MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017205	AG	3	6	461	466	50 %	0 %	50 %	0 %	384189585
2	NC_017205	CA	3	6	2318	2323	50 %	0 %	0 %	50 %	384189588
3	NC_017205	TA	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
4	NC_017205	AT	3	6	2771	2776	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
5	NC_017205	AT	3	6	3067	3072	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
6	NC_017205	AT	3	6	3160	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
7	NC_017205	AT	3	6	3608	3613	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
8	NC_017205	CA	3	6	4021	4026	50 %	0 %	0 %	50 %	384189588
9	NC_017205	GC	3	6	4236	4241	0 %	0 %	50 %	50 %	384189589
10	NC_017205	AT	3	6	7850	7855	50 %	50 %	0 %	0 %	384189592
11	NC_017205	AG	3	6	8232	8237	50 %	0 %	50 %	0 %	384189593
12	NC_017205	AT	3	6	8526	8531	50 %	50 %	0 %	0 %	384189593
13	NC_017205	AC	3	6	8681	8686	50 %	0 %	0 %	50 %	384189593
14	NC_017205	AT	3	6	10328	10333	50 %	50 %	0 %	0 %	384189593
15	NC_017205	AG	4	8	10505	10512	50 %	0 %	50 %	0 %	384189593
16	NC_017205	TA	3	6	10581	10586	50 %	50 %	0 %	0 %	384189594
17	NC_017205	TA	3	6	10654	10659	50 %	50 %	0 %	0 %	384189594
18	NC_017205	AG	4	8	10849	10856	50 %	0 %	50 %	0 %	384189594
19	NC_017205	AC	3	6	12261	12266	50 %	0 %	0 %	50 %	384189595
20	NC_017205	AT	3	6	12854	12859	50 %	50 %	0 %	0 %	384189595
21	NC_017205	CT	3	6	13046	13051	0 %	50 %	0 %	50 %	384189595
22	NC_017205	TA	4	8	14016	14023	50 %	50 %	0 %	0 %	384189596
23	NC_017205	GT	3	6	14064	14069	0 %	50 %	50 %	0 %	384189596
24	NC_017205	AT	3	6	14290	14295	50 %	50 %	0 %	0 %	384189596
25	NC_017205	TA	4	8	14400	14407	50 %	50 %	0 %	0 %	384189596
26	NC_017205	TA	3	6	15738	15743	50 %	50 %	0 %	0 %	384189598
27	NC_017205	TA	3	6	15748	15753	50 %	50 %	0 %	0 %	384189598
28	NC_017205	TA	3	6	15857	15862	50 %	50 %	0 %	0 %	384189598
29	NC_017205	AG	3	6	16422	16427	50 %	0 %	50 %	0 %	384189599
30	NC_017205	TG	3	6	16603	16608	0 %	50 %	50 %	0 %	384189599
31	NC_017205	GA	3	6	16733	16738	50 %	0 %	50 %	0 %	384189599
32	NC_017205	TA	3	6	18543	18548	50 %	50 %	0 %	0 %	384189601
33	NC_017205	TA	3	6	19125	19130	50 %	50 %	0 %	0 %	384189601
34	NC_017205	TA	3	6	19591	19596	50 %	50 %	0 %	0 %	384189602
35	NC_017205	GT	3	6	20068	20073	0 %	50 %	50 %	0 %	384189602
36	NC_017205	TA	3	6	20342	20347	50 %	50 %	0 %	0 %	384189602
37	NC_017205	TA	3	6	20351	20356	50 %	50 %	0 %	0 %	384189602
38	NC_017205	TA	3	6	20573	20578	50 %	50 %	0 %	0 %	384189602
39	NC_017205	CA	3	6	20805	20810	50 %	0 %	0 %	50 %	384189602
40	NC_017205	AT	3	6	21021	21026	50 %	50 %	0 %	0 %	384189603
41	NC_017205	AG	3	6	21500	21505	50 %	0 %	50 %	0 %	384189604
42	NC_017205	GA	3	6	22350	22355	50 %	0 %	50 %	0 %	384189604
43	NC_017205	TA	3	6	22388	22393	50 %	50 %	0 %	0 %	384189604
44	NC_017205	AT	3	6	22484	22489	50 %	50 %	0 %	0 %	384189604
45	NC_017205	AT	3	6	23033	23038	50 %	50 %	0 %	0 %	384189605
46	NC_017205	TG	3	6	23158	23163	0 %	50 %	50 %	0 %	384189605
47	NC_017205	GA	3	6	23197	23202	50 %	0 %	50 %	0 %	384189605
48	NC_017205	AT	4	8	25326	25333	50 %	50 %	0 %	0 %	384189607
49	NC_017205	AT	3	6	25948	25953	50 %	50 %	0 %	0 %	384189607
50	NC_017205	TG	3	6	26052	26057	0 %	50 %	50 %	0 %	384189607
51	NC_017205	CT	3	6	26344	26349	0 %	50 %	0 %	50 %	384189607
52	NC_017205	GA	3	6	26667	26672	50 %	0 %	50 %	0 %	384189607
53	NC_017205	TA	3	6	26809	26814	50 %	50 %	0 %	0 %	384189607
54	NC_017205	AT	4	8	27970	27977	50 %	50 %	0 %	0 %	384189608
55	NC_017205	AG	3	6	28958	28963	50 %	0 %	50 %	0 %	384189609
56	NC_017205	AT	3	6	29521	29526	50 %	50 %	0 %	0 %	384189610
57	NC_017205	TA	3	6	30926	30931	50 %	50 %	0 %	0 %	384189611
58	NC_017205	TA	3	6	31431	31436	50 %	50 %	0 %	0 %	384189612
59	NC_017205	AT	3	6	31964	31969	50 %	50 %	0 %	0 %	384189612
60	NC_017205	AT	3	6	32274	32279	50 %	50 %	0 %	0 %	384189613
61	NC_017205	AT	3	6	32336	32341	50 %	50 %	0 %	0 %	384189613
62	NC_017205	TA	3	6	32546	32551	50 %	50 %	0 %	0 %	384189613
63	NC_017205	TA	3	6	32841	32846	50 %	50 %	0 %	0 %	384189613
64	NC_017205	AT	3	6	33029	33034	50 %	50 %	0 %	0 %	384189613
65	NC_017205	TA	3	6	33635	33640	50 %	50 %	0 %	0 %	384189615
66	NC_017205	AT	3	6	35768	35773	50 %	50 %	0 %	0 %	384189618
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68	NC_017205	TG	3	6	36309	36314	0 %	50 %	50 %	0 %	384189619
69	NC_017205	AT	3	6	36453	36458	50 %	50 %	0 %	0 %	384189619
70	NC_017205	AG	3	6	37161	37166	50 %	0 %	50 %	0 %	384189621
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72	NC_017205	TA	3	6	38030	38035	50 %	50 %	0 %	0 %	384189623
73	NC_017205	AG	3	6	38708	38713	50 %	0 %	50 %	0 %	384189625
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82	NC_017205	TA	3	6	41664	41669	50 %	50 %	0 %	0 %	384189633
83	NC_017205	AT	3	6	41679	41684	50 %	50 %	0 %	0 %	384189633
84	NC_017205	AG	3	6	42230	42235	50 %	0 %	50 %	0 %	384189633
85	NC_017205	TA	3	6	42412	42417	50 %	50 %	0 %	0 %	384189634
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92	NC_017205	TA	3	6	46742	46747	50 %	50 %	0 %	0 %	384189638
93	NC_017205	AT	3	6	47105	47110	50 %	50 %	0 %	0 %	384189638
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95	NC_017205	AT	4	8	48852	48859	50 %	50 %	0 %	0 %	384189640
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98	NC_017205	AT	3	6	52232	52237	50 %	50 %	0 %	0 %	384189645
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103	NC_017205	TA	3	6	53240	53245	50 %	50 %	0 %	0 %	384189647
104	NC_017205	AG	3	6	53988	53993	50 %	0 %	50 %	0 %	384189648
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108	NC_017205	AT	4	8	56035	56042	50 %	50 %	0 %	0 %	384189652
109	NC_017205	AT	3	6	56299	56304	50 %	50 %	0 %	0 %	384189652
110	NC_017205	TA	3	6	56526	56531	50 %	50 %	0 %	0 %	384189652
111	NC_017205	GT	3	6	56597	56602	0 %	50 %	50 %	0 %	384189652
112	NC_017205	GA	3	6	56615	56620	50 %	0 %	50 %	0 %	384189652
113	NC_017205	TA	3	6	56643	56648	50 %	50 %	0 %	0 %	384189652
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119	NC_017205	AT	3	6	62752	62757	50 %	50 %	0 %	0 %	384189659
120	NC_017205	TA	3	6	63018	63023	50 %	50 %	0 %	0 %	384189659
121	NC_017205	TA	3	6	63120	63125	50 %	50 %	0 %	0 %	384189659
122	NC_017205	GA	3	6	63819	63824	50 %	0 %	50 %	0 %	384189661
123	NC_017205	AT	3	6	63933	63938	50 %	50 %	0 %	0 %	384189661
124	NC_017205	CA	3	6	64130	64135	50 %	0 %	0 %	50 %	384189661
125	NC_017205	AT	3	6	64187	64192	50 %	50 %	0 %	0 %	384189661
126	NC_017205	AC	3	6	64632	64637	50 %	0 %	0 %	50 %	384189662
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129	NC_017205	AG	3	6	65941	65946	50 %	0 %	50 %	0 %	384189663
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133	NC_017205	TA	3	6	68734	68739	50 %	50 %	0 %	0 %	384189666
134	NC_017205	TA	3	6	69304	69309	50 %	50 %	0 %	0 %	384189667
135	NC_017205	AG	3	6	69596	69601	50 %	0 %	50 %	0 %	384189668
136	NC_017205	TA	3	6	71480	71485	50 %	50 %	0 %	0 %	384189670

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.