MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017202	GT	3	6	508	513	0 %	50 %	50 %	0 %	384183675
2	NC_017202	TA	3	6	2553	2558	50 %	50 %	0 %	0 %	384183676
3	NC_017202	AC	3	6	3300	3305	50 %	0 %	0 %	50 %	384183676
4	NC_017202	GT	3	6	3775	3780	0 %	50 %	50 %	0 %	384183676
5	NC_017202	TA	3	6	3790	3795	50 %	50 %	0 %	0 %	384183676
6	NC_017202	AT	3	6	4636	4641	50 %	50 %	0 %	0 %	384183677
7	NC_017202	AT	3	6	4953	4958	50 %	50 %	0 %	0 %	384183677
8	NC_017202	AT	3	6	5185	5190	50 %	50 %	0 %	0 %	384183677
9	NC_017202	AC	3	6	6365	6370	50 %	0 %	0 %	50 %	384183678
10	NC_017202	TA	3	6	6592	6597	50 %	50 %	0 %	0 %	384183679
11	NC_017202	AG	3	6	6737	6742	50 %	0 %	50 %	0 %	384183679
12	NC_017202	GA	3	6	7258	7263	50 %	0 %	50 %	0 %	384183680
13	NC_017202	GA	3	6	7730	7735	50 %	0 %	50 %	0 %	384183681
14	NC_017202	AT	3	6	7762	7767	50 %	50 %	0 %	0 %	384183681
15	NC_017202	AG	3	6	7936	7941	50 %	0 %	50 %	0 %	384183681
16	NC_017202	TA	3	6	9970	9975	50 %	50 %	0 %	0 %	384183683
17	NC_017202	AT	3	6	10095	10100	50 %	50 %	0 %	0 %	384183683
18	NC_017202	TA	3	6	10717	10722	50 %	50 %	0 %	0 %	384183684
19	NC_017202	TC	3	6	14204	14209	0 %	50 %	0 %	50 %	384183688
20	NC_017202	AG	3	6	14264	14269	50 %	0 %	50 %	0 %	384183688
21	NC_017202	GT	3	6	15697	15702	0 %	50 %	50 %	0 %	384183689
22	NC_017202	TA	3	6	17742	17747	50 %	50 %	0 %	0 %	384183690
23	NC_017202	AC	3	6	18489	18494	50 %	0 %	0 %	50 %	384183690
24	NC_017202	GT	3	6	18964	18969	0 %	50 %	50 %	0 %	384183690
25	NC_017202	TA	3	6	18979	18984	50 %	50 %	0 %	0 %	384183690
26	NC_017202	CT	3	6	20216	20221	0 %	50 %	0 %	50 %	384183692
27	NC_017202	AT	3	6	22103	22108	50 %	50 %	0 %	0 %	384183693
28	NC_017202	TA	4	8	22330	22337	50 %	50 %	0 %	0 %	384183693
29	NC_017202	TA	3	6	22392	22397	50 %	50 %	0 %	0 %	384183693
30	NC_017202	AG	3	6	22892	22897	50 %	0 %	50 %	0 %	384183693
31	NC_017202	AC	3	6	22925	22930	50 %	0 %	0 %	50 %	384183693
32	NC_017202	AT	3	6	23018	23023	50 %	50 %	0 %	0 %	384183693
33	NC_017202	TG	3	6	24198	24203	0 %	50 %	50 %	0 %	384183694
34	NC_017202	AT	3	6	24271	24276	50 %	50 %	0 %	0 %	384183694
35	NC_017202	TC	3	6	24300	24305	0 %	50 %	0 %	50 %	384183694
36	NC_017202	AC	3	6	24318	24323	50 %	0 %	0 %	50 %	384183694
37	NC_017202	TA	3	6	24389	24394	50 %	50 %	0 %	0 %	384183694
38	NC_017202	TA	3	6	24615	24620	50 %	50 %	0 %	0 %	384183694
39	NC_017202	TA	3	6	26277	26282	50 %	50 %	0 %	0 %	384183695
40	NC_017202	TC	3	6	26318	26323	0 %	50 %	0 %	50 %	384183695
41	NC_017202	AT	3	6	26689	26694	50 %	50 %	0 %	0 %	384183695
42	NC_017202	TC	3	6	27038	27043	0 %	50 %	0 %	50 %	384183695
43	NC_017202	TA	3	6	27238	27243	50 %	50 %	0 %	0 %	384183695
44	NC_017202	AG	3	6	28532	28537	50 %	0 %	50 %	0 %	384183695
45	NC_017202	TC	3	6	28541	28546	0 %	50 %	0 %	50 %	384183695
46	NC_017202	TA	3	6	28657	28662	50 %	50 %	0 %	0 %	384183695
47	NC_017202	CA	3	6	30704	30709	50 %	0 %	0 %	50 %	384183698
48	NC_017202	TA	3	6	30834	30839	50 %	50 %	0 %	0 %	384183698
49	NC_017202	AT	3	6	31157	31162	50 %	50 %	0 %	0 %	384183698
50	NC_017202	AT	3	6	31453	31458	50 %	50 %	0 %	0 %	384183698
51	NC_017202	AT	3	6	31546	31551	50 %	50 %	0 %	0 %	384183698
52	NC_017202	AT	3	6	31994	31999	50 %	50 %	0 %	0 %	384183698
53	NC_017202	CA	3	6	32407	32412	50 %	0 %	0 %	50 %	384183698
54	NC_017202	GC	3	6	32622	32627	0 %	0 %	50 %	50 %	384183699
55	NC_017202	AT	3	6	35200	35205	50 %	50 %	0 %	0 %	384183702
56	NC_017202	GA	3	6	35839	35844	50 %	0 %	50 %	0 %	384183703
57	NC_017202	AT	3	6	37512	37517	50 %	50 %	0 %	0 %	384183704
58	NC_017202	AT	3	6	37658	37663	50 %	50 %	0 %	0 %	384183704
59	NC_017202	TA	3	6	37705	37710	50 %	50 %	0 %	0 %	384183705
60	NC_017202	AT	3	6	39221	39226	50 %	50 %	0 %	0 %	384183707
61	NC_017202	TA	3	6	40284	40289	50 %	50 %	0 %	0 %	384183708
62	NC_017202	AT	3	6	40324	40329	50 %	50 %	0 %	0 %	384183708
63	NC_017202	AG	3	6	41067	41072	50 %	0 %	50 %	0 %	384183709
64	NC_017202	AT	3	6	41114	41119	50 %	50 %	0 %	0 %	384183709
65	NC_017202	AT	3	6	41252	41257	50 %	50 %	0 %	0 %	384183709
66	NC_017202	AT	3	6	41474	41479	50 %	50 %	0 %	0 %	384183709
67	NC_017202	TA	3	6	41540	41545	50 %	50 %	0 %	0 %	384183709
68	NC_017202	AT	3	6	41822	41827	50 %	50 %	0 %	0 %	384183709
69	NC_017202	AT	4	8	43182	43189	50 %	50 %	0 %	0 %	384183710
70	NC_017202	AT	3	6	43493	43498	50 %	50 %	0 %	0 %	384183711
71	NC_017202	AG	3	6	43740	43745	50 %	0 %	50 %	0 %	384183711
72	NC_017202	AT	3	6	43990	43995	50 %	50 %	0 %	0 %	384183711
73	NC_017202	AT	3	6	44727	44732	50 %	50 %	0 %	0 %	384183712
74	NC_017202	TA	3	6	44751	44756	50 %	50 %	0 %	0 %	384183712
75	NC_017202	TA	4	8	45712	45719	50 %	50 %	0 %	0 %	384183713
76	NC_017202	TA	3	6	45767	45772	50 %	50 %	0 %	0 %	384183713
77	NC_017202	AT	3	6	45852	45857	50 %	50 %	0 %	0 %	384183713
78	NC_017202	AT	3	6	46288	46293	50 %	50 %	0 %	0 %	384183713
79	NC_017202	AT	3	6	47790	47795	50 %	50 %	0 %	0 %	384183714
80	NC_017202	AG	3	6	48335	48340	50 %	0 %	50 %	0 %	384183714
81	NC_017202	GT	3	6	49081	49086	0 %	50 %	50 %	0 %	384183714
82	NC_017202	AG	3	6	50607	50612	50 %	0 %	50 %	0 %	384183715
83	NC_017202	AC	3	6	50846	50851	50 %	0 %	0 %	50 %	384183715
84	NC_017202	TA	3	6	51077	51082	50 %	50 %	0 %	0 %	384183715
85	NC_017202	TA	3	6	51176	51181	50 %	50 %	0 %	0 %	384183715
86	NC_017202	TA	3	6	52531	52536	50 %	50 %	0 %	0 %	384183716
87	NC_017202	GA	3	6	53171	53176	50 %	0 %	50 %	0 %	384183717
88	NC_017202	AT	3	6	54465	54470	50 %	50 %	0 %	0 %	384183718
89	NC_017202	TA	3	6	54628	54633	50 %	50 %	0 %	0 %	384183718
90	NC_017202	TA	3	6	56876	56881	50 %	50 %	0 %	0 %	384183722
91	NC_017202	AC	3	6	57548	57553	50 %	0 %	0 %	50 %	384183723
92	NC_017202	AT	3	6	58174	58179	50 %	50 %	0 %	0 %	384183725
93	NC_017202	TA	3	6	58313	58318	50 %	50 %	0 %	0 %	384183725
94	NC_017202	AT	3	6	59876	59881	50 %	50 %	0 %	0 %	384183726
95	NC_017202	AT	3	6	60629	60634	50 %	50 %	0 %	0 %	384183727
96	NC_017202	CA	3	6	62327	62332	50 %	0 %	0 %	50 %	384183730
97	NC_017202	AT	4	8	62586	62593	50 %	50 %	0 %	0 %	384183730
98	NC_017202	AC	3	6	62811	62816	50 %	0 %	0 %	50 %	384183730
99	NC_017202	AT	3	6	62837	62842	50 %	50 %	0 %	0 %	384183730
100	NC_017202	TA	3	6	63484	63489	50 %	50 %	0 %	0 %	384183731
101	NC_017202	TA	3	6	63831	63836	50 %	50 %	0 %	0 %	384183731
102	NC_017202	AG	3	6	64777	64782	50 %	0 %	50 %	0 %	384183732
103	NC_017202	AT	3	6	64969	64974	50 %	50 %	0 %	0 %	384183732
104	NC_017202	GT	3	6	65562	65567	0 %	50 %	50 %	0 %	384183732
105	NC_017202	AT	3	6	67701	67706	50 %	50 %	0 %	0 %	384183735
106	NC_017202	TC	3	6	68167	68172	0 %	50 %	0 %	50 %	384183735
107	NC_017202	CT	3	6	68657	68662	0 %	50 %	0 %	50 %	384183735
108	NC_017202	AG	3	6	69719	69724	50 %	0 %	50 %	0 %	384183737
109	NC_017202	AT	3	6	70388	70393	50 %	50 %	0 %	0 %	384183739
110	NC_017202	AT	3	6	71625	71630	50 %	50 %	0 %	0 %	384183741
111	NC_017202	AG	3	6	71802	71807	50 %	0 %	50 %	0 %	384183741
112	NC_017202	AT	3	6	73236	73241	50 %	50 %	0 %	0 %	384183742
113	NC_017202	TG	3	6	73962	73967	0 %	50 %	50 %	0 %	384183743
114	NC_017202	TC	3	6	74216	74221	0 %	50 %	0 %	50 %	384183743
115	NC_017202	TA	3	6	74461	74466	50 %	50 %	0 %	0 %	384183743
116	NC_017202	AG	3	6	75890	75895	50 %	0 %	50 %	0 %	384183745
117	NC_017202	CT	4	8	77267	77274	0 %	50 %	0 %	50 %	384183746
118	NC_017202	GA	4	8	77969	77976	50 %	0 %	50 %	0 %	384183748
119	NC_017202	AT	3	6	78231	78236	50 %	50 %	0 %	0 %	384183748
120	NC_017202	AT	3	6	79052	79057	50 %	50 %	0 %	0 %	384183748
121	NC_017202	AG	3	6	79199	79204	50 %	0 %	50 %	0 %	384183748
122	NC_017202	AC	3	6	79366	79371	50 %	0 %	0 %	50 %	384183748
123	NC_017202	AG	4	8	80430	80437	50 %	0 %	50 %	0 %	384183749
124	NC_017202	AC	3	6	81646	81651	50 %	0 %	0 %	50 %	384183751
125	NC_017202	AT	3	6	82239	82244	50 %	50 %	0 %	0 %	384183751
126	NC_017202	CT	3	6	82431	82436	0 %	50 %	0 %	50 %	384183751
127	NC_017202	GA	3	6	83456	83461	50 %	0 %	50 %	0 %	384183752
128	NC_017202	TG	3	6	83464	83469	0 %	50 %	50 %	0 %	384183752
129	NC_017202	TA	3	6	83661	83666	50 %	50 %	0 %	0 %	384183752
130	NC_017202	GA	3	6	84539	84544	50 %	0 %	50 %	0 %	384183752
131	NC_017202	GA	3	6	85171	85176	50 %	0 %	50 %	0 %	384183754
132	NC_017202	AT	3	6	85695	85700	50 %	50 %	0 %	0 %	384183755
133	NC_017202	GA	3	6	85994	85999	50 %	0 %	50 %	0 %	384183755
134	NC_017202	TA	3	6	86156	86161	50 %	50 %	0 %	0 %	384183755
135	NC_017202	AT	3	6	86601	86606	50 %	50 %	0 %	0 %	384183755
136	NC_017202	TA	3	6	87238	87243	50 %	50 %	0 %	0 %	384183755
137	NC_017202	TA	3	6	88431	88436	50 %	50 %	0 %	0 %	384183757
138	NC_017202	AT	3	6	88738	88743	50 %	50 %	0 %	0 %	384183757
139	NC_017202	TC	3	6	89292	89297	0 %	50 %	0 %	50 %	384183757
140	NC_017202	AG	3	6	89833	89838	50 %	0 %	50 %	0 %	384183757
141	NC_017202	GA	3	6	90149	90154	50 %	0 %	50 %	0 %	384183758
142	NC_017202	AT	3	6	90200	90205	50 %	50 %	0 %	0 %	384183758
143	NC_017202	TA	4	8	92781	92788	50 %	50 %	0 %	0 %	384183760
144	NC_017202	AT	4	8	93502	93509	50 %	50 %	0 %	0 %	384183761
145	NC_017202	AT	4	8	95284	95291	50 %	50 %	0 %	0 %	384183762
146	NC_017202	TA	3	6	96226	96231	50 %	50 %	0 %	0 %	384183763
147	NC_017202	AT	4	8	96387	96394	50 %	50 %	0 %	0 %	384183763
148	NC_017202	CT	3	6	96409	96414	0 %	50 %	0 %	50 %	384183763
149	NC_017202	TG	3	6	97297	97302	0 %	50 %	50 %	0 %	384183766
150	NC_017202	TA	3	6	97949	97954	50 %	50 %	0 %	0 %	384183767
151	NC_017202	TA	3	6	98002	98007	50 %	50 %	0 %	0 %	384183767
152	NC_017202	AT	3	6	98859	98864	50 %	50 %	0 %	0 %	384183768
153	NC_017202	TA	3	6	99296	99301	50 %	50 %	0 %	0 %	384183769
154	NC_017202	GT	3	6	99351	99356	0 %	50 %	50 %	0 %	384183769
155	NC_017202	AT	3	6	99452	99457	50 %	50 %	0 %	0 %	384183769
156	NC_017202	TA	3	6	99525	99530	50 %	50 %	0 %	0 %	384183769
157	NC_017202	TA	3	6	99877	99882	50 %	50 %	0 %	0 %	384183770
158	NC_017202	AT	3	6	99927	99932	50 %	50 %	0 %	0 %	384183770
159	NC_017202	TA	3	6	100369	100374	50 %	50 %	0 %	0 %	384183771
160	NC_017202	AT	3	6	100392	100397	50 %	50 %	0 %	0 %	384183771
161	NC_017202	TA	3	6	100630	100635	50 %	50 %	0 %	0 %	384183771
162	NC_017202	TA	3	6	101273	101278	50 %	50 %	0 %	0 %	384183773
163	NC_017202	AT	3	6	101457	101462	50 %	50 %	0 %	0 %	384183773
164	NC_017202	AT	3	6	101576	101581	50 %	50 %	0 %	0 %	384183773
165	NC_017202	AT	3	6	101656	101661	50 %	50 %	0 %	0 %	384183773
166	NC_017202	AT	3	6	104159	104164	50 %	50 %	0 %	0 %	384183774
167	NC_017202	AT	3	6	104490	104495	50 %	50 %	0 %	0 %	384183775
168	NC_017202	CA	3	6	105532	105537	50 %	0 %	0 %	50 %	384183776
169	NC_017202	TA	3	6	106095	106100	50 %	50 %	0 %	0 %	384183777
170	NC_017202	AG	3	6	106139	106144	50 %	0 %	50 %	0 %	384183777
171	NC_017202	AG	3	6	107569	107574	50 %	0 %	50 %	0 %	384183779
172	NC_017202	CT	3	6	107588	107593	0 %	50 %	0 %	50 %	384183779
173	NC_017202	TA	3	6	108231	108236	50 %	50 %	0 %	0 %	384183780
174	NC_017202	AT	3	6	109499	109504	50 %	50 %	0 %	0 %	384183782
175	NC_017202	AT	3	6	110442	110447	50 %	50 %	0 %	0 %	384183784
176	NC_017202	AG	3	6	111351	111356	50 %	0 %	50 %	0 %	384183786
177	NC_017202	CT	3	6	111714	111719	0 %	50 %	0 %	50 %	384183786
178	NC_017202	AT	3	6	112033	112038	50 %	50 %	0 %	0 %	384183787
179	NC_017202	GT	3	6	112408	112413	0 %	50 %	50 %	0 %	384183789
180	NC_017202	AT	4	8	112748	112755	50 %	50 %	0 %	0 %	384183790
181	NC_017202	AT	3	6	113455	113460	50 %	50 %	0 %	0 %	384183792
182	NC_017202	GT	3	6	113650	113655	0 %	50 %	50 %	0 %	384183792
183	NC_017202	TA	3	6	114748	114753	50 %	50 %	0 %	0 %	384183795
184	NC_017202	TA	3	6	114782	114787	50 %	50 %	0 %	0 %	384183795
185	NC_017202	AT	3	6	115018	115023	50 %	50 %	0 %	0 %	384183796
186	NC_017202	GA	3	6	115116	115121	50 %	0 %	50 %	0 %	384183796
187	NC_017202	TA	3	6	116825	116830	50 %	50 %	0 %	0 %	384183798
188	NC_017202	TA	3	6	117037	117042	50 %	50 %	0 %	0 %	384183798
189	NC_017202	AT	3	6	117081	117086	50 %	50 %	0 %	0 %	384183798
190	NC_017202	AT	3	6	117693	117698	50 %	50 %	0 %	0 %	384183799
191	NC_017202	AG	3	6	118537	118542	50 %	0 %	50 %	0 %	384183800
192	NC_017202	AG	3	6	118770	118775	50 %	0 %	50 %	0 %	384183801
193	NC_017202	CT	3	6	118789	118794	0 %	50 %	0 %	50 %	384183801
194	NC_017202	TC	3	6	119011	119016	0 %	50 %	0 %	50 %	384183801
195	NC_017202	CT	3	6	119072	119077	0 %	50 %	0 %	50 %	384183801
196	NC_017202	TA	3	6	119175	119180	50 %	50 %	0 %	0 %	384183801
197	NC_017202	AT	3	6	119341	119346	50 %	50 %	0 %	0 %	384183802
198	NC_017202	TA	3	6	120422	120427	50 %	50 %	0 %	0 %	384183804
199	NC_017202	GT	4	8	120627	120634	0 %	50 %	50 %	0 %	384183805
200	NC_017202	GA	4	8	120770	120777	50 %	0 %	50 %	0 %	384183806
201	NC_017202	TA	3	6	120938	120943	50 %	50 %	0 %	0 %	384183806
202	NC_017202	TA	3	6	121582	121587	50 %	50 %	0 %	0 %	384183806
203	NC_017202	GA	3	6	121644	121649	50 %	0 %	50 %	0 %	384183806
204	NC_017202	TA	3	6	121964	121969	50 %	50 %	0 %	0 %	384183807
205	NC_017202	TA	3	6	122838	122843	50 %	50 %	0 %	0 %	384183807
206	NC_017202	AT	3	6	123186	123191	50 %	50 %	0 %	0 %	384183808
207	NC_017202	TC	3	6	123926	123931	0 %	50 %	0 %	50 %	384183809
208	NC_017202	AT	3	6	124116	124121	50 %	50 %	0 %	0 %	384183809
209	NC_017202	CT	3	6	124200	124205	0 %	50 %	0 %	50 %	384183809
210	NC_017202	AT	3	6	125052	125057	50 %	50 %	0 %	0 %	384183810
211	NC_017202	GA	3	6	126657	126662	50 %	0 %	50 %	0 %	384183813
212	NC_017202	AT	3	6	126838	126843	50 %	50 %	0 %	0 %	384183813
213	NC_017202	AT	3	6	127843	127848	50 %	50 %	0 %	0 %	384183815

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.