MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127

Total Repeats: 1425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017202	TCT	2	6	162	167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183675
2	NC_017202	TAG	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183675
3	NC_017202	CAA	2	6	405	410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183675
4	NC_017202	TTG	2	6	475	480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183675
5	NC_017202	ATA	2	6	520	525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183675
6	NC_017202	TAT	2	6	632	637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183675
7	NC_017202	AGG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183675
8	NC_017202	AAC	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183675
9	NC_017202	TTA	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183675
10	NC_017202	GTC	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183675
11	NC_017202	TTA	2	6	829	834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183675
12	NC_017202	CTT	2	6	854	859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183675
13	NC_017202	ACT	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183675
14	NC_017202	GAA	2	6	1278	1283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
15	NC_017202	TCT	2	6	1365	1370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
16	NC_017202	TTA	2	6	1386	1391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
17	NC_017202	CAA	2	6	1404	1409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183676
18	NC_017202	AAT	2	6	1422	1427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183676
19	NC_017202	TTC	2	6	1480	1485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
20	NC_017202	ATG	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
21	NC_017202	TTA	2	6	1999	2004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
22	NC_017202	GAA	2	6	2103	2108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
23	NC_017202	AAC	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183676
24	NC_017202	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
25	NC_017202	CGA	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183676
26	NC_017202	ATG	3	9	2350	2358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
27	NC_017202	TAT	2	6	2379	2384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
28	NC_017202	CAT	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
29	NC_017202	TGA	2	6	2468	2473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
30	NC_017202	ATG	2	6	2488	2493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
31	NC_017202	AGA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
32	NC_017202	CTT	2	6	2706	2711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
33	NC_017202	ATG	3	9	2950	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183676
34	NC_017202	ATC	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
35	NC_017202	CTT	3	9	3037	3045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
36	NC_017202	TAC	2	6	3179	3184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
37	NC_017202	CTT	2	6	3219	3224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183676
38	NC_017202	CAT	2	6	3225	3230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183676
39	NC_017202	GAA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
40	NC_017202	TTG	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183676
41	NC_017202	CTC	2	6	3325	3330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183676
42	NC_017202	TGG	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183676
43	NC_017202	AGA	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
44	NC_017202	TAA	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183676
45	NC_017202	TAA	2	6	3608	3613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183676
46	NC_017202	ATT	2	6	3759	3764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183676
47	NC_017202	AGA	2	6	3809	3814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
48	NC_017202	AGA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183676
49	NC_017202	ACA	2	6	4214	4219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183677
50	NC_017202	ATA	2	6	4223	4228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183677
51	NC_017202	TCT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
52	NC_017202	TTC	2	6	4271	4276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
53	NC_017202	AGG	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183677
54	NC_017202	ATC	2	6	4367	4372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183677
55	NC_017202	AGA	2	6	4444	4449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183677
56	NC_017202	ATG	2	6	4519	4524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183677
57	NC_017202	CTT	2	6	4797	4802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
58	NC_017202	TCT	2	6	4991	4996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
59	NC_017202	ATT	2	6	5077	5082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183677
60	NC_017202	ACC	2	6	5170	5175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183677
61	NC_017202	TCG	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183677
62	NC_017202	ATA	2	6	5304	5309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183677
63	NC_017202	TTA	2	6	5357	5362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183677
64	NC_017202	TTC	2	6	5527	5532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183677
65	NC_017202	CGG	2	6	6009	6014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384183678
66	NC_017202	CCA	2	6	6262	6267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183678
67	NC_017202	AGA	2	6	6384	6389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183678
68	NC_017202	AGA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183679
69	NC_017202	AGG	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183679
70	NC_017202	TAA	2	6	6768	6773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183679
71	NC_017202	ATT	2	6	6838	6843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183680
72	NC_017202	AAG	2	6	6853	6858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183680
73	NC_017202	CAG	2	6	6885	6890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183680
74	NC_017202	TAA	2	6	6934	6939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183680
75	NC_017202	GAC	2	6	7025	7030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183680
76	NC_017202	ACC	2	6	7042	7047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183680
77	NC_017202	TGA	2	6	7249	7254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183680
78	NC_017202	ACA	2	6	7636	7641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183681
79	NC_017202	TAA	2	6	7706	7711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183681
80	NC_017202	AGA	2	6	7726	7731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183681
81	NC_017202	AAG	2	6	7805	7810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183681
82	NC_017202	AGA	2	6	7872	7877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183681
83	NC_017202	AGA	3	9	7914	7922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183681
84	NC_017202	AGA	2	6	8633	8638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183682
85	NC_017202	ACA	2	6	8687	8692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183682
86	NC_017202	AGA	2	6	8769	8774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183682
87	NC_017202	ACT	2	6	9604	9609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183683
88	NC_017202	ATG	2	6	9633	9638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183683
89	NC_017202	GAG	2	6	9651	9656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183683
90	NC_017202	AGA	2	6	9935	9940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183683
91	NC_017202	GAA	2	6	9981	9986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183683
92	NC_017202	TAA	2	6	10067	10072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183683
93	NC_017202	AGA	2	6	10139	10144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183683
94	NC_017202	CTT	2	6	10208	10213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183683
95	NC_017202	AAG	2	6	10422	10427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183683
96	NC_017202	GCG	2	6	10510	10515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384183683
97	NC_017202	TTA	2	6	10603	10608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183683
98	NC_017202	TCC	2	6	10754	10759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384183684
99	NC_017202	TAA	2	6	12055	12060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183685
100	NC_017202	TGT	2	6	12061	12066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183685
101	NC_017202	TGT	2	6	12798	12803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183686
102	NC_017202	CAG	2	6	13395	13400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183687
103	NC_017202	CGG	2	6	13425	13430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384183687
104	NC_017202	CAG	2	6	13437	13442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183687
105	NC_017202	TAA	2	6	13465	13470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183687
106	NC_017202	TAG	2	6	13498	13503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183687
107	NC_017202	AGA	2	6	13510	13515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183687
108	NC_017202	AAC	2	6	13584	13589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183687
109	NC_017202	AGA	2	6	13645	13650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183687
110	NC_017202	CTT	2	6	13862	13867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183687
111	NC_017202	TGA	2	6	13951	13956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183687
112	NC_017202	AGA	2	6	13969	13974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183687
113	NC_017202	TGA	2	6	14002	14007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183687
114	NC_017202	AGA	2	6	14176	14181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183688
115	NC_017202	GAA	2	6	14189	14194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183688
116	NC_017202	TGA	2	6	14220	14225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183688
117	NC_017202	TTG	2	6	14369	14374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183688
118	NC_017202	GAT	2	6	14381	14386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183688
119	NC_017202	TTG	3	9	14387	14395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183688
120	NC_017202	TTG	2	6	14486	14491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183688
121	NC_017202	GAT	2	6	14646	14651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183688
122	NC_017202	CTT	2	6	14671	14676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183688
123	NC_017202	GTT	2	6	14752	14757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183688
124	NC_017202	ATT	2	6	14762	14767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183688
125	NC_017202	TCT	2	6	15351	15356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183689
126	NC_017202	TAG	2	6	15548	15553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183689
127	NC_017202	CAA	2	6	15594	15599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183689
128	NC_017202	TTG	2	6	15664	15669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183689
129	NC_017202	ATA	2	6	15709	15714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183689
130	NC_017202	TAT	2	6	15821	15826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183689
131	NC_017202	AGG	2	6	15839	15844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183689
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