MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	AAATC	2	10	3084	3093	60 %	20 %	0 %	20 %	384189676
2	NC_017206	TTCAT	2	10	5328	5337	20 %	60 %	0 %	20 %	384189677
3	NC_017206	AATTA	2	10	6839	6848	60 %	40 %	0 %	0 %	384189679
4	NC_017206	CACAT	2	10	7169	7178	40 %	20 %	0 %	40 %	384189680
5	NC_017206	AAAAG	2	10	7663	7672	80 %	0 %	20 %	0 %	384189680
6	NC_017206	CTTTT	2	10	13175	13184	0 %	80 %	0 %	20 %	384189685
7	NC_017206	TCCAT	2	10	13521	13530	20 %	40 %	0 %	40 %	384189686
8	NC_017206	GATCC	2	10	14424	14433	20 %	20 %	20 %	40 %	384189688
9	NC_017206	TTTTC	2	10	17205	17214	0 %	80 %	0 %	20 %	384189691
10	NC_017206	TTCCT	2	10	17310	17319	0 %	60 %	0 %	40 %	384189692
11	NC_017206	AATTT	2	10	18586	18595	40 %	60 %	0 %	0 %	384189695
12	NC_017206	ATTCG	2	10	19723	19732	20 %	40 %	20 %	20 %	384189697
13	NC_017206	ATCAA	2	10	20132	20141	60 %	20 %	0 %	20 %	384189697
14	NC_017206	ATTTT	2	10	21508	21517	20 %	80 %	0 %	0 %	384189698
15	NC_017206	TTTGG	2	10	22761	22770	0 %	60 %	40 %	0 %	384189700
16	NC_017206	AATCT	2	10	24583	24592	40 %	40 %	0 %	20 %	384189703
17	NC_017206	ATTTT	2	10	26643	26652	20 %	80 %	0 %	0 %	384189705
18	NC_017206	CTTGA	2	10	28021	28030	20 %	40 %	20 %	20 %	384189706
19	NC_017206	AGATT	2	10	29989	29998	40 %	40 %	20 %	0 %	384189708
20	NC_017206	ATAAA	2	10	30064	30073	80 %	20 %	0 %	0 %	384189708
21	NC_017206	ATGAA	2	10	30200	30209	60 %	20 %	20 %	0 %	384189708
22	NC_017206	GTAAT	2	10	32139	32148	40 %	40 %	20 %	0 %	384189710
23	NC_017206	TAAAA	2	10	34764	34773	80 %	20 %	0 %	0 %	384189716
24	NC_017206	GAACA	2	10	36202	36211	60 %	0 %	20 %	20 %	384189717
25	NC_017206	TTATT	2	10	37209	37218	20 %	80 %	0 %	0 %	384189718
26	NC_017206	ATTGA	2	10	38381	38390	40 %	40 %	20 %	0 %	384189719
27	NC_017206	GAAAA	2	10	38801	38810	80 %	0 %	20 %	0 %	384189719
28	NC_017206	ACAAT	2	10	39606	39615	60 %	20 %	0 %	20 %	384189719
29	NC_017206	ATATA	2	10	40177	40186	60 %	40 %	0 %	0 %	384189719
30	NC_017206	CGATT	2	10	43761	43770	20 %	40 %	20 %	20 %	384189723
31	NC_017206	CATTA	2	10	45362	45371	40 %	40 %	0 %	20 %	384189726
32	NC_017206	TTTAA	2	10	47883	47892	40 %	60 %	0 %	0 %	384189729
33	NC_017206	ATAGT	2	10	48155	48164	40 %	40 %	20 %	0 %	384189729
34	NC_017206	ATAAA	2	10	48362	48371	80 %	20 %	0 %	0 %	384189729
35	NC_017206	ATATA	2	10	48662	48671	60 %	40 %	0 %	0 %	384189729
36	NC_017206	TCAGA	2	10	49060	49069	40 %	20 %	20 %	20 %	384189730
37	NC_017206	TAAAA	2	10	52438	52447	80 %	20 %	0 %	0 %	384189734
38	NC_017206	ATTTG	2	10	55870	55879	20 %	60 %	20 %	0 %	384189737
39	NC_017206	TTCCT	2	10	55941	55950	0 %	60 %	0 %	40 %	384189737
40	NC_017206	ATACA	2	10	56886	56895	60 %	20 %	0 %	20 %	384189738
41	NC_017206	CACTA	2	10	57069	57078	40 %	20 %	0 %	40 %	384189738
42	NC_017206	TTCTT	2	10	60657	60666	0 %	80 %	0 %	20 %	384189743
43	NC_017206	CATTT	2	10	60721	60730	20 %	60 %	0 %	20 %	384189743
44	NC_017206	GTATT	2	10	60978	60987	20 %	60 %	20 %	0 %	384189744
45	NC_017206	CTTTT	2	10	63217	63226	0 %	80 %	0 %	20 %	384189749
46	NC_017206	TTTCT	2	10	63370	63379	0 %	80 %	0 %	20 %	384189749
47	NC_017206	ATTTA	2	10	69534	69543	40 %	60 %	0 %	0 %	384189755
48	NC_017206	TCGTT	2	10	70233	70242	0 %	60 %	20 %	20 %	384189755
49	NC_017206	CCAGT	2	10	70599	70608	20 %	20 %	20 %	40 %	384189755
50	NC_017206	TTTCC	2	10	72147	72156	0 %	60 %	0 %	40 %	384189756
51	NC_017206	CAATT	2	10	72434	72443	40 %	40 %	0 %	20 %	384189756
52	NC_017206	GTTTT	2	10	75207	75216	0 %	80 %	20 %	0 %	384189759
53	NC_017206	TTCCA	2	10	75868	75877	20 %	40 %	0 %	40 %	384189761
54	NC_017206	GTAAA	2	10	76170	76179	60 %	20 %	20 %	0 %	384189762
55	NC_017206	ATAAA	2	10	76288	76297	80 %	20 %	0 %	0 %	384189762
56	NC_017206	ATCTT	2	10	79539	79548	20 %	60 %	0 %	20 %	384189764
57	NC_017206	GAACA	2	10	80645	80654	60 %	0 %	20 %	20 %	384189767
58	NC_017206	TTGAT	2	10	80730	80739	20 %	60 %	20 %	0 %	384189767

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.