MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017202	TTTAAT	2	12	4937	4948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183677
2	NC_017202	AATACG	2	12	5233	5244	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384183677
3	NC_017202	GAAATG	2	12	10665	10676	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017202	AAAGAG	2	12	14009	14020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183687
5	NC_017202	ATTCAT	2	12	23065	23076	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384183693
6	NC_017202	CGTATT	2	12	24011	24022	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384183694
7	NC_017202	TTCATA	2	12	24147	24158	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384183694
8	NC_017202	GTAAAA	2	12	27302	27313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183695
9	NC_017202	AATATA	2	12	29357	29368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017202	AAATAA	2	12	37272	37283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017202	TGATAA	2	12	41271	41282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183709
12	NC_017202	AAAAGA	2	12	43562	43573	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384183711
13	NC_017202	AGAAAA	2	12	46263	46274	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384183713
14	NC_017202	TATTTT	2	12	46820	46831	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017202	ATGCCC	2	12	52673	52684	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384183716
16	NC_017202	GATTTT	2	12	52721	52732	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384183716
17	NC_017202	TTAAAA	2	12	54679	54690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183719
18	NC_017202	TGCTCT	2	12	57736	57747	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384183724
19	NC_017202	TGCTGT	2	12	58669	58680	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384183725
20	NC_017202	TATTAA	2	12	59381	59392	50 %	50 %	0 %	0 %	384183725
21	NC_017202	TTATTT	2	12	62684	62695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384183730
22	NC_017202	ACCTGA	2	12	66826	66837	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384183734
23	NC_017202	GCATTA	2	12	70947	70958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017202	ACAGTA	2	12	74157	74168	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384183743
25	NC_017202	ACTACA	2	12	74184	74195	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384183743
26	NC_017202	GGCGTG	2	12	75129	75140	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017202	GATAAA	4	24	75944	75967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183745
28	NC_017202	ATGAAT	2	12	76196	76207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183745
29	NC_017202	GAAAAG	2	12	76296	76307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183745
30	NC_017202	AAAGGA	2	12	79893	79904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183749
31	NC_017202	GCAAAT	2	12	80063	80074	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384183749
32	NC_017202	AAATGT	2	12	80357	80368	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183749
33	NC_017202	ATTTTA	2	12	83620	83631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183752
34	NC_017202	TTGAAA	2	12	84198	84209	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183752
35	NC_017202	ATGAAA	2	12	85098	85109	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183754
36	NC_017202	TTTAAG	2	12	85846	85857	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183755
37	NC_017202	AGAAAA	2	12	87543	87554	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384183755
38	NC_017202	GTATCC	2	12	88197	88208	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384183757
39	NC_017202	AAACTG	2	12	88293	88304	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384183757
40	NC_017202	AAAATA	2	12	88557	88568	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384183757
41	NC_017202	GAAAAA	2	12	89636	89647	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384183757
42	NC_017202	GAAAAA	2	12	89804	89815	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384183757
43	NC_017202	ATGTAG	2	12	90735	90746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183758
44	NC_017202	ATATTT	2	12	90972	90983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183758
45	NC_017202	TCAAAT	2	12	91551	91562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384183759
46	NC_017202	GATATT	2	12	93113	93124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183760
47	NC_017202	TTATGA	2	12	93190	93201	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183760
48	NC_017202	GGTATT	2	12	95148	95159	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384183762
49	NC_017202	AAGGAA	2	12	96876	96887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183764
50	NC_017202	TGAATA	2	12	98298	98309	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183768
51	NC_017202	TTTTAA	2	12	99745	99756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017202	AAAATG	2	12	100787	100798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183772
53	NC_017202	TTAAAA	2	12	105678	105689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183776
54	NC_017202	TTTGCA	2	12	107704	107715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384183779
55	NC_017202	AATGCA	2	12	107962	107973	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017202	AGTTAG	2	12	109546	109557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183782
57	NC_017202	TTTGGA	2	12	112591	112602	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384183789
58	NC_017202	AATTAG	2	12	117727	117738	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183799
59	NC_017202	AAATTT	2	12	118332	118343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017202	AATAAA	2	12	119181	119192	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384183801
61	NC_017202	TAGAAA	2	12	119507	119518	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183802
62	NC_017202	AATGTG	2	12	120972	120983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183806
63	NC_017202	ATCAGA	2	12	121450	121461	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384183806
64	NC_017202	TTTGGT	2	12	121918	121929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183807

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.