MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	TTGA	2	8	643	650	25 %	50 %	25 %	0 %	384189673
2	NC_017206	AATT	2	8	863	870	50 %	50 %	0 %	0 %	384189674
3	NC_017206	CTTT	2	8	1439	1446	0 %	75 %	0 %	25 %	384189675
4	NC_017206	TTAT	2	8	1540	1547	25 %	75 %	0 %	0 %	384189675
5	NC_017206	ATTT	2	8	1571	1578	25 %	75 %	0 %	0 %	384189675
6	NC_017206	AGTA	2	8	1897	1904	50 %	25 %	25 %	0 %	384189675
7	NC_017206	TTTC	2	8	2158	2165	0 %	75 %	0 %	25 %	384189675
8	NC_017206	TCTA	2	8	3309	3316	25 %	50 %	0 %	25 %	384189676
9	NC_017206	AATG	2	8	3444	3451	50 %	25 %	25 %	0 %	384189676
10	NC_017206	AAGA	2	8	3621	3628	75 %	0 %	25 %	0 %	384189676
11	NC_017206	TGAT	2	8	3827	3834	25 %	50 %	25 %	0 %	384189676
12	NC_017206	CTAT	2	8	5351	5358	25 %	50 %	0 %	25 %	384189677
13	NC_017206	AGAA	2	8	5640	5647	75 %	0 %	25 %	0 %	384189677
14	NC_017206	AATT	2	8	6325	6332	50 %	50 %	0 %	0 %	384189678
15	NC_017206	GAAT	2	8	6491	6498	50 %	25 %	25 %	0 %	384189678
16	NC_017206	TATT	2	8	7161	7168	25 %	75 %	0 %	0 %	384189680
17	NC_017206	TGAT	2	8	7307	7314	25 %	50 %	25 %	0 %	384189680
18	NC_017206	GAAA	2	8	7821	7828	75 %	0 %	25 %	0 %	384189680
19	NC_017206	GTAT	2	8	8034	8041	25 %	50 %	25 %	0 %	384189680
20	NC_017206	AACA	2	8	8319	8326	75 %	0 %	0 %	25 %	384189681
21	NC_017206	AAAG	2	8	8622	8629	75 %	0 %	25 %	0 %	384189682
22	NC_017206	TGGT	2	8	8818	8825	0 %	50 %	50 %	0 %	384189682
23	NC_017206	TCCT	2	8	8935	8942	0 %	50 %	0 %	50 %	384189682
24	NC_017206	ATGA	2	8	9134	9141	50 %	25 %	25 %	0 %	384189682
25	NC_017206	TGAT	2	8	9150	9157	25 %	50 %	25 %	0 %	384189682
26	NC_017206	AAAT	2	8	9180	9187	75 %	25 %	0 %	0 %	384189682
27	NC_017206	GTAT	2	8	9273	9280	25 %	50 %	25 %	0 %	384189682
28	NC_017206	AAAT	2	8	9325	9332	75 %	25 %	0 %	0 %	384189682
29	NC_017206	ATGA	2	8	9570	9577	50 %	25 %	25 %	0 %	384189683
30	NC_017206	AACT	2	8	9868	9875	50 %	25 %	0 %	25 %	384189683
31	NC_017206	TAAA	2	8	9985	9992	75 %	25 %	0 %	0 %	384189683
32	NC_017206	TCAC	2	8	11494	11501	25 %	25 %	0 %	50 %	384189685
33	NC_017206	ATCA	2	8	11637	11644	50 %	25 %	0 %	25 %	384189685
34	NC_017206	CTTT	2	8	12044	12051	0 %	75 %	0 %	25 %	384189685
35	NC_017206	CTTG	2	8	12165	12172	0 %	50 %	25 %	25 %	384189685
36	NC_017206	ATTT	2	8	12507	12514	25 %	75 %	0 %	0 %	384189685
37	NC_017206	TTTC	2	8	13012	13019	0 %	75 %	0 %	25 %	384189685
38	NC_017206	CGCC	2	8	13065	13072	0 %	0 %	25 %	75 %	384189685
39	NC_017206	TTTG	2	8	13381	13388	0 %	75 %	25 %	0 %	384189686
40	NC_017206	TTCC	2	8	13531	13538	0 %	50 %	0 %	50 %	384189686
41	NC_017206	CTTT	2	8	13976	13983	0 %	75 %	0 %	25 %	384189687
42	NC_017206	TTTG	2	8	14218	14225	0 %	75 %	25 %	0 %	384189688
43	NC_017206	AGAA	2	8	14953	14960	75 %	0 %	25 %	0 %	384189689
44	NC_017206	GAAC	2	8	15415	15422	50 %	0 %	25 %	25 %	384189689
45	NC_017206	CTTT	2	8	15608	15615	0 %	75 %	0 %	25 %	384189689
46	NC_017206	GTAA	2	8	19810	19817	50 %	25 %	25 %	0 %	384189697
47	NC_017206	GAAG	2	8	22342	22349	50 %	0 %	50 %	0 %	384189699
48	NC_017206	GAAG	2	8	22402	22409	50 %	0 %	50 %	0 %	384189699
49	NC_017206	TGTT	2	8	22917	22924	0 %	75 %	25 %	0 %	384189700
50	NC_017206	CTTT	2	8	23363	23370	0 %	75 %	0 %	25 %	384189702
51	NC_017206	ATTA	2	8	23394	23401	50 %	50 %	0 %	0 %	384189702
52	NC_017206	TAAG	2	8	23682	23689	50 %	25 %	25 %	0 %	384189702
53	NC_017206	AGAT	2	8	24290	24297	50 %	25 %	25 %	0 %	384189703
54	NC_017206	TTGA	2	8	24477	24484	25 %	50 %	25 %	0 %	384189703
55	NC_017206	AATG	2	8	24513	24520	50 %	25 %	25 %	0 %	384189703
56	NC_017206	TAAA	2	8	24631	24638	75 %	25 %	0 %	0 %	384189703
57	NC_017206	ATTT	2	8	24802	24809	25 %	75 %	0 %	0 %	384189703
58	NC_017206	ATTT	2	8	25378	25385	25 %	75 %	0 %	0 %	384189703
59	NC_017206	TTAC	2	8	26018	26025	25 %	50 %	0 %	25 %	384189704
60	NC_017206	AGAA	2	8	26043	26050	75 %	0 %	25 %	0 %	384189704
61	NC_017206	AGAA	2	8	26131	26138	75 %	0 %	25 %	0 %	384189704
62	NC_017206	GATT	2	8	26493	26500	25 %	50 %	25 %	0 %	384189705
63	NC_017206	ACCA	2	8	28381	28388	50 %	0 %	0 %	50 %	384189706
64	NC_017206	TCCA	2	8	28512	28519	25 %	25 %	0 %	50 %	384189706
65	NC_017206	AACC	2	8	28541	28548	50 %	0 %	0 %	50 %	384189706
66	NC_017206	TCCC	2	8	28668	28675	0 %	25 %	0 %	75 %	384189706
67	NC_017206	GGCT	2	8	28691	28698	0 %	25 %	50 %	25 %	384189706
68	NC_017206	ACTT	2	8	29200	29207	25 %	50 %	0 %	25 %	384189707
69	NC_017206	TAAA	2	8	29533	29540	75 %	25 %	0 %	0 %	384189707
70	NC_017206	CGTT	2	8	29750	29757	0 %	50 %	25 %	25 %	384189707
71	NC_017206	ATCT	2	8	30029	30036	25 %	50 %	0 %	25 %	384189708
72	NC_017206	ATAA	2	8	30162	30169	75 %	25 %	0 %	0 %	384189708
73	NC_017206	GCTG	2	8	30809	30816	0 %	25 %	50 %	25 %	384189709
74	NC_017206	AAAT	2	8	30955	30962	75 %	25 %	0 %	0 %	384189709
75	NC_017206	AGTA	2	8	32092	32099	50 %	25 %	25 %	0 %	384189710
76	NC_017206	TTGT	2	8	32951	32958	0 %	75 %	25 %	0 %	384189711
77	NC_017206	TTTA	2	8	33274	33281	25 %	75 %	0 %	0 %	384189712
78	NC_017206	TTAC	2	8	33335	33342	25 %	50 %	0 %	25 %	384189712
79	NC_017206	AGAA	2	8	33638	33645	75 %	0 %	25 %	0 %	384189713
80	NC_017206	TAAA	2	8	33674	33681	75 %	25 %	0 %	0 %	384189713
81	NC_017206	AATC	2	8	33920	33927	50 %	25 %	0 %	25 %	384189714
82	NC_017206	CTCC	2	8	34064	34071	0 %	25 %	0 %	75 %	384189714
83	NC_017206	AAAT	2	8	34209	34216	75 %	25 %	0 %	0 %	384189715
84	NC_017206	GTAT	2	8	35527	35534	25 %	50 %	25 %	0 %	384189717
85	NC_017206	ATAA	2	8	35625	35632	75 %	25 %	0 %	0 %	384189717
86	NC_017206	GAAA	2	8	35984	35991	75 %	0 %	25 %	0 %	384189717
87	NC_017206	ATTC	2	8	36985	36992	25 %	50 %	0 %	25 %	384189718
88	NC_017206	TGAT	2	8	37560	37567	25 %	50 %	25 %	0 %	384189718
89	NC_017206	ATAA	2	8	37925	37932	75 %	25 %	0 %	0 %	384189719
90	NC_017206	TAAT	2	8	38430	38437	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
91	NC_017206	TAAG	2	8	38592	38599	50 %	25 %	25 %	0 %	384189719
92	NC_017206	ATTA	2	8	38743	38750	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
93	NC_017206	AATT	2	8	38814	38821	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
94	NC_017206	AAAT	2	8	39001	39008	75 %	25 %	0 %	0 %	384189719
95	NC_017206	AAAT	2	8	39289	39296	75 %	25 %	0 %	0 %	384189719
96	NC_017206	AATT	2	8	39930	39937	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
97	NC_017206	GCAT	2	8	40128	40135	25 %	25 %	25 %	25 %	384189719
98	NC_017206	ATTT	2	8	40337	40344	25 %	75 %	0 %	0 %	384189719
99	NC_017206	GGTT	2	8	40811	40818	0 %	50 %	50 %	0 %	384189719
100	NC_017206	CAAA	2	8	40985	40992	75 %	0 %	0 %	25 %	384189719
101	NC_017206	TCTA	2	8	42258	42265	25 %	50 %	0 %	25 %	384189720
102	NC_017206	TATG	2	8	42447	42454	25 %	50 %	25 %	0 %	384189720
103	NC_017206	AATT	2	8	42904	42911	50 %	50 %	0 %	0 %	384189721
104	NC_017206	AGTG	2	8	43049	43056	25 %	25 %	50 %	0 %	384189721
105	NC_017206	TCTT	2	8	44329	44336	0 %	75 %	0 %	25 %	384189725
106	NC_017206	AACT	2	8	46917	46924	50 %	25 %	0 %	25 %	384189728
107	NC_017206	GATT	2	8	47404	47411	25 %	50 %	25 %	0 %	384189729
108	NC_017206	TAAG	2	8	47704	47711	50 %	25 %	25 %	0 %	384189729
109	NC_017206	ATTT	2	8	47875	47882	25 %	75 %	0 %	0 %	384189729
110	NC_017206	AGCT	2	8	48047	48054	25 %	25 %	25 %	25 %	384189729
111	NC_017206	AAAC	2	8	48200	48207	75 %	0 %	0 %	25 %	384189729
112	NC_017206	CTAA	2	8	48690	48697	50 %	25 %	0 %	25 %	384189729
113	NC_017206	TAAA	2	8	48839	48846	75 %	25 %	0 %	0 %	384189730
114	NC_017206	ATTT	2	8	49117	49124	25 %	75 %	0 %	0 %	384189730
115	NC_017206	TCAC	2	8	49212	49219	25 %	25 %	0 %	50 %	384189730
116	NC_017206	GTTG	2	8	49285	49292	0 %	50 %	50 %	0 %	384189730
117	NC_017206	TCTA	2	8	49606	49613	25 %	50 %	0 %	25 %	384189731
118	NC_017206	ATAA	2	8	50226	50233	75 %	25 %	0 %	0 %	384189732
119	NC_017206	GTTT	2	8	50583	50590	0 %	75 %	25 %	0 %	384189732
120	NC_017206	GTTA	2	8	51008	51015	25 %	50 %	25 %	0 %	384189732
121	NC_017206	TGAA	2	8	51483	51490	50 %	25 %	25 %	0 %	384189733
122	NC_017206	TTTA	2	8	51518	51525	25 %	75 %	0 %	0 %	384189733
123	NC_017206	ATTG	2	8	51581	51588	25 %	50 %	25 %	0 %	384189733
124	NC_017206	TTAA	2	8	51627	51634	50 %	50 %	0 %	0 %	384189733
125	NC_017206	ATTT	2	8	53133	53140	25 %	75 %	0 %	0 %	384189734
126	NC_017206	CAAC	2	8	53900	53907	50 %	0 %	0 %	50 %	384189735
127	NC_017206	AGGA	2	8	54028	54035	50 %	0 %	50 %	0 %	384189735
128	NC_017206	GTTA	2	8	54168	54175	25 %	50 %	25 %	0 %	384189736
129	NC_017206	AAAT	2	8	55014	55021	75 %	25 %	0 %	0 %	384189737
130	NC_017206	TCTT	2	8	55232	55239	0 %	75 %	0 %	25 %	384189737
131	NC_017206	CCTA	2	8	55279	55286	25 %	25 %	0 %	50 %	384189737
132	NC_017206	AATT	2	8	55639	55646	50 %	50 %	0 %	0 %	384189737
133	NC_017206	CAAA	2	8	55810	55817	75 %	0 %	0 %	25 %	384189737
134	NC_017206	TCAA	2	8	55859	55866	50 %	25 %	0 %	25 %	384189737
135	NC_017206	TCAT	2	8	57007	57014	25 %	50 %	0 %	25 %	384189738
136	NC_017206	ATTG	2	8	57199	57206	25 %	50 %	25 %	0 %	384189738
137	NC_017206	AGTT	2	8	57705	57712	25 %	50 %	25 %	0 %	384189739
138	NC_017206	TAAA	2	8	58044	58051	75 %	25 %	0 %	0 %	384189739
139	NC_017206	ATTG	2	8	58106	58113	25 %	50 %	25 %	0 %	384189740
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.