MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB26

Total Repeats: 439

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017201	TA	3	6	345	350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017201	GT	3	6	693	698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017201	AT	3	6	909	914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017201	AT	4	8	1006	1013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017201	GA	3	6	1117	1122	50 %	0 %	50 %	0 %	384183358
6	NC_017201	AT	3	6	1130	1135	50 %	50 %	0 %	0 %	384183358
7	NC_017201	TA	3	6	1433	1438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017201	AC	3	6	1856	1861	50 %	0 %	0 %	50 %	384183360
9	NC_017201	TA	3	6	2012	2017	50 %	50 %	0 %	0 %	384183360
10	NC_017201	TA	3	6	2227	2232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017201	GA	3	6	2284	2289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017201	GA	3	6	3054	3059	50 %	0 %	50 %	0 %	384183362
13	NC_017201	AT	3	6	3969	3974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017201	AC	3	6	4306	4311	50 %	0 %	0 %	50 %	384183364
15	NC_017201	AT	3	6	4879	4884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017201	AT	3	6	5059	5064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017201	TA	3	6	5354	5359	50 %	50 %	0 %	0 %	384183365
18	NC_017201	TA	4	8	5612	5619	50 %	50 %	0 %	0 %	384183365
19	NC_017201	AT	3	6	6721	6726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017201	AT	3	6	6860	6865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017201	TA	3	6	7066	7071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017201	TC	3	6	7269	7274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017201	CA	3	6	7540	7545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017201	TC	3	6	7936	7941	0 %	50 %	0 %	50 %	384183367
25	NC_017201	AT	3	6	8353	8358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017201	TA	3	6	9367	9372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017201	AG	3	6	9795	9800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017201	TA	3	6	9967	9972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017201	AT	3	6	10975	10980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017201	AT	3	6	12168	12173	50 %	50 %	0 %	0 %	384183370
31	NC_017201	CT	3	6	12404	12409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017201	TA	3	6	12844	12849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017201	TG	3	6	12899	12904	0 %	50 %	50 %	0 %	384183372
34	NC_017201	TC	3	6	13867	13872	0 %	50 %	0 %	50 %	384183373
35	NC_017201	AT	3	6	15612	15617	50 %	50 %	0 %	0 %	384183376
36	NC_017201	TA	3	6	15976	15981	50 %	50 %	0 %	0 %	384183376
37	NC_017201	AT	3	6	16294	16299	50 %	50 %	0 %	0 %	384183376
38	NC_017201	TA	3	6	17293	17298	50 %	50 %	0 %	0 %	384183377
39	NC_017201	TA	3	6	17427	17432	50 %	50 %	0 %	0 %	384183377
40	NC_017201	AT	3	6	17864	17869	50 %	50 %	0 %	0 %	384183378
41	NC_017201	CT	3	6	18208	18213	0 %	50 %	0 %	50 %	384183378
42	NC_017201	TA	4	8	18225	18232	50 %	50 %	0 %	0 %	384183378
43	NC_017201	TA	3	6	18727	18732	50 %	50 %	0 %	0 %	384183378
44	NC_017201	AT	3	6	19009	19014	50 %	50 %	0 %	0 %	384183379
45	NC_017201	TA	3	6	19100	19105	50 %	50 %	0 %	0 %	384183379
46	NC_017201	AT	3	6	19332	19337	50 %	50 %	0 %	0 %	384183379
47	NC_017201	AT	3	6	19862	19867	50 %	50 %	0 %	0 %	384183379
48	NC_017201	TC	3	6	19876	19881	0 %	50 %	0 %	50 %	384183379
49	NC_017201	TC	3	6	19918	19923	0 %	50 %	0 %	50 %	384183379
50	NC_017201	TC	3	6	19999	20004	0 %	50 %	0 %	50 %	384183379
51	NC_017201	AT	3	6	20122	20127	50 %	50 %	0 %	0 %	384183379
52	NC_017201	TA	3	6	20454	20459	50 %	50 %	0 %	0 %	384183379
53	NC_017201	CT	3	6	20784	20789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017201	AT	3	6	21008	21013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017201	TA	4	8	21522	21529	50 %	50 %	0 %	0 %	384183380
56	NC_017201	CT	3	6	22552	22557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017201	TA	3	6	22710	22715	50 %	50 %	0 %	0 %	384183381
58	NC_017201	AT	3	6	22794	22799	50 %	50 %	0 %	0 %	384183381
59	NC_017201	AT	4	8	23047	23054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017201	AT	3	6	23366	23371	50 %	50 %	0 %	0 %	384183382
61	NC_017201	GT	3	6	23807	23812	0 %	50 %	50 %	0 %	384183383
62	NC_017201	AC	3	6	24432	24437	50 %	0 %	0 %	50 %	384183383
63	NC_017201	TA	3	6	24562	24567	50 %	50 %	0 %	0 %	384183383
64	NC_017201	TC	3	6	24778	24783	0 %	50 %	0 %	50 %	384183384
65	NC_017201	TA	3	6	25266	25271	50 %	50 %	0 %	0 %	384183385
66	NC_017201	TA	3	6	25441	25446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017201	TA	3	6	25542	25547	50 %	50 %	0 %	0 %	384183386
68	NC_017201	CT	3	6	25549	25554	0 %	50 %	0 %	50 %	384183386
69	NC_017201	AT	3	6	25826	25831	50 %	50 %	0 %	0 %	384183386
70	NC_017201	CT	3	6	25839	25844	0 %	50 %	0 %	50 %	384183386
71	NC_017201	TA	3	6	26077	26082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017201	TA	3	6	26268	26273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017201	AC	3	6	26305	26310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017201	GA	3	6	26407	26412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017201	CT	3	6	26850	26855	0 %	50 %	0 %	50 %	384183388
76	NC_017201	AT	3	6	26874	26879	50 %	50 %	0 %	0 %	384183388
77	NC_017201	TA	3	6	27567	27572	50 %	50 %	0 %	0 %	384183389
78	NC_017201	TA	4	8	28241	28248	50 %	50 %	0 %	0 %	384183391
79	NC_017201	TA	3	6	28267	28272	50 %	50 %	0 %	0 %	384183391
80	NC_017201	TA	3	6	28445	28450	50 %	50 %	0 %	0 %	384183391
81	NC_017201	TA	3	6	28925	28930	50 %	50 %	0 %	0 %	384183392
82	NC_017201	AT	3	6	29051	29056	50 %	50 %	0 %	0 %	384183392
83	NC_017201	AT	3	6	29158	29163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85	NC_017201	AT	3	6	31068	31073	50 %	50 %	0 %	0 %	384183396
86	NC_017201	TA	3	6	32352	32357	50 %	50 %	0 %	0 %	384183398
87	NC_017201	AT	3	6	32824	32829	50 %	50 %	0 %	0 %	384183399
88	NC_017201	AT	3	6	33098	33103	50 %	50 %	0 %	0 %	384183400
89	NC_017201	TC	3	6	33373	33378	0 %	50 %	0 %	50 %	384183401
90	NC_017201	TA	3	6	33637	33642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017201	AT	3	6	34008	34013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017201	TA	4	8	34015	34022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017201	AT	3	6	34052	34057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017201	TC	3	6	34941	34946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017201	TC	3	6	35186	35191	0 %	50 %	0 %	50 %	384183404
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98	NC_017201	CT	3	6	36067	36072	0 %	50 %	0 %	50 %	384183405
99	NC_017201	TA	3	6	36571	36576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017201	TC	4	8	38060	38067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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102	NC_017201	TA	4	8	38687	38694	50 %	50 %	0 %	0 %	384183409
103	NC_017201	TA	3	6	38840	38845	50 %	50 %	0 %	0 %	384183409
104	NC_017201	TA	3	6	39562	39567	50 %	50 %	0 %	0 %	384183410
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106	NC_017201	GT	3	6	39977	39982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_017201	TA	4	8	41009	41016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017201	TA	3	6	41686	41691	50 %	50 %	0 %	0 %	384183413
110	NC_017201	TG	3	6	42096	42101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017201	TA	3	6	42676	42681	50 %	50 %	0 %	0 %	384183414
112	NC_017201	TA	3	6	42829	42834	50 %	50 %	0 %	0 %	384183414
113	NC_017201	TA	4	8	42876	42883	50 %	50 %	0 %	0 %	384183414
114	NC_017201	CA	3	6	42927	42932	50 %	0 %	0 %	50 %	384183414
115	NC_017201	TA	3	6	43269	43274	50 %	50 %	0 %	0 %	384183414
116	NC_017201	GC	3	6	44528	44533	0 %	0 %	50 %	50 %	384183414
117	NC_017201	TC	3	6	45182	45187	0 %	50 %	0 %	50 %	384183414
118	NC_017201	AT	3	6	45217	45222	50 %	50 %	0 %	0 %	384183414
119	NC_017201	AT	3	6	45975	45980	50 %	50 %	0 %	0 %	384183415
120	NC_017201	CT	3	6	46223	46228	0 %	50 %	0 %	50 %	384183415
121	NC_017201	AT	3	6	46245	46250	50 %	50 %	0 %	0 %	384183415
122	NC_017201	TA	3	6	46460	46465	50 %	50 %	0 %	0 %	384183415
123	NC_017201	AT	3	6	48027	48032	50 %	50 %	0 %	0 %	384183415
124	NC_017201	TA	3	6	48469	48474	50 %	50 %	0 %	0 %	384183415
125	NC_017201	AT	3	6	48554	48559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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127	NC_017201	AT	3	6	49116	49121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017201	TA	3	6	49308	49313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017201	TA	4	8	49594	49601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017201	AT	3	6	49827	49832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017201	CA	3	6	49842	49847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017201	GT	3	6	49942	49947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017201	AT	3	6	50624	50629	50 %	50 %	0 %	0 %	384183417
134	NC_017201	CA	3	6	50743	50748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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136	NC_017201	TC	3	6	51425	51430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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141	NC_017201	TA	3	6	52915	52920	50 %	50 %	0 %	0 %	384183419
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148	NC_017201	TA	3	6	54567	54572	50 %	50 %	0 %	0 %	384183420
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438	NC_017201	CG	3	6	187178	187183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
439	NC_017201	AC	3	6	187296	187301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.