MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT51

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017204	AT	3	6	200	205	50 %	50 %	0 %	0 %	384183549
2	NC_017204	AG	3	6	867	872	50 %	0 %	50 %	0 %	384183549
3	NC_017204	TC	3	6	1447	1452	0 %	50 %	0 %	50 %	384183550
4	NC_017204	TA	3	6	3196	3201	50 %	50 %	0 %	0 %	384183553
5	NC_017204	AT	3	6	3372	3377	50 %	50 %	0 %	0 %	384183553
6	NC_017204	TG	3	6	3601	3606	0 %	50 %	50 %	0 %	384183554
7	NC_017204	TA	3	6	8325	8330	50 %	50 %	0 %	0 %	384183559
8	NC_017204	GA	3	6	9214	9219	50 %	0 %	50 %	0 %	384183560
9	NC_017204	AT	3	6	9327	9332	50 %	50 %	0 %	0 %	384183560
10	NC_017204	GA	3	6	9695	9700	50 %	0 %	50 %	0 %	384183560
11	NC_017204	TA	3	6	10041	10046	50 %	50 %	0 %	0 %	384183561
12	NC_017204	AT	3	6	11317	11322	50 %	50 %	0 %	0 %	384183562
13	NC_017204	TC	3	6	11495	11500	0 %	50 %	0 %	50 %	384183562
14	NC_017204	CA	3	6	13271	13276	50 %	0 %	0 %	50 %	384183565
15	NC_017204	AT	3	6	13817	13822	50 %	50 %	0 %	0 %	384183566
16	NC_017204	TA	3	6	14851	14856	50 %	50 %	0 %	0 %	384183566
17	NC_017204	AG	3	6	16037	16042	50 %	0 %	50 %	0 %	384183567
18	NC_017204	AT	3	6	16366	16371	50 %	50 %	0 %	0 %	384183567
19	NC_017204	AT	3	6	16771	16776	50 %	50 %	0 %	0 %	384183567
20	NC_017204	CA	3	6	16848	16853	50 %	0 %	0 %	50 %	384183567
21	NC_017204	GA	3	6	17848	17853	50 %	0 %	50 %	0 %	384183567
22	NC_017204	GA	3	6	17961	17966	50 %	0 %	50 %	0 %	384183567
23	NC_017204	GA	3	6	18097	18102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017204	GA	3	6	18305	18310	50 %	0 %	50 %	0 %	384183568
25	NC_017204	AT	3	6	18607	18612	50 %	50 %	0 %	0 %	384183568
26	NC_017204	AT	3	6	19695	19700	50 %	50 %	0 %	0 %	384183568
27	NC_017204	TA	3	6	20140	20145	50 %	50 %	0 %	0 %	384183569
28	NC_017204	TA	3	6	20433	20438	50 %	50 %	0 %	0 %	384183569
29	NC_017204	TA	3	6	20746	20751	50 %	50 %	0 %	0 %	384183570
30	NC_017204	TA	3	6	21167	21172	50 %	50 %	0 %	0 %	384183570
31	NC_017204	TA	3	6	25072	25077	50 %	50 %	0 %	0 %	384183574
32	NC_017204	AG	3	6	25422	25427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017204	CT	3	6	25434	25439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017204	TA	3	6	25467	25472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017204	TC	3	6	25921	25926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017204	TA	3	6	25968	25973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017204	TA	3	6	26920	26925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017204	CT	3	6	27299	27304	0 %	50 %	0 %	50 %	384183577
39	NC_017204	TA	3	6	27594	27599	50 %	50 %	0 %	0 %	384183577
40	NC_017204	TA	3	6	27987	27992	50 %	50 %	0 %	0 %	384183577
41	NC_017204	TA	3	6	28449	28454	50 %	50 %	0 %	0 %	384183578
42	NC_017204	TC	3	6	30213	30218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017204	AT	4	8	31092	31099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017204	TA	3	6	31235	31240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017204	TA	3	6	31837	31842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017204	CT	3	6	31851	31856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017204	TC	3	6	32840	32845	0 %	50 %	0 %	50 %	384183586
48	NC_017204	TA	3	6	32925	32930	50 %	50 %	0 %	0 %	384183586
49	NC_017204	GT	3	6	33456	33461	0 %	50 %	50 %	0 %	384183587
50	NC_017204	AT	3	6	34056	34061	50 %	50 %	0 %	0 %	384183587
51	NC_017204	TC	3	6	34571	34576	0 %	50 %	0 %	50 %	384183588
52	NC_017204	TA	3	6	35528	35533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017204	TG	3	6	35735	35740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017204	AG	3	6	35801	35806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017204	CT	3	6	36654	36659	0 %	50 %	0 %	50 %	384183590
56	NC_017204	TG	3	6	36780	36785	0 %	50 %	50 %	0 %	384183590
57	NC_017204	CT	3	6	36855	36860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017204	AT	3	6	36908	36913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017204	GA	3	6	38655	38660	50 %	0 %	50 %	0 %	384183595
60	NC_017204	AT	3	6	38933	38938	50 %	50 %	0 %	0 %	384183595
61	NC_017204	TA	3	6	39293	39298	50 %	50 %	0 %	0 %	384183595
62	NC_017204	TA	3	6	40491	40496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017204	AG	3	6	40599	40604	50 %	0 %	50 %	0 %	384183598
64	NC_017204	AT	3	6	40617	40622	50 %	50 %	0 %	0 %	384183598
65	NC_017204	GA	3	6	42093	42098	50 %	0 %	50 %	0 %	384183601
66	NC_017204	AC	3	6	43355	43360	50 %	0 %	0 %	50 %	384183604
67	NC_017204	AT	3	6	43744	43749	50 %	50 %	0 %	0 %	384183604
68	NC_017204	TA	3	6	44021	44026	50 %	50 %	0 %	0 %	384183605
69	NC_017204	GA	3	6	45301	45306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017204	AG	3	6	45631	45636	50 %	0 %	50 %	0 %	384183611
71	NC_017204	AG	3	6	46102	46107	50 %	0 %	50 %	0 %	384183612
72	NC_017204	AG	3	6	46238	46243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017204	CA	3	6	46490	46495	50 %	0 %	0 %	50 %	384183613
74	NC_017204	AG	3	6	46658	46663	50 %	0 %	50 %	0 %	384183614
75	NC_017204	GA	3	6	47001	47006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017204	AG	3	6	47008	47013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017204	TA	3	6	47209	47214	50 %	50 %	0 %	0 %	384183615
78	NC_017204	TA	3	6	47852	47857	50 %	50 %	0 %	0 %	384183616
79	NC_017204	TA	4	8	47990	47997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017204	TA	3	6	48015	48020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017204	AG	3	6	48312	48317	50 %	0 %	50 %	0 %	384183617
82	NC_017204	AT	4	8	48388	48395	50 %	50 %	0 %	0 %	384183617
83	NC_017204	GA	3	6	48502	48507	50 %	0 %	50 %	0 %	384183617
84	NC_017204	TA	3	6	48719	48724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017204	TC	3	6	49893	49898	0 %	50 %	0 %	50 %	384183619
86	NC_017204	AT	3	6	49997	50002	50 %	50 %	0 %	0 %	384183619
87	NC_017204	TA	3	6	50361	50366	50 %	50 %	0 %	0 %	384183619
88	NC_017204	AT	3	6	50679	50684	50 %	50 %	0 %	0 %	384183619

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.