MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB26

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017201	CGATT	2	10	2033	2042	20 %	40 %	20 %	20 %	384183360
2	NC_017201	TAAAA	2	10	2044	2053	80 %	20 %	0 %	0 %	384183360
3	NC_017201	CATTA	2	10	3659	3668	40 %	40 %	0 %	20 %	384183363
4	NC_017201	TTCTG	2	10	3771	3780	0 %	60 %	20 %	20 %	384183363
5	NC_017201	ATTCG	2	10	13919	13928	20 %	40 %	20 %	20 %	384183373
6	NC_017201	ACAAA	2	10	16219	16228	80 %	0 %	0 %	20 %	384183376
7	NC_017201	GTTTT	2	10	21929	21938	0 %	80 %	20 %	0 %	384183380
8	NC_017201	TTTGA	2	10	25766	25775	20 %	60 %	20 %	0 %	384183386
9	NC_017201	TTCAC	2	10	26714	26723	20 %	40 %	0 %	40 %	384183388
10	NC_017201	ATTTC	2	10	28370	28379	20 %	60 %	0 %	20 %	384183391
11	NC_017201	GAAAA	2	10	29017	29026	80 %	0 %	20 %	0 %	384183392
12	NC_017201	TTTTA	2	10	29447	29456	20 %	80 %	0 %	0 %	384183393
13	NC_017201	TATCT	2	10	34761	34770	20 %	60 %	0 %	20 %	384183403
14	NC_017201	CAAAT	2	10	35629	35638	60 %	20 %	0 %	20 %	384183405
15	NC_017201	TTTCT	2	10	36059	36068	0 %	80 %	0 %	20 %	384183405
16	NC_017201	GTTGA	2	10	43422	43431	20 %	40 %	40 %	0 %	384183414
17	NC_017201	AAAGA	2	10	45034	45043	80 %	0 %	20 %	0 %	384183414
18	NC_017201	AGAAT	2	10	45280	45289	60 %	20 %	20 %	0 %	384183414
19	NC_017201	GTAAA	2	10	47486	47495	60 %	20 %	20 %	0 %	384183415
20	NC_017201	GTACT	2	10	48921	48930	20 %	40 %	20 %	20 %	384183416
21	NC_017201	ATGCA	2	10	51827	51836	40 %	20 %	20 %	20 %	384183419
22	NC_017201	TACAT	2	10	52256	52265	40 %	40 %	0 %	20 %	384183419
23	NC_017201	TTGTC	2	10	52460	52469	0 %	60 %	20 %	20 %	384183419
24	NC_017201	TTCTT	2	10	53469	53478	0 %	80 %	0 %	20 %	384183419
25	NC_017201	TAAAA	2	10	53488	53497	80 %	20 %	0 %	0 %	384183419
26	NC_017201	ATCTT	2	10	54982	54991	20 %	60 %	0 %	20 %	384183420
27	NC_017201	TAAAA	2	10	56398	56407	80 %	20 %	0 %	0 %	384183421
28	NC_017201	ATATT	2	10	56829	56838	40 %	60 %	0 %	0 %	384183421
29	NC_017201	ATTTT	2	10	57685	57694	20 %	80 %	0 %	0 %	384183423
30	NC_017201	AACCA	2	10	58914	58923	60 %	0 %	0 %	40 %	384183425
31	NC_017201	CAATC	2	10	58929	58938	40 %	20 %	0 %	40 %	384183425
32	NC_017201	AGTTC	2	10	61498	61507	20 %	40 %	20 %	20 %	384183428
33	NC_017201	TCACA	2	10	62572	62581	40 %	20 %	0 %	40 %	384183428
34	NC_017201	ATCAA	2	10	63086	63095	60 %	20 %	0 %	20 %	384183429
35	NC_017201	TTGAA	2	10	63716	63725	40 %	40 %	20 %	0 %	384183429
36	NC_017201	CTTTT	2	10	64234	64243	0 %	80 %	0 %	20 %	384183430
37	NC_017201	AATTT	2	10	64354	64363	40 %	60 %	0 %	0 %	384183430
38	NC_017201	AAATG	2	10	66681	66690	60 %	20 %	20 %	0 %	384183434
39	NC_017201	ATTTG	2	10	67719	67728	20 %	60 %	20 %	0 %	384183436
40	NC_017201	CTTTT	2	10	73258	73267	0 %	80 %	0 %	20 %	384183443
41	NC_017201	AAATT	2	10	74259	74268	60 %	40 %	0 %	0 %	384183443
42	NC_017201	TGTAC	2	10	74649	74658	20 %	40 %	20 %	20 %	384183443
43	NC_017201	GCAAA	2	10	74727	74736	60 %	0 %	20 %	20 %	384183443
44	NC_017201	ATACT	2	10	75787	75796	40 %	40 %	0 %	20 %	384183444
45	NC_017201	AAAAG	2	10	78858	78867	80 %	0 %	20 %	0 %	384183447
46	NC_017201	TTGAA	2	10	79728	79737	40 %	40 %	20 %	0 %	384183447
47	NC_017201	TCATT	2	10	79804	79813	20 %	60 %	0 %	20 %	384183447
48	NC_017201	GGTTT	2	10	83059	83068	0 %	60 %	40 %	0 %	384183449
49	NC_017201	TTCTT	2	10	83499	83508	0 %	80 %	0 %	20 %	384183449
50	NC_017201	CAATC	2	10	87091	87100	40 %	20 %	0 %	40 %	384183452
51	NC_017201	TTTTC	2	10	87186	87195	0 %	80 %	0 %	20 %	384183452
52	NC_017201	TAAAG	2	10	88040	88049	60 %	20 %	20 %	0 %	384183453
53	NC_017201	TTAAA	2	10	88093	88102	60 %	40 %	0 %	0 %	384183453
54	NC_017201	ACTCC	2	10	89381	89390	20 %	20 %	0 %	60 %	384183455
55	NC_017201	CATCT	2	10	89470	89479	20 %	40 %	0 %	40 %	384183455
56	NC_017201	TTCAA	2	10	89749	89758	40 %	40 %	0 %	20 %	384183456
57	NC_017201	TTGTT	2	10	93756	93765	0 %	80 %	20 %	0 %	384183464
58	NC_017201	ATAAA	2	10	95594	95603	80 %	20 %	0 %	0 %	384183468
59	NC_017201	GAAAA	2	10	97965	97974	80 %	0 %	20 %	0 %	384183470
60	NC_017201	CATTA	2	10	98563	98572	40 %	40 %	0 %	20 %	384183470
61	NC_017201	AAATT	2	10	98739	98748	60 %	40 %	0 %	0 %	384183471
62	NC_017201	TGTAA	2	10	99873	99882	40 %	40 %	20 %	0 %	384183472
63	NC_017201	CTTTT	2	10	101984	101993	0 %	80 %	0 %	20 %	384183473
64	NC_017201	TAAAT	2	10	103409	103418	60 %	40 %	0 %	0 %	384183473
65	NC_017201	ATTTC	2	10	103553	103562	20 %	60 %	0 %	20 %	384183474
66	NC_017201	AGTTT	2	10	103967	103976	20 %	60 %	20 %	0 %	384183474
67	NC_017201	TACCT	2	10	104960	104969	20 %	40 %	0 %	40 %	384183475
68	NC_017201	TTATT	2	10	106003	106012	20 %	80 %	0 %	0 %	384183475
69	NC_017201	GATTT	2	10	109613	109622	20 %	60 %	20 %	0 %	384183479
70	NC_017201	TGAGT	2	10	110421	110430	20 %	40 %	40 %	0 %	384183479
71	NC_017201	GCTTT	2	10	110929	110938	0 %	60 %	20 %	20 %	384183479
72	NC_017201	TACAA	2	10	114073	114082	60 %	20 %	0 %	20 %	384183480
73	NC_017201	GTTTT	2	10	117155	117164	0 %	80 %	20 %	0 %	384183482
74	NC_017201	ATTTA	2	10	117287	117296	40 %	60 %	0 %	0 %	384183482
75	NC_017201	CATTG	2	10	117659	117668	20 %	40 %	20 %	20 %	384183483
76	NC_017201	TCCCC	2	10	119045	119054	0 %	20 %	0 %	80 %	384183483
77	NC_017201	AACAT	2	10	119367	119376	60 %	20 %	0 %	20 %	384183483
78	NC_017201	AGTAT	2	10	120026	120035	40 %	40 %	20 %	0 %	384183483
79	NC_017201	CTTTC	2	10	123202	123211	0 %	60 %	0 %	40 %	384183485
80	NC_017201	CGAAA	2	10	124307	124316	60 %	0 %	20 %	20 %	384183487
81	NC_017201	GATTT	2	10	124784	124793	20 %	60 %	20 %	0 %	384183487
82	NC_017201	AAGAA	2	10	125080	125089	80 %	0 %	20 %	0 %	384183487
83	NC_017201	AAAAG	2	10	126793	126802	80 %	0 %	20 %	0 %	384183490
84	NC_017201	AAGAG	2	10	127039	127048	60 %	0 %	40 %	0 %	384183491
85	NC_017201	ATTCT	2	10	127408	127417	20 %	60 %	0 %	20 %	384183491
86	NC_017201	AATTT	2	10	131665	131674	40 %	60 %	0 %	0 %	384183495
87	NC_017201	TGGTT	2	10	132066	132075	0 %	60 %	40 %	0 %	384183496
88	NC_017201	AAAAT	2	10	135147	135156	80 %	20 %	0 %	0 %	384183499
89	NC_017201	AAGAA	2	10	140311	140320	80 %	0 %	20 %	0 %	384183506
90	NC_017201	AGAAA	2	10	140821	140830	80 %	0 %	20 %	0 %	384183507
91	NC_017201	ATTTT	2	10	141410	141419	20 %	80 %	0 %	0 %	384183508
92	NC_017201	ATGGG	2	10	142970	142979	20 %	20 %	60 %	0 %	384183512
93	NC_017201	CAAAA	2	10	143290	143299	80 %	0 %	0 %	20 %	384183513
94	NC_017201	GTATC	2	10	143307	143316	20 %	40 %	20 %	20 %	384183513
95	NC_017201	TTAAA	2	10	143534	143543	60 %	40 %	0 %	0 %	384183513
96	NC_017201	AAAAT	2	10	143555	143564	80 %	20 %	0 %	0 %	384183513
97	NC_017201	AAAGA	2	10	143989	143998	80 %	0 %	20 %	0 %	384183513
98	NC_017201	TTTAG	2	10	144013	144022	20 %	60 %	20 %	0 %	384183513
99	NC_017201	AAAGA	2	10	144384	144393	80 %	0 %	20 %	0 %	384183513
100	NC_017201	AAGAA	2	10	145593	145602	80 %	0 %	20 %	0 %	384183513
101	NC_017201	ATGCA	2	10	146183	146192	40 %	20 %	20 %	20 %	384183515
102	NC_017201	AACAG	2	10	146803	146812	60 %	0 %	20 %	20 %	384183517
103	NC_017201	GTAAA	2	10	147091	147100	60 %	20 %	20 %	0 %	384183517
104	NC_017201	ATTTT	2	10	149448	149457	20 %	80 %	0 %	0 %	384183518
105	NC_017201	GAGAA	2	10	150842	150851	60 %	0 %	40 %	0 %	384183519
106	NC_017201	TTAAT	2	10	151115	151124	40 %	60 %	0 %	0 %	384183519
107	NC_017201	GAAGA	2	10	160272	160281	60 %	0 %	40 %	0 %	384183526
108	NC_017201	CCTAT	2	10	160733	160742	20 %	40 %	0 %	40 %	384183526
109	NC_017201	AAGTA	2	10	160913	160922	60 %	20 %	20 %	0 %	384183526
110	NC_017201	CATTA	2	10	162931	162940	40 %	40 %	0 %	20 %	384183528
111	NC_017201	AATGA	2	10	163718	163727	60 %	20 %	20 %	0 %	384183528
112	NC_017201	GCAAA	2	10	164600	164609	60 %	0 %	20 %	20 %	384183528
113	NC_017201	TTTCT	2	10	167526	167535	0 %	80 %	0 %	20 %	384183531
114	NC_017201	GATTC	2	10	168790	168799	20 %	40 %	20 %	20 %	384183531
115	NC_017201	AATGA	2	10	170770	170779	60 %	20 %	20 %	0 %	384183532
116	NC_017201	TTCTT	2	10	177972	177981	0 %	80 %	0 %	20 %	384183541
117	NC_017201	GAATG	2	10	177986	177995	40 %	20 %	40 %	0 %	384183541
118	NC_017201	CCTTA	2	10	180446	180455	20 %	40 %	0 %	40 %	384183543
119	NC_017201	CATTT	2	10	181086	181095	20 %	60 %	0 %	20 %	384183544
120	NC_017201	TATCG	2	10	182164	182173	20 %	40 %	20 %	20 %	384183545
121	NC_017201	GGCTT	2	10	183541	183550	0 %	40 %	40 %	20 %	384183546
122	NC_017201	TCAAA	2	10	184073	184082	60 %	20 %	0 %	20 %	384183547
123	NC_017201	CTAAA	2	10	184628	184637	60 %	20 %	0 %	20 %	384183547
124	NC_017201	ACGAA	2	10	185185	185194	60 %	0 %	20 %	20 %	384183547
125	NC_017201	AAGTT	2	10	186466	186475	40 %	40 %	20 %	0 %	384183547

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.