MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017205	ATAA	2	8	4	11	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017205	TAAT	2	8	254	261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017205	TTGA	2	8	821	828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017205	TCTT	2	8	1149	1156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017205	CCTT	2	8	1525	1532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017205	TTTA	2	8	5280	5287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017205	ATAA	2	8	5570	5577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017205	ATAA	2	8	5740	5747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017205	TACT	2	8	6542	6549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017205	GGAT	2	8	7083	7090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017205	TCTT	2	8	7215	7222	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017205	AATA	2	8	7239	7246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017205	GGTG	2	8	11298	11305	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017205	AAGT	2	8	11416	11423	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017205	GCTT	2	8	11595	11602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017205	ACTG	2	8	11730	11737	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017205	GTTT	2	8	19376	19383	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017205	AAAT	2	8	23615	23622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017205	AATT	2	8	25050	25057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017205	AAAT	2	8	25079	25086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017205	CTTT	2	8	33518	33525	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017205	ATAA	2	8	36894	36901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017205	TATT	2	8	36902	36909	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017205	ATAA	2	8	36946	36953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017205	ATAA	2	8	36980	36987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017205	AGAA	2	8	37000	37007	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017205	AAAT	2	8	45025	45032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017205	TAAT	3	12	45230	45241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017205	ATTT	2	8	45320	45327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017205	ACTT	2	8	49458	49465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017205	CAAA	2	8	51399	51406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017205	ATAA	2	8	51658	51665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017205	ATAA	2	8	51768	51775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017205	AACA	2	8	52519	52526	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017205	GTTG	2	8	54140	54147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017205	ATTT	2	8	54505	54512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017205	CACC	2	8	54882	54889	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_017205	TTTA	2	8	55007	55014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017205	AGAA	2	8	57297	57304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017205	TAAT	2	8	57655	57662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017205	AAAT	2	8	60430	60437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017205	ATTT	2	8	60445	60452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017205	ATTA	2	8	60678	60685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017205	TAAA	2	8	60708	60715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017205	AGGC	2	8	61115	61122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017205	TTTA	2	8	61632	61639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017205	ATAA	2	8	61648	61655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017205	AAAT	2	8	62338	62345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017205	ATAA	3	12	62390	62401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017205	TGAT	2	8	63431	63438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017205	TGGA	2	8	63516	63523	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017205	AAAT	2	8	64204	64211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017205	ATTT	2	8	65098	65105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017205	TTTA	2	8	65299	65306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017205	ATTT	2	8	65441	65448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017205	GTTT	2	8	67430	67437	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017205	ATTT	2	8	69009	69016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017205	TAAG	2	8	69035	69042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.