MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	TTTA	2	8	809	816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017206	GAAA	2	8	2403	2410	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017206	TGAA	2	8	2450	2457	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017206	AAAT	2	8	4101	4108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017206	AAAC	2	8	4347	4354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017206	AATT	2	8	4384	4391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017206	TTGT	2	8	4822	4829	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017206	AGAT	2	8	5867	5874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017206	ATTA	2	8	6653	6660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017206	AAAT	2	8	6875	6882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017206	TATT	2	8	6966	6973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017206	GAGG	2	8	9554	9561	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017206	TGTA	2	8	10239	10246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017206	TCGT	2	8	10355	10362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017206	TAAA	2	8	10456	10463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017206	CATA	2	8	15994	16001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017206	AGTT	2	8	16021	16028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017206	CAAC	2	8	18364	18371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017206	ATTG	2	8	18391	18398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017206	TAGA	2	8	19184	19191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017206	ATTT	2	8	20712	20719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017206	ATTT	2	8	21616	21623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017206	GATT	2	8	21973	21980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017206	ATTT	2	8	23723	23730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017206	TTTC	2	8	26780	26787	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017206	TTAA	2	8	26939	26946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017206	TAAC	2	8	27098	27105	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017206	TAAA	2	8	27727	27734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017206	TACT	2	8	27888	27895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017206	AATA	2	8	31974	31981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017206	ATAA	2	8	32032	32039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017206	ACTT	2	8	34928	34935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017206	ATCT	2	8	35257	35264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017206	AATA	2	8	35474	35481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017206	ATCC	2	8	41384	41391	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017206	TATT	2	8	41642	41649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017206	TTTA	2	8	41855	41862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017206	AATA	2	8	41934	41941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017206	TATT	2	8	42001	42008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017206	TTCT	2	8	45117	45124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017206	CTAA	2	8	45596	45603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017206	CTAT	2	8	46149	46156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017206	TTTC	2	8	47097	47104	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017206	TTAT	2	8	47151	47158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017206	AAAT	2	8	47169	47176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017206	AAAT	2	8	47255	47262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017206	GTTT	2	8	49937	49944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017206	ACAA	2	8	52120	52127	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017206	CTTT	2	8	53727	53734	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017206	TTCT	2	8	54681	54688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017206	AACA	2	8	55974	55981	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017206	ATTT	2	8	57258	57265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017206	CACT	2	8	57483	57490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017206	ATTT	2	8	57543	57550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017206	ATGT	2	8	58062	58069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017206	TTAT	2	8	59564	59571	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017206	TGAT	2	8	59616	59623	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017206	ATAA	2	8	59645	59652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017206	AAAT	2	8	59677	59684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017206	GTTA	2	8	61263	61270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017206	ATTA	2	8	62210	62217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017206	CTTT	2	8	63493	63500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017206	GTAA	2	8	71393	71400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017206	CTAA	2	8	71502	71509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017206	TACA	2	8	71596	71603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017206	CCTT	2	8	74179	74186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017206	CCCT	2	8	80769	80776	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_017206	GTTT	2	8	81256	81263	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017206	GTTT	2	8	81532	81539	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017206	TGTC	2	8	81807	81814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017206	TTTG	2	8	81986	81993	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017206	TTTC	2	8	82776	82783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017206	TTTG	2	8	82862	82869	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017206	CATT	2	8	83142	83149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017206	GATT	2	8	83328	83335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.