MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	TTGA	2	8	643	650	25 %	50 %	25 %	0 %	384189673
2	NC_017206	TTTA	2	8	809	816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017206	AATT	2	8	863	870	50 %	50 %	0 %	0 %	384189674
4	NC_017206	CTTT	2	8	1439	1446	0 %	75 %	0 %	25 %	384189675
5	NC_017206	TTAT	2	8	1540	1547	25 %	75 %	0 %	0 %	384189675
6	NC_017206	ATTT	2	8	1571	1578	25 %	75 %	0 %	0 %	384189675
7	NC_017206	AGTA	2	8	1897	1904	50 %	25 %	25 %	0 %	384189675
8	NC_017206	TTTC	2	8	2158	2165	0 %	75 %	0 %	25 %	384189675
9	NC_017206	GAAA	2	8	2403	2410	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017206	TGAA	2	8	2450	2457	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017206	TCTA	2	8	3309	3316	25 %	50 %	0 %	25 %	384189676
12	NC_017206	AATG	2	8	3444	3451	50 %	25 %	25 %	0 %	384189676
13	NC_017206	AAGA	2	8	3621	3628	75 %	0 %	25 %	0 %	384189676
14	NC_017206	TGAT	2	8	3827	3834	25 %	50 %	25 %	0 %	384189676
15	NC_017206	AAAT	2	8	4101	4108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017206	AAAC	2	8	4347	4354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017206	AATT	2	8	4384	4391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017206	TTGT	2	8	4822	4829	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017206	CTAT	2	8	5351	5358	25 %	50 %	0 %	25 %	384189677
20	NC_017206	AGAA	2	8	5640	5647	75 %	0 %	25 %	0 %	384189677
21	NC_017206	AGAT	2	8	5867	5874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017206	AATT	2	8	6325	6332	50 %	50 %	0 %	0 %	384189678
23	NC_017206	GAAT	2	8	6491	6498	50 %	25 %	25 %	0 %	384189678
24	NC_017206	ATTA	2	8	6653	6660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017206	AAAT	2	8	6875	6882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017206	TATT	2	8	6966	6973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017206	TATT	2	8	7161	7168	25 %	75 %	0 %	0 %	384189680
28	NC_017206	TGAT	2	8	7307	7314	25 %	50 %	25 %	0 %	384189680
29	NC_017206	GAAA	2	8	7821	7828	75 %	0 %	25 %	0 %	384189680
30	NC_017206	GTAT	2	8	8034	8041	25 %	50 %	25 %	0 %	384189680
31	NC_017206	AACA	2	8	8319	8326	75 %	0 %	0 %	25 %	384189681
32	NC_017206	AAAG	2	8	8622	8629	75 %	0 %	25 %	0 %	384189682
33	NC_017206	TGGT	2	8	8818	8825	0 %	50 %	50 %	0 %	384189682
34	NC_017206	TCCT	2	8	8935	8942	0 %	50 %	0 %	50 %	384189682
35	NC_017206	ATGA	2	8	9134	9141	50 %	25 %	25 %	0 %	384189682
36	NC_017206	TGAT	2	8	9150	9157	25 %	50 %	25 %	0 %	384189682
37	NC_017206	AAAT	2	8	9180	9187	75 %	25 %	0 %	0 %	384189682
38	NC_017206	GTAT	2	8	9273	9280	25 %	50 %	25 %	0 %	384189682
39	NC_017206	AAAT	2	8	9325	9332	75 %	25 %	0 %	0 %	384189682
40	NC_017206	GAGG	2	8	9554	9561	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017206	ATGA	2	8	9570	9577	50 %	25 %	25 %	0 %	384189683
42	NC_017206	AACT	2	8	9868	9875	50 %	25 %	0 %	25 %	384189683
43	NC_017206	TAAA	2	8	9985	9992	75 %	25 %	0 %	0 %	384189683
44	NC_017206	TGTA	2	8	10239	10246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017206	TCGT	2	8	10355	10362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017206	TAAA	2	8	10456	10463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017206	TCAC	2	8	11494	11501	25 %	25 %	0 %	50 %	384189685
48	NC_017206	ATCA	2	8	11637	11644	50 %	25 %	0 %	25 %	384189685
49	NC_017206	CTTT	2	8	12044	12051	0 %	75 %	0 %	25 %	384189685
50	NC_017206	CTTG	2	8	12165	12172	0 %	50 %	25 %	25 %	384189685
51	NC_017206	ATTT	2	8	12507	12514	25 %	75 %	0 %	0 %	384189685
52	NC_017206	TTTC	2	8	13012	13019	0 %	75 %	0 %	25 %	384189685
53	NC_017206	CGCC	2	8	13065	13072	0 %	0 %	25 %	75 %	384189685
54	NC_017206	TTTG	2	8	13381	13388	0 %	75 %	25 %	0 %	384189686
55	NC_017206	TTCC	2	8	13531	13538	0 %	50 %	0 %	50 %	384189686
56	NC_017206	CTTT	2	8	13976	13983	0 %	75 %	0 %	25 %	384189687
57	NC_017206	TTTG	2	8	14218	14225	0 %	75 %	25 %	0 %	384189688
58	NC_017206	AGAA	2	8	14953	14960	75 %	0 %	25 %	0 %	384189689
59	NC_017206	GAAC	2	8	15415	15422	50 %	0 %	25 %	25 %	384189689
60	NC_017206	CTTT	2	8	15608	15615	0 %	75 %	0 %	25 %	384189689
61	NC_017206	CATA	2	8	15994	16001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017206	AGTT	2	8	16021	16028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017206	CAAC	2	8	18364	18371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017206	ATTG	2	8	18391	18398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017206	TAGA	2	8	19184	19191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017206	GTAA	2	8	19810	19817	50 %	25 %	25 %	0 %	384189697
67	NC_017206	ATTT	2	8	20712	20719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017206	ATTT	2	8	21616	21623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017206	GATT	2	8	21973	21980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017206	GAAG	2	8	22342	22349	50 %	0 %	50 %	0 %	384189699
71	NC_017206	GAAG	2	8	22402	22409	50 %	0 %	50 %	0 %	384189699
72	NC_017206	TGTT	2	8	22917	22924	0 %	75 %	25 %	0 %	384189700
73	NC_017206	CTTT	2	8	23363	23370	0 %	75 %	0 %	25 %	384189702
74	NC_017206	ATTA	2	8	23394	23401	50 %	50 %	0 %	0 %	384189702
75	NC_017206	TAAG	2	8	23682	23689	50 %	25 %	25 %	0 %	384189702
76	NC_017206	ATTT	2	8	23723	23730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017206	AGAT	2	8	24290	24297	50 %	25 %	25 %	0 %	384189703
78	NC_017206	TTGA	2	8	24477	24484	25 %	50 %	25 %	0 %	384189703
79	NC_017206	AATG	2	8	24513	24520	50 %	25 %	25 %	0 %	384189703
80	NC_017206	TAAA	2	8	24631	24638	75 %	25 %	0 %	0 %	384189703
81	NC_017206	ATTT	2	8	24802	24809	25 %	75 %	0 %	0 %	384189703
82	NC_017206	ATTT	2	8	25378	25385	25 %	75 %	0 %	0 %	384189703
83	NC_017206	TTAC	2	8	26018	26025	25 %	50 %	0 %	25 %	384189704
84	NC_017206	AGAA	2	8	26043	26050	75 %	0 %	25 %	0 %	384189704
85	NC_017206	AGAA	2	8	26131	26138	75 %	0 %	25 %	0 %	384189704
86	NC_017206	GATT	2	8	26493	26500	25 %	50 %	25 %	0 %	384189705
87	NC_017206	TTTC	2	8	26780	26787	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017206	TTAA	2	8	26939	26946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017206	TAAC	2	8	27098	27105	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017206	TAAA	2	8	27727	27734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017206	TACT	2	8	27888	27895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017206	ACCA	2	8	28381	28388	50 %	0 %	0 %	50 %	384189706
93	NC_017206	TCCA	2	8	28512	28519	25 %	25 %	0 %	50 %	384189706
94	NC_017206	AACC	2	8	28541	28548	50 %	0 %	0 %	50 %	384189706
95	NC_017206	TCCC	2	8	28668	28675	0 %	25 %	0 %	75 %	384189706
96	NC_017206	GGCT	2	8	28691	28698	0 %	25 %	50 %	25 %	384189706
97	NC_017206	ACTT	2	8	29200	29207	25 %	50 %	0 %	25 %	384189707
98	NC_017206	TAAA	2	8	29533	29540	75 %	25 %	0 %	0 %	384189707
99	NC_017206	CGTT	2	8	29750	29757	0 %	50 %	25 %	25 %	384189707
100	NC_017206	ATCT	2	8	30029	30036	25 %	50 %	0 %	25 %	384189708
101	NC_017206	ATAA	2	8	30162	30169	75 %	25 %	0 %	0 %	384189708
102	NC_017206	GCTG	2	8	30809	30816	0 %	25 %	50 %	25 %	384189709
103	NC_017206	AAAT	2	8	30955	30962	75 %	25 %	0 %	0 %	384189709
104	NC_017206	AATA	2	8	31974	31981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017206	ATAA	2	8	32032	32039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017206	AGTA	2	8	32092	32099	50 %	25 %	25 %	0 %	384189710
107	NC_017206	TTGT	2	8	32951	32958	0 %	75 %	25 %	0 %	384189711
108	NC_017206	TTTA	2	8	33274	33281	25 %	75 %	0 %	0 %	384189712
109	NC_017206	TTAC	2	8	33335	33342	25 %	50 %	0 %	25 %	384189712
110	NC_017206	AGAA	2	8	33638	33645	75 %	0 %	25 %	0 %	384189713
111	NC_017206	TAAA	2	8	33674	33681	75 %	25 %	0 %	0 %	384189713
112	NC_017206	AATC	2	8	33920	33927	50 %	25 %	0 %	25 %	384189714
113	NC_017206	CTCC	2	8	34064	34071	0 %	25 %	0 %	75 %	384189714
114	NC_017206	AAAT	2	8	34209	34216	75 %	25 %	0 %	0 %	384189715
115	NC_017206	ACTT	2	8	34928	34935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017206	ATCT	2	8	35257	35264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017206	AATA	2	8	35474	35481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017206	GTAT	2	8	35527	35534	25 %	50 %	25 %	0 %	384189717
119	NC_017206	ATAA	2	8	35625	35632	75 %	25 %	0 %	0 %	384189717
120	NC_017206	GAAA	2	8	35984	35991	75 %	0 %	25 %	0 %	384189717
121	NC_017206	ATTC	2	8	36985	36992	25 %	50 %	0 %	25 %	384189718
122	NC_017206	TGAT	2	8	37560	37567	25 %	50 %	25 %	0 %	384189718
123	NC_017206	ATAA	2	8	37925	37932	75 %	25 %	0 %	0 %	384189719
124	NC_017206	TAAT	2	8	38430	38437	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
125	NC_017206	TAAG	2	8	38592	38599	50 %	25 %	25 %	0 %	384189719
126	NC_017206	ATTA	2	8	38743	38750	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
127	NC_017206	AATT	2	8	38814	38821	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
128	NC_017206	AAAT	2	8	39001	39008	75 %	25 %	0 %	0 %	384189719
129	NC_017206	AAAT	2	8	39289	39296	75 %	25 %	0 %	0 %	384189719
130	NC_017206	AATT	2	8	39930	39937	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
131	NC_017206	GCAT	2	8	40128	40135	25 %	25 %	25 %	25 %	384189719
132	NC_017206	ATTT	2	8	40337	40344	25 %	75 %	0 %	0 %	384189719
133	NC_017206	GGTT	2	8	40811	40818	0 %	50 %	50 %	0 %	384189719
134	NC_017206	CAAA	2	8	40985	40992	75 %	0 %	0 %	25 %	384189719
135	NC_017206	ATCC	2	8	41384	41391	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017206	TATT	2	8	41642	41649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017206	TTTA	2	8	41855	41862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017206	AATA	2	8	41934	41941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017206	TATT	2	8	42001	42008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017206	TCTA	2	8	42258	42265	25 %	50 %	0 %	25 %	384189720
141	NC_017206	TATG	2	8	42447	42454	25 %	50 %	25 %	0 %	384189720
142	NC_017206	AATT	2	8	42904	42911	50 %	50 %	0 %	0 %	384189721
143	NC_017206	AGTG	2	8	43049	43056	25 %	25 %	50 %	0 %	384189721
144	NC_017206	TCTT	2	8	44329	44336	0 %	75 %	0 %	25 %	384189725
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146	NC_017206	CTAA	2	8	45596	45603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.