MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017202	TACAG	2	10	729	738	40 %	20 %	20 %	20 %	384183675
2	NC_017202	AAGCA	2	10	1519	1528	60 %	0 %	20 %	20 %	384183676
3	NC_017202	GTATA	2	10	1547	1556	40 %	40 %	20 %	0 %	384183676
4	NC_017202	TGAAT	2	10	2267	2276	40 %	40 %	20 %	0 %	384183676
5	NC_017202	GATAT	2	10	7714	7723	40 %	40 %	20 %	0 %	384183681
6	NC_017202	CAAGT	2	10	12855	12864	40 %	20 %	20 %	20 %	384183686
7	NC_017202	AAAGT	2	10	13521	13530	60 %	20 %	20 %	0 %	384183687
8	NC_017202	TACAG	2	10	15918	15927	40 %	20 %	20 %	20 %	384183689
9	NC_017202	AAGCA	2	10	16708	16717	60 %	0 %	20 %	20 %	384183690
10	NC_017202	GTATA	2	10	16736	16745	40 %	40 %	20 %	0 %	384183690
11	NC_017202	TGAAT	2	10	17456	17465	40 %	40 %	20 %	0 %	384183690
12	NC_017202	TCGGT	2	10	20569	20578	0 %	40 %	40 %	20 %	384183692
13	NC_017202	GTTTT	2	10	22356	22365	0 %	80 %	20 %	0 %	384183693
14	NC_017202	AACAA	2	10	24511	24520	80 %	0 %	0 %	20 %	384183694
15	NC_017202	CATTT	2	10	30870	30879	20 %	60 %	0 %	20 %	384183698
16	NC_017202	CTCTT	2	10	32010	32019	0 %	60 %	0 %	40 %	384183698
17	NC_017202	ATGAT	2	10	35234	35243	40 %	40 %	20 %	0 %	384183703
18	NC_017202	CCAAT	2	10	40415	40424	40 %	20 %	0 %	40 %	384183708
19	NC_017202	AAAGA	2	10	41362	41371	80 %	0 %	20 %	0 %	384183709
20	NC_017202	AAAGA	2	10	43211	43220	80 %	0 %	20 %	0 %	384183711
21	NC_017202	TTAAA	2	10	45304	45313	60 %	40 %	0 %	0 %	384183712
22	NC_017202	GTAAT	2	10	45750	45759	40 %	40 %	20 %	0 %	384183713
23	NC_017202	TATCA	2	10	48261	48270	40 %	40 %	0 %	20 %	384183714
24	NC_017202	ATTTA	2	10	49510	49519	40 %	60 %	0 %	0 %	384183714
25	NC_017202	ATTTA	2	10	49783	49792	40 %	60 %	0 %	0 %	384183714
26	NC_017202	GAACA	2	10	54025	54034	60 %	0 %	20 %	20 %	384183718
27	NC_017202	TTATT	2	10	55032	55041	20 %	80 %	0 %	0 %	384183719
28	NC_017202	AAATT	2	10	56497	56506	60 %	40 %	0 %	0 %	384183721
29	NC_017202	CATTT	2	10	58263	58272	20 %	60 %	0 %	20 %	384183725
30	NC_017202	TAATC	2	10	60350	60359	40 %	40 %	0 %	20 %	384183727
31	NC_017202	CAATG	2	10	60494	60503	40 %	20 %	20 %	20 %	384183727
32	NC_017202	CTAAT	2	10	65873	65882	40 %	40 %	0 %	20 %	384183732
33	NC_017202	TTAGT	2	10	65993	66002	20 %	60 %	20 %	0 %	384183732
34	NC_017202	CATAC	2	10	66449	66458	40 %	20 %	0 %	40 %	384183733
35	NC_017202	CATTT	2	10	66943	66952	20 %	60 %	0 %	20 %	384183734
36	NC_017202	ATTTT	2	10	67292	67301	20 %	80 %	0 %	0 %	384183734
37	NC_017202	TAATA	2	10	67353	67362	60 %	40 %	0 %	0 %	384183734
38	NC_017202	AAAAG	2	10	70014	70023	80 %	0 %	20 %	0 %	384183738
39	NC_017202	TTTAT	2	10	71495	71504	20 %	80 %	0 %	0 %	384183741
40	NC_017202	TCTTT	2	10	71659	71668	0 %	80 %	0 %	20 %	384183741
41	NC_017202	TTGGT	2	10	72635	72644	0 %	60 %	40 %	0 %	384183741
42	NC_017202	TAAAG	2	10	73644	73653	60 %	20 %	20 %	0 %	384183743
43	NC_017202	ATTTT	2	10	75620	75629	20 %	80 %	0 %	0 %	384183744
44	NC_017202	GAAAA	2	10	75972	75981	80 %	0 %	20 %	0 %	384183745
45	NC_017202	AAGAA	2	10	76186	76195	80 %	0 %	20 %	0 %	384183745
46	NC_017202	GTATG	2	10	80755	80764	20 %	40 %	40 %	0 %	384183750
47	NC_017202	ACTAA	2	10	81211	81220	60 %	20 %	0 %	20 %	384183751
48	NC_017202	ATTAG	2	10	81331	81340	40 %	40 %	20 %	0 %	384183751
49	NC_017202	ATAAA	2	10	83164	83173	80 %	20 %	0 %	0 %	384183752
50	NC_017202	GTTGA	2	10	84411	84420	20 %	40 %	40 %	0 %	384183752
51	NC_017202	AGTTT	2	10	85321	85330	20 %	60 %	20 %	0 %	384183754
52	NC_017202	TAGTT	2	10	86025	86034	20 %	60 %	20 %	0 %	384183755
53	NC_017202	ATTTA	2	10	86231	86240	40 %	60 %	0 %	0 %	384183755
54	NC_017202	TGAAA	2	10	88633	88642	60 %	20 %	20 %	0 %	384183757
55	NC_017202	AATTC	2	10	89766	89775	40 %	40 %	0 %	20 %	384183757
56	NC_017202	ACGAG	2	10	93821	93830	40 %	0 %	40 %	20 %	384183761
57	NC_017202	TTAGT	2	10	95704	95713	20 %	60 %	20 %	0 %	384183762
58	NC_017202	ATCAT	2	10	96701	96710	40 %	40 %	0 %	20 %	384183763
59	NC_017202	TAAAA	2	10	96921	96930	80 %	20 %	0 %	0 %	384183764
60	NC_017202	CAAAG	2	10	97417	97426	60 %	0 %	20 %	20 %	384183766
61	NC_017202	ACCCT	2	10	98592	98601	20 %	20 %	0 %	60 %	384183768
62	NC_017202	TAAAG	2	10	98686	98695	60 %	20 %	20 %	0 %	384183768
63	NC_017202	ACGAA	2	10	99540	99549	60 %	0 %	20 %	20 %	384183769
64	NC_017202	GGTAA	2	10	100612	100621	40 %	20 %	40 %	0 %	384183771
65	NC_017202	ATTAA	2	10	102404	102413	60 %	40 %	0 %	0 %	384183774
66	NC_017202	AAAAG	2	10	102418	102427	80 %	0 %	20 %	0 %	384183774
67	NC_017202	GGGAT	2	10	102976	102985	20 %	20 %	60 %	0 %	384183774
68	NC_017202	ATTGA	2	10	103652	103661	40 %	40 %	20 %	0 %	384183774
69	NC_017202	TATTT	2	10	104965	104974	20 %	80 %	0 %	0 %	384183776
70	NC_017202	TACTT	2	10	105272	105281	20 %	60 %	0 %	20 %	384183776
71	NC_017202	AATTT	2	10	108186	108195	40 %	60 %	0 %	0 %	384183780
72	NC_017202	ATTGT	2	10	109327	109336	20 %	60 %	20 %	0 %	384183782
73	NC_017202	GTTGA	2	10	109641	109650	20 %	40 %	40 %	0 %	384183783
74	NC_017202	AACCA	2	10	109783	109792	60 %	0 %	0 %	40 %	384183783
75	NC_017202	AAAGA	2	10	109852	109861	80 %	0 %	20 %	0 %	384183783
76	NC_017202	GAAAT	2	10	111039	111048	60 %	20 %	20 %	0 %	384183785
77	NC_017202	CATCC	2	10	114479	114488	20 %	20 %	0 %	60 %	384183794
78	NC_017202	GAAAA	2	10	118839	118848	80 %	0 %	20 %	0 %	384183801
79	NC_017202	ACAAA	2	10	120169	120178	80 %	0 %	0 %	20 %	384183803
80	NC_017202	TTAAA	2	10	122159	122168	60 %	40 %	0 %	0 %	384183807
81	NC_017202	AAACA	2	10	122798	122807	80 %	0 %	0 %	20 %	384183807
82	NC_017202	AAGAT	2	10	123776	123785	60 %	20 %	20 %	0 %	384183809
83	NC_017202	TCAAA	2	10	125555	125564	60 %	20 %	0 %	20 %	384183811
84	NC_017202	TCAAT	2	10	126904	126913	40 %	40 %	0 %	20 %	384183813
85	NC_017202	TTTTA	2	10	127536	127545	20 %	80 %	0 %	0 %	384183815

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.