MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	AT	3	6	380	385	50 %	50 %	0 %	0 %	384189673
2	NC_017206	AT	3	6	1118	1123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017206	CT	3	6	1642	1647	0 %	50 %	0 %	50 %	384189675
4	NC_017206	AC	3	6	2243	2248	50 %	0 %	0 %	50 %	384189675
5	NC_017206	AT	3	6	2426	2431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017206	AT	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017206	TA	3	6	2745	2750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017206	TG	3	6	2812	2817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017206	AT	3	6	3392	3397	50 %	50 %	0 %	0 %	384189676
10	NC_017206	AT	3	6	4113	4118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017206	AT	3	6	4326	4331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017206	TA	3	6	4688	4693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017206	TA	3	6	4840	4845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017206	TA	3	6	4877	4882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017206	AT	3	6	5052	5057	50 %	50 %	0 %	0 %	384189677
16	NC_017206	TC	3	6	5184	5189	0 %	50 %	0 %	50 %	384189677
17	NC_017206	AT	4	8	6280	6287	50 %	50 %	0 %	0 %	384189678
18	NC_017206	GA	3	6	6502	6507	50 %	0 %	50 %	0 %	384189678
19	NC_017206	TA	3	6	7070	7075	50 %	50 %	0 %	0 %	384189680
20	NC_017206	AC	3	6	8508	8513	50 %	0 %	0 %	50 %	384189681
21	NC_017206	GA	3	6	8694	8699	50 %	0 %	50 %	0 %	384189682
22	NC_017206	CT	3	6	8891	8896	0 %	50 %	0 %	50 %	384189682
23	NC_017206	CA	3	6	10166	10171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017206	AT	3	6	10439	10444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017206	TC	3	6	11091	11096	0 %	50 %	0 %	50 %	384189685
26	NC_017206	AT	3	6	13167	13172	50 %	50 %	0 %	0 %	384189685
27	NC_017206	AG	3	6	14862	14867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017206	AT	3	6	14947	14952	50 %	50 %	0 %	0 %	384189689
29	NC_017206	CT	3	6	16541	16546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017206	TA	3	6	17383	17388	50 %	50 %	0 %	0 %	384189692
31	NC_017206	TC	3	6	18260	18265	0 %	50 %	0 %	50 %	384189694
32	NC_017206	CT	3	6	18463	18468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017206	AT	3	6	18611	18616	50 %	50 %	0 %	0 %	384189695
34	NC_017206	TA	3	6	18875	18880	50 %	50 %	0 %	0 %	384189696
35	NC_017206	TA	3	6	20796	20801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017206	CT	3	6	20969	20974	0 %	50 %	0 %	50 %	384189698
37	NC_017206	AT	3	6	21010	21015	50 %	50 %	0 %	0 %	384189698
38	NC_017206	AT	3	6	21178	21183	50 %	50 %	0 %	0 %	384189698
39	NC_017206	TA	3	6	22083	22088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017206	AT	3	6	22613	22618	50 %	50 %	0 %	0 %	384189700
41	NC_017206	TA	3	6	22637	22642	50 %	50 %	0 %	0 %	384189700
42	NC_017206	AT	3	6	23748	23753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017206	TA	3	6	24844	24849	50 %	50 %	0 %	0 %	384189703
44	NC_017206	CT	3	6	25265	25270	0 %	50 %	0 %	50 %	384189703
45	NC_017206	AT	3	6	25349	25354	50 %	50 %	0 %	0 %	384189703
46	NC_017206	CT	3	6	25515	25520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017206	TA	3	6	25641	25646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017206	TA	3	6	26315	26320	50 %	50 %	0 %	0 %	384189704
49	NC_017206	TA	4	8	26325	26332	50 %	50 %	0 %	0 %	384189704
50	NC_017206	AT	5	10	26528	26537	50 %	50 %	0 %	0 %	384189705
51	NC_017206	AC	3	6	27154	27159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017206	TC	3	6	27597	27602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017206	TA	3	6	27914	27919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017206	AC	3	6	28494	28499	50 %	0 %	0 %	50 %	384189706
55	NC_017206	AG	4	8	29029	29036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017206	CT	3	6	31249	31254	0 %	50 %	0 %	50 %	384189709
57	NC_017206	AT	3	6	31545	31550	50 %	50 %	0 %	0 %	384189709
58	NC_017206	TA	3	6	32159	32164	50 %	50 %	0 %	0 %	384189710
59	NC_017206	CA	3	6	33198	33203	50 %	0 %	0 %	50 %	384189712
60	NC_017206	CT	3	6	33428	33433	0 %	50 %	0 %	50 %	384189712
61	NC_017206	AT	3	6	33542	33547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017206	AC	3	6	33874	33879	50 %	0 %	0 %	50 %	384189714
63	NC_017206	AC	3	6	34048	34053	50 %	0 %	0 %	50 %	384189714
64	NC_017206	TA	3	6	34361	34366	50 %	50 %	0 %	0 %	384189716
65	NC_017206	TA	3	6	35398	35403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017206	AT	3	6	36642	36647	50 %	50 %	0 %	0 %	384189717
67	NC_017206	TA	3	6	36805	36810	50 %	50 %	0 %	0 %	384189717
68	NC_017206	AT	3	6	38016	38021	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
69	NC_017206	AC	3	6	38101	38106	50 %	0 %	0 %	50 %	384189719
70	NC_017206	AT	3	6	38116	38121	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
71	NC_017206	AT	4	8	38181	38188	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
72	NC_017206	GA	3	6	38501	38506	50 %	0 %	50 %	0 %	384189719
73	NC_017206	TA	3	6	38978	38983	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
74	NC_017206	AT	3	6	39327	39332	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
75	NC_017206	AT	3	6	40074	40079	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
76	NC_017206	AT	3	6	41092	41097	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
77	NC_017206	AT	4	8	41175	41182	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
78	NC_017206	TA	4	8	41348	41355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017206	TA	3	6	42011	42016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017206	AT	3	6	42732	42737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017206	GA	3	6	42843	42848	50 %	0 %	50 %	0 %	384189721
82	NC_017206	AT	3	6	42856	42861	50 %	50 %	0 %	0 %	384189721
83	NC_017206	TA	4	8	43160	43167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017206	TA	3	6	43740	43745	50 %	50 %	0 %	0 %	384189723
85	NC_017206	CA	3	6	43794	43799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017206	TA	3	6	43930	43935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017206	GA	3	6	43987	43992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017206	TA	3	6	44306	44311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017206	GA	3	6	44758	44763	50 %	0 %	50 %	0 %	384189725
90	NC_017206	AT	3	6	45672	45677	50 %	50 %	0 %	0 %	384189727
91	NC_017206	AT	3	6	45915	45920	50 %	50 %	0 %	0 %	384189727
92	NC_017206	AT	4	8	45993	46000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017206	AT	3	6	46299	46304	50 %	50 %	0 %	0 %	384189728
94	NC_017206	TA	3	6	46528	46533	50 %	50 %	0 %	0 %	384189728
95	NC_017206	GT	3	6	47004	47009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017206	AT	3	6	48382	48387	50 %	50 %	0 %	0 %	384189729
97	NC_017206	TC	3	6	49243	49248	0 %	50 %	0 %	50 %	384189730
98	NC_017206	TA	3	6	49954	49959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017206	TA	4	8	50008	50015	50 %	50 %	0 %	0 %	384189732
100	NC_017206	TA	3	6	50414	50419	50 %	50 %	0 %	0 %	384189732
101	NC_017206	TC	3	6	51383	51388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017206	AT	3	6	51407	51412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017206	TA	3	6	51971	51976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017206	AT	3	6	52195	52200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017206	TA	3	6	52466	52471	50 %	50 %	0 %	0 %	384189734
106	NC_017206	TA	3	6	52932	52937	50 %	50 %	0 %	0 %	384189734
107	NC_017206	TA	4	8	53110	53117	50 %	50 %	0 %	0 %	384189734
108	NC_017206	GT	3	6	53182	53187	0 %	50 %	50 %	0 %	384189734
109	NC_017206	CA	3	6	54237	54242	50 %	0 %	0 %	50 %	384189736
110	NC_017206	AC	3	6	55353	55358	50 %	0 %	0 %	50 %	384189737
111	NC_017206	AT	4	8	56118	56125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017206	AT	3	6	56465	56470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017206	AC	3	6	58242	58247	50 %	0 %	0 %	50 %	384189740
114	NC_017206	AT	3	6	58733	58738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017206	GT	3	6	59013	59018	0 %	50 %	50 %	0 %	384189741
116	NC_017206	TA	3	6	59669	59674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017206	AT	3	6	60163	60168	50 %	50 %	0 %	0 %	384189743
118	NC_017206	AT	3	6	60223	60228	50 %	50 %	0 %	0 %	384189743
119	NC_017206	AT	3	6	60691	60696	50 %	50 %	0 %	0 %	384189743
120	NC_017206	AT	3	6	62078	62083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017206	AT	3	6	62274	62279	50 %	50 %	0 %	0 %	384189747
122	NC_017206	GT	3	6	62984	62989	0 %	50 %	50 %	0 %	384189749
123	NC_017206	TA	3	6	64107	64112	50 %	50 %	0 %	0 %	384189750
124	NC_017206	AT	3	6	64696	64701	50 %	50 %	0 %	0 %	384189751
125	NC_017206	AT	3	6	66485	66490	50 %	50 %	0 %	0 %	384189752
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127	NC_017206	AT	3	6	68166	68171	50 %	50 %	0 %	0 %	384189753
128	NC_017206	TA	3	6	69170	69175	50 %	50 %	0 %	0 %	384189754
129	NC_017206	TA	3	6	69732	69737	50 %	50 %	0 %	0 %	384189755
130	NC_017206	AT	3	6	70279	70284	50 %	50 %	0 %	0 %	384189755
131	NC_017206	AT	3	6	71652	71657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017206	AT	3	6	73189	73194	50 %	50 %	0 %	0 %	384189756
133	NC_017206	TA	3	6	75090	75095	50 %	50 %	0 %	0 %	384189759
134	NC_017206	CG	3	6	75170	75175	0 %	0 %	50 %	50 %	384189759
135	NC_017206	AT	3	6	75946	75951	50 %	50 %	0 %	0 %	384189761
136	NC_017206	AT	3	6	76376	76381	50 %	50 %	0 %	0 %	384189763
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138	NC_017206	TA	3	6	76919	76924	50 %	50 %	0 %	0 %	384189763
139	NC_017206	TA	3	6	77070	77075	50 %	50 %	0 %	0 %	384189763
140	NC_017206	TG	3	6	77376	77381	0 %	50 %	50 %	0 %	384189764
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143	NC_017206	TG	3	6	78249	78254	0 %	50 %	50 %	0 %	384189764
144	NC_017206	AC	3	6	79831	79836	50 %	0 %	0 %	50 %	384189764
145	NC_017206	AG	3	6	80357	80362	50 %	0 %	50 %	0 %	384189766
146	NC_017206	GT	3	6	81392	81397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017206	TA	3	6	82665	82670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.