384189675
2	NC_017206	TGTATA	2	12	3527	3538	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384189676
3	NC_017206	GAAAAT	2	12	8870	8881	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384189682
4	NC_017206	CAAGAG	2	12	9927	9938	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384189683
5	NC_017206	TTTATT	2	12	10150	10161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017206	AAATTT	2	12	10398	10409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017206	TATTAA	2	12	13902	13913	50 %	50 %	0 %	0 %	384189687
8	NC_017206	ATTTTC	2	12	18052	18063	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384189693
9	NC_017206	AATTTA	2	12	18635	18646	50 %	50 %	0 %	0 %	384189695
10	NC_017206	TAAACA	2	12	19410	19421	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384189697
11	NC_017206	AATTTA	2	12	20781	20792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017206	AAGAAA	2	12	24406	24417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384189703
13	NC_017206	TTGATT	2	12	27237	27248	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017206	CAGTAT	2	12	29214	29225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384189707
15	NC_017206	AAATAA	2	12	30644	30655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017206	CTAAAA	2	12	32437	32448	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017206	AATTCA	2	12	33188	33199	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384189712
18	NC_017206	TAACTA	2	12	34936	34947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017206	TCTTTT	2	12	34967	34978	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017206	TTAAAA	2	12	36856	36867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189718
21	NC_017206	AAGTTA	2	12	38040	38051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384189719
22	NC_017206	TATCTG	2	12	38274	38285	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384189719
23	NC_017206	TTAGAA	2	12	40520	40531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384189719
24	NC_017206	ATAGAT	2	12	41326	41337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017206	ACTTAT	2	12	41779	41790	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017206	ATCCCA	2	12	44575	44586	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384189725
27	NC_017206	CCATAT	2	12	48431	48442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189729
28	NC_017206	CCTAAT	2	12	52691	52702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189734
29	NC_017206	GATATT	2	12	53072	53083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384189734
30	NC_017206	TTATAT	2	12	54117	54128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189736
31	NC_017206	TATTTA	2	12	59828	59839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189743
32	NC_017206	TTTATC	2	12	59913	59924	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384189743
33	NC_017206	TCAAAT	2	12	60091	60102	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384189743
34	NC_017206	ACTTGT	2	12	60343	60354	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384189743
35	NC_017206	TTTCTT	2	12	64549	64560	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384189750
36	NC_017206	CTTCCT	2	12	66176	66187	0 %	50 %	0 %	50 %	384189752
37	NC_017206	ATGAAC	2	12	67850	67861	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384189753
38	NC_017206	TTCCAT	2	12	76614	76625	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384189763
39	NC_017206	AATCCA	2	12	77937	77948	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384189764
40	NC_017206	GGTTGT	2	12	80951	80962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017206	AATTTT	2	12	83488	83499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.