MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB26

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017201	TTTCTA	2	12	2243	2254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017201	ATCCCA	2	12	2871	2882	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384183362
3	NC_017201	TGAGTT	2	12	9945	9956	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017201	ATACGT	2	12	10449	10460	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017201	AGATTT	3	18	17694	17711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183378
6	NC_017201	TGAAGG	2	12	18423	18434	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384183378
7	NC_017201	TCCATT	2	12	20948	20959	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017201	TGGTCT	2	12	23933	23944	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384183383
9	NC_017201	TTTAAC	2	12	24619	24630	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384183383
10	NC_017201	ATTTAA	2	12	26097	26108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017201	TTCACT	2	12	28696	28707	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017201	CAAAAA	2	12	29327	29338	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384183393
13	NC_017201	TTAACA	2	12	30545	30556	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384183395
14	NC_017201	TTAATT	2	12	31951	31962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017201	GAAAAA	2	12	35532	35543	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017201	TTACAA	2	12	36741	36752	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017201	TAACTC	2	12	39508	39519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183410
18	NC_017201	ATTTAC	2	12	42847	42858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384183414
19	NC_017201	ATAAAC	2	12	49815	49826	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017201	AATGAA	2	12	56504	56515	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183421
21	NC_017201	TTTAAA	2	12	59703	59714	50 %	50 %	0 %	0 %	384183426
22	NC_017201	ATTGAT	2	12	62104	62115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183428
23	NC_017201	AAGTAG	2	12	65759	65770	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017201	GAAATA	2	12	66083	66094	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017201	ATTAAT	2	12	66795	66806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017201	TCAATC	2	12	68046	68057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183437
27	NC_017201	AAAATT	2	12	68281	68292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183438
28	NC_017201	TTCCTC	2	12	69196	69207	0 %	50 %	0 %	50 %	384183439
29	NC_017201	AGTTGT	2	12	70786	70797	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384183442
30	NC_017201	TTTAAT	2	12	71471	71482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017201	AGTTAT	2	12	75740	75751	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183444
32	NC_017201	TCCTTA	2	12	79155	79166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384183447
33	NC_017201	CTCTTC	2	12	80592	80603	0 %	50 %	0 %	50 %	384183447
34	NC_017201	ATAAAA	2	12	83992	84003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017201	TATTAA	2	12	86022	86033	50 %	50 %	0 %	0 %	384183451
36	NC_017201	TTCTTT	2	12	92068	92079	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384183461
37	NC_017201	ACGAAT	2	12	97732	97743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384183470
38	NC_017201	CCACAA	2	12	108210	108221	50 %	0 %	0 %	50 %	384183478
39	NC_017201	AATTTC	2	12	109655	109666	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384183479
40	NC_017201	TTTTCA	2	12	110905	110916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384183479
41	NC_017201	AACAAG	2	12	113622	113633	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384183480
42	NC_017201	AACTCG	2	12	114658	114669	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384183480
43	NC_017201	AGAAAA	2	12	114700	114711	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384183480
44	NC_017201	TTACAT	2	12	116243	116254	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384183481
45	NC_017201	GTAGAC	2	12	124372	124383	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384183487
46	NC_017201	GAAAAA	2	12	125907	125918	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384183488
47	NC_017201	TGTTCC	2	12	126964	126975	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017201	GATTTA	2	12	128704	128715	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183493
49	NC_017201	ATGAAT	2	12	129485	129496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183494
50	NC_017201	TTTTGT	2	12	135039	135050	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384183499
51	NC_017201	ATATAG	2	12	136873	136884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017201	TCAAAT	2	12	139179	139190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384183505
53	NC_017201	AGAGGA	2	12	139771	139782	50 %	0 %	50 %	0 %	384183506
54	NC_017201	GATTTA	2	12	144694	144705	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183513
55	NC_017201	TTACAT	2	12	147341	147352	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017201	TTTTTC	2	12	151565	151576	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384183519
57	NC_017201	TCAAAA	2	12	151750	151761	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017201	TCAAAA	2	12	152970	152981	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017201	CTTTTA	2	12	153242	153253	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017201	GTAGTG	2	12	154175	154186	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384183521
61	NC_017201	TTGTTC	2	12	154231	154242	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384183521
62	NC_017201	TATTTT	2	12	154500	154511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384183521
63	NC_017201	TTTTAA	2	12	156753	156764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183524
64	NC_017201	ATTTTC	2	12	180275	180286	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.