MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB26

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017201	TATAC	2	10	2176	2185	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017201	TATTT	2	10	5081	5090	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017201	TGGCA	2	10	7146	7155	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017201	AATAA	2	10	7478	7487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017201	TTTTA	2	10	12559	12568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017201	CATAA	2	10	31821	31830	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017201	AGTTT	2	10	31967	31976	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017201	TAACA	2	10	32593	32602	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017201	ATAAA	2	10	33240	33249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017201	GGTTA	2	10	33316	33325	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017201	AAAAT	2	10	33712	33721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017201	AGAAA	2	10	34069	34078	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017201	CTCAA	2	10	34893	34902	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017201	CTCTC	2	10	40873	40882	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017201	TCTTT	2	10	48990	48999	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017201	AAATT	2	10	50756	50765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017201	CTTTA	2	10	59044	59053	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017201	GAAAG	2	10	65287	65296	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017201	TTTTA	2	10	67586	67595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017201	ATTTA	2	10	69957	69966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017201	ATTGT	2	10	69995	70004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017201	AAAGC	2	10	75078	75087	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017201	ATTCA	2	10	75187	75196	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017201	TTTTA	2	10	84017	84026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017201	ATTTT	2	10	85184	85193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017201	AATTT	2	10	87016	87025	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017201	ATTAC	2	10	88680	88689	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017201	ATTCC	2	10	92704	92713	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017201	ACAAT	2	10	94542	94551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017201	TCTCC	2	10	97266	97275	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_017201	CTTAT	2	10	97394	97403	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017201	ACTAA	2	10	106553	106562	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017201	TTAAG	2	10	109028	109037	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017201	ATTGT	2	10	113205	113214	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017201	TGAAA	2	10	115216	115225	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017201	TGGAA	2	10	122096	122105	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017201	ATGAA	2	10	122146	122155	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017201	TCTAC	2	10	125309	125318	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017201	TTTGT	2	10	126121	126130	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017201	ATGTA	2	10	127701	127710	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017201	TAGAA	2	10	133336	133345	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017201	TGTAT	2	10	133761	133770	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017201	GAATG	2	10	136290	136299	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017201	TCTTT	2	10	140982	140991	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017201	AAATT	2	10	147400	147409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017201	TGTAC	2	10	152743	152752	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017201	TACCT	2	10	157985	157994	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017201	AGTTA	2	10	158716	158725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017201	TCATA	2	10	159792	159801	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017201	ATTTA	2	10	159877	159886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017201	TAAAA	2	10	160068	160077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017201	GTCAT	2	10	166432	166441	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017201	AATAA	2	10	178382	178391	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017201	ATCAA	2	10	178404	178413	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017201	TTAAG	2	10	182275	182284	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.