MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT51

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017204	A	6	6	105	110	100 %	0 %	0 %	0 %	384183549
2	NC_017204	A	6	6	652	657	100 %	0 %	0 %	0 %	384183549
3	NC_017204	A	6	6	892	897	100 %	0 %	0 %	0 %	384183549
4	NC_017204	A	7	7	1260	1266	100 %	0 %	0 %	0 %	384183549
5	NC_017204	T	6	6	2304	2309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017204	T	6	6	2351	2356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017204	A	6	6	3834	3839	100 %	0 %	0 %	0 %	384183554
8	NC_017204	A	7	7	5026	5032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017204	A	6	6	5061	5066	100 %	0 %	0 %	0 %	384183557
10	NC_017204	T	6	6	5482	5487	0 %	100 %	0 %	0 %	384183557
11	NC_017204	A	6	6	7613	7618	100 %	0 %	0 %	0 %	384183559
12	NC_017204	A	7	7	7678	7684	100 %	0 %	0 %	0 %	384183559
13	NC_017204	A	7	7	7733	7739	100 %	0 %	0 %	0 %	384183559
14	NC_017204	A	7	7	7898	7904	100 %	0 %	0 %	0 %	384183559
15	NC_017204	A	6	6	8055	8060	100 %	0 %	0 %	0 %	384183559
16	NC_017204	A	6	6	8470	8475	100 %	0 %	0 %	0 %	384183559
17	NC_017204	A	7	7	8560	8566	100 %	0 %	0 %	0 %	384183559
18	NC_017204	A	6	6	8688	8693	100 %	0 %	0 %	0 %	384183559
19	NC_017204	A	6	6	9081	9086	100 %	0 %	0 %	0 %	384183560
20	NC_017204	A	6	6	10556	10561	100 %	0 %	0 %	0 %	384183561
21	NC_017204	T	6	6	11648	11653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017204	A	6	6	12470	12475	100 %	0 %	0 %	0 %	384183565
23	NC_017204	A	6	6	12757	12762	100 %	0 %	0 %	0 %	384183565
24	NC_017204	A	6	6	12875	12880	100 %	0 %	0 %	0 %	384183565
25	NC_017204	A	6	6	14387	14392	100 %	0 %	0 %	0 %	384183566
26	NC_017204	A	6	6	14876	14881	100 %	0 %	0 %	0 %	384183566
27	NC_017204	A	6	6	15235	15240	100 %	0 %	0 %	0 %	384183566
28	NC_017204	A	6	6	15352	15357	100 %	0 %	0 %	0 %	384183566
29	NC_017204	A	6	6	15628	15633	100 %	0 %	0 %	0 %	384183567
30	NC_017204	T	7	7	18198	18204	0 %	100 %	0 %	0 %	384183568
31	NC_017204	A	6	6	19041	19046	100 %	0 %	0 %	0 %	384183568
32	NC_017204	A	6	6	19158	19163	100 %	0 %	0 %	0 %	384183568
33	NC_017204	T	6	6	19425	19430	0 %	100 %	0 %	0 %	384183568
34	NC_017204	A	6	6	20365	20370	100 %	0 %	0 %	0 %	384183569
35	NC_017204	A	6	6	21182	21187	100 %	0 %	0 %	0 %	384183570
36	NC_017204	T	6	6	21761	21766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017204	A	6	6	21819	21824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017204	A	6	6	21933	21938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017204	A	7	7	21968	21974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017204	A	6	6	23439	23444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017204	A	7	7	23971	23977	100 %	0 %	0 %	0 %	384183573
42	NC_017204	A	6	6	24055	24060	100 %	0 %	0 %	0 %	384183574
43	NC_017204	A	6	6	25111	25116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017204	T	7	7	25143	25149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017204	A	7	7	25163	25169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017204	T	6	6	25174	25179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017204	A	6	6	25478	25483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017204	T	6	6	26844	26849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017204	T	7	7	26991	26997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017204	T	7	7	27064	27070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017204	A	7	7	27098	27104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017204	A	6	6	28158	28163	100 %	0 %	0 %	0 %	384183577
53	NC_017204	A	6	6	28484	28489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017204	T	7	7	28511	28517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017204	A	6	6	28576	28581	100 %	0 %	0 %	0 %	384183579
56	NC_017204	T	6	6	28703	28708	0 %	100 %	0 %	0 %	384183579
57	NC_017204	T	6	6	28952	28957	0 %	100 %	0 %	0 %	384183580
58	NC_017204	T	6	6	29431	29436	0 %	100 %	0 %	0 %	384183581
59	NC_017204	A	7	7	30350	30356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017204	T	6	6	30393	30398	0 %	100 %	0 %	0 %	384183582
61	NC_017204	A	7	7	31112	31118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017204	T	7	7	31191	31197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017204	T	6	6	31421	31426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017204	T	6	6	31462	31467	0 %	100 %	0 %	0 %	384183583
65	NC_017204	T	7	7	31740	31746	0 %	100 %	0 %	0 %	384183584
66	NC_017204	A	6	6	32357	32362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017204	A	6	6	32522	32527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017204	T	6	6	33218	33223	0 %	100 %	0 %	0 %	384183586
69	NC_017204	T	6	6	33399	33404	0 %	100 %	0 %	0 %	384183587
70	NC_017204	T	6	6	33427	33432	0 %	100 %	0 %	0 %	384183587
71	NC_017204	T	6	6	33687	33692	0 %	100 %	0 %	0 %	384183587
72	NC_017204	T	6	6	33735	33740	0 %	100 %	0 %	0 %	384183587
73	NC_017204	T	6	6	34036	34041	0 %	100 %	0 %	0 %	384183587
74	NC_017204	T	7	7	34269	34275	0 %	100 %	0 %	0 %	384183588
75	NC_017204	T	6	6	34454	34459	0 %	100 %	0 %	0 %	384183588
76	NC_017204	T	6	6	34556	34561	0 %	100 %	0 %	0 %	384183588
77	NC_017204	T	6	6	34816	34821	0 %	100 %	0 %	0 %	384183588
78	NC_017204	T	6	6	35082	35087	0 %	100 %	0 %	0 %	384183588
79	NC_017204	T	6	6	35162	35167	0 %	100 %	0 %	0 %	384183588
80	NC_017204	A	7	7	35316	35322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017204	T	6	6	35331	35336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017204	A	6	6	35346	35351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017204	T	7	7	35385	35391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017204	T	7	7	35511	35517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017204	A	6	6	35533	35538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017204	A	6	6	35592	35597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017204	A	6	6	36105	36110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017204	T	7	7	36547	36553	0 %	100 %	0 %	0 %	384183590
89	NC_017204	T	6	6	36954	36959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017204	T	7	7	37192	37198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017204	A	6	6	37583	37588	100 %	0 %	0 %	0 %	384183592
92	NC_017204	T	6	6	37892	37897	0 %	100 %	0 %	0 %	384183593
93	NC_017204	A	6	6	37965	37970	100 %	0 %	0 %	0 %	384183593
94	NC_017204	T	7	7	38029	38035	0 %	100 %	0 %	0 %	384183593
95	NC_017204	A	6	6	39396	39401	100 %	0 %	0 %	0 %	384183596
96	NC_017204	A	6	6	39659	39664	100 %	0 %	0 %	0 %	384183596
97	NC_017204	A	6	6	39737	39742	100 %	0 %	0 %	0 %	384183596
98	NC_017204	A	6	6	39770	39775	100 %	0 %	0 %	0 %	384183597
99	NC_017204	A	6	6	40128	40133	100 %	0 %	0 %	0 %	384183597
100	NC_017204	A	6	6	40459	40464	100 %	0 %	0 %	0 %	384183597
101	NC_017204	A	6	6	40631	40636	100 %	0 %	0 %	0 %	384183598
102	NC_017204	A	6	6	40777	40782	100 %	0 %	0 %	0 %	384183598
103	NC_017204	A	7	7	40808	40814	100 %	0 %	0 %	0 %	384183598
104	NC_017204	A	7	7	40892	40898	100 %	0 %	0 %	0 %	384183598
105	NC_017204	A	6	6	41604	41609	100 %	0 %	0 %	0 %	384183600
106	NC_017204	A	6	6	41611	41616	100 %	0 %	0 %	0 %	384183600
107	NC_017204	A	7	7	42246	42252	100 %	0 %	0 %	0 %	384183601
108	NC_017204	T	6	6	42458	42463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017204	T	6	6	44037	44042	0 %	100 %	0 %	0 %	384183605
110	NC_017204	T	6	6	44472	44477	0 %	100 %	0 %	0 %	384183607
111	NC_017204	A	6	6	45421	45426	100 %	0 %	0 %	0 %	384183610
112	NC_017204	A	7	7	45613	45619	100 %	0 %	0 %	0 %	384183611
113	NC_017204	A	7	7	46186	46192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017204	A	8	8	46451	46458	100 %	0 %	0 %	0 %	384183613
115	NC_017204	A	6	6	46693	46698	100 %	0 %	0 %	0 %	384183614
116	NC_017204	A	6	6	46864	46869	100 %	0 %	0 %	0 %	384183614
117	NC_017204	A	6	6	47148	47153	100 %	0 %	0 %	0 %	384183615
118	NC_017204	A	6	6	47869	47874	100 %	0 %	0 %	0 %	384183616
119	NC_017204	A	6	6	47922	47927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017204	A	7	7	48543	48549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017204	A	6	6	48774	48779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017204	A	6	6	49365	49370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017204	T	8	8	49395	49402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017204	A	6	6	49429	49434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017204	A	7	7	49577	49583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017204	T	6	6	49596	49601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017204	A	6	6	49663	49668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017204	T	6	6	49707	49712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017204	A	6	6	49974	49979	100 %	0 %	0 %	0 %	384183619
130	NC_017204	T	6	6	50002	50007	0 %	100 %	0 %	0 %	384183619
131	NC_017204	A	6	6	50234	50239	100 %	0 %	0 %	0 %	384183619
132	NC_017204	A	6	6	50439	50444	100 %	0 %	0 %	0 %	384183619
133	NC_017204	A	7	7	50603	50609	100 %	0 %	0 %	0 %	384183619
134	NC_017204	A	7	7	51151	51157	100 %	0 %	0 %	0 %	384183620

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.