MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	TCCCT	2	10	272	281	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_017206	CAAAA	2	10	2630	2639	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017206	AAATC	2	10	3084	3093	60 %	20 %	0 %	20 %	384189676
4	NC_017206	AATTG	2	10	4018	4027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017206	TCTTA	2	10	4458	4467	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017206	GGCGG	2	10	4601	4610	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017206	TTCAT	2	10	5328	5337	20 %	60 %	0 %	20 %	384189677
8	NC_017206	AATTA	2	10	6839	6848	60 %	40 %	0 %	0 %	384189679
9	NC_017206	CACAT	2	10	7169	7178	40 %	20 %	0 %	40 %	384189680
10	NC_017206	AAAAG	2	10	7663	7672	80 %	0 %	20 %	0 %	384189680
11	NC_017206	CTTTT	2	10	13175	13184	0 %	80 %	0 %	20 %	384189685
12	NC_017206	TCCAT	2	10	13521	13530	20 %	40 %	0 %	40 %	384189686
13	NC_017206	GATCC	2	10	14424	14433	20 %	20 %	20 %	40 %	384189688
14	NC_017206	TAAAA	2	10	16449	16458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017206	TTCAA	2	10	16740	16749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017206	TTTTC	2	10	17205	17214	0 %	80 %	0 %	20 %	384189691
17	NC_017206	TTCCT	2	10	17310	17319	0 %	60 %	0 %	40 %	384189692
18	NC_017206	CCTTC	2	10	18303	18312	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_017206	AATTT	2	10	18586	18595	40 %	60 %	0 %	0 %	384189695
20	NC_017206	ATTCG	2	10	19723	19732	20 %	40 %	20 %	20 %	384189697
21	NC_017206	ATCAA	2	10	20132	20141	60 %	20 %	0 %	20 %	384189697
22	NC_017206	ATTTT	2	10	21508	21517	20 %	80 %	0 %	0 %	384189698
23	NC_017206	TTTGG	2	10	22761	22770	0 %	60 %	40 %	0 %	384189700
24	NC_017206	AATCT	2	10	24583	24592	40 %	40 %	0 %	20 %	384189703
25	NC_017206	TTTCT	2	10	25477	25486	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017206	AGATA	2	10	25651	25660	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017206	ATTTT	2	10	26643	26652	20 %	80 %	0 %	0 %	384189705
28	NC_017206	ATTTC	2	10	26877	26886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017206	TATAA	2	10	27785	27794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017206	CTTGA	2	10	28021	28030	20 %	40 %	20 %	20 %	384189706
31	NC_017206	AGATT	2	10	29989	29998	40 %	40 %	20 %	0 %	384189708
32	NC_017206	ATAAA	2	10	30064	30073	80 %	20 %	0 %	0 %	384189708
33	NC_017206	ATGAA	2	10	30200	30209	60 %	20 %	20 %	0 %	384189708
34	NC_017206	TTAAA	2	10	30621	30630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017206	CTTTT	2	10	30754	30763	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017206	GTAAT	2	10	32139	32148	40 %	40 %	20 %	0 %	384189710
37	NC_017206	TAAAA	2	10	34764	34773	80 %	20 %	0 %	0 %	384189716
38	NC_017206	ACCAT	2	10	35338	35347	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017206	GAACA	2	10	36202	36211	60 %	0 %	20 %	20 %	384189717
40	NC_017206	TTATT	2	10	37209	37218	20 %	80 %	0 %	0 %	384189718
41	NC_017206	ATTGA	2	10	38381	38390	40 %	40 %	20 %	0 %	384189719
42	NC_017206	GAAAA	2	10	38801	38810	80 %	0 %	20 %	0 %	384189719
43	NC_017206	ACAAT	2	10	39606	39615	60 %	20 %	0 %	20 %	384189719
44	NC_017206	ATATA	2	10	40177	40186	60 %	40 %	0 %	0 %	384189719
45	NC_017206	CTTTT	2	10	41408	41417	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017206	TTTCA	2	10	41761	41770	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017206	CGATT	2	10	43761	43770	20 %	40 %	20 %	20 %	384189723
48	NC_017206	TATAC	2	10	43879	43888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017206	CATTA	2	10	45362	45371	40 %	40 %	0 %	20 %	384189726
50	NC_017206	TTTAA	2	10	47883	47892	40 %	60 %	0 %	0 %	384189729
51	NC_017206	ATAGT	2	10	48155	48164	40 %	40 %	20 %	0 %	384189729
52	NC_017206	ATAAA	2	10	48362	48371	80 %	20 %	0 %	0 %	384189729
53	NC_017206	ATATA	2	10	48662	48671	60 %	40 %	0 %	0 %	384189729
54	NC_017206	TCAGA	2	10	49060	49069	40 %	20 %	20 %	20 %	384189730
55	NC_017206	TTGAA	2	10	51933	51942	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017206	GGATT	2	10	52317	52326	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017206	TAAAA	2	10	52438	52447	80 %	20 %	0 %	0 %	384189734
58	NC_017206	TTTAT	2	10	53608	53617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017206	ATTTA	2	10	54096	54105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017206	ATTTG	2	10	55870	55879	20 %	60 %	20 %	0 %	384189737
61	NC_017206	TTCCT	2	10	55941	55950	0 %	60 %	0 %	40 %	384189737
62	NC_017206	ACATA	2	10	56057	56066	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017206	ATACA	2	10	56886	56895	60 %	20 %	0 %	20 %	384189738
64	NC_017206	CACTA	2	10	57069	57078	40 %	20 %	0 %	40 %	384189738
65	NC_017206	TATAA	2	10	59045	59054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017206	TCCAT	2	10	59468	59477	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017206	TTCTT	2	10	60657	60666	0 %	80 %	0 %	20 %	384189743
68	NC_017206	CATTT	2	10	60721	60730	20 %	60 %	0 %	20 %	384189743
69	NC_017206	GTATT	2	10	60978	60987	20 %	60 %	20 %	0 %	384189744
70	NC_017206	CTTTT	2	10	63217	63226	0 %	80 %	0 %	20 %	384189749
71	NC_017206	TTTCT	2	10	63370	63379	0 %	80 %	0 %	20 %	384189749
72	NC_017206	ATTTA	2	10	69534	69543	40 %	60 %	0 %	0 %	384189755
73	NC_017206	TCGTT	2	10	70233	70242	0 %	60 %	20 %	20 %	384189755
74	NC_017206	CCAGT	2	10	70599	70608	20 %	20 %	20 %	40 %	384189755
75	NC_017206	TTTCC	2	10	72147	72156	0 %	60 %	0 %	40 %	384189756
76	NC_017206	CAATT	2	10	72434	72443	40 %	40 %	0 %	20 %	384189756
77	NC_017206	GTTTT	2	10	75207	75216	0 %	80 %	20 %	0 %	384189759
78	NC_017206	TTCCA	2	10	75868	75877	20 %	40 %	0 %	40 %	384189761
79	NC_017206	GTAAA	2	10	76170	76179	60 %	20 %	20 %	0 %	384189762
80	NC_017206	ATAAA	2	10	76288	76297	80 %	20 %	0 %	0 %	384189762
81	NC_017206	ATCTT	2	10	79539	79548	20 %	60 %	0 %	20 %	384189764
82	NC_017206	GAACA	2	10	80645	80654	60 %	0 %	20 %	20 %	384189767
83	NC_017206	TTGAT	2	10	80730	80739	20 %	60 %	20 %	0 %	384189767

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.