MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT51

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017204	TGAAGG	2	12	1652	1663	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384183550
2	NC_017204	AACTGA	2	12	4688	4699	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384183556
3	NC_017204	AAAGAA	2	12	4940	4951	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384183556
4	NC_017204	TAAAAG	2	12	5391	5402	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183557
5	NC_017204	TAAAGG	2	12	6820	6831	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384183559
6	NC_017204	AGGAGT	2	12	9672	9683	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384183560
7	NC_017204	AATTTG	2	12	12602	12613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183565
8	NC_017204	AGGAAA	2	12	14369	14380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183566
9	NC_017204	CTGATT	2	12	15889	15900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384183567
10	NC_017204	GTTACA	2	12	18501	18512	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384183568
11	NC_017204	AGAACC	2	12	18617	18628	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384183568
12	NC_017204	TGTAGC	2	12	19628	19639	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384183568
13	NC_017204	ATGTTT	2	12	23141	23152	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384183572
14	NC_017204	TTTCTT	2	12	23789	23800	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384183573
15	NC_017204	ACAGTT	2	12	24628	24639	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384183574
16	NC_017204	AAACCA	2	12	24640	24651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183574
17	NC_017204	TATGTG	2	12	25093	25104	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384183574
18	NC_017204	AAATTC	2	12	28871	28882	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384183580
19	NC_017204	CTTTTT	2	12	28930	28941	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384183580
20	NC_017204	AAATCA	2	12	32096	32107	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384183585
21	NC_017204	TTTAAT	2	12	34247	34258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183588
22	NC_017204	GATTTT	2	12	40063	40074	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384183597
23	NC_017204	GATATT	2	12	49000	49011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183618

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.