MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	AT	3	6	380	385	50 %	50 %	0 %	0 %	384189673
2	NC_017206	CT	3	6	1642	1647	0 %	50 %	0 %	50 %	384189675
3	NC_017206	AC	3	6	2243	2248	50 %	0 %	0 %	50 %	384189675
4	NC_017206	AT	3	6	3392	3397	50 %	50 %	0 %	0 %	384189676
5	NC_017206	AT	3	6	5052	5057	50 %	50 %	0 %	0 %	384189677
6	NC_017206	TC	3	6	5184	5189	0 %	50 %	0 %	50 %	384189677
7	NC_017206	AT	4	8	6280	6287	50 %	50 %	0 %	0 %	384189678
8	NC_017206	GA	3	6	6502	6507	50 %	0 %	50 %	0 %	384189678
9	NC_017206	TA	3	6	7070	7075	50 %	50 %	0 %	0 %	384189680
10	NC_017206	AC	3	6	8508	8513	50 %	0 %	0 %	50 %	384189681
11	NC_017206	GA	3	6	8694	8699	50 %	0 %	50 %	0 %	384189682
12	NC_017206	CT	3	6	8891	8896	0 %	50 %	0 %	50 %	384189682
13	NC_017206	TC	3	6	11091	11096	0 %	50 %	0 %	50 %	384189685
14	NC_017206	AT	3	6	13167	13172	50 %	50 %	0 %	0 %	384189685
15	NC_017206	AT	3	6	14947	14952	50 %	50 %	0 %	0 %	384189689
16	NC_017206	TA	3	6	17383	17388	50 %	50 %	0 %	0 %	384189692
17	NC_017206	TC	3	6	18260	18265	0 %	50 %	0 %	50 %	384189694
18	NC_017206	AT	3	6	18611	18616	50 %	50 %	0 %	0 %	384189695
19	NC_017206	TA	3	6	18875	18880	50 %	50 %	0 %	0 %	384189696
20	NC_017206	CT	3	6	20969	20974	0 %	50 %	0 %	50 %	384189698
21	NC_017206	AT	3	6	21010	21015	50 %	50 %	0 %	0 %	384189698
22	NC_017206	AT	3	6	21178	21183	50 %	50 %	0 %	0 %	384189698
23	NC_017206	AT	3	6	22613	22618	50 %	50 %	0 %	0 %	384189700
24	NC_017206	TA	3	6	22637	22642	50 %	50 %	0 %	0 %	384189700
25	NC_017206	TA	3	6	24844	24849	50 %	50 %	0 %	0 %	384189703
26	NC_017206	CT	3	6	25265	25270	0 %	50 %	0 %	50 %	384189703
27	NC_017206	AT	3	6	25349	25354	50 %	50 %	0 %	0 %	384189703
28	NC_017206	TA	3	6	26315	26320	50 %	50 %	0 %	0 %	384189704
29	NC_017206	TA	4	8	26325	26332	50 %	50 %	0 %	0 %	384189704
30	NC_017206	AT	5	10	26528	26537	50 %	50 %	0 %	0 %	384189705
31	NC_017206	AC	3	6	28494	28499	50 %	0 %	0 %	50 %	384189706
32	NC_017206	CT	3	6	31249	31254	0 %	50 %	0 %	50 %	384189709
33	NC_017206	AT	3	6	31545	31550	50 %	50 %	0 %	0 %	384189709
34	NC_017206	TA	3	6	32159	32164	50 %	50 %	0 %	0 %	384189710
35	NC_017206	CA	3	6	33198	33203	50 %	0 %	0 %	50 %	384189712
36	NC_017206	CT	3	6	33428	33433	0 %	50 %	0 %	50 %	384189712
37	NC_017206	AC	3	6	33874	33879	50 %	0 %	0 %	50 %	384189714
38	NC_017206	AC	3	6	34048	34053	50 %	0 %	0 %	50 %	384189714
39	NC_017206	TA	3	6	34361	34366	50 %	50 %	0 %	0 %	384189716
40	NC_017206	AT	3	6	36642	36647	50 %	50 %	0 %	0 %	384189717
41	NC_017206	TA	3	6	36805	36810	50 %	50 %	0 %	0 %	384189717
42	NC_017206	AT	3	6	38016	38021	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
43	NC_017206	AC	3	6	38101	38106	50 %	0 %	0 %	50 %	384189719
44	NC_017206	AT	3	6	38116	38121	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
45	NC_017206	AT	4	8	38181	38188	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
46	NC_017206	GA	3	6	38501	38506	50 %	0 %	50 %	0 %	384189719
47	NC_017206	TA	3	6	38978	38983	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
48	NC_017206	AT	3	6	39327	39332	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
49	NC_017206	AT	3	6	40074	40079	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
50	NC_017206	AT	3	6	41092	41097	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
51	NC_017206	AT	4	8	41175	41182	50 %	50 %	0 %	0 %	384189719
52	NC_017206	GA	3	6	42843	42848	50 %	0 %	50 %	0 %	384189721
53	NC_017206	AT	3	6	42856	42861	50 %	50 %	0 %	0 %	384189721
54	NC_017206	TA	3	6	43740	43745	50 %	50 %	0 %	0 %	384189723
55	NC_017206	GA	3	6	44758	44763	50 %	0 %	50 %	0 %	384189725
56	NC_017206	AT	3	6	45672	45677	50 %	50 %	0 %	0 %	384189727
57	NC_017206	AT	3	6	45915	45920	50 %	50 %	0 %	0 %	384189727
58	NC_017206	AT	3	6	46299	46304	50 %	50 %	0 %	0 %	384189728
59	NC_017206	TA	3	6	46528	46533	50 %	50 %	0 %	0 %	384189728
60	NC_017206	AT	3	6	48382	48387	50 %	50 %	0 %	0 %	384189729
61	NC_017206	TC	3	6	49243	49248	0 %	50 %	0 %	50 %	384189730
62	NC_017206	TA	4	8	50008	50015	50 %	50 %	0 %	0 %	384189732
63	NC_017206	TA	3	6	50414	50419	50 %	50 %	0 %	0 %	384189732
64	NC_017206	TA	3	6	52466	52471	50 %	50 %	0 %	0 %	384189734
65	NC_017206	TA	3	6	52932	52937	50 %	50 %	0 %	0 %	384189734
66	NC_017206	TA	4	8	53110	53117	50 %	50 %	0 %	0 %	384189734
67	NC_017206	GT	3	6	53182	53187	0 %	50 %	50 %	0 %	384189734
68	NC_017206	CA	3	6	54237	54242	50 %	0 %	0 %	50 %	384189736
69	NC_017206	AC	3	6	55353	55358	50 %	0 %	0 %	50 %	384189737
70	NC_017206	AC	3	6	58242	58247	50 %	0 %	0 %	50 %	384189740
71	NC_017206	GT	3	6	59013	59018	0 %	50 %	50 %	0 %	384189741
72	NC_017206	AT	3	6	60163	60168	50 %	50 %	0 %	0 %	384189743
73	NC_017206	AT	3	6	60223	60228	50 %	50 %	0 %	0 %	384189743
74	NC_017206	AT	3	6	60691	60696	50 %	50 %	0 %	0 %	384189743
75	NC_017206	AT	3	6	62274	62279	50 %	50 %	0 %	0 %	384189747
76	NC_017206	GT	3	6	62984	62989	0 %	50 %	50 %	0 %	384189749
77	NC_017206	TA	3	6	64107	64112	50 %	50 %	0 %	0 %	384189750
78	NC_017206	AT	3	6	64696	64701	50 %	50 %	0 %	0 %	384189751
79	NC_017206	AT	3	6	66485	66490	50 %	50 %	0 %	0 %	384189752
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81	NC_017206	AT	3	6	68166	68171	50 %	50 %	0 %	0 %	384189753
82	NC_017206	TA	3	6	69170	69175	50 %	50 %	0 %	0 %	384189754
83	NC_017206	TA	3	6	69732	69737	50 %	50 %	0 %	0 %	384189755
84	NC_017206	AT	3	6	70279	70284	50 %	50 %	0 %	0 %	384189755
85	NC_017206	AT	3	6	73189	73194	50 %	50 %	0 %	0 %	384189756
86	NC_017206	TA	3	6	75090	75095	50 %	50 %	0 %	0 %	384189759
87	NC_017206	CG	3	6	75170	75175	0 %	0 %	50 %	50 %	384189759
88	NC_017206	AT	3	6	75946	75951	50 %	50 %	0 %	0 %	384189761
89	NC_017206	AT	3	6	76376	76381	50 %	50 %	0 %	0 %	384189763
90	NC_017206	CT	3	6	76769	76774	0 %	50 %	0 %	50 %	384189763
91	NC_017206	TA	3	6	76919	76924	50 %	50 %	0 %	0 %	384189763
92	NC_017206	TA	3	6	77070	77075	50 %	50 %	0 %	0 %	384189763
93	NC_017206	TG	3	6	77376	77381	0 %	50 %	50 %	0 %	384189764
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95	NC_017206	CT	3	6	77894	77899	0 %	50 %	0 %	50 %	384189764
96	NC_017206	TG	3	6	78249	78254	0 %	50 %	50 %	0 %	384189764
97	NC_017206	AC	3	6	79831	79836	50 %	0 %	0 %	50 %	384189764
98	NC_017206	AG	3	6	80357	80362	50 %	0 %	50 %	0 %	384189766

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.