MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB26

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017201	ATCCCA	2	12	2871	2882	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384183362
2	NC_017201	AGATTT	3	18	17694	17711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183378
3	NC_017201	TGAAGG	2	12	18423	18434	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384183378
4	NC_017201	TGGTCT	2	12	23933	23944	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384183383
5	NC_017201	TTTAAC	2	12	24619	24630	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384183383
6	NC_017201	CAAAAA	2	12	29327	29338	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384183393
7	NC_017201	TTAACA	2	12	30545	30556	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384183395
8	NC_017201	TAACTC	2	12	39508	39519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183410
9	NC_017201	ATTTAC	2	12	42847	42858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384183414
10	NC_017201	AATGAA	2	12	56504	56515	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384183421
11	NC_017201	TTTAAA	2	12	59703	59714	50 %	50 %	0 %	0 %	384183426
12	NC_017201	ATTGAT	2	12	62104	62115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183428
13	NC_017201	TCAATC	2	12	68046	68057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183437
14	NC_017201	AAAATT	2	12	68281	68292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183438
15	NC_017201	TTCCTC	2	12	69196	69207	0 %	50 %	0 %	50 %	384183439
16	NC_017201	AGTTGT	2	12	70786	70797	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384183442
17	NC_017201	AGTTAT	2	12	75740	75751	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183444
18	NC_017201	TCCTTA	2	12	79155	79166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384183447
19	NC_017201	CTCTTC	2	12	80592	80603	0 %	50 %	0 %	50 %	384183447
20	NC_017201	TATTAA	2	12	86022	86033	50 %	50 %	0 %	0 %	384183451
21	NC_017201	TTCTTT	2	12	92068	92079	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384183461
22	NC_017201	ACGAAT	2	12	97732	97743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384183470
23	NC_017201	CCACAA	2	12	108210	108221	50 %	0 %	0 %	50 %	384183478
24	NC_017201	AATTTC	2	12	109655	109666	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384183479
25	NC_017201	TTTTCA	2	12	110905	110916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384183479
26	NC_017201	AACAAG	2	12	113622	113633	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384183480
27	NC_017201	AACTCG	2	12	114658	114669	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384183480
28	NC_017201	AGAAAA	2	12	114700	114711	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384183480
29	NC_017201	TTACAT	2	12	116243	116254	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384183481
30	NC_017201	GTAGAC	2	12	124372	124383	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384183487
31	NC_017201	GAAAAA	2	12	125907	125918	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384183488
32	NC_017201	GATTTA	2	12	128704	128715	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183493
33	NC_017201	ATGAAT	2	12	129485	129496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183494
34	NC_017201	TTTTGT	2	12	135039	135050	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384183499
35	NC_017201	TCAAAT	2	12	139179	139190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384183505
36	NC_017201	AGAGGA	2	12	139771	139782	50 %	0 %	50 %	0 %	384183506
37	NC_017201	GATTTA	2	12	144694	144705	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384183513
38	NC_017201	TTTTTC	2	12	151565	151576	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384183519
39	NC_017201	GTAGTG	2	12	154175	154186	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384183521
40	NC_017201	TTGTTC	2	12	154231	154242	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384183521
41	NC_017201	TATTTT	2	12	154500	154511	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384183521
42	NC_017201	TTTTAA	2	12	156753	156764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183524

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.