MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017205	GA	3	6	219	224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017205	TA	3	6	240	245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017205	AG	3	6	461	466	50 %	0 %	50 %	0 %	384189585
4	NC_017205	CA	3	6	1601	1606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017205	CA	3	6	2318	2323	50 %	0 %	0 %	50 %	384189588
6	NC_017205	TA	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
7	NC_017205	AT	3	6	2771	2776	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
8	NC_017205	AT	3	6	3067	3072	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
9	NC_017205	AT	3	6	3160	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
10	NC_017205	AT	3	6	3608	3613	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
11	NC_017205	CA	3	6	4021	4026	50 %	0 %	0 %	50 %	384189588
12	NC_017205	GC	3	6	4236	4241	0 %	0 %	50 %	50 %	384189589
13	NC_017205	TA	3	6	5677	5682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017205	TA	3	6	7245	7250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017205	AT	3	6	7850	7855	50 %	50 %	0 %	0 %	384189592
16	NC_017205	AG	3	6	8232	8237	50 %	0 %	50 %	0 %	384189593
17	NC_017205	AT	3	6	8526	8531	50 %	50 %	0 %	0 %	384189593
18	NC_017205	AC	3	6	8681	8686	50 %	0 %	0 %	50 %	384189593
19	NC_017205	AT	3	6	10328	10333	50 %	50 %	0 %	0 %	384189593
20	NC_017205	AG	4	8	10505	10512	50 %	0 %	50 %	0 %	384189593
21	NC_017205	TA	3	6	10581	10586	50 %	50 %	0 %	0 %	384189594
22	NC_017205	TA	3	6	10654	10659	50 %	50 %	0 %	0 %	384189594
23	NC_017205	AG	4	8	10849	10856	50 %	0 %	50 %	0 %	384189594
24	NC_017205	AT	3	6	11491	11496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017205	AC	3	6	12261	12266	50 %	0 %	0 %	50 %	384189595
26	NC_017205	AT	3	6	12854	12859	50 %	50 %	0 %	0 %	384189595
27	NC_017205	CT	3	6	13046	13051	0 %	50 %	0 %	50 %	384189595
28	NC_017205	TA	4	8	14016	14023	50 %	50 %	0 %	0 %	384189596
29	NC_017205	GT	3	6	14064	14069	0 %	50 %	50 %	0 %	384189596
30	NC_017205	AT	3	6	14290	14295	50 %	50 %	0 %	0 %	384189596
31	NC_017205	TA	4	8	14400	14407	50 %	50 %	0 %	0 %	384189596
32	NC_017205	TA	3	6	15738	15743	50 %	50 %	0 %	0 %	384189598
33	NC_017205	TA	3	6	15748	15753	50 %	50 %	0 %	0 %	384189598
34	NC_017205	TA	3	6	15857	15862	50 %	50 %	0 %	0 %	384189598
35	NC_017205	AG	3	6	16422	16427	50 %	0 %	50 %	0 %	384189599
36	NC_017205	TG	3	6	16603	16608	0 %	50 %	50 %	0 %	384189599
37	NC_017205	GA	3	6	16733	16738	50 %	0 %	50 %	0 %	384189599
38	NC_017205	TA	3	6	18543	18548	50 %	50 %	0 %	0 %	384189601
39	NC_017205	TA	3	6	19125	19130	50 %	50 %	0 %	0 %	384189601
40	NC_017205	TA	3	6	19591	19596	50 %	50 %	0 %	0 %	384189602
41	NC_017205	GT	3	6	20068	20073	0 %	50 %	50 %	0 %	384189602
42	NC_017205	TA	3	6	20342	20347	50 %	50 %	0 %	0 %	384189602
43	NC_017205	TA	3	6	20351	20356	50 %	50 %	0 %	0 %	384189602
44	NC_017205	TA	3	6	20573	20578	50 %	50 %	0 %	0 %	384189602
45	NC_017205	CA	3	6	20805	20810	50 %	0 %	0 %	50 %	384189602
46	NC_017205	AT	3	6	21021	21026	50 %	50 %	0 %	0 %	384189603
47	NC_017205	GT	3	6	21433	21438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017205	AG	3	6	21500	21505	50 %	0 %	50 %	0 %	384189604
49	NC_017205	GA	3	6	22350	22355	50 %	0 %	50 %	0 %	384189604
50	NC_017205	TA	3	6	22388	22393	50 %	50 %	0 %	0 %	384189604
51	NC_017205	AT	3	6	22484	22489	50 %	50 %	0 %	0 %	384189604
52	NC_017205	AT	3	6	22925	22930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017205	TA	3	6	22949	22954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017205	AT	3	6	23033	23038	50 %	50 %	0 %	0 %	384189605
55	NC_017205	TG	3	6	23158	23163	0 %	50 %	50 %	0 %	384189605
56	NC_017205	GA	3	6	23197	23202	50 %	0 %	50 %	0 %	384189605
57	NC_017205	AT	4	8	25326	25333	50 %	50 %	0 %	0 %	384189607
58	NC_017205	AT	3	6	25948	25953	50 %	50 %	0 %	0 %	384189607
59	NC_017205	TG	3	6	26052	26057	0 %	50 %	50 %	0 %	384189607
60	NC_017205	CT	3	6	26344	26349	0 %	50 %	0 %	50 %	384189607
61	NC_017205	GA	3	6	26667	26672	50 %	0 %	50 %	0 %	384189607
62	NC_017205	TA	3	6	26809	26814	50 %	50 %	0 %	0 %	384189607
63	NC_017205	AT	4	8	27970	27977	50 %	50 %	0 %	0 %	384189608
64	NC_017205	AG	3	6	28958	28963	50 %	0 %	50 %	0 %	384189609
65	NC_017205	AT	3	6	29521	29526	50 %	50 %	0 %	0 %	384189610
66	NC_017205	TA	3	6	30926	30931	50 %	50 %	0 %	0 %	384189611
67	NC_017205	TA	3	6	31431	31436	50 %	50 %	0 %	0 %	384189612
68	NC_017205	AT	3	6	31964	31969	50 %	50 %	0 %	0 %	384189612
69	NC_017205	AT	3	6	32274	32279	50 %	50 %	0 %	0 %	384189613
70	NC_017205	AT	3	6	32336	32341	50 %	50 %	0 %	0 %	384189613
71	NC_017205	TA	3	6	32546	32551	50 %	50 %	0 %	0 %	384189613
72	NC_017205	TA	3	6	32841	32846	50 %	50 %	0 %	0 %	384189613
73	NC_017205	AT	3	6	33029	33034	50 %	50 %	0 %	0 %	384189613
74	NC_017205	TA	3	6	33635	33640	50 %	50 %	0 %	0 %	384189615
75	NC_017205	AT	3	6	35768	35773	50 %	50 %	0 %	0 %	384189618
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78	NC_017205	AT	3	6	36453	36458	50 %	50 %	0 %	0 %	384189619
79	NC_017205	TA	3	6	37073	37078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017205	AT	3	6	37097	37102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017205	GA	3	6	37126	37131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017205	AG	3	6	37161	37166	50 %	0 %	50 %	0 %	384189621
83	NC_017205	AT	3	6	37540	37545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017205	GA	3	6	37794	37799	50 %	0 %	50 %	0 %	384189623
85	NC_017205	TA	3	6	38030	38035	50 %	50 %	0 %	0 %	384189623
86	NC_017205	AG	3	6	38708	38713	50 %	0 %	50 %	0 %	384189625
87	NC_017205	AT	3	6	38859	38864	50 %	50 %	0 %	0 %	384189625
88	NC_017205	AC	3	6	38883	38888	50 %	0 %	0 %	50 %	384189625
89	NC_017205	GA	3	6	39010	39015	50 %	0 %	50 %	0 %	384189626
90	NC_017205	TG	3	6	40149	40154	0 %	50 %	50 %	0 %	384189629
91	NC_017205	TA	3	6	40157	40162	50 %	50 %	0 %	0 %	384189629
92	NC_017205	TA	4	8	40530	40537	50 %	50 %	0 %	0 %	384189630
93	NC_017205	TG	3	6	40623	40628	0 %	50 %	50 %	0 %	384189630
94	NC_017205	TA	3	6	40736	40741	50 %	50 %	0 %	0 %	384189631
95	NC_017205	TA	3	6	41664	41669	50 %	50 %	0 %	0 %	384189633
96	NC_017205	AT	3	6	41679	41684	50 %	50 %	0 %	0 %	384189633
97	NC_017205	AG	3	6	42230	42235	50 %	0 %	50 %	0 %	384189633
98	NC_017205	TA	3	6	42412	42417	50 %	50 %	0 %	0 %	384189634
99	NC_017205	AG	3	6	42706	42711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_017205	TA	3	6	44047	44052	50 %	50 %	0 %	0 %	384189637
103	NC_017205	AG	3	6	44077	44082	50 %	0 %	50 %	0 %	384189637
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105	NC_017205	GA	3	6	45350	45355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017205	GA	3	6	45368	45373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017205	TA	3	6	46354	46359	50 %	50 %	0 %	0 %	384189638
108	NC_017205	TA	3	6	46742	46747	50 %	50 %	0 %	0 %	384189638
109	NC_017205	AT	3	6	47105	47110	50 %	50 %	0 %	0 %	384189638
110	NC_017205	TA	4	8	48806	48813	50 %	50 %	0 %	0 %	384189640
111	NC_017205	AT	4	8	48852	48859	50 %	50 %	0 %	0 %	384189640
112	NC_017205	AG	3	6	49337	49342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017205	TC	3	6	49356	49361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017205	TA	3	6	49377	49382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017205	TA	3	6	49568	49573	50 %	50 %	0 %	0 %	384189641
116	NC_017205	AT	3	6	50279	50284	50 %	50 %	0 %	0 %	384189641
117	NC_017205	TA	3	6	51756	51761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017205	TA	3	6	51808	51813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017205	AT	3	6	52232	52237	50 %	50 %	0 %	0 %	384189645
120	NC_017205	AG	3	6	52384	52389	50 %	0 %	50 %	0 %	384189645
121	NC_017205	AT	4	8	52558	52565	50 %	50 %	0 %	0 %	384189646
122	NC_017205	TA	3	6	52910	52915	50 %	50 %	0 %	0 %	384189646
123	NC_017205	TA	4	8	53197	53204	50 %	50 %	0 %	0 %	384189647
124	NC_017205	TA	3	6	53240	53245	50 %	50 %	0 %	0 %	384189647
125	NC_017205	AG	3	6	53988	53993	50 %	0 %	50 %	0 %	384189648
126	NC_017205	TA	3	6	54034	54039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017205	AT	3	6	54376	54381	50 %	50 %	0 %	0 %	384189649
128	NC_017205	TA	3	6	54528	54533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017205	GT	3	6	54547	54552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_017205	AT	3	6	55889	55894	50 %	50 %	0 %	0 %	384189652
132	NC_017205	AT	4	8	56035	56042	50 %	50 %	0 %	0 %	384189652
133	NC_017205	AT	3	6	56299	56304	50 %	50 %	0 %	0 %	384189652
134	NC_017205	TA	3	6	56526	56531	50 %	50 %	0 %	0 %	384189652
135	NC_017205	GT	3	6	56597	56602	0 %	50 %	50 %	0 %	384189652
136	NC_017205	GA	3	6	56615	56620	50 %	0 %	50 %	0 %	384189652
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142	NC_017205	GA	3	6	60735	60740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017205	CA	3	6	61276	61281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017205	AT	3	6	61455	61460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017205	AT	3	6	61659	61664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.