MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017205	AATT	2	8	570	577	50 %	50 %	0 %	0 %	384189585
2	NC_017205	AATG	2	8	599	606	50 %	25 %	25 %	0 %	384189585
3	NC_017205	GAAA	2	8	1449	1456	75 %	0 %	25 %	0 %	384189586
4	NC_017205	AATT	2	8	1468	1475	50 %	50 %	0 %	0 %	384189586
5	NC_017205	CCTT	2	8	2386	2393	0 %	50 %	0 %	50 %	384189588
6	NC_017205	ATTC	2	8	2646	2653	25 %	50 %	0 %	25 %	384189588
7	NC_017205	GATA	2	8	2708	2715	50 %	25 %	25 %	0 %	384189588
8	NC_017205	GTAA	2	8	3266	3273	50 %	25 %	25 %	0 %	384189588
9	NC_017205	GGAT	2	8	3525	3532	25 %	25 %	50 %	0 %	384189588
10	NC_017205	ATTA	2	8	3732	3739	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
11	NC_017205	TGTT	2	8	3808	3815	0 %	75 %	25 %	0 %	384189588
12	NC_017205	AGAA	2	8	3929	3936	75 %	0 %	25 %	0 %	384189588
13	NC_017205	TTAC	2	8	4105	4112	25 %	50 %	0 %	25 %	384189588
14	NC_017205	ACAT	2	8	4197	4204	50 %	25 %	0 %	25 %	384189589
15	NC_017205	ATCT	2	8	4430	4437	25 %	50 %	0 %	25 %	384189589
16	NC_017205	TGTA	2	8	4442	4449	25 %	50 %	25 %	0 %	384189589
17	NC_017205	AGCT	2	8	5012	5019	25 %	25 %	25 %	25 %	384189589
18	NC_017205	TTTG	2	8	5816	5823	0 %	75 %	25 %	0 %	384189590
19	NC_017205	AGAA	2	8	6101	6108	75 %	0 %	25 %	0 %	384189590
20	NC_017205	GCTT	2	8	6254	6261	0 %	50 %	25 %	25 %	384189590
21	NC_017205	GTTT	2	8	6815	6822	0 %	75 %	25 %	0 %	384189591
22	NC_017205	TTAT	2	8	6931	6938	25 %	75 %	0 %	0 %	384189591
23	NC_017205	TTTA	2	8	8005	8012	25 %	75 %	0 %	0 %	384189593
24	NC_017205	ATGA	2	8	8517	8524	50 %	25 %	25 %	0 %	384189593
25	NC_017205	TTAT	2	8	8852	8859	25 %	75 %	0 %	0 %	384189593
26	NC_017205	GAAA	2	8	8918	8925	75 %	0 %	25 %	0 %	384189593
27	NC_017205	TGGA	2	8	9560	9567	25 %	25 %	50 %	0 %	384189593
28	NC_017205	GAAC	2	8	10033	10040	50 %	0 %	25 %	25 %	384189593
29	NC_017205	TAAA	2	8	10276	10283	75 %	25 %	0 %	0 %	384189593
30	NC_017205	TTTA	2	8	10597	10604	25 %	75 %	0 %	0 %	384189594
31	NC_017205	TTTA	2	8	10695	10702	25 %	75 %	0 %	0 %	384189594
32	NC_017205	GAAA	2	8	10747	10754	75 %	0 %	25 %	0 %	384189594
33	NC_017205	ACAT	2	8	10966	10973	50 %	25 %	0 %	25 %	384189594
34	NC_017205	TTAT	2	8	11013	11020	25 %	75 %	0 %	0 %	384189594
35	NC_017205	AAAG	2	8	11860	11867	75 %	0 %	25 %	0 %	384189595
36	NC_017205	AATT	2	8	11914	11921	50 %	50 %	0 %	0 %	384189595
37	NC_017205	AAAG	2	8	14035	14042	75 %	0 %	25 %	0 %	384189596
38	NC_017205	ATTG	2	8	14152	14159	25 %	50 %	25 %	0 %	384189596
39	NC_017205	AAAG	2	8	14941	14948	75 %	0 %	25 %	0 %	384189596
40	NC_017205	AAAG	2	8	15113	15120	75 %	0 %	25 %	0 %	384189596
41	NC_017205	TTAA	2	8	15500	15507	50 %	50 %	0 %	0 %	384189597
42	NC_017205	GAAT	2	8	15758	15765	50 %	25 %	25 %	0 %	384189598
43	NC_017205	ATGG	2	8	18305	18312	25 %	25 %	50 %	0 %	384189601
44	NC_017205	ATTG	2	8	18320	18327	25 %	50 %	25 %	0 %	384189601
45	NC_017205	ATCT	2	8	18732	18739	25 %	50 %	0 %	25 %	384189601
46	NC_017205	ATAC	2	8	19202	19209	50 %	25 %	0 %	25 %	384189601
47	NC_017205	TTTA	2	8	19237	19244	25 %	75 %	0 %	0 %	384189601
48	NC_017205	ATTA	2	8	19294	19301	50 %	50 %	0 %	0 %	384189601
49	NC_017205	ACAA	2	8	19756	19763	75 %	0 %	0 %	25 %	384189602
50	NC_017205	AAAC	2	8	19786	19793	75 %	0 %	0 %	25 %	384189602
51	NC_017205	GATG	2	8	19959	19966	25 %	25 %	50 %	0 %	384189602
52	NC_017205	AGAA	2	8	19988	19995	75 %	0 %	25 %	0 %	384189602
53	NC_017205	TAAA	2	8	20090	20097	75 %	25 %	0 %	0 %	384189602
54	NC_017205	AATT	2	8	20099	20106	50 %	50 %	0 %	0 %	384189602
55	NC_017205	GAAT	2	8	20432	20439	50 %	25 %	25 %	0 %	384189602
56	NC_017205	AGTA	2	8	20736	20743	50 %	25 %	25 %	0 %	384189602
57	NC_017205	TTAT	3	12	21011	21022	25 %	75 %	0 %	0 %	384189603
58	NC_017205	AATG	2	8	21098	21105	50 %	25 %	25 %	0 %	384189603
59	NC_017205	AGAA	2	8	21194	21201	75 %	0 %	25 %	0 %	384189603
60	NC_017205	GGAT	2	8	21441	21448	25 %	25 %	50 %	0 %	384189604
61	NC_017205	AAGC	2	8	21548	21555	50 %	0 %	25 %	25 %	384189604
62	NC_017205	GATA	2	8	21688	21695	50 %	25 %	25 %	0 %	384189604
63	NC_017205	TCTG	2	8	23116	23123	0 %	50 %	25 %	25 %	384189605
64	NC_017205	GAAA	2	8	23947	23954	75 %	0 %	25 %	0 %	384189606
65	NC_017205	TAAA	2	8	24819	24826	75 %	25 %	0 %	0 %	384189606
66	NC_017205	AACT	2	8	25248	25255	50 %	25 %	0 %	25 %	384189607
67	NC_017205	ACAT	2	8	25344	25351	50 %	25 %	0 %	25 %	384189607
68	NC_017205	TAAT	2	8	25443	25450	50 %	50 %	0 %	0 %	384189607
69	NC_017205	GAAT	2	8	25509	25516	50 %	25 %	25 %	0 %	384189607
70	NC_017205	ATTT	2	8	25535	25542	25 %	75 %	0 %	0 %	384189607
71	NC_017205	ATAA	2	8	25571	25578	75 %	25 %	0 %	0 %	384189607
72	NC_017205	GAAA	2	8	25880	25887	75 %	0 %	25 %	0 %	384189607
73	NC_017205	AAAT	2	8	26551	26558	75 %	25 %	0 %	0 %	384189607
74	NC_017205	AGGA	2	8	26661	26668	50 %	0 %	50 %	0 %	384189607
75	NC_017205	TAAT	2	8	26940	26947	50 %	50 %	0 %	0 %	384189607
76	NC_017205	TAAA	2	8	27339	27346	75 %	25 %	0 %	0 %	384189607
77	NC_017205	TTTG	2	8	27779	27786	0 %	75 %	25 %	0 %	384189608
78	NC_017205	CCAT	2	8	27993	28000	25 %	25 %	0 %	50 %	384189608
79	NC_017205	TAAT	2	8	28127	28134	50 %	50 %	0 %	0 %	384189608
80	NC_017205	TGAA	2	8	28804	28811	50 %	25 %	25 %	0 %	384189609
81	NC_017205	TTGT	2	8	29090	29097	0 %	75 %	25 %	0 %	384189610
82	NC_017205	TTGT	2	8	30182	30189	0 %	75 %	25 %	0 %	384189611
83	NC_017205	AAGG	2	8	30223	30230	50 %	0 %	50 %	0 %	384189611
84	NC_017205	AGCA	2	8	30467	30474	50 %	0 %	25 %	25 %	384189611
85	NC_017205	ATTT	2	8	30645	30652	25 %	75 %	0 %	0 %	384189611
86	NC_017205	AACA	2	8	30971	30978	75 %	0 %	0 %	25 %	384189611
87	NC_017205	TGGA	2	8	30980	30987	25 %	25 %	50 %	0 %	384189611
88	NC_017205	GATG	2	8	31123	31130	25 %	25 %	50 %	0 %	384189611
89	NC_017205	CCTA	2	8	31239	31246	25 %	25 %	0 %	50 %	384189611
90	NC_017205	AGGG	2	8	31247	31254	25 %	0 %	75 %	0 %	384189611
91	NC_017205	CATT	2	8	32168	32175	25 %	50 %	0 %	25 %	384189612
92	NC_017205	TAAA	2	8	32196	32203	75 %	25 %	0 %	0 %	384189612
93	NC_017205	GATG	2	8	32915	32922	25 %	25 %	50 %	0 %	384189613
94	NC_017205	AGTT	2	8	32995	33002	25 %	50 %	25 %	0 %	384189613
95	NC_017205	ATTA	2	8	33189	33196	50 %	50 %	0 %	0 %	384189614
96	NC_017205	AGTG	2	8	33549	33556	25 %	25 %	50 %	0 %	384189615
97	NC_017205	AACC	2	8	33802	33809	50 %	0 %	0 %	50 %	384189615
98	NC_017205	AAAG	2	8	33879	33886	75 %	0 %	25 %	0 %	384189615
99	NC_017205	AGAT	2	8	34261	34268	50 %	25 %	25 %	0 %	384189616
100	NC_017205	TATT	2	8	34359	34366	25 %	75 %	0 %	0 %	384189616
101	NC_017205	ATGA	2	8	34403	34410	50 %	25 %	25 %	0 %	384189616
102	NC_017205	ATTT	2	8	35013	35020	25 %	75 %	0 %	0 %	384189617
103	NC_017205	GAAT	2	8	35353	35360	50 %	25 %	25 %	0 %	384189617
104	NC_017205	TCTT	2	8	35393	35400	0 %	75 %	0 %	25 %	384189617
105	NC_017205	GTTT	2	8	35456	35463	0 %	75 %	25 %	0 %	384189617
106	NC_017205	TACT	2	8	35800	35807	25 %	50 %	0 %	25 %	384189618
107	NC_017205	TAGT	2	8	35812	35819	25 %	50 %	25 %	0 %	384189618
108	NC_017205	TTAC	2	8	36058	36065	25 %	50 %	0 %	25 %	384189618
109	NC_017205	ATTT	2	8	36224	36231	25 %	75 %	0 %	0 %	384189619
110	NC_017205	TGAG	2	8	36324	36331	25 %	25 %	50 %	0 %	384189619
111	NC_017205	ATGG	2	8	37268	37275	25 %	25 %	50 %	0 %	384189621
112	NC_017205	TTTA	2	8	38410	38417	25 %	75 %	0 %	0 %	384189624
113	NC_017205	AGAT	2	8	38644	38651	50 %	25 %	25 %	0 %	384189625
114	NC_017205	CATA	2	8	38693	38700	50 %	25 %	0 %	25 %	384189625
115	NC_017205	ATGG	2	8	39109	39116	25 %	25 %	50 %	0 %	384189626
116	NC_017205	ATTT	2	8	39188	39195	25 %	75 %	0 %	0 %	384189626
117	NC_017205	AACA	2	8	39856	39863	75 %	0 %	0 %	25 %	384189628
118	NC_017205	TTTG	2	8	40128	40135	0 %	75 %	25 %	0 %	384189629
119	NC_017205	TAAA	2	8	40570	40577	75 %	25 %	0 %	0 %	384189630
120	NC_017205	ATTA	2	8	40824	40831	50 %	50 %	0 %	0 %	384189631
121	NC_017205	TAAA	2	8	40905	40912	75 %	25 %	0 %	0 %	384189631
122	NC_017205	AAAT	2	8	41280	41287	75 %	25 %	0 %	0 %	384189632
123	NC_017205	TAAA	2	8	41565	41572	75 %	25 %	0 %	0 %	384189633
124	NC_017205	TTTC	2	8	41608	41615	0 %	75 %	0 %	25 %	384189633
125	NC_017205	TCTA	2	8	41649	41656	25 %	50 %	0 %	25 %	384189633
126	NC_017205	AAGT	2	8	41689	41696	50 %	25 %	25 %	0 %	384189633
127	NC_017205	AGAA	2	8	41938	41945	75 %	0 %	25 %	0 %	384189633
128	NC_017205	AATT	2	8	41967	41974	50 %	50 %	0 %	0 %	384189633
129	NC_017205	GTAT	2	8	42145	42152	25 %	50 %	25 %	0 %	384189633
130	NC_017205	AAAT	2	8	42239	42246	75 %	25 %	0 %	0 %	384189633
131	NC_017205	GATG	2	8	42342	42349	25 %	25 %	50 %	0 %	384189634
132	NC_017205	CTTT	2	8	42427	42434	0 %	75 %	0 %	25 %	384189634
133	NC_017205	GGAA	2	8	42624	42631	50 %	0 %	50 %	0 %	384189634
134	NC_017205	GAAC	2	8	43229	43236	50 %	0 %	25 %	25 %	384189635
135	NC_017205	AATT	2	8	44432	44439	50 %	50 %	0 %	0 %	384189637
136	NC_017205	AGTA	2	8	45705	45712	50 %	25 %	25 %	0 %	384189638
137	NC_017205	AAGG	2	8	45858	45865	50 %	0 %	50 %	0 %	384189638
138	NC_017205	CTTA	2	8	46127	46134	25 %	50 %	0 %	25 %	384189638
139	NC_017205	GAAA	2	8	46329	46336	75 %	0 %	25 %	0 %	384189638
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.