MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT51

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017204	ATACA	2	10	1589	1598	60 %	20 %	0 %	20 %	384183550
2	NC_017204	AAATG	2	10	6583	6592	60 %	20 %	20 %	0 %	384183559
3	NC_017204	TAATT	2	10	9761	9770	40 %	60 %	0 %	0 %	384183561
4	NC_017204	AGTTT	2	10	10429	10438	20 %	60 %	20 %	0 %	384183561
5	NC_017204	GTTTG	2	10	12024	12033	0 %	60 %	40 %	0 %	384183563
6	NC_017204	AATGC	2	10	13444	13453	40 %	20 %	20 %	20 %	384183565
7	NC_017204	CAACA	2	10	15991	16000	60 %	0 %	0 %	40 %	384183567
8	NC_017204	ATTTG	2	10	16493	16502	20 %	60 %	20 %	0 %	384183567
9	NC_017204	ATACA	2	10	16840	16849	60 %	20 %	0 %	20 %	384183567
10	NC_017204	GGTTC	2	10	18426	18435	0 %	40 %	40 %	20 %	384183568
11	NC_017204	ATGAA	2	10	20581	20590	60 %	20 %	20 %	0 %	384183570
12	NC_017204	CGAAA	2	10	21640	21649	60 %	0 %	20 %	20 %	384183571
13	NC_017204	TTTGA	2	10	22421	22430	20 %	60 %	20 %	0 %	384183572
14	NC_017204	CGAAT	2	10	22831	22840	40 %	20 %	20 %	20 %	384183572
15	NC_017204	GAAAA	2	10	23947	23956	80 %	0 %	20 %	0 %	384183573
16	NC_017204	TGGAT	2	10	25261	25270	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017204	AAAGA	2	10	25371	25380	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017204	CCCCT	2	10	27576	27585	0 %	20 %	0 %	80 %	384183577
19	NC_017204	AATGT	2	10	29030	29039	40 %	40 %	20 %	0 %	384183580
20	NC_017204	TCTCT	2	10	30553	30562	0 %	60 %	0 %	40 %	384183582
21	NC_017204	AAAAG	2	10	31263	31272	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017204	TAAAT	2	10	31397	31406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017204	CCCAA	2	10	34356	34365	40 %	0 %	0 %	60 %	384183588
24	NC_017204	TTTAT	2	10	36046	36055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017204	TCATA	2	10	36083	36092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017204	CTTCT	2	10	36292	36301	0 %	60 %	0 %	40 %	384183590
27	NC_017204	GCATT	2	10	36323	36332	20 %	40 %	20 %	20 %	384183590
28	NC_017204	AAGAA	2	10	36428	36437	80 %	0 %	20 %	0 %	384183590
29	NC_017204	AAATT	2	10	38896	38905	60 %	40 %	0 %	0 %	384183595
30	NC_017204	ATTTT	2	10	40328	40337	20 %	80 %	0 %	0 %	384183597
31	NC_017204	TTAAA	2	10	41215	41224	60 %	40 %	0 %	0 %	384183599
32	NC_017204	AATTT	2	10	41299	41308	40 %	60 %	0 %	0 %	384183599
33	NC_017204	TAAAA	2	10	44143	44152	80 %	20 %	0 %	0 %	384183606
34	NC_017204	GGTGC	2	10	44340	44349	0 %	20 %	60 %	20 %	384183606
35	NC_017204	GATGG	2	10	45621	45630	20 %	20 %	60 %	0 %	384183611
36	NC_017204	CGAAG	2	10	47234	47243	40 %	0 %	40 %	20 %	384183615
37	NC_017204	GCTAT	2	10	47412	47421	20 %	40 %	20 %	20 %	384183615
38	NC_017204	AATGA	2	10	48127	48136	60 %	20 %	20 %	0 %	384183617
39	NC_017204	GGGAT	2	10	48796	48805	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017204	GATTA	2	10	49251	49260	40 %	40 %	20 %	0 %	384183618
41	NC_017204	TAATT	2	10	49272	49281	40 %	60 %	0 %	0 %	384183618
42	NC_017204	AATTG	2	10	49473	49482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017204	CAATA	2	10	49510	49519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017204	TTCAA	2	10	49721	49730	40 %	40 %	0 %	20 %	384183619

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.