MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT281

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017203	ACAAA	2	10	88	97	80 %	0 %	0 %	20 %	384183817
2	NC_017203	ATTTG	2	10	140	149	20 %	60 %	20 %	0 %	384183817
3	NC_017203	ATATC	2	10	3491	3500	40 %	40 %	0 %	20 %	384183819
4	NC_017203	TTTGT	2	10	5171	5180	0 %	80 %	20 %	0 %	384183820
5	NC_017203	CTATT	2	10	6234	6243	20 %	60 %	0 %	20 %	384183822
6	NC_017203	ATTTT	2	10	6364	6373	20 %	80 %	0 %	0 %	384183822
7	NC_017203	CTACA	2	10	7987	7996	40 %	20 %	0 %	40 %	384183823
8	NC_017203	AAAGT	2	10	8690	8699	60 %	20 %	20 %	0 %	384183823
9	NC_017203	TATTC	2	10	10295	10304	20 %	60 %	0 %	20 %	384183827
10	NC_017203	TGTTT	2	10	11636	11645	0 %	80 %	20 %	0 %	384183829
11	NC_017203	AAAAC	2	10	12605	12614	80 %	0 %	0 %	20 %	384183830
12	NC_017203	TAATA	2	10	15244	15253	60 %	40 %	0 %	0 %	384183832
13	NC_017203	TCAAT	2	10	17749	17758	40 %	40 %	0 %	20 %	384183835
14	NC_017203	AACAA	2	10	19058	19067	80 %	0 %	0 %	20 %	384183836
15	NC_017203	CCATT	2	10	20333	20342	20 %	40 %	0 %	40 %	384183837
16	NC_017203	TCTTA	2	10	28480	28489	20 %	60 %	0 %	20 %	384183845
17	NC_017203	AATAC	2	10	28656	28665	60 %	20 %	0 %	20 %	384183845
18	NC_017203	AGTAA	2	10	32207	32216	60 %	20 %	20 %	0 %	384183850
19	NC_017203	ACAGA	2	10	40501	40510	60 %	0 %	20 %	20 %	384183861
20	NC_017203	TTGCT	2	10	41975	41984	0 %	60 %	20 %	20 %	384183862
21	NC_017203	AAATT	2	10	44112	44121	60 %	40 %	0 %	0 %	384183865
22	NC_017203	GAAAA	2	10	44229	44238	80 %	0 %	20 %	0 %	384183865
23	NC_017203	ATGAA	2	10	44261	44270	60 %	20 %	20 %	0 %	384183865
24	NC_017203	TTCAA	2	10	45906	45915	40 %	40 %	0 %	20 %	384183869
25	NC_017203	TCTTT	2	10	48036	48045	0 %	80 %	0 %	20 %	384183870
26	NC_017203	ATTAT	2	10	50352	50361	40 %	60 %	0 %	0 %	384183872
27	NC_017203	AGAAA	2	10	51636	51645	80 %	0 %	20 %	0 %	384183873
28	NC_017203	ATTGA	2	10	52561	52570	40 %	40 %	20 %	0 %	384183873
29	NC_017203	TTTTA	2	10	53151	53160	20 %	80 %	0 %	0 %	384183875
30	NC_017203	AAAAT	2	10	55559	55568	80 %	20 %	0 %	0 %	384183877
31	NC_017203	TATAA	2	10	56222	56231	60 %	40 %	0 %	0 %	384183878
32	NC_017203	AATAC	2	10	58247	58256	60 %	20 %	0 %	20 %	384183882
33	NC_017203	AAGAA	2	10	58298	58307	80 %	0 %	20 %	0 %	384183882
34	NC_017203	AAATG	2	10	58504	58513	60 %	20 %	20 %	0 %	384183883
35	NC_017203	AAGAA	2	10	58568	58577	80 %	0 %	20 %	0 %	384183883
36	NC_017203	TTTCC	2	10	60974	60983	0 %	60 %	0 %	40 %	384183885
37	NC_017203	CTTTA	2	10	71889	71898	20 %	60 %	0 %	20 %	384183895
38	NC_017203	TATGG	2	10	72669	72678	20 %	40 %	40 %	0 %	384183896
39	NC_017203	TCTTT	2	10	72928	72937	0 %	80 %	0 %	20 %	384183896
40	NC_017203	CATTT	2	10	74764	74773	20 %	60 %	0 %	20 %	384183898
41	NC_017203	ACAAA	2	10	76852	76861	80 %	0 %	0 %	20 %	384183903
42	NC_017203	ATTAC	2	10	77905	77914	40 %	40 %	0 %	20 %	384183905
43	NC_017203	AATGA	2	10	79224	79233	60 %	20 %	20 %	0 %	384183906
44	NC_017203	CCTTT	2	10	80351	80360	0 %	60 %	0 %	40 %	384183906
45	NC_017203	TTTTC	2	10	80483	80492	0 %	80 %	0 %	20 %	384183906
46	NC_017203	TCGGA	2	10	81385	81394	20 %	20 %	40 %	20 %	384183907
47	NC_017203	TGTCC	2	10	81780	81789	0 %	40 %	20 %	40 %	384183908
48	NC_017203	TTCGC	2	10	83027	83036	0 %	40 %	20 %	40 %	384183908
49	NC_017203	TTTCA	2	10	85050	85059	20 %	60 %	0 %	20 %	384183910
50	NC_017203	TTCAC	2	10	88107	88116	20 %	40 %	0 %	40 %	384183911
51	NC_017203	AACCA	2	10	91010	91019	60 %	0 %	0 %	40 %	384183911
52	NC_017203	TAGAT	2	10	91805	91814	40 %	40 %	20 %	0 %	384183911
53	NC_017203	ATTTA	2	10	93266	93275	40 %	60 %	0 %	0 %	384183913
54	NC_017203	TCGTT	2	10	93965	93974	0 %	60 %	20 %	20 %	384183913
55	NC_017203	CCAGT	2	10	94331	94340	20 %	20 %	20 %	40 %	384183913
56	NC_017203	CTTTT	2	10	96721	96730	0 %	80 %	0 %	20 %	384183914
57	NC_017203	TAAAT	2	10	97117	97126	60 %	40 %	0 %	0 %	384183915
58	NC_017203	TACCA	2	10	98664	98673	40 %	20 %	0 %	40 %	384183919
59	NC_017203	CCATT	2	10	99347	99356	20 %	40 %	0 %	40 %	384183921
60	NC_017203	AATCA	2	10	100904	100913	60 %	20 %	0 %	20 %	384183923
61	NC_017203	AATCA	2	10	100916	100925	60 %	20 %	0 %	20 %	384183923
62	NC_017203	CTCAT	2	10	101388	101397	20 %	40 %	0 %	40 %	384183923
63	NC_017203	AGCGA	2	10	103037	103046	40 %	0 %	40 %	20 %	384183925
64	NC_017203	ACCTT	2	10	103317	103326	20 %	40 %	0 %	40 %	384183925
65	NC_017203	TTTTA	2	10	108876	108885	20 %	80 %	0 %	0 %	384183931
66	NC_017203	TAATG	2	10	109735	109744	40 %	40 %	20 %	0 %	384183932
67	NC_017203	CATTT	2	10	110335	110344	20 %	60 %	0 %	20 %	384183933
68	NC_017203	CTTTC	2	10	113363	113372	0 %	60 %	0 %	40 %	384183938
69	NC_017203	TTTTC	2	10	114778	114787	0 %	80 %	0 %	20 %	384183939
70	NC_017203	ATTGG	2	10	115055	115064	20 %	40 %	40 %	0 %	384183940
71	NC_017203	TCATT	2	10	117088	117097	20 %	60 %	0 %	20 %	384183943
72	NC_017203	CTTTT	2	10	117590	117599	0 %	80 %	0 %	20 %	384183943
73	NC_017203	TTTTC	2	10	117733	117742	0 %	80 %	0 %	20 %	384183943
74	NC_017203	CTTTT	2	10	122014	122023	0 %	80 %	0 %	20 %	384183947
75	NC_017203	TTGGT	2	10	122034	122043	0 %	60 %	40 %	0 %	384183947
76	NC_017203	CATCA	2	10	123360	123369	40 %	20 %	0 %	40 %	384183947
77	NC_017203	CTTCT	2	10	123928	123937	0 %	60 %	0 %	40 %	384183948
78	NC_017203	TTTCT	2	10	124270	124279	0 %	80 %	0 %	20 %	384183948
79	NC_017203	AACAA	2	10	128020	128029	80 %	0 %	0 %	20 %	384183950
80	NC_017203	TTAAT	2	10	137539	137548	40 %	60 %	0 %	0 %	384183959
81	NC_017203	AAGTG	2	10	137825	137834	40 %	20 %	40 %	0 %	384183959
82	NC_017203	TTACT	2	10	146575	146584	20 %	60 %	0 %	20 %	384183965
83	NC_017203	GAAAT	2	10	150209	150218	60 %	20 %	20 %	0 %	384183969
84	NC_017203	TTCTA	2	10	153796	153805	20 %	60 %	0 %	20 %	384183974
85	NC_017203	TTCAA	2	10	158467	158476	40 %	40 %	0 %	20 %	384183981
86	NC_017203	ATTAT	2	10	158493	158502	40 %	60 %	0 %	0 %	384183981
87	NC_017203	TGTAT	2	10	159366	159375	20 %	60 %	20 %	0 %	384183982
88	NC_017203	TGGCT	2	10	163548	163557	0 %	40 %	40 %	20 %	384183984
89	NC_017203	CATAA	2	10	164669	164678	60 %	20 %	0 %	20 %	384183985
90	NC_017203	GAAAA	2	10	164816	164825	80 %	0 %	20 %	0 %	384183985
91	NC_017203	TTAAT	2	10	168056	168065	40 %	60 %	0 %	0 %	384183987
92	NC_017203	ATATT	2	10	168581	168590	40 %	60 %	0 %	0 %	384183987
93	NC_017203	AAATT	2	10	171594	171603	60 %	40 %	0 %	0 %	384183992
94	NC_017203	AATTA	2	10	171677	171686	60 %	40 %	0 %	0 %	384183992
95	NC_017203	AAGAG	2	10	172099	172108	60 %	0 %	40 %	0 %	384183993
96	NC_017203	GATAT	2	10	174778	174787	40 %	40 %	20 %	0 %	384183994
97	NC_017203	GGAGA	2	10	181373	181382	40 %	0 %	60 %	0 %	384183997
98	NC_017203	AGGAA	2	10	187229	187238	60 %	0 %	40 %	0 %	384184006
99	NC_017203	TTTTG	2	10	187638	187647	0 %	80 %	20 %	0 %	384184008
100	NC_017203	TTACA	2	10	187782	187791	40 %	40 %	0 %	20 %	384184008
101	NC_017203	ATGGA	2	10	192276	192285	40 %	20 %	40 %	0 %	384184010
102	NC_017203	AATGC	2	10	193239	193248	40 %	20 %	20 %	20 %	384184010
103	NC_017203	GAAAT	2	10	195388	195397	60 %	20 %	20 %	0 %	384184012
104	NC_017203	GTATG	2	10	196686	196695	20 %	40 %	40 %	0 %	384184014
105	NC_017203	TTCTT	2	10	196704	196713	0 %	80 %	0 %	20 %	384184014
106	NC_017203	CCATA	2	10	196989	196998	40 %	20 %	0 %	40 %	384184015
107	NC_017203	TTCCG	2	10	197108	197117	0 %	40 %	20 %	40 %	384184015
108	NC_017203	ATTTT	2	10	197756	197765	20 %	80 %	0 %	0 %	384184017
109	NC_017203	GGAAA	2	10	197916	197925	60 %	0 %	40 %	0 %	384184018
110	NC_017203	AATGA	2	10	201955	201964	60 %	20 %	20 %	0 %	384184022
111	NC_017203	AAAGA	2	10	202456	202465	80 %	0 %	20 %	0 %	384184022
112	NC_017203	AGAAA	2	10	204346	204355	80 %	0 %	20 %	0 %	384184024
113	NC_017203	TGTAA	2	10	205669	205678	40 %	40 %	20 %	0 %	384184027
114	NC_017203	CGAAA	2	10	207083	207092	60 %	0 %	20 %	20 %	384184028
115	NC_017203	AATTT	2	10	207833	207842	40 %	60 %	0 %	0 %	384184031
116	NC_017203	CATTA	2	10	209507	209516	40 %	40 %	0 %	20 %	384184033
117	NC_017203	TGAAA	2	10	212557	212566	60 %	20 %	20 %	0 %	384184036
118	NC_017203	TAACA	2	10	215594	215603	60 %	20 %	0 %	20 %	384184040
119	NC_017203	AAAAC	2	10	215739	215748	80 %	0 %	0 %	20 %	384184040
120	NC_017203	TGTTT	2	10	219348	219357	0 %	80 %	20 %	0 %	384184043
121	NC_017203	TTGTT	2	10	220999	221008	0 %	80 %	20 %	0 %	384184045
122	NC_017203	GATGG	2	10	221126	221135	20 %	20 %	60 %	0 %	384184045
123	NC_017203	TTAAA	2	10	222164	222173	60 %	40 %	0 %	0 %	384184046
124	NC_017203	AGACG	2	10	222513	222522	40 %	0 %	40 %	20 %	384184046
125	NC_017203	AAACA	2	10	225738	225747	80 %	0 %	0 %	20 %	384184049
126	NC_017203	AAGAT	2	10	227456	227465	60 %	20 %	20 %	0 %	384184050
127	NC_017203	AACCT	2	10	229305	229314	40 %	20 %	0 %	40 %	384184051
128	NC_017203	TTAGT	2	10	235134	235143	20 %	60 %	20 %	0 %	384184057
129	NC_017203	TTCAA	2	10	236979	236988	40 %	40 %	0 %	20 %	384184059
130	NC_017203	TTCTA	2	10	237830	237839	20 %	60 %	0 %	20 %	384184060
131	NC_017203	ATATT	2	10	238470	238479	40 %	60 %	0 %	0 %	384184061
132	NC_017203	ATATA	2	10	238600	238609	60 %	40 %	0 %	0 %	384184061
133	NC_017203	ATATT	2	10	238651	238660	40 %	60 %	0 %	0 %	384184061
134	NC_017203	TAAAT	2	10	239176	239185	60 %	40 %	0 %	0 %	384184062
135	NC_017203	GAACT	2	10	242187	242196	40 %	20 %	20 %	20 %	384184064
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.