MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT51

Total Repeats: 671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017204	GTC	2	6	155	160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183549
2	NC_017204	AAC	2	6	191	196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183549
3	NC_017204	AGA	3	9	231	239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
4	NC_017204	AGC	2	6	242	247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183549
5	NC_017204	AGA	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
6	NC_017204	AGA	2	6	309	314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
7	NC_017204	GCT	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183549
8	NC_017204	ATG	2	6	371	376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183549
9	NC_017204	AAG	2	6	443	448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
10	NC_017204	TGA	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183549
11	NC_017204	GAA	2	6	502	507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
12	NC_017204	GAT	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183549
13	NC_017204	TAT	2	6	603	608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183549
14	NC_017204	TTC	2	6	625	630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183549
15	NC_017204	AAT	2	6	757	762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183549
16	NC_017204	TGA	2	6	792	797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183549
17	NC_017204	GGT	2	6	826	831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183549
18	NC_017204	AGA	2	6	849	854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
19	NC_017204	TAT	2	6	908	913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183549
20	NC_017204	GCT	2	6	973	978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183549
21	NC_017204	AGG	2	6	986	991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183549
22	NC_017204	AGA	2	6	1008	1013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
23	NC_017204	CTA	2	6	1052	1057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183549
24	NC_017204	AGA	2	6	1110	1115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
25	NC_017204	GAA	2	6	1126	1131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
26	NC_017204	GCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183549
27	NC_017204	TGC	2	6	1197	1202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183549
28	NC_017204	GAA	2	6	1231	1236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183549
29	NC_017204	ACA	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183549
30	NC_017204	CAA	2	6	1323	1328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183550
31	NC_017204	TTA	2	6	1329	1334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183550
32	NC_017204	TAC	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183550
33	NC_017204	TCT	2	6	1380	1385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183550
34	NC_017204	TTA	2	6	1389	1394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183550
35	NC_017204	GGC	2	6	1512	1517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384183550
36	NC_017204	AGA	2	6	1628	1633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183550
37	NC_017204	ATC	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183550
38	NC_017204	GAA	2	6	1784	1789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183550
39	NC_017204	ATT	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183550
40	NC_017204	GAA	2	6	1851	1856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183550
41	NC_017204	TTA	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183550
42	NC_017204	CTT	2	6	2077	2082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183550
43	NC_017204	ATT	3	9	2094	2102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183550
44	NC_017204	ACA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183550
45	NC_017204	TGA	3	9	2216	2224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183550
46	NC_017204	AGT	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183551
47	NC_017204	TGC	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183551
48	NC_017204	AAG	2	6	2529	2534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183551
49	NC_017204	AAG	2	6	2595	2600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183551
50	NC_017204	AAG	2	6	2606	2611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183551
51	NC_017204	AGA	2	6	2669	2674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183552
52	NC_017204	AAG	2	6	2762	2767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183552
53	NC_017204	CTG	2	6	2804	2809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183552
54	NC_017204	ATG	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183552
55	NC_017204	GAA	2	6	2961	2966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183552
56	NC_017204	TAT	2	6	2970	2975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183552
57	NC_017204	GTT	2	6	2983	2988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183552
58	NC_017204	AGT	2	6	2994	2999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183552
59	NC_017204	ATT	2	6	3050	3055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183552
60	NC_017204	GAT	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183553
61	NC_017204	GAT	2	6	3189	3194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183553
62	NC_017204	GTA	3	9	3210	3218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183553
63	NC_017204	ACT	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183553
64	NC_017204	CTG	3	9	3313	3321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183553
65	NC_017204	GAA	2	6	3429	3434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183553
66	NC_017204	ATC	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183553
67	NC_017204	CAG	2	6	3619	3624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183554
68	NC_017204	AAG	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183554
69	NC_017204	CTG	2	6	3742	3747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183554
70	NC_017204	ATG	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183554
71	NC_017204	ATA	2	6	3996	4001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183555
72	NC_017204	GAT	2	6	4071	4076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183555
73	NC_017204	AAT	2	6	4113	4118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183555
74	NC_017204	GAT	2	6	4251	4256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183555
75	NC_017204	GTA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183555
76	NC_017204	ACT	2	6	4419	4424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183556
77	NC_017204	TAT	2	6	4539	4544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183556
78	NC_017204	TTA	2	6	4593	4598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183556
79	NC_017204	GTT	2	6	4818	4823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183556
80	NC_017204	TCT	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183556
81	NC_017204	ACC	2	6	4916	4921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183556
82	NC_017204	TGA	2	6	5067	5072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183557
83	NC_017204	CGA	2	6	5117	5122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183557
84	NC_017204	ATT	2	6	5156	5161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183557
85	NC_017204	AGC	2	6	5239	5244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183557
86	NC_017204	AGA	3	9	5257	5265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183557
87	NC_017204	AGC	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183557
88	NC_017204	GAT	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183557
89	NC_017204	GAT	2	6	5360	5365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183557
90	NC_017204	GAA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183557
91	NC_017204	CAG	3	9	5538	5546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183557
92	NC_017204	GAT	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183558
93	NC_017204	AGC	2	6	5717	5722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183558
94	NC_017204	AAG	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183558
95	NC_017204	GAA	2	6	5742	5747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183558
96	NC_017204	GAA	2	6	5782	5787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183558
97	NC_017204	TAC	2	6	5790	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183558
98	NC_017204	AGA	2	6	5883	5888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183558
99	NC_017204	AAG	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183558
100	NC_017204	ACA	2	6	6061	6066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183559
101	NC_017204	TGC	2	6	6214	6219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183559
102	NC_017204	TCT	2	6	6269	6274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183559
103	NC_017204	GAA	2	6	6413	6418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183559
104	NC_017204	AGA	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183559
105	NC_017204	GTG	2	6	6489	6494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183559
106	NC_017204	TTC	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183559
107	NC_017204	GCT	2	6	6551	6556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183559
108	NC_017204	AAG	2	6	6564	6569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183559
109	NC_017204	TAA	2	6	6967	6972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183559
110	NC_017204	AGA	2	6	7020	7025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183559
111	NC_017204	GCA	2	6	7027	7032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183559
112	NC_017204	TAC	2	6	7069	7074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183559
113	NC_017204	TCC	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183559
114	NC_017204	ATT	2	6	7139	7144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183559
115	NC_017204	TGC	2	6	7159	7164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183559
116	NC_017204	ATG	2	6	7253	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183559
117	NC_017204	ATG	2	6	7511	7516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183559
118	NC_017204	TGA	2	6	7524	7529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183559
119	NC_017204	TTC	2	6	7706	7711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183559
120	NC_017204	TTG	2	6	7826	7831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183559
121	NC_017204	GAA	2	6	7963	7968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183559
122	NC_017204	AAT	2	6	8023	8028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183559
123	NC_017204	TAC	2	6	8140	8145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183559
124	NC_017204	TCT	2	6	8177	8182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183559
125	NC_017204	TTG	2	6	8292	8297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183559
126	NC_017204	CAA	2	6	8317	8322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183559
127	NC_017204	TGT	2	6	8344	8349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183559
128	NC_017204	ATT	2	6	8510	8515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183559
129	NC_017204	GTT	2	6	8576	8581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183559
130	NC_017204	ATG	2	6	8639	8644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183559
131	NC_017204	ACC	2	6	8743	8748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183559
132	NC_017204	CTG	2	6	8808	8813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183559
133	NC_017204	GAA	2	6	8863	8868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183559
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136	NC_017204	GGT	2	6	9043	9048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183560
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140	NC_017204	CCG	2	6	9595	9600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384183560
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151	NC_017204	CAA	2	6	10609	10614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183561
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153	NC_017204	TGC	2	6	10637	10642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183561
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251	NC_017204	ATG	2	6	18016	18021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183567
252	NC_017204	GTC	2	6	18046	18051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183567
253	NC_017204	TGG	2	6	18057	18062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183567
254	NC_017204	GAA	2	6	18077	18082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183567
255	NC_017204	CTA	2	6	18132	18137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183568
256	NC_017204	CCA	2	6	18213	18218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183568
257	NC_017204	GTA	2	6	18255	18260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183568
258	NC_017204	GAT	2	6	18267	18272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183568
259	NC_017204	ACC	2	6	18530	18535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183568
260	NC_017204	GCT	2	6	18567	18572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183568
261	NC_017204	TGA	2	6	18644	18649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183568
262	NC_017204	ATT	2	6	18807	18812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183568
263	NC_017204	ATG	2	6	18832	18837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183568
264	NC_017204	AGA	2	6	18866	18871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183568
265	NC_017204	AAT	2	6	18872	18877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183568
266	NC_017204	CTT	2	6	18881	18886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183568
267	NC_017204	CTG	2	6	18892	18897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183568
268	NC_017204	GAT	2	6	19092	19097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183568
269	NC_017204	AAG	2	6	19270	19275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183568
270	NC_017204	GGC	2	6	19284	19289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384183568
271	NC_017204	TTC	2	6	19340	19345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183568
272	NC_017204	GCA	2	6	19455	19460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183568
273	NC_017204	GTT	2	6	19473	19478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183568
274	NC_017204	ATT	2	6	19527	19532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183568
275	NC_017204	ACA	2	6	19536	19541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183568
276	NC_017204	ATA	2	6	19606	19611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183568
277	NC_017204	CTA	2	6	19618	19623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183568
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279	NC_017204	AAT	2	6	19842	19847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183568
280	NC_017204	TGC	2	6	19889	19894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183568
281	NC_017204	AGG	2	6	20501	20506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183569
282	NC_017204	ATT	2	6	20574	20579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183570
283	NC_017204	GCA	2	6	20603	20608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183570
284	NC_017204	ACG	2	6	20665	20670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183570
285	NC_017204	GAA	2	6	20675	20680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183570
286	NC_017204	GGA	2	6	20844	20849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183570
287	NC_017204	TCA	2	6	20876	20881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183570
288	NC_017204	AAC	2	6	20895	20900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183570
289	NC_017204	TAC	2	6	20909	20914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183570
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293	NC_017204	CAA	2	6	21063	21068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183570
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333	NC_017204	AAG	2	6	24720	24725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183574
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341	NC_017204	CAC	2	6	25031	25036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183574
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343	NC_017204	GAC	2	6	25680	25685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183575
344	NC_017204	GTT	2	6	25744	25749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183575
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349	NC_017204	GAT	2	6	26310	26315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183576
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351	NC_017204	CCA	2	6	26353	26358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183576
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355	NC_017204	ATA	2	6	26572	26577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183576
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357	NC_017204	ATA	2	6	27229	27234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183577
358	NC_017204	ACA	2	6	27248	27253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183577
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361	NC_017204	ATA	2	6	27436	27441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183577
362	NC_017204	GAA	2	6	27480	27485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183577
363	NC_017204	CTA	2	6	27557	27562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183577
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365	NC_017204	ATA	2	6	27622	27627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183577
366	NC_017204	GAA	2	6	27711	27716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183577
367	NC_017204	TAT	2	6	27766	27771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183577
368	NC_017204	GGT	2	6	27793	27798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183577
369	NC_017204	CAG	2	6	27925	27930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183577
370	NC_017204	AAT	2	6	28020	28025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183577
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372	NC_017204	AAG	2	6	28144	28149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183577
373	NC_017204	GAA	2	6	28209	28214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183577
374	NC_017204	TGA	2	6	28230	28235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183577
375	NC_017204	TAT	2	6	28251	28256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183578
376	NC_017204	CAC	2	6	28311	28316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183578
377	NC_017204	TGG	2	6	28351	28356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183578
378	NC_017204	TGG	2	6	28387	28392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183578
379	NC_017204	ACC	2	6	28417	28422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183578
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